RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000483164.5

GIGYF2-238, Transcript of GRB10 interacting GYF protein 2, human

TSL 5

Gene GIGYF2, Length 577 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
GIGYF2-238	ENST00000483164	USP8	P40818	1118 aa		5.06	□□□□□ -1.6
GIGYF2-238	ENST00000483164	CLDN8	P56748	225 aa		5.06	□□□□□ -1.6
GIGYF2-238	ENST00000483164	RPS13	P62277	151 aa	Known RBP	5.06	□□□□□ -1.6
GIGYF2-238	ENST00000483164	PDE1B	Q01064	536 aa		5.06	□□□□□ -1.6
GIGYF2-238	ENST00000483164	BNC1	Q01954	994 aa		5.06	□□□□□ -1.6
GIGYF2-238	ENST00000483164	FGL1	Q08830	312 aa		5.06	□□□□□ -1.6
GIGYF2-238	ENST00000483164	DRP2	Q13474	957 aa		5.06	□□□□□ -1.6
GIGYF2-238	ENST00000483164	OR4A47	Q6IF82	309 aa		5.06	□□□□□ -1.6
GIGYF2-238	ENST00000483164	CPEB2	Q7Z5Q1	589 aa	Known RBP	5.06	□□□□□ -1.6
GIGYF2-238	ENST00000483164	AADAT	Q8N5Z0	425 aa		5.06	□□□□□ -1.6
GIGYF2-238	ENST00000483164	SMYD1	Q8NB12	490 aa		5.06	□□□□□ -1.6
GIGYF2-238	ENST00000483164	SYT14	Q8NB59	555 aa		5.06	□□□□□ -1.6
GIGYF2-238	ENST00000483164	ACVR1C	Q8NER5	493 aa		5.06	□□□□□ -1.6
GIGYF2-238	ENST00000483164	OR4C5	Q8NGB2	326 aa		5.06	□□□□□ -1.6
GIGYF2-238	ENST00000483164	OR5D13	Q8NGL4	314 aa		5.06	□□□□□ -1.6
GIGYF2-238	ENST00000483164	OR52I2	Q8NH67	350 aa		5.06	□□□□□ -1.6
GIGYF2-238	ENST00000483164	SENP5	Q96HI0	755 aa	Predicted RBP	5.06	□□□□□ -1.6
GIGYF2-238	ENST00000483164	ZBED3	Q96IU2	234 aa	Predicted RBP	5.06	□□□□□ -1.6
GIGYF2-238	ENST00000483164	VSTM2L	Q96N03	204 aa		5.06	□□□□□ -1.6
GIGYF2-238	ENST00000483164	S1PR3	Q99500	378 aa		5.06	□□□□□ -1.6
GIGYF2-238	ENST00000483164	NDUFAF3	Q9BU61	184 aa		5.06	□□□□□ -1.6
GIGYF2-238	ENST00000483164	MIS12	Q9H081	205 aa		5.06	□□□□□ -1.6
GIGYF2-238	ENST00000483164	DNTTIP1	Q9H147	329 aa		5.06	□□□□□ -1.6
GIGYF2-238	ENST00000483164	EBF3	Q9H4W6	596 aa		5.06	□□□□□ -1.6
GIGYF2-238	ENST00000483164	ZNF701	Q9NV72	531 aa	Predicted RBP	5.06	□□□□□ -1.6
GIGYF2-238	ENST00000483164	ONECUT1	Q9UBC0	465 aa		5.06	□□□□□ -1.6
GIGYF2-238	ENST00000483164	IFT52	Q9Y366	437 aa		5.06	□□□□□ -1.6
GIGYF2-238	ENST00000483164	ZSCAN21	Q9Y5A6	473 aa	Predicted RBP	5.06	□□□□□ -1.6
GIGYF2-238	ENST00000483164	SRPRB	Q9Y5M8	271 aa	Known RBP	5.06	□□□□□ -1.6
GIGYF2-238	ENST00000483164	UMODL1	Q5DID0	1318 aa		5.05	□□□□□ -1.6
GIGYF2-238	ENST00000483164	PRR23D1	E9PI22	279 aa	Predicted RBP	5.05	□□□□□ -1.6
GIGYF2-238	ENST00000483164		K7ERQ8	282 aa		5.05	□□□□□ -1.6
GIGYF2-238	ENST00000483164	TULP2	O00295	520 aa		5.05	□□□□□ -1.6
GIGYF2-238	ENST00000483164	KRT36	O76013	467 aa		5.05	□□□□□ -1.6
GIGYF2-238	ENST00000483164	DFFB	O76075	338 aa		5.05	□□□□□ -1.6
GIGYF2-238	ENST00000483164	GOT2	P00505	430 aa	Known RBP	5.05	□□□□□ -1.6
GIGYF2-238	ENST00000483164	H1F0	P07305	194 aa	Known RBP	5.05	□□□□□ -1.6
GIGYF2-238	ENST00000483164	PRR23D2	P0DMB1	279 aa	Predicted RBP	5.05	□□□□□ -1.6
GIGYF2-238	ENST00000483164	GOT1	P17174	413 aa		5.05	□□□□□ -1.6
GIGYF2-238	ENST00000483164	CHRNB2	P17787	502 aa		5.05	□□□□□ -1.6
GIGYF2-238	ENST00000483164	TNFRSF1B	P20333	461 aa		5.05	□□□□□ -1.6
GIGYF2-238	ENST00000483164	U2AF2	P26368	475 aa	Known RBP eCLIP	5.05	□□□□□ -1.6	2e-6	■■■□□ 14.7
GIGYF2-238	ENST00000483164	MNDA	P41218	407 aa		5.05	□□□□□ -1.6
GIGYF2-238	ENST00000483164	STAR	P49675	285 aa		5.05	□□□□□ -1.6
GIGYF2-238	ENST00000483164	BTG3	Q14201	252 aa	Predicted RBP	5.05	□□□□□ -1.6
GIGYF2-238	ENST00000483164	SPHAR	Q15513	63 aa		5.05	□□□□□ -1.6
GIGYF2-238	ENST00000483164	DUSP6	Q16828	381 aa		5.05	□□□□□ -1.6
GIGYF2-238	ENST00000483164	MTHFSD	Q2M296	383 aa	Known RBP	5.05	□□□□□ -1.6
GIGYF2-238	ENST00000483164	ZNF528	Q3MIS6	628 aa		5.05	□□□□□ -1.6
GIGYF2-238	ENST00000483164	FAM76B	Q5HYJ3	339 aa		5.05	□□□□□ -1.6
GIGYF2-238	ENST00000483164	CTSL3P	Q5NE16	218 aa		5.05	□□□□□ -1.6
GIGYF2-238	ENST00000483164	C10orf120	Q5SQS8	335 aa		5.05	□□□□□ -1.6
GIGYF2-238	ENST00000483164	PIK3CD-AS1	Q5SR53	167 aa		5.05	□□□□□ -1.6
GIGYF2-238	ENST00000483164	LIPK	Q5VXJ0	399 aa		5.05	□□□□□ -1.6
GIGYF2-238	ENST00000483164	PYHIN1	Q6K0P9	492 aa		5.05	□□□□□ -1.6
GIGYF2-238	ENST00000483164	ZSCAN25	Q6NSZ9	544 aa		5.05	□□□□□ -1.6
GIGYF2-238	ENST00000483164	KDM7A	Q6ZMT4	941 aa		5.05	□□□□□ -1.6
GIGYF2-238	ENST00000483164	ANO5	Q75V66	913 aa		5.05	□□□□□ -1.6
GIGYF2-238	ENST00000483164	COMTD1	Q86VU5	262 aa		5.05	□□□□□ -1.6
GIGYF2-238	ENST00000483164	SLC22A16	Q86VW1	577 aa		5.05	□□□□□ -1.6
GIGYF2-238	ENST00000483164	PALB2	Q86YC2	1186 aa		5.05	□□□□□ -1.6
GIGYF2-238	ENST00000483164	VSTM4	Q8IW00	320 aa		5.05	□□□□□ -1.6
GIGYF2-238	ENST00000483164	CHERP	Q8IWX8	916 aa	Known RBP	5.05	□□□□□ -1.6
GIGYF2-238	ENST00000483164	MMD2	Q8IY49	270 aa		5.05	□□□□□ -1.6
GIGYF2-238	ENST00000483164	OR2AK2	Q8NG84	335 aa		5.05	□□□□□ -1.6
GIGYF2-238	ENST00000483164	OR6M1	Q8NGM8	313 aa		5.05	□□□□□ -1.6
GIGYF2-238	ENST00000483164	OR9A1P	Q8NGU1	263 aa		5.05	□□□□□ -1.6
GIGYF2-238	ENST00000483164	OR5R1	Q8NH85	324 aa		5.05	□□□□□ -1.6
GIGYF2-238	ENST00000483164	SEPT8	Q92599	483 aa		5.05	□□□□□ -1.6
GIGYF2-238	ENST00000483164	SEMA4D	Q92854	862 aa		5.05	□□□□□ -1.6
GIGYF2-238	ENST00000483164	TESK2	Q96S53	571 aa		5.05	□□□□□ -1.6
GIGYF2-238	ENST00000483164	NDN	Q99608	321 aa		5.05	□□□□□ -1.6
GIGYF2-238	ENST00000483164	MAP3K3	Q99759	626 aa		5.05	□□□□□ -1.6
GIGYF2-238	ENST00000483164	RTP3	Q9BQQ7	232 aa		5.05	□□□□□ -1.6
GIGYF2-238	ENST00000483164	RIOK1	Q9BRS2	568 aa	Known RBP	5.05	□□□□□ -1.6
GIGYF2-238	ENST00000483164	CHRDL1	Q9BU40	450 aa		5.05	□□□□□ -1.6
GIGYF2-238	ENST00000483164	ARRDC1-AS1	Q9H2J1	176 aa		5.05	□□□□□ -1.6
GIGYF2-238	ENST00000483164	RIMS4	Q9H426	269 aa	Predicted RBP	5.05	□□□□□ -1.6
GIGYF2-238	ENST00000483164	C5orf66	Q9H5L9	145 aa		5.05	□□□□□ -1.6
GIGYF2-238	ENST00000483164	EXOC1	Q9NV70	894 aa		5.05	□□□□□ -1.6
GIGYF2-238	ENST00000483164	LHX3	Q9UBR4	397 aa		5.05	□□□□□ -1.6
GIGYF2-238	ENST00000483164	SLC12A6	Q9UHW9	1150 aa		5.05	□□□□□ -1.6
GIGYF2-238	ENST00000483164	CDH9	Q9ULB4	789 aa		5.05	□□□□□ -1.6
GIGYF2-238	ENST00000483164	FZD10	Q9ULW2	581 aa		5.05	□□□□□ -1.6
GIGYF2-238	ENST00000483164	PIGL	Q9Y2B2	252 aa		5.05	□□□□□ -1.6
GIGYF2-238	ENST00000483164	PCDHAC2	Q9Y5I4	1007 aa		5.05	□□□□□ -1.6
GIGYF2-238	ENST00000483164	PTPRC	P08575	1304 aa		5.04	□□□□□ -1.6
GIGYF2-238	ENST00000483164		A0A087WUV0	522 aa	Predicted RBP	5.04	□□□□□ -1.6
GIGYF2-238	ENST00000483164	LOC100506127	A0A0U1RQW1	187 aa		5.04	□□□□□ -1.6
GIGYF2-238	ENST00000483164	MYMK	A6NI61	221 aa		5.04	□□□□□ -1.6
GIGYF2-238	ENST00000483164	JAK2	O60674	1132 aa		5.04	□□□□□ -1.6
GIGYF2-238	ENST00000483164	SAP30	O75446	220 aa		5.04	□□□□□ -1.6
GIGYF2-238	ENST00000483164	SCGN	O76038	276 aa		5.04	□□□□□ -1.6
GIGYF2-238	ENST00000483164	BMP10	O95393	424 aa		5.04	□□□□□ -1.6
GIGYF2-238	ENST00000483164	ANP32D	O95626	131 aa		5.04	□□□□□ -1.6
GIGYF2-238	ENST00000483164	CAVIN2	O95810	425 aa		5.04	□□□□□ -1.6
GIGYF2-238	ENST00000483164	ODC1	P11926	461 aa		5.04	□□□□□ -1.6
GIGYF2-238	ENST00000483164	CD59	P13987	128 aa		5.04	□□□□□ -1.6
GIGYF2-238	ENST00000483164	HOXB6	P17509	224 aa	Known RBP	5.04	□□□□□ -1.6
GIGYF2-238	ENST00000483164	GNLY	P22749	145 aa		5.04	□□□□□ -1.6

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