RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000495188.2

RNF146-208, Transcript of ring finger protein 146, human

TSL 2

Gene RNF146, Length 593 nt, Biotype retained intron.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
RNF146-208	ENST00000495188	RAB40C	Q96S21	281 aa		4.39	□□□□□ -1.71
RNF146-208	ENST00000495188	NAPB	Q9H115	298 aa		4.39	□□□□□ -1.71
RNF146-208	ENST00000495188	ZDHHC6	Q9H6R6	413 aa		4.39	□□□□□ -1.71
RNF146-208	ENST00000495188	NT5DC2	Q9H857	520 aa		4.39	□□□□□ -1.71
RNF146-208	ENST00000495188	RNPEPL1	Q9HAU8	725 aa		4.39	□□□□□ -1.71
RNF146-208	ENST00000495188	PSORS1C1	Q9UIG5	152 aa		4.39	□□□□□ -1.71
RNF146-208	ENST00000495188	ZNF646	O15015	1829 aa	Predicted RBP	4.39	□□□□□ -1.71
RNF146-208	ENST00000495188	FOXI3	A8MTJ6	420 aa	Predicted RBP	4.38	□□□□□ -1.71
RNF146-208	ENST00000495188	CS	O75390	466 aa	Known RBP	4.38	□□□□□ -1.71
RNF146-208	ENST00000495188	RGS19	P49795	217 aa		4.38	□□□□□ -1.71
RNF146-208	ENST00000495188	SLC17A1	Q14916	467 aa		4.38	□□□□□ -1.71
RNF146-208	ENST00000495188	PCK2	Q16822	640 aa		4.38	□□□□□ -1.71
RNF146-208	ENST00000495188	REP15	Q6BDI9	236 aa		4.38	□□□□□ -1.71
RNF146-208	ENST00000495188	SERINC5	Q86VE9	423 aa		4.38	□□□□□ -1.71
RNF146-208	ENST00000495188	ZNF584	Q8IVC4	421 aa		4.38	□□□□□ -1.71
RNF146-208	ENST00000495188	GVQW1	Q8N7I0	195 aa		4.38	□□□□□ -1.71
RNF146-208	ENST00000495188	ESAM	Q96AP7	390 aa		4.38	□□□□□ -1.71
RNF146-208	ENST00000495188	PCED1B	Q96HM7	432 aa		4.38	□□□□□ -1.71
RNF146-208	ENST00000495188	GUCD1	Q96NT3	240 aa		4.38	□□□□□ -1.71
RNF146-208	ENST00000495188	S1PR3	Q99500	378 aa		4.38	□□□□□ -1.71
RNF146-208	ENST00000495188	APOL2	Q9BQE5	337 aa		4.38	□□□□□ -1.71
RNF146-208	ENST00000495188	EXOC6B	Q9Y2D4	811 aa		4.38	□□□□□ -1.71
RNF146-208	ENST00000495188		A0A0U1RQK1	487 aa		4.37	□□□□□ -1.71
RNF146-208	ENST00000495188	ZNF320	A2RRD8	509 aa		4.37	□□□□□ -1.71
RNF146-208	ENST00000495188	VENTX	O95231	258 aa		4.37	□□□□□ -1.71
RNF146-208	ENST00000495188	RPL27	P61353	136 aa	Known RBP	4.37	□□□□□ -1.71
RNF146-208	ENST00000495188	RUNX3	Q13761	415 aa		4.37	□□□□□ -1.71
RNF146-208	ENST00000495188	RPS6KA1	Q15418	735 aa		4.37	□□□□□ -1.71
RNF146-208	ENST00000495188	C1orf189	Q5VU69	101 aa		4.37	□□□□□ -1.71
RNF146-208	ENST00000495188	LAX1	Q8IWV1	398 aa		4.37	□□□□□ -1.71
RNF146-208	ENST00000495188	ICA1L	Q8NDH6	482 aa		4.37	□□□□□ -1.71
RNF146-208	ENST00000495188	GOLGA5	Q8TBA6	731 aa		4.37	□□□□□ -1.71
RNF146-208	ENST00000495188	MRPL24	Q96A35	216 aa	Known RBP	4.37	□□□□□ -1.71
RNF146-208	ENST00000495188	NUSAP1	Q9BXS6	441 aa	Known RBP	4.37	□□□□□ -1.71
RNF146-208	ENST00000495188	FAM212B	Q9NTI7	297 aa	Predicted RBP	4.37	□□□□□ -1.71
RNF146-208	ENST00000495188	TEKT2	Q9UIF3	430 aa		4.37	□□□□□ -1.71
RNF146-208	ENST00000495188	KCNK6	Q9Y257	313 aa		4.37	□□□□□ -1.71
RNF146-208	ENST00000495188	DUSP11	O75319	330 aa	Known RBP	4.36	□□□□□ -1.71
RNF146-208	ENST00000495188	ANXA9	O76027	345 aa		4.36	□□□□□ -1.71
RNF146-208	ENST00000495188	GAS8	O95995	478 aa		4.36	□□□□□ -1.71
RNF146-208	ENST00000495188	PDGFB	P01127	241 aa	Predicted RBP	4.36	□□□□□ -1.71
RNF146-208	ENST00000495188	GPX3	P22352	226 aa		4.36	□□□□□ -1.71
RNF146-208	ENST00000495188	SERPINB6	P35237	376 aa		4.36	□□□□□ -1.71
RNF146-208	ENST00000495188	TNNT3	P45378	269 aa	Predicted RBP	4.36	□□□□□ -1.71
RNF146-208	ENST00000495188	ADAR	P55265	1226 aa	Known RBP	4.36	□□□□□ -1.71
RNF146-208	ENST00000495188		Q1RN00	199 aa		4.36	□□□□□ -1.71
RNF146-208	ENST00000495188	FUT11	Q495W5	492 aa		4.36	□□□□□ -1.71
RNF146-208	ENST00000495188	ATAD3C	Q5T2N8	411 aa		4.36	□□□□□ -1.71
RNF146-208	ENST00000495188	RFWD3	Q6PCD5	774 aa		4.36	□□□□□ -1.71
RNF146-208	ENST00000495188	TMEM126B	Q8IUX1	230 aa		4.36	□□□□□ -1.71
RNF146-208	ENST00000495188	CCDC71	Q8IV32	467 aa	Predicted RBP	4.36	□□□□□ -1.71
RNF146-208	ENST00000495188	OR1K1	Q8NGR3	316 aa		4.36	□□□□□ -1.71
RNF146-208	ENST00000495188	RBM18	Q96H35	190 aa	Known RBP	4.36	□□□□□ -1.71
RNF146-208	ENST00000495188	AGPAT1	Q99943	283 aa		4.36	□□□□□ -1.71
RNF146-208	ENST00000495188	WWP1	Q9H0M0	922 aa		4.36	□□□□□ -1.71
RNF146-208	ENST00000495188	DPEP3	Q9H4B8	488 aa		4.36	□□□□□ -1.71
RNF146-208	ENST00000495188	CNIH4	Q9P003	139 aa		4.36	□□□□□ -1.71
RNF146-208	ENST00000495188	TMEM129	A0AVI4	362 aa		4.35	□□□□□ -1.71
RNF146-208	ENST00000495188	SLC7A4	O43246	635 aa		4.35	□□□□□ -1.71
RNF146-208	ENST00000495188	KBTBD11	O94819	623 aa		4.35	□□□□□ -1.71
RNF146-208	ENST00000495188	EPO	P01588	193 aa		4.35	□□□□□ -1.71
RNF146-208	ENST00000495188	THY1	P04216	161 aa		4.35	□□□□□ -1.71
RNF146-208	ENST00000495188	FOSL2	P15408	326 aa		4.35	□□□□□ -1.71
RNF146-208	ENST00000495188	ALDH3B1	P43353	468 aa		4.35	□□□□□ -1.71
RNF146-208	ENST00000495188	TNFSF10	P50591	281 aa		4.35	□□□□□ -1.71
RNF146-208	ENST00000495188	STX1B	P61266	288 aa		4.35	□□□□□ -1.71
RNF146-208	ENST00000495188	GSTO1	P78417	241 aa		4.35	□□□□□ -1.71
RNF146-208	ENST00000495188	LCP2	Q13094	533 aa		4.35	□□□□□ -1.71
RNF146-208	ENST00000495188	OR1C1	Q15619	314 aa		4.35	□□□□□ -1.71
RNF146-208	ENST00000495188	STXBP2	Q15833	593 aa		4.35	□□□□□ -1.71
RNF146-208	ENST00000495188	DCAF12	Q5T6F0	453 aa		4.35	□□□□□ -1.71
RNF146-208	ENST00000495188	LINC00242	Q5T6M2	205 aa		4.35	□□□□□ -1.71
RNF146-208	ENST00000495188	CD164L2	Q6UWJ8	174 aa		4.35	□□□□□ -1.71
RNF146-208	ENST00000495188	ZBED8	Q8IZ13	594 aa		4.35	□□□□□ -1.71
RNF146-208	ENST00000495188	OR6T1	Q8NGN1	323 aa		4.35	□□□□□ -1.71
RNF146-208	ENST00000495188	FLVCR1-AS1	Q8TAF5	88 aa		4.35	□□□□□ -1.71
RNF146-208	ENST00000495188	C16orf58	Q96GQ5	468 aa		4.35	□□□□□ -1.71
RNF146-208	ENST00000495188	CUTC	Q9NTM9	273 aa		4.35	□□□□□ -1.71
RNF146-208	ENST00000495188	EXOC7	Q9UPT5	735 aa		4.35	□□□□□ -1.71
RNF146-208	ENST00000495188	ZFP37	Q9Y6Q3	630 aa	Predicted RBP	4.35	□□□□□ -1.71
RNF146-208	ENST00000495188	ZNF318	Q5VUA4	2279 aa		4.34	□□□□□ -1.71
RNF146-208	ENST00000495188	RNF212B	A8MTL3	300 aa		4.34	□□□□□ -1.71
RNF146-208	ENST00000495188		A8MU10	97 aa		4.34	□□□□□ -1.71
RNF146-208	ENST00000495188	CPNE6	O95741	557 aa		4.34	□□□□□ -1.71
RNF146-208	ENST00000495188	BRCC3	P46736	316 aa		4.34	□□□□□ -1.71
RNF146-208	ENST00000495188	KCNK10	P57789	538 aa		4.34	□□□□□ -1.71
RNF146-208	ENST00000495188	PPIA	P62937	165 aa	Known RBP	4.34	□□□□□ -1.71
RNF146-208	ENST00000495188	HSPA14	Q0VDF9	509 aa		4.34	□□□□□ -1.71
RNF146-208	ENST00000495188	GIT2	Q14161	759 aa		4.34	□□□□□ -1.71
RNF146-208	ENST00000495188	HEPACAM	Q14CZ8	416 aa		4.34	□□□□□ -1.71
RNF146-208	ENST00000495188	WSCD2	Q2TBF2	565 aa		4.34	□□□□□ -1.71
RNF146-208	ENST00000495188	KCTD11	Q693B1	232 aa		4.34	□□□□□ -1.71
RNF146-208	ENST00000495188		Q6ZRG5	221 aa		4.34	□□□□□ -1.71
RNF146-208	ENST00000495188	PIWIL3	Q7Z3Z3	882 aa	Known RBP	4.34	□□□□□ -1.71
RNF146-208	ENST00000495188	WDR49	Q8IV35	697 aa		4.34	□□□□□ -1.71
RNF146-208	ENST00000495188	CACNG6	Q9BXT2	260 aa		4.34	□□□□□ -1.71
RNF146-208	ENST00000495188	ABCD2	Q9UBJ2	740 aa		4.34	□□□□□ -1.71
RNF146-208	ENST00000495188	VSIG4	Q9Y279	399 aa		4.34	□□□□□ -1.71
RNF146-208	ENST00000495188	NAALAD2	Q9Y3Q0	740 aa		4.34	□□□□□ -1.71
RNF146-208	ENST00000495188	POGZ	Q7Z3K3	1410 aa		4.33	□□□□□ -1.72

Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 20.2 ms