RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000494664.5

TIMMDC1-208, Transcript of translocase of inner mitochondrial membrane domain containing 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene TIMMDC1, Length 2,394 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TIMMDC1-208ENST00000494664 CARTPTQ16568 116 aa11.27□□□□□ -0.6
TIMMDC1-208ENST00000494664 CTU2Q2VPK5 515 aaKnown RBP11.27□□□□□ -0.6
TIMMDC1-208ENST00000494664 PTCHD3Q3KNS1 767 aa11.27□□□□□ -0.6
TIMMDC1-208ENST00000494664 SPATA19Q7Z5L4 167 aa11.27□□□□□ -0.6
TIMMDC1-208ENST00000494664 RAB44Q7Z6P3 723 aaPredicted RBP11.27□□□□□ -0.6
TIMMDC1-208ENST00000494664 PIP4P1Q86T03 277 aa11.27□□□□□ -0.6
TIMMDC1-208ENST00000494664 CCDC103Q8IW40 242 aa11.27□□□□□ -0.6
TIMMDC1-208ENST00000494664 ASCC1Q8N9N2 400 aaKnown RBP11.27□□□□□ -0.6
TIMMDC1-208ENST00000494664 MCFD2Q8NI22 146 aa11.27□□□□□ -0.6
TIMMDC1-208ENST00000494664 IFI44Q8TCB0 444 aa11.27□□□□□ -0.6
TIMMDC1-208ENST00000494664 TWIST2Q8WVJ9 160 aa11.27□□□□□ -0.6
TIMMDC1-208ENST00000494664 TUBGCP3Q96CW5 907 aa11.27□□□□□ -0.6
TIMMDC1-208ENST00000494664 MED8Q96G25 268 aa11.27□□□□□ -0.6
TIMMDC1-208ENST00000494664 PPM1MQ96MI6 270 aa11.27□□□□□ -0.6
TIMMDC1-208ENST00000494664 ZNF300Q96RE9 604 aaPredicted RBP11.27□□□□□ -0.6
TIMMDC1-208ENST00000494664 ARPC5LQ9BPX5 153 aa11.27□□□□□ -0.6
TIMMDC1-208ENST00000494664 UGT2B28Q9BY64 529 aa11.27□□□□□ -0.6
TIMMDC1-208ENST00000494664 SLIRPQ9GZT3 109 aaKnown RBP11.27□□□□□ -0.6
TIMMDC1-208ENST00000494664 MMP27Q9H306 513 aa11.27□□□□□ -0.6
TIMMDC1-208ENST00000494664 SLC52A3Q9NQ40 469 aa11.27□□□□□ -0.6
TIMMDC1-208ENST00000494664 FTSJ1Q9UET6 329 aa11.27□□□□□ -0.6
TIMMDC1-208ENST00000494664 C3orf18Q9UK00 162 aa11.27□□□□□ -0.6
TIMMDC1-208ENST00000494664 ZNF221Q9UK13 617 aa11.27□□□□□ -0.6
TIMMDC1-208ENST00000494664 SH2B3Q9UQQ2 575 aa11.27□□□□□ -0.6
TIMMDC1-208ENST00000494664 FRYQ5TBA9 3013 aa11.27□□□□□ -0.61
TIMMDC1-208ENST00000494664 CEP295Q9C0D2 2601 aa11.27□□□□□ -0.61
TIMMDC1-208ENST00000494664 IGHV1OR21-1A0A087WYE8 117 aa11.27□□□□□ -0.61
TIMMDC1-208ENST00000494664 LOC100130705A0A1B0GUX0 176 aa11.27□□□□□ -0.61
TIMMDC1-208ENST00000494664 OR6C74A6NCV1 312 aa11.27□□□□□ -0.61
TIMMDC1-208ENST00000494664 CCDC154A6NI56 674 aa11.27□□□□□ -0.61
TIMMDC1-208ENST00000494664 LILRA5A6NI73 299 aa11.27□□□□□ -0.61
TIMMDC1-208ENST00000494664 PIP5K1BO14986 540 aa11.27□□□□□ -0.61
TIMMDC1-208ENST00000494664 UBXN7O94888 489 aa11.27□□□□□ -0.61
TIMMDC1-208ENST00000494664 KCNK2O95069 426 aa11.27□□□□□ -0.61
TIMMDC1-208ENST00000494664 ALX3O95076 343 aa11.27□□□□□ -0.61
TIMMDC1-208ENST00000494664 LDOC1O95751 146 aaPredicted RBP11.27□□□□□ -0.61
TIMMDC1-208ENST00000494664 ANXA5P08758 320 aa11.27□□□□□ -0.61
TIMMDC1-208ENST00000494664 HGFP14210 728 aa11.27□□□□□ -0.61
TIMMDC1-208ENST00000494664 POLR2CP19387 275 aaPredicted RBP11.27□□□□□ -0.61
TIMMDC1-208ENST00000494664 CSF2RBP32927 897 aa11.27□□□□□ -0.61
TIMMDC1-208ENST00000494664 HSPA7P48741 367 aa11.27□□□□□ -0.61
TIMMDC1-208ENST00000494664 MRPL19P49406 292 aaKnown RBP11.27□□□□□ -0.61
TIMMDC1-208ENST00000494664 ISL1P61371 349 aa11.27□□□□□ -0.61
TIMMDC1-208ENST00000494664 LSM3P62310 102 aaKnown RBP11.27□□□□□ -0.61
TIMMDC1-208ENST00000494664 HERVK_113P63132 956 aa11.27□□□□□ -0.61
TIMMDC1-208ENST00000494664 TUBA1BP68363 451 aa11.27□□□□□ -0.61
TIMMDC1-208ENST00000494664 NFKB2Q00653 900 aa11.27□□□□□ -0.61
TIMMDC1-208ENST00000494664 CFHR1Q03591 330 aa11.27□□□□□ -0.61
TIMMDC1-208ENST00000494664 EMX2Q04743 252 aa11.27□□□□□ -0.61
TIMMDC1-208ENST00000494664 NAE1Q13564 534 aa11.27□□□□□ -0.61
TIMMDC1-208ENST00000494664 TSTA3Q13630 321 aaPredicted RBP11.27□□□□□ -0.61
TIMMDC1-208ENST00000494664 AMZ1Q400G9 498 aa11.27□□□□□ -0.61
TIMMDC1-208ENST00000494664 UNC50Q53HI1 259 aa11.27□□□□□ -0.61
TIMMDC1-208ENST00000494664 FAM219BQ5XKK7 198 aa11.27□□□□□ -0.61
TIMMDC1-208ENST00000494664 TUBA1AQ71U36 451 aa11.27□□□□□ -0.61
TIMMDC1-208ENST00000494664 TMPRSS9Q7Z410 1059 aa11.27□□□□□ -0.61
TIMMDC1-208ENST00000494664 FBXO39Q8N4B4 442 aa11.27□□□□□ -0.61
TIMMDC1-208ENST00000494664 ZFPM2Q8WW38 1151 aa11.27□□□□□ -0.61
TIMMDC1-208ENST00000494664 PROX1Q92786 737 aa11.27□□□□□ -0.61
TIMMDC1-208ENST00000494664 MED30Q96HR3 178 aa11.27□□□□□ -0.61
TIMMDC1-208ENST00000494664 OR4K3Q96R72 315 aa11.27□□□□□ -0.61
TIMMDC1-208ENST00000494664 MBOAT4Q96T53 435 aa11.27□□□□□ -0.61
TIMMDC1-208ENST00000494664 CCDC3Q9BQI4 270 aa11.27□□□□□ -0.61
TIMMDC1-208ENST00000494664 ACAT2Q9BWD1 397 aa11.27□□□□□ -0.61
TIMMDC1-208ENST00000494664 ERVK-6Q9BXR3 956 aa11.27□□□□□ -0.61
TIMMDC1-208ENST00000494664 UCK1Q9HA47 277 aa11.27□□□□□ -0.61
TIMMDC1-208ENST00000494664 CCDC177Q9NQR7 707 aaPredicted RBP11.27□□□□□ -0.61
TIMMDC1-208ENST00000494664 INTS7Q9NVH2 962 aaKnown RBP11.27□□□□□ -0.61
TIMMDC1-208ENST00000494664 DNAJB9Q9UBS3 223 aa11.27□□□□□ -0.61
TIMMDC1-208ENST00000494664 SATB2Q9UPW6 733 aa11.27□□□□□ -0.61
TIMMDC1-208ENST00000494664 TMA7Q9Y2S6 64 aaKnown RBP11.27□□□□□ -0.61
TIMMDC1-208ENST00000494664 TPRKBQ9Y3C4 175 aa11.27□□□□□ -0.61
TIMMDC1-208ENST00000494664 A0A1W2PQM1 296 aa11.26□□□□□ -0.61
TIMMDC1-208ENST00000494664 KRT6AP02538 564 aa11.26□□□□□ -0.61
TIMMDC1-208ENST00000494664 KRT6BP04259 564 aa11.26□□□□□ -0.61
TIMMDC1-208ENST00000494664 CHRM5P08912 532 aaPredicted RBP11.26□□□□□ -0.61
TIMMDC1-208ENST00000494664 AGXTP21549 392 aa11.26□□□□□ -0.61
TIMMDC1-208ENST00000494664 ACVR2AP27037 513 aa11.26□□□□□ -0.61
TIMMDC1-208ENST00000494664 CAPZBP47756 277 aa11.26□□□□□ -0.61
TIMMDC1-208ENST00000494664 SLC6A12P48065 614 aa11.26□□□□□ -0.61
TIMMDC1-208ENST00000494664 DEFA1P59665 94 aa11.26□□□□□ -0.61
TIMMDC1-208ENST00000494664 DEFA3P59666 94 aa11.26□□□□□ -0.61
TIMMDC1-208ENST00000494664 KCNAB2Q13303 367 aa11.26□□□□□ -0.61
TIMMDC1-208ENST00000494664 RCAN2Q14206 197 aa11.26□□□□□ -0.61
TIMMDC1-208ENST00000494664 RFX4Q33E94 735 aa11.26□□□□□ -0.61
TIMMDC1-208ENST00000494664 SYT6Q5T7P8 510 aaPredicted RBP11.26□□□□□ -0.61
TIMMDC1-208ENST00000494664 ZNF691Q5VV52 312 aa11.26□□□□□ -0.61
TIMMDC1-208ENST00000494664 ANKS6Q68DC2 871 aa11.26□□□□□ -0.61
TIMMDC1-208ENST00000494664 SULT1C3Q6IMI6 304 aa11.26□□□□□ -0.61
TIMMDC1-208ENST00000494664 DEFB124Q8NES8 71 aa11.26□□□□□ -0.61
TIMMDC1-208ENST00000494664 OR2L8Q8NGY9 312 aa11.26□□□□□ -0.61
TIMMDC1-208ENST00000494664 FLVCR1-AS1Q8TAF5 88 aa11.26□□□□□ -0.61
TIMMDC1-208ENST00000494664 TRIM63Q969Q1 353 aa11.26□□□□□ -0.61
TIMMDC1-208ENST00000494664 TRIM8Q9BZR9 551 aa11.26□□□□□ -0.61
TIMMDC1-208ENST00000494664 AMBRA1Q9C0C7 1298 aa11.26□□□□□ -0.61
TIMMDC1-208ENST00000494664 TWSG1Q9GZX9 223 aa11.26□□□□□ -0.61
TIMMDC1-208ENST00000494664 HRASLS2Q9NWW9 162 aa11.26□□□□□ -0.61
TIMMDC1-208ENST00000494664 TOR4AQ9NXH8 423 aa11.26□□□□□ -0.61
TIMMDC1-208ENST00000494664 WWOXQ9NZC7 414 aa11.26□□□□□ -0.61
TIMMDC1-208ENST00000494664 CRNNQ9UBG3 495 aaPredicted RBP11.26□□□□□ -0.61
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 26.2 ms