RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000489344.5

RBM3-208, Transcript of RNA binding motif protein 3, human

TSL 2

Gene RBM3, Length 724 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
RBM3-208	ENST00000489344	CD274	Q9NZQ7	290 aa		12.84	□□□□□ -0.35
RBM3-208	ENST00000489344	DCDC2	Q9UHG0	476 aa		12.84	□□□□□ -0.35
RBM3-208	ENST00000489344	LGALS13	Q9UHV8	139 aa		12.84	□□□□□ -0.35
RBM3-208	ENST00000489344	FEZF1	A0PJY2	475 aa		12.83	□□□□□ -0.36
RBM3-208	ENST00000489344	NCF1B	A6NI72	391 aa	Predicted RBP	12.83	□□□□□ -0.36
RBM3-208	ENST00000489344	SYCE1L	A8MT33	242 aa		12.83	□□□□□ -0.36
RBM3-208	ENST00000489344		A8MUA0	341 aa		12.83	□□□□□ -0.36
RBM3-208	ENST00000489344	NCF1C	A8MVU1	366 aa	Predicted RBP	12.83	□□□□□ -0.36
RBM3-208	ENST00000489344	ACOT7	O00154	380 aa		12.83	□□□□□ -0.36
RBM3-208	ENST00000489344	B4GALT2	O60909	372 aa		12.83	□□□□□ -0.36
RBM3-208	ENST00000489344	KERA	O60938	352 aa		12.83	□□□□□ -0.36
RBM3-208	ENST00000489344	NCF1	P14598	390 aa	Predicted RBP	12.83	□□□□□ -0.36
RBM3-208	ENST00000489344	IL10	P22301	178 aa		12.83	□□□□□ -0.36
RBM3-208	ENST00000489344	CCND1	P24385	295 aa		12.83	□□□□□ -0.36
RBM3-208	ENST00000489344	PEX19	P40855	299 aa		12.83	□□□□□ -0.36
RBM3-208	ENST00000489344	DCAF7	P61962	342 aa		12.83	□□□□□ -0.36
RBM3-208	ENST00000489344	NKX6-1	P78426	367 aa	Predicted RBP	12.83	□□□□□ -0.36
RBM3-208	ENST00000489344	ZNF844	Q08AG5	666 aa		12.83	□□□□□ -0.36
RBM3-208	ENST00000489344	KRT71	Q3SY84	523 aa		12.83	□□□□□ -0.36
RBM3-208	ENST00000489344	CEP85L	Q5SZL2	805 aa		12.83	□□□□□ -0.36
RBM3-208	ENST00000489344	C1orf185	Q5T7R7	199 aa		12.83	□□□□□ -0.36
RBM3-208	ENST00000489344	SULT1C3	Q6IMI6	304 aa		12.83	□□□□□ -0.36
RBM3-208	ENST00000489344	CAPN13	Q6MZZ7	669 aa	Predicted RBP	12.83	□□□□□ -0.36
RBM3-208	ENST00000489344	LRIG3	Q6UXM1	1119 aa		12.83	□□□□□ -0.36
RBM3-208	ENST00000489344	SH2D5	Q6ZV89	423 aa		12.83	□□□□□ -0.36
RBM3-208	ENST00000489344	CROCCP2	Q86T23	111 aa		12.83	□□□□□ -0.36
RBM3-208	ENST00000489344	LCA5	Q86VQ0	697 aa		12.83	□□□□□ -0.36
RBM3-208	ENST00000489344	TCAIM	Q8N3R3	496 aa		12.83	□□□□□ -0.36
RBM3-208	ENST00000489344	OR56A3	Q8NH54	315 aa		12.83	□□□□□ -0.36
RBM3-208	ENST00000489344	TBC1D20	Q96BZ9	403 aa		12.83	□□□□□ -0.36
RBM3-208	ENST00000489344	RHBDF1	Q96CC6	855 aa		12.83	□□□□□ -0.36
RBM3-208	ENST00000489344	PTCHD1	Q96NR3	888 aa		12.83	□□□□□ -0.36
RBM3-208	ENST00000489344	SARG	Q9BW04	601 aa		12.83	□□□□□ -0.36
RBM3-208	ENST00000489344	PCBD2	Q9H0N5	130 aa		12.83	□□□□□ -0.36
RBM3-208	ENST00000489344	ZDHHC11	Q9H8X9	412 aa		12.83	□□□□□ -0.36
RBM3-208	ENST00000489344	CCDC177	Q9NQR7	707 aa	Predicted RBP	12.83	□□□□□ -0.36
RBM3-208	ENST00000489344	TMEM184C	Q9NVA4	438 aa		12.83	□□□□□ -0.36
RBM3-208	ENST00000489344	ARGLU1	Q9NWB6	273 aa	Predicted RBP	12.83	□□□□□ -0.36
RBM3-208	ENST00000489344	KCMF1	Q9P0J7	381 aa		12.83	□□□□□ -0.36
RBM3-208	ENST00000489344	FBXW2	Q9UKT8	454 aa		12.83	□□□□□ -0.36
RBM3-208	ENST00000489344	ERVK-11	Q9UQG0	969 aa		12.83	□□□□□ -0.36
RBM3-208	ENST00000489344	SON	P18583	2426 aa	Known RBP	12.83	□□□□□ -0.36
RBM3-208	ENST00000489344	KCNE1B	A0A087WTH5	132 aa		12.82	□□□□□ -0.36
RBM3-208	ENST00000489344		A0A0G2JMM0	328 aa		12.82	□□□□□ -0.36
RBM3-208	ENST00000489344	TRBV11-1	A0A0K0K1C0	115 aa		12.82	□□□□□ -0.36
RBM3-208	ENST00000489344		A0A1W2PPB8	328 aa		12.82	□□□□□ -0.36
RBM3-208	ENST00000489344		A0A1W2PRS3	328 aa		12.82	□□□□□ -0.36
RBM3-208	ENST00000489344	OR14I1	A6ND48	311 aa		12.82	□□□□□ -0.36
RBM3-208	ENST00000489344	KIR3DP1	A8MWS1	328 aa		12.82	□□□□□ -0.36
RBM3-208	ENST00000489344	SUPT3H	B4E1H0	165 aa		12.82	□□□□□ -0.36
RBM3-208	ENST00000489344	TAPBP	O15533	448 aa		12.82	□□□□□ -0.36
RBM3-208	ENST00000489344	SUPT3H	O75486	399 aa		12.82	□□□□□ -0.36
RBM3-208	ENST00000489344	ITGA10	O75578	1167 aa		12.82	□□□□□ -0.36
RBM3-208	ENST00000489344	S100B	P04271	92 aa	Predicted RBP	12.82	□□□□□ -0.36
RBM3-208	ENST00000489344	GSTA1	P08263	222 aa		12.82	□□□□□ -0.36
RBM3-208	ENST00000489344	MTHFD2	P13995	350 aa		12.82	□□□□□ -0.36
RBM3-208	ENST00000489344	JAK1	P23458	1154 aa		12.82	□□□□□ -0.36
RBM3-208	ENST00000489344	TACR1	P25103	407 aa		12.82	□□□□□ -0.36
RBM3-208	ENST00000489344	TBPL1	P62380	186 aa		12.82	□□□□□ -0.36
RBM3-208	ENST00000489344	OLR1	P78380	273 aa		12.82	□□□□□ -0.36
RBM3-208	ENST00000489344	HYAL2	Q12891	473 aa		12.82	□□□□□ -0.36
RBM3-208	ENST00000489344	DAZAP2	Q15038	168 aa	Predicted RBP	12.82	□□□□□ -0.36
RBM3-208	ENST00000489344	PCBP2	Q15366	365 aa	Known RBP eCLIP	12.82	□□□□□ -0.36
RBM3-208	ENST00000489344	TECRL	Q5HYJ1	363 aa		12.82	□□□□□ -0.36
RBM3-208	ENST00000489344	LCTL	Q6UWM7	567 aa		12.82	□□□□□ -0.36
RBM3-208	ENST00000489344	ASPG	Q86U10	573 aa		12.82	□□□□□ -0.36
RBM3-208	ENST00000489344	ARMC10	Q8N2F6	343 aa		12.82	□□□□□ -0.36
RBM3-208	ENST00000489344	PDPR	Q8NCN5	879 aa		12.82	□□□□□ -0.36
RBM3-208	ENST00000489344	PSD4	Q8NDX1	1056 aa		12.82	□□□□□ -0.36
RBM3-208	ENST00000489344	NFAM1	Q8NET5	270 aa	Predicted RBP	12.82	□□□□□ -0.36
RBM3-208	ENST00000489344	OR2M7	Q8NG81	312 aa		12.82	□□□□□ -0.36
RBM3-208	ENST00000489344	SLC13A3	Q8WWT9	602 aa		12.82	□□□□□ -0.36
RBM3-208	ENST00000489344	EXT2	Q93063	718 aa		12.82	□□□□□ -0.36
RBM3-208	ENST00000489344	PYCR2	Q96C36	320 aa		12.82	□□□□□ -0.36
RBM3-208	ENST00000489344	THAP11	Q96EK4	314 aa		12.82	□□□□□ -0.36
RBM3-208	ENST00000489344	MRPL57	Q9BQC6	102 aa	Known RBP	12.82	□□□□□ -0.36
RBM3-208	ENST00000489344	SGPP1	Q9BX95	441 aa		12.82	□□□□□ -0.36
RBM3-208	ENST00000489344	TTTY12	Q9BZ98	90 aa		12.82	□□□□□ -0.36
RBM3-208	ENST00000489344	ALKBH4	Q9NXW9	302 aa		12.82	□□□□□ -0.36
RBM3-208	ENST00000489344	NUDT4	Q9NZJ9	180 aa		12.82	□□□□□ -0.36
RBM3-208	ENST00000489344	TMEM216	Q9P0N5	145 aa		12.82	□□□□□ -0.36
RBM3-208	ENST00000489344	B4GALT7	Q9UBV7	327 aa		12.82	□□□□□ -0.36
RBM3-208	ENST00000489344	PTBP2	Q9UKA9	531 aa	Known RBP	12.82	□□□□□ -0.36
RBM3-208	ENST00000489344	ACAD8	Q9UKU7	415 aa		12.82	□□□□□ -0.36
RBM3-208	ENST00000489344		G3V3Y1	287 aa		12.81	□□□□□ -0.36
RBM3-208	ENST00000489344	UBXN8	O00124	270 aa		12.81	□□□□□ -0.36
RBM3-208	ENST00000489344	SYT5	O00445	386 aa		12.81	□□□□□ -0.36
RBM3-208	ENST00000489344	CHST10	O43529	356 aa		12.81	□□□□□ -0.36
RBM3-208	ENST00000489344	WDR1	O75083	606 aa		12.81	□□□□□ -0.36
RBM3-208	ENST00000489344	DNAJB6	O75190	326 aa		12.81	□□□□□ -0.36
RBM3-208	ENST00000489344	H2AFX	P16104	143 aa	Predicted RBP	12.81	□□□□□ -0.36
RBM3-208	ENST00000489344	NPPB	P16860	134 aa		12.81	□□□□□ -0.36
RBM3-208	ENST00000489344	KRT4	P19013	534 aa		12.81	□□□□□ -0.36
RBM3-208	ENST00000489344	MAOA	P21397	527 aa		12.81	□□□□□ -0.36
RBM3-208	ENST00000489344	GGT5	P36269	586 aa		12.81	□□□□□ -0.36
RBM3-208	ENST00000489344	CCT5	P48643	541 aa		12.81	□□□□□ -0.36
RBM3-208	ENST00000489344	BTG2	P78543	158 aa		12.81	□□□□□ -0.36
RBM3-208	ENST00000489344	SLC18A2	Q05940	514 aa		12.81	□□□□□ -0.36
RBM3-208	ENST00000489344	CASP8	Q14790	479 aa		12.81	□□□□□ -0.36
RBM3-208	ENST00000489344	C18orf21	Q32NC0	220 aa	Predicted RBP	12.81	□□□□□ -0.36

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