RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000477334.1

RBM39-231, Transcript of RNA binding motif protein 39, human

TSL 2

Gene RBM39, Length 949 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
RBM39-231	ENST00000477334	DCAF12	Q5T6F0	453 aa		3.39	□□□□□ -1.87
RBM39-231	ENST00000477334	C9orf66	Q5T8R8	295 aa		3.39	□□□□□ -1.87
RBM39-231	ENST00000477334	CD164L2	Q6UWJ8	174 aa		3.39	□□□□□ -1.87
RBM39-231	ENST00000477334	UNC45B	Q8IWX7	931 aa		3.39	□□□□□ -1.87
RBM39-231	ENST00000477334	SFRP1	Q8N474	314 aa		3.39	□□□□□ -1.87
RBM39-231	ENST00000477334	CHCHD4	Q8N4Q1	142 aa		3.39	□□□□□ -1.87
RBM39-231	ENST00000477334	C4orf32	Q8N8J7	132 aa		3.39	□□□□□ -1.87
RBM39-231	ENST00000477334	MSANTD4	Q8NCY6	345 aa		3.39	□□□□□ -1.87
RBM39-231	ENST00000477334	OR1B1	Q8NGR6	318 aa		3.39	□□□□□ -1.87
RBM39-231	ENST00000477334	MRPL24	Q96A35	216 aa	Known RBP	3.39	□□□□□ -1.87
RBM39-231	ENST00000477334	CFAP36	Q96G28	342 aa		3.39	□□□□□ -1.87
RBM39-231	ENST00000477334	C5orf30	Q96GV9	206 aa		3.39	□□□□□ -1.87
RBM39-231	ENST00000477334	CXorf58	Q96LI9	332 aa		3.39	□□□□□ -1.87
RBM39-231	ENST00000477334	S1PR3	Q99500	378 aa		3.39	□□□□□ -1.87
RBM39-231	ENST00000477334	NUSAP1	Q9BXS6	441 aa	Known RBP	3.39	□□□□□ -1.87
RBM39-231	ENST00000477334	WWP1	Q9H0M0	922 aa		3.39	□□□□□ -1.87
RBM39-231	ENST00000477334	SP140L	Q9H930	580 aa		3.39	□□□□□ -1.87
RBM39-231	ENST00000477334	MAD2L2	Q9UI95	211 aa		3.39	□□□□□ -1.87
RBM39-231	ENST00000477334	TEKT2	Q9UIF3	430 aa		3.39	□□□□□ -1.87
RBM39-231	ENST00000477334	MGAT4A	Q9UM21	535 aa		3.39	□□□□□ -1.87
RBM39-231	ENST00000477334	SH3PXD2B	A1X283	911 aa		3.38	□□□□□ -1.87
RBM39-231	ENST00000477334	SRRM5	B3KS81	715 aa		3.38	□□□□□ -1.87
RBM39-231	ENST00000477334	RTN2	O75298	545 aa		3.38	□□□□□ -1.87
RBM39-231	ENST00000477334	ANXA9	O76027	345 aa		3.38	□□□□□ -1.87
RBM39-231	ENST00000477334	TPBGL	P0DKB5	382 aa		3.38	□□□□□ -1.87
RBM39-231	ENST00000477334	CALR	P27797	417 aa	Known RBP	3.38	□□□□□ -1.87
RBM39-231	ENST00000477334	PPP2R1A	P30153	589 aa		3.38	□□□□□ -1.87
RBM39-231	ENST00000477334	SLC1A6	P48664	564 aa		3.38	□□□□□ -1.87
RBM39-231	ENST00000477334	RIG	Q13278	110 aa		3.38	□□□□□ -1.87
RBM39-231	ENST00000477334	FASTK	Q14296	549 aa	Known RBP	3.38	□□□□□ -1.87
RBM39-231	ENST00000477334	GK2	Q14410	553 aa	Predicted RBP	3.38	□□□□□ -1.87
RBM39-231	ENST00000477334	MEF2D	Q14814	521 aa		3.38	□□□□□ -1.87
RBM39-231	ENST00000477334	SLC17A1	Q14916	467 aa		3.38	□□□□□ -1.87
RBM39-231	ENST00000477334	OR1C1	Q15619	314 aa		3.38	□□□□□ -1.87
RBM39-231	ENST00000477334	STX1A	Q16623	288 aa		3.38	□□□□□ -1.87
RBM39-231	ENST00000477334	TMEM44	Q2T9K0	475 aa		3.38	□□□□□ -1.87
RBM39-231	ENST00000477334	CCDC92	Q53HC0	331 aa	Predicted RBP	3.38	□□□□□ -1.87
RBM39-231	ENST00000477334	NUFIP2	Q7Z417	695 aa	Known RBP	3.38	□□□□□ -1.87
RBM39-231	ENST00000477334	ZSCAN30	Q86W11	494 aa		3.38	□□□□□ -1.87
RBM39-231	ENST00000477334	SERPINA12	Q8IW75	414 aa		3.38	□□□□□ -1.87
RBM39-231	ENST00000477334	STH	Q8IWL8	128 aa		3.38	□□□□□ -1.87
RBM39-231	ENST00000477334	CARNMT1	Q8N4J0	409 aa		3.38	□□□□□ -1.87
RBM39-231	ENST00000477334	ZNRF1	Q8ND25	227 aa		3.38	□□□□□ -1.87
RBM39-231	ENST00000477334	OR4L1	Q8NH43	312 aa		3.38	□□□□□ -1.87
RBM39-231	ENST00000477334	TCP11	Q8WWU5	503 aa		3.38	□□□□□ -1.87
RBM39-231	ENST00000477334	KRT35	Q92764	455 aa		3.38	□□□□□ -1.87
RBM39-231	ENST00000477334	TOMM40L	Q969M1	308 aa		3.38	□□□□□ -1.87
RBM39-231	ENST00000477334	ESAM	Q96AP7	390 aa		3.38	□□□□□ -1.87
RBM39-231	ENST00000477334	RAB40C	Q96S21	281 aa		3.38	□□□□□ -1.87
RBM39-231	ENST00000477334	MRPL9	Q9BYD2	267 aa	Known RBP	3.38	□□□□□ -1.87
RBM39-231	ENST00000477334	MARCH7	Q9H992	704 aa		3.38	□□□□□ -1.87
RBM39-231	ENST00000477334	ZCCHC3	Q9NUD5	404 aa	Known RBP	3.38	□□□□□ -1.87
RBM39-231	ENST00000477334	TECR	Q9NZ01	308 aa	Known RBP	3.38	□□□□□ -1.87
RBM39-231	ENST00000477334	FOXA2	Q9Y261	457 aa	Predicted RBP	3.38	□□□□□ -1.87
RBM39-231	ENST00000477334	FBXO7	Q9Y3I1	522 aa		3.38	□□□□□ -1.87
RBM39-231	ENST00000477334	SNX5	Q9Y5X3	404 aa		3.38	□□□□□ -1.87
RBM39-231	ENST00000477334	GON4L	Q3T8J9	2241 aa		3.38	□□□□□ -1.87
RBM39-231	ENST00000477334	IGHV3-16	A0A0C4DH30	117 aa		3.37	□□□□□ -1.87
RBM39-231	ENST00000477334		A0A1B0GTH9	108 aa		3.37	□□□□□ -1.87
RBM39-231	ENST00000477334	TEX48	A0A1B0GUV7	120 aa		3.37	□□□□□ -1.87
RBM39-231	ENST00000477334	PHF1	O43189	567 aa	Predicted RBP	3.37	□□□□□ -1.87
RBM39-231	ENST00000477334	TXNL1	O43396	289 aa		3.37	□□□□□ -1.87
RBM39-231	ENST00000477334	KIN	O60870	393 aa	Known RBP	3.37	□□□□□ -1.87
RBM39-231	ENST00000477334	DUSP11	O75319	330 aa	Known RBP	3.37	□□□□□ -1.87
RBM39-231	ENST00000477334	CSDE1	O75534	798 aa	Known RBP	3.37	□□□□□ -1.87
RBM39-231	ENST00000477334	OR9G9	P0C7N8	305 aa		3.37	□□□□□ -1.87
RBM39-231	ENST00000477334	FOLR2	P14207	255 aa		3.37	□□□□□ -1.87
RBM39-231	ENST00000477334	UGT1A6	P19224	532 aa		3.37	□□□□□ -1.87
RBM39-231	ENST00000477334	CASP3	P42574	277 aa		3.37	□□□□□ -1.87
RBM39-231	ENST00000477334	MTIF2	P46199	727 aa	Known RBP	3.37	□□□□□ -1.87
RBM39-231	ENST00000477334	PRELP	P51888	382 aa		3.37	□□□□□ -1.87
RBM39-231	ENST00000477334	KRT31	Q15323	416 aa		3.37	□□□□□ -1.87
RBM39-231	ENST00000477334	FAM182A	Q5T1J6	154 aa		3.37	□□□□□ -1.87
RBM39-231	ENST00000477334	AGAP7P	Q5VUJ5	663 aa		3.37	□□□□□ -1.87
RBM39-231	ENST00000477334	EMB	Q6PCB8	327 aa		3.37	□□□□□ -1.87
RBM39-231	ENST00000477334	REG3G	Q6UW15	175 aa		3.37	□□□□□ -1.87
RBM39-231	ENST00000477334		Q6ZRG5	221 aa		3.37	□□□□□ -1.87
RBM39-231	ENST00000477334	C17orf64	Q86WR6	236 aa		3.37	□□□□□ -1.87
RBM39-231	ENST00000477334	FBXW8	Q8N3Y1	598 aa		3.37	□□□□□ -1.87
RBM39-231	ENST00000477334	ARL10	Q8N8L6	244 aa		3.37	□□□□□ -1.87
RBM39-231	ENST00000477334	SIDT2	Q8NBJ9	832 aa	Known RBP	3.37	□□□□□ -1.87
RBM39-231	ENST00000477334	OR4A16	Q8NH70	328 aa		3.37	□□□□□ -1.87
RBM39-231	ENST00000477334	CDHR1	Q96JP9	859 aa		3.37	□□□□□ -1.87
RBM39-231	ENST00000477334	RUNDC3B	Q96NL0	473 aa		3.37	□□□□□ -1.87
RBM39-231	ENST00000477334	RBM24	Q9BX46	236 aa	Known RBP	3.37	□□□□□ -1.87
RBM39-231	ENST00000477334	TSPYL1	Q9H0U9	437 aa		3.37	□□□□□ -1.87
RBM39-231	ENST00000477334	NT5DC2	Q9H857	520 aa		3.37	□□□□□ -1.87
RBM39-231	ENST00000477334	GDF3	Q9NR23	364 aa		3.37	□□□□□ -1.87
RBM39-231	ENST00000477334	DNAJC11	Q9NVH1	559 aa		3.37	□□□□□ -1.87
RBM39-231	ENST00000477334	MRTO4	Q9UKD2	239 aa	Known RBP	3.37	□□□□□ -1.87
RBM39-231	ENST00000477334	RARRES3	Q9UL19	164 aa		3.37	□□□□□ -1.87
RBM39-231	ENST00000477334	CPQ	Q9Y646	472 aa		3.37	□□□□□ -1.87
RBM39-231	ENST00000477334	TRIM64	A6NGJ6	449 aa		3.36	□□□□□ -1.87
RBM39-231	ENST00000477334	TRIM64B	A6NI03	449 aa		3.36	□□□□□ -1.87
RBM39-231	ENST00000477334	FRAT2	O75474	233 aa	Predicted RBP	3.36	□□□□□ -1.87
RBM39-231	ENST00000477334	PRDM1	O75626	825 aa		3.36	□□□□□ -1.87
RBM39-231	ENST00000477334	SEMA4F	O95754	770 aa		3.36	□□□□□ -1.87
RBM39-231	ENST00000477334	BAG2	O95816	211 aa		3.36	□□□□□ -1.87
RBM39-231	ENST00000477334	IGHG1	P01857	330 aa		3.36	□□□□□ -1.87
RBM39-231	ENST00000477334	CT45A8	P0DMV1	189 aa		3.36	□□□□□ -1.87

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