RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000513524.5

GPBP1-206, Transcript of GC-rich promoter binding protein 1, human

TSL 5

Gene GPBP1, Length 529 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
GPBP1-206	ENST00000513524	ZNF485	Q8NCK3	441 aa		4.58	□□□□□ -1.68
GPBP1-206	ENST00000513524	ZNF519	Q8TB69	540 aa		4.58	□□□□□ -1.68
GPBP1-206	ENST00000513524	ATP8B4	Q8TF62	1192 aa		4.58	□□□□□ -1.68
GPBP1-206	ENST00000513524	HIST1H2AC	Q93077	130 aa		4.58	□□□□□ -1.68
GPBP1-206	ENST00000513524	MRPL53	Q96EL3	112 aa	Known RBP	4.58	□□□□□ -1.68
GPBP1-206	ENST00000513524	PCED1B	Q96HM7	432 aa		4.58	□□□□□ -1.68
GPBP1-206	ENST00000513524	SAMD8	Q96LT4	415 aa		4.58	□□□□□ -1.68
GPBP1-206	ENST00000513524	ZNF599	Q96NL3	588 aa		4.58	□□□□□ -1.68
GPBP1-206	ENST00000513524	COQ7	Q99807	217 aa		4.58	□□□□□ -1.68
GPBP1-206	ENST00000513524	FTHL17	Q9BXU8	183 aa		4.58	□□□□□ -1.68
GPBP1-206	ENST00000513524	NACA2	Q9H009	215 aa		4.58	□□□□□ -1.68
GPBP1-206	ENST00000513524	RAB17	Q9H0T7	212 aa		4.58	□□□□□ -1.68
GPBP1-206	ENST00000513524	GDF3	Q9NR23	364 aa		4.58	□□□□□ -1.68
GPBP1-206	ENST00000513524	TEX10	Q9NXF1	929 aa	Predicted RBP	4.58	□□□□□ -1.68
GPBP1-206	ENST00000513524	TMEM181	Q9P2C4	612 aa		4.58	□□□□□ -1.68
GPBP1-206	ENST00000513524	BAIAP2L1	Q9UHR4	511 aa		4.58	□□□□□ -1.68
GPBP1-206	ENST00000513524	FGD5	Q6ZNL6	1462 aa		4.57	□□□□□ -1.68
GPBP1-206	ENST00000513524	NDUFAF8	A1L188	74 aa		4.57	□□□□□ -1.68
GPBP1-206	ENST00000513524	SHISA7	A6NL88	538 aa		4.57	□□□□□ -1.68
GPBP1-206	ENST00000513524	ANHX	E9PGG2	379 aa		4.57	□□□□□ -1.68
GPBP1-206	ENST00000513524	SYNGR4	O95473	234 aa		4.57	□□□□□ -1.68
GPBP1-206	ENST00000513524	TGFA	P01135	160 aa		4.57	□□□□□ -1.68
GPBP1-206	ENST00000513524	GLRA1	P23415	457 aa		4.57	□□□□□ -1.68
GPBP1-206	ENST00000513524	HSPA1L	P34931	641 aa		4.57	□□□□□ -1.68
GPBP1-206	ENST00000513524	NUMB	P49757	651 aa		4.57	□□□□□ -1.68
GPBP1-206	ENST00000513524	KRTAP10-7	P60409	375 aa	Predicted RBP	4.57	□□□□□ -1.68
GPBP1-206	ENST00000513524	ERVK-16	P61578	105 aa		4.57	□□□□□ -1.68
GPBP1-206	ENST00000513524	RBBP4	Q09028	425 aa		4.57	□□□□□ -1.68
GPBP1-206	ENST00000513524	WSCD2	Q2TBF2	565 aa		4.57	□□□□□ -1.68
GPBP1-206	ENST00000513524	DDI2	Q5TDH0	399 aa		4.57	□□□□□ -1.68
GPBP1-206	ENST00000513524	ISLR2	Q6UXK2	745 aa		4.57	□□□□□ -1.68
GPBP1-206	ENST00000513524	FRRS1	Q6ZNA5	592 aa		4.57	□□□□□ -1.68
GPBP1-206	ENST00000513524		Q6ZRP5	223 aa		4.57	□□□□□ -1.68
GPBP1-206	ENST00000513524	CATSPERD	Q86XM0	798 aa		4.57	□□□□□ -1.68
GPBP1-206	ENST00000513524	GOLGA5	Q8TBA6	731 aa		4.57	□□□□□ -1.68
GPBP1-206	ENST00000513524	TCP11	Q8WWU5	503 aa		4.57	□□□□□ -1.68
GPBP1-206	ENST00000513524	SLCO2A1	Q92959	643 aa		4.57	□□□□□ -1.68
GPBP1-206	ENST00000513524	POM121L2	Q96KW2	1035 aa		4.57	□□□□□ -1.68
GPBP1-206	ENST00000513524	TRIM51	Q9BSJ1	452 aa		4.57	□□□□□ -1.68
GPBP1-206	ENST00000513524	MCRIP2	Q9BUT9	160 aa	Known RBP	4.57	□□□□□ -1.68
GPBP1-206	ENST00000513524	HPS4	Q9NQG7	708 aa		4.57	□□□□□ -1.68
GPBP1-206	ENST00000513524	TECR	Q9NZ01	308 aa	Known RBP	4.57	□□□□□ -1.68
GPBP1-206	ENST00000513524	PLA2G4C	Q9UP65	541 aa		4.57	□□□□□ -1.68
GPBP1-206	ENST00000513524	PLEKHA6	Q9Y2H5	1048 aa		4.57	□□□□□ -1.68
GPBP1-206	ENST00000513524	WIPI2	Q9Y4P8	454 aa		4.57	□□□□□ -1.68
GPBP1-206	ENST00000513524	CLCA3P	Q9Y6N3	262 aa		4.57	□□□□□ -1.68
GPBP1-206	ENST00000513524	SNED1	Q8TER0	1413 aa		4.56	□□□□□ -1.68
GPBP1-206	ENST00000513524	UBE4B	O95155	1302 aa		4.56	□□□□□ -1.68
GPBP1-206	ENST00000513524	IGLV7-46	A0A075B6I9	117 aa		4.56	□□□□□ -1.68
GPBP1-206	ENST00000513524	TMCO5B	A8MYB1	307 aa		4.56	□□□□□ -1.68
GPBP1-206	ENST00000513524	TNFSF12	O43508	249 aa		4.56	□□□□□ -1.68
GPBP1-206	ENST00000513524	GNS	P15586	552 aa		4.56	□□□□□ -1.68
GPBP1-206	ENST00000513524	DES	P17661	470 aa		4.56	□□□□□ -1.68
GPBP1-206	ENST00000513524	RPA1	P27694	616 aa		4.56	□□□□□ -1.68
GPBP1-206	ENST00000513524	PDHA2	P29803	388 aa		4.56	□□□□□ -1.68
GPBP1-206	ENST00000513524	RPL9	P32969	192 aa	Known RBP	4.56	□□□□□ -1.68
GPBP1-206	ENST00000513524	CAMLG	P49069	296 aa		4.56	□□□□□ -1.68
GPBP1-206	ENST00000513524	CDKL1	Q00532	357 aa		4.56	□□□□□ -1.68
GPBP1-206	ENST00000513524	EXOSC7	Q15024	291 aa	Known RBP	4.56	□□□□□ -1.68
GPBP1-206	ENST00000513524	KARS	Q15046	597 aa	Known RBP	4.56	□□□□□ -1.68
GPBP1-206	ENST00000513524	EPC2	Q52LR7	807 aa		4.56	□□□□□ -1.68
GPBP1-206	ENST00000513524	RAET1G	Q6H3X3	334 aa		4.56	□□□□□ -1.68
GPBP1-206	ENST00000513524	TRIM65	Q6PJ69	517 aa		4.56	□□□□□ -1.68
GPBP1-206	ENST00000513524	LCLAT1	Q6UWP7	414 aa		4.56	□□□□□ -1.68
GPBP1-206	ENST00000513524	OLFM4	Q6UX06	510 aa		4.56	□□□□□ -1.68
GPBP1-206	ENST00000513524	ZNF730	Q6ZMV8	503 aa		4.56	□□□□□ -1.68
GPBP1-206	ENST00000513524	KIF6	Q6ZMV9	814 aa		4.56	□□□□□ -1.68
GPBP1-206	ENST00000513524	STXBP4	Q6ZWJ1	553 aa		4.56	□□□□□ -1.68
GPBP1-206	ENST00000513524	BNIPL	Q7Z465	357 aa		4.56	□□□□□ -1.68
GPBP1-206	ENST00000513524	KRTAP7-1	Q8IUC3	87 aa		4.56	□□□□□ -1.68
GPBP1-206	ENST00000513524	OR10G7	Q8NGN6	311 aa		4.56	□□□□□ -1.68
GPBP1-206	ENST00000513524	LIPH	Q8WWY8	451 aa		4.56	□□□□□ -1.68
GPBP1-206	ENST00000513524	RSPH1	Q8WYR4	309 aa		4.56	□□□□□ -1.68
GPBP1-206	ENST00000513524	C14orf79	Q96F83	325 aa		4.56	□□□□□ -1.68
GPBP1-206	ENST00000513524	TAAR6	Q96RI8	345 aa		4.56	□□□□□ -1.68
GPBP1-206	ENST00000513524	OVOL2	Q9BRP0	275 aa		4.56	□□□□□ -1.68
GPBP1-206	ENST00000513524	PINK1	Q9BXM7	581 aa		4.56	□□□□□ -1.68
GPBP1-206	ENST00000513524	SIRPD	Q9H106	197 aa		4.56	□□□□□ -1.68
GPBP1-206	ENST00000513524	CLIP2	Q9UDT6	1046 aa		4.56	□□□□□ -1.68
GPBP1-206	ENST00000513524	DIMT1	Q9UNQ2	313 aa	Known RBP	4.56	□□□□□ -1.68
GPBP1-206	ENST00000513524		A0A0U1RRA0	63 aa		4.55	□□□□□ -1.68
GPBP1-206	ENST00000513524		A0A1B0GU03	582 aa		4.55	□□□□□ -1.68
GPBP1-206	ENST00000513524		A8MU76	341 aa		4.55	□□□□□ -1.68
GPBP1-206	ENST00000513524	TLX2	O43763	284 aa	Predicted RBP	4.55	□□□□□ -1.68
GPBP1-206	ENST00000513524	LRP3	O75074	770 aa		4.55	□□□□□ -1.68
GPBP1-206	ENST00000513524	CS	O75390	466 aa	Known RBP	4.55	□□□□□ -1.68
GPBP1-206	ENST00000513524	ANXA9	O76027	345 aa		4.55	□□□□□ -1.68
GPBP1-206	ENST00000513524	TRIM16	O95361	564 aa		4.55	□□□□□ -1.68
GPBP1-206	ENST00000513524	PROS1	P07225	676 aa		4.55	□□□□□ -1.68
GPBP1-206	ENST00000513524	MBL2	P11226	248 aa	Predicted RBP	4.55	□□□□□ -1.68
GPBP1-206	ENST00000513524	DPEP1	P16444	411 aa		4.55	□□□□□ -1.68
GPBP1-206	ENST00000513524	AOC1	P19801	751 aa		4.55	□□□□□ -1.68
GPBP1-206	ENST00000513524	EDNRA	P25101	427 aa		4.55	□□□□□ -1.68
GPBP1-206	ENST00000513524	PKLR	P30613	574 aa		4.55	□□□□□ -1.68
GPBP1-206	ENST00000513524	AKT2	P31751	481 aa		4.55	□□□□□ -1.68
GPBP1-206	ENST00000513524	CCL11	P51671	97 aa		4.55	□□□□□ -1.68
GPBP1-206	ENST00000513524	LIMK2	P53671	638 aa		4.55	□□□□□ -1.68
GPBP1-206	ENST00000513524	SLC26A5	P58743	744 aa		4.55	□□□□□ -1.68
GPBP1-206	ENST00000513524	POLR2F	P61218	127 aa	Known RBP	4.55	□□□□□ -1.68
GPBP1-206	ENST00000513524	HTD2	P86397	168 aa		4.55	□□□□□ -1.68

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