RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000466901.5

COPS7B-218, Transcript of COP9 signalosome subunit 7B, humanhuman

TSL 3

Gene COPS7B, Length 598 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COPS7B-218ENST00000466901 VPS29Q9UBQ0 182 aa7.31□□□□□ -1.24
COPS7B-218ENST00000466901 VPS4AQ9UN37 437 aa7.31□□□□□ -1.24
COPS7B-218ENST00000466901 PPIEQ9UNP9 301 aaKnown RBP7.31□□□□□ -1.24
COPS7B-218ENST00000466901 TIMM22Q9Y584 194 aa7.31□□□□□ -1.24
COPS7B-218ENST00000466901 PCDHGA10Q9Y5H3 936 aa7.31□□□□□ -1.24
COPS7B-218ENST00000466901 COPG1Q9Y678 874 aaKnown RBP7.31□□□□□ -1.24
COPS7B-218ENST00000466901 SVILO95425 2214 aa7.31□□□□□ -1.24
COPS7B-218ENST00000466901 RELNP78509 3460 aa7.31□□□□□ -1.24
COPS7B-218ENST00000466901 SHANK1Q9Y566 2161 aa7.3□□□□□ -1.24
COPS7B-218ENST00000466901 TRBV11-1A0A0K0K1C0 115 aa7.3□□□□□ -1.24
COPS7B-218ENST00000466901 GLOD5A6NK44 160 aa7.3□□□□□ -1.24
COPS7B-218ENST00000466901 C17orf105B2RV13 164 aa7.3□□□□□ -1.24
COPS7B-218ENST00000466901 CDK2AP1O14519 115 aa7.3□□□□□ -1.24
COPS7B-218ENST00000466901 FCHO1O14526 889 aa7.3□□□□□ -1.24
COPS7B-218ENST00000466901 UBFD1O14562 309 aaKnown RBP7.3□□□□□ -1.24
COPS7B-218ENST00000466901 PGRMC2O15173 223 aa7.3□□□□□ -1.24
COPS7B-218ENST00000466901 DYRK3O43781 588 aa7.3□□□□□ -1.24
COPS7B-218ENST00000466901 FGF17O60258 216 aa7.3□□□□□ -1.24
COPS7B-218ENST00000466901 GPR75O95800 540 aa7.3□□□□□ -1.24
COPS7B-218ENST00000466901 AIFM1O95831 613 aa7.3□□□□□ -1.24
COPS7B-218ENST00000466901 UROSP10746 265 aa7.3□□□□□ -1.24
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COPS7B-218ENST00000466901 STT3AP46977 705 aa7.3□□□□□ -1.24
COPS7B-218ENST00000466901 GPR143P51810 404 aa7.3□□□□□ -1.24
COPS7B-218ENST00000466901 MAPK12P53778 367 aa7.3□□□□□ -1.24
COPS7B-218ENST00000466901 PLIN5Q00G26 463 aa7.3□□□□□ -1.24
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COPS7B-218ENST00000466901 GALNT1Q10472 559 aaPredicted RBP7.3□□□□□ -1.24
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COPS7B-218ENST00000466901 CEP85LQ5SZL2 805 aa7.3□□□□□ -1.24
COPS7B-218ENST00000466901 NDUFAF5Q5TEU4 345 aa7.3□□□□□ -1.24
COPS7B-218ENST00000466901 HSDL2Q6YN16 418 aa7.3□□□□□ -1.24
COPS7B-218ENST00000466901 CROCCP2Q86T23 111 aa7.3□□□□□ -1.24
COPS7B-218ENST00000466901 LGI4Q8N135 537 aa7.3□□□□□ -1.24
COPS7B-218ENST00000466901 C1orf52Q8N6N3 182 aaKnown RBP7.3□□□□□ -1.24
COPS7B-218ENST00000466901 HORMAD2Q8N7B1 307 aa7.3□□□□□ -1.24
COPS7B-218ENST00000466901 APCDD1LQ8NCL9 501 aa7.3□□□□□ -1.24
COPS7B-218ENST00000466901 MORN4Q8NDC4 146 aa7.3□□□□□ -1.24
COPS7B-218ENST00000466901 TCP10LQ8TDR4 215 aa7.3□□□□□ -1.24
COPS7B-218ENST00000466901 THAP3Q8WTV1 239 aaPredicted RBP7.3□□□□□ -1.24
COPS7B-218ENST00000466901 PTPMT1Q8WUK0 201 aaPredicted RBP7.3□□□□□ -1.24
COPS7B-218ENST00000466901 NCLNQ969V3 563 aa7.3□□□□□ -1.24
COPS7B-218ENST00000466901 SNRNP40Q96DI7 357 aaKnown RBP7.3□□□□□ -1.24
COPS7B-218ENST00000466901 C19orf60Q96EN9 201 aa7.3□□□□□ -1.24
COPS7B-218ENST00000466901 KCNA7Q96RP8 456 aa7.3□□□□□ -1.24
COPS7B-218ENST00000466901 NPAS2Q99743 824 aa7.3□□□□□ -1.24
COPS7B-218ENST00000466901 UTP23Q9BRU9 249 aaKnown RBP7.3□□□□□ -1.24
COPS7B-218ENST00000466901 PELOQ9BRX2 385 aaKnown RBP7.3□□□□□ -1.24
COPS7B-218ENST00000466901 TRMOQ9BU70 441 aa7.3□□□□□ -1.24
COPS7B-218ENST00000466901 OR8D2Q9GZM6 311 aa7.3□□□□□ -1.24
COPS7B-218ENST00000466901 AGPAT4Q9NRZ5 378 aa7.3□□□□□ -1.24
COPS7B-218ENST00000466901 SLC17A7Q9P2U7 560 aa7.3□□□□□ -1.24
COPS7B-218ENST00000466901 COPS7AQ9UBW8 275 aa7.3□□□□□ -1.24
COPS7B-218ENST00000466901 UBR5O95071 2799 aaPredicted RBP7.3□□□□□ -1.24
COPS7B-218ENST00000466901 ESPL1Q14674 2120 aa7.3□□□□□ -1.24
COPS7B-218ENST00000466901 FLNCQ14315 2725 aa7.29□□□□□ -1.24
COPS7B-218ENST00000466901 SERTM1A2A2V5 107 aa7.29□□□□□ -1.24
COPS7B-218ENST00000466901 GABRR3A8MPY1 467 aa7.29□□□□□ -1.24
COPS7B-218ENST00000466901 CTIFO43310 598 aaKnown RBP7.29□□□□□ -1.24
COPS7B-218ENST00000466901 OR10H2O60403 315 aa7.29□□□□□ -1.24
COPS7B-218ENST00000466901 MAN1A2O60476 641 aa7.29□□□□□ -1.24
COPS7B-218ENST00000466901 PRAMEF2O60811 474 aa7.29□□□□□ -1.24
COPS7B-218ENST00000466901 PRKRAO75569 313 aaKnown RBP7.29□□□□□ -1.24
COPS7B-218ENST00000466901 ZFAND5O76080 213 aa7.29□□□□□ -1.24
COPS7B-218ENST00000466901 ALOX15P16050 662 aaPredicted RBP7.29□□□□□ -1.24
COPS7B-218ENST00000466901 CREB1P16220 341 aa7.29□□□□□ -1.24
COPS7B-218ENST00000466901 PIK3R1P27986 724 aa7.29□□□□□ -1.24
COPS7B-218ENST00000466901 ALDH3A1P30838 453 aa7.29□□□□□ -1.24
COPS7B-218ENST00000466901 CD96P40200 585 aa7.29□□□□□ -1.24
COPS7B-218ENST00000466901 HTR6P50406 440 aa7.29□□□□□ -1.24
COPS7B-218ENST00000466901 FOXA1P55317 472 aa7.29□□□□□ -1.24
COPS7B-218ENST00000466901 MLF1P58340 268 aa7.29□□□□□ -1.24
COPS7B-218ENST00000466901 TRA2BP62995 288 aaKnown RBP7.29□□□□□ -1.24
COPS7B-218ENST00000466901 IGLV3-21P80748 117 aaPredicted RBP7.29□□□□□ -1.24
COPS7B-218ENST00000466901 OC90Q02509 493 aaPredicted RBP7.29□□□□□ -1.24
COPS7B-218ENST00000466901 BTKQ06187 659 aa7.29□□□□□ -1.24
COPS7B-218ENST00000466901 ACSM2AQ08AH3 577 aa7.29□□□□□ -1.24
COPS7B-218ENST00000466901 TUBA3CQ13748 450 aa7.29□□□□□ -1.24
COPS7B-218ENST00000466901 OR1C1Q15619 314 aa7.29□□□□□ -1.24
COPS7B-218ENST00000466901 IMPG1Q17R60 797 aa7.29□□□□□ -1.24
COPS7B-218ENST00000466901 PRR30Q53SZ7 412 aaPredicted RBP7.29□□□□□ -1.24
COPS7B-218ENST00000466901 SPIN4Q56A73 249 aa7.29□□□□□ -1.24
COPS7B-218ENST00000466901 ZNF766Q5HY98 468 aa7.29□□□□□ -1.24
COPS7B-218ENST00000466901 SPDYAQ5MJ70 313 aa7.29□□□□□ -1.24
COPS7B-218ENST00000466901 FAM219BQ5XKK7 198 aa7.29□□□□□ -1.24
COPS7B-218ENST00000466901 ACSM2BQ68CK6 577 aa7.29□□□□□ -1.24
COPS7B-218ENST00000466901 SPINK14Q6IE38 97 aa7.29□□□□□ -1.24
COPS7B-218ENST00000466901 OR52E8Q6IFG1 317 aa7.29□□□□□ -1.24
COPS7B-218ENST00000466901 RPUSD3Q6P087 351 aaKnown RBP7.29□□□□□ -1.24
COPS7B-218ENST00000466901 TUBA3EQ6PEY2 450 aa7.29□□□□□ -1.24
COPS7B-218ENST00000466901 SCIMPQ6UWF3 145 aa7.29□□□□□ -1.24
COPS7B-218ENST00000466901 FAM180AQ6UWF9 173 aa7.29□□□□□ -1.24
COPS7B-218ENST00000466901 HOMEZQ8IX15 550 aa7.29□□□□□ -1.24
COPS7B-218ENST00000466901 ST13P4Q8IZP2 240 aaPredicted RBP7.29□□□□□ -1.24
COPS7B-218ENST00000466901 GALNT11Q8NCW6 608 aa7.29□□□□□ -1.24
COPS7B-218ENST00000466901 OR4K14Q8NGD5 310 aa7.29□□□□□ -1.24
COPS7B-218ENST00000466901 OR5L2Q8NGL0 311 aa7.29□□□□□ -1.24
COPS7B-218ENST00000466901 SLC2A12Q8TD20 617 aa7.29□□□□□ -1.24
COPS7B-218ENST00000466901 CHTF18Q8WVB6 975 aa7.29□□□□□ -1.24
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