RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000466636.1

SRPRB-202, Transcript of SRP receptor subunit beta, humanhuman

TSL 3

Gene SRPRB, Length 917 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRPRB-202ENST00000466636 DAPP1Q9UN19 280 aa9.01□□□□□ -0.97
SRPRB-202ENST00000466636 PLCL2Q9UPR0 1127 aa9.01□□□□□ -0.97
SRPRB-202ENST00000466636 C15orf41Q9Y2V0 281 aa9.01□□□□□ -0.97
SRPRB-202ENST00000466636 MN1Q10571 1320 aaPredicted RBP9.01□□□□□ -0.97
SRPRB-202ENST00000466636 A0A1W2PS29 197 aa9□□□□□ -0.97
SRPRB-202ENST00000466636 ZNF860A6NHJ4 632 aa9□□□□□ -0.97
SRPRB-202ENST00000466636 PATE3B3GLJ2 98 aa9□□□□□ -0.97
SRPRB-202ENST00000466636 TXNDC9O14530 226 aa9□□□□□ -0.97
SRPRB-202ENST00000466636 HNRNPRO43390 633 aaKnown RBP9□□□□□ -0.97
SRPRB-202ENST00000466636 GMNNO75496 209 aa9□□□□□ -0.97
SRPRB-202ENST00000466636 TIPRLO75663 272 aa9□□□□□ -0.97
SRPRB-202ENST00000466636 ALPPL2P10696 532 aa9□□□□□ -0.97
SRPRB-202ENST00000466636 ETFAP13804 333 aa9□□□□□ -0.97
SRPRB-202ENST00000466636 PNLIPP16233 465 aa9□□□□□ -0.97
SRPRB-202ENST00000466636 CSNK2A2P19784 350 aaPredicted RBP9□□□□□ -0.97
SRPRB-202ENST00000466636 IL10P22301 178 aa9□□□□□ -0.97
SRPRB-202ENST00000466636 CPN2P22792 545 aa9□□□□□ -0.97
SRPRB-202ENST00000466636 AVPR2P30518 371 aa9□□□□□ -0.97
SRPRB-202ENST00000466636 CHI3L1P36222 383 aaPredicted RBP9□□□□□ -0.97
SRPRB-202ENST00000466636 BUD31P41223 144 aaPredicted RBP9□□□□□ -0.97
SRPRB-202ENST00000466636 CCT8P50990 548 aa9□□□□□ -0.97
SRPRB-202ENST00000466636 NCBP2P52298 156 aaKnown RBP eCLIP9□□□□□ -0.97
SRPRB-202ENST00000466636 OLR1P78380 273 aa9□□□□□ -0.97
SRPRB-202ENST00000466636 EEF1A2Q05639 463 aaKnown RBP9□□□□□ -0.97
SRPRB-202ENST00000466636 HSPB3Q12988 150 aa9□□□□□ -0.97
SRPRB-202ENST00000466636 FADDQ13158 208 aa9□□□□□ -0.97
SRPRB-202ENST00000466636 VEZF1Q14119 521 aa9□□□□□ -0.97
SRPRB-202ENST00000466636 NR0B2Q15466 257 aa9□□□□□ -0.97
SRPRB-202ENST00000466636 NKG7Q16617 165 aa9□□□□□ -0.97
SRPRB-202ENST00000466636 INAVAQ3KP66 663 aa9□□□□□ -0.97
SRPRB-202ENST00000466636 GCNT6Q5T4J0 391 aa9□□□□□ -0.97
SRPRB-202ENST00000466636 WLSQ5T9L3 541 aa9□□□□□ -0.97
SRPRB-202ENST00000466636 OR52E8Q6IFG1 317 aa9□□□□□ -0.97
SRPRB-202ENST00000466636 SLC23A3Q6PIS1 610 aa9□□□□□ -0.97
SRPRB-202ENST00000466636 BRICD5Q6PL45 260 aa9□□□□□ -0.97
SRPRB-202ENST00000466636 TMEM64Q6YI46 380 aa9□□□□□ -0.97
SRPRB-202ENST00000466636 PRSS42Q7Z5A4 293 aa9□□□□□ -0.97
SRPRB-202ENST00000466636 SPRED1Q7Z699 444 aa9□□□□□ -0.97
SRPRB-202ENST00000466636 RNF130Q86XS8 419 aa9□□□□□ -0.97
SRPRB-202ENST00000466636 SHISA5Q8N114 240 aa9□□□□□ -0.97
SRPRB-202ENST00000466636 Q8N9G6 341 aaPredicted RBP9□□□□□ -0.97
SRPRB-202ENST00000466636 FAM181AQ8N9Y4 354 aa9□□□□□ -0.97
SRPRB-202ENST00000466636 NETO1Q8TDF5 533 aa9□□□□□ -0.97
SRPRB-202ENST00000466636 NCLNQ969V3 563 aa9□□□□□ -0.97
SRPRB-202ENST00000466636 AHCYL2Q96HN2 611 aaKnown RBP9□□□□□ -0.97
SRPRB-202ENST00000466636 BBS4Q96RK4 519 aa9□□□□□ -0.97
SRPRB-202ENST00000466636 USB1Q9BQ65 265 aaKnown RBP9□□□□□ -0.97
SRPRB-202ENST00000466636 NPLQ9BXD5 320 aaPredicted RBP9□□□□□ -0.97
SRPRB-202ENST00000466636 GAREM1Q9H706 876 aa9□□□□□ -0.97
SRPRB-202ENST00000466636 DCAF13Q9NV06 445 aaKnown RBP9□□□□□ -0.97
SRPRB-202ENST00000466636 MS4A12Q9NXJ0 267 aa9□□□□□ -0.97
SRPRB-202ENST00000466636 TMEM9Q9P0T7 183 aa9□□□□□ -0.97
SRPRB-202ENST00000466636 SLC6A14Q9UN76 642 aa9□□□□□ -0.97
SRPRB-202ENST00000466636 AURKCQ9UQB9 309 aa9□□□□□ -0.97
SRPRB-202ENST00000466636 NAALAD2Q9Y3Q0 740 aa9□□□□□ -0.97
SRPRB-202ENST00000466636 LRRC42Q9Y546 428 aa9□□□□□ -0.97
SRPRB-202ENST00000466636 EML5Q05BV3 1969 aa9□□□□□ -0.97
SRPRB-202ENST00000466636 TECTAO75443 2155 aa8.99□□□□□ -0.97
SRPRB-202ENST00000466636 FITM1A5D6W6 292 aa8.99□□□□□ -0.97
SRPRB-202ENST00000466636 CYR61O00622 381 aa8.99□□□□□ -0.97
SRPRB-202ENST00000466636 FOXS1O43638 330 aa8.99□□□□□ -0.97
SRPRB-202ENST00000466636 SIGLEC6O43699 453 aa8.99□□□□□ -0.97
SRPRB-202ENST00000466636 ERAL1O75616 437 aaKnown RBP8.99□□□□□ -0.97
SRPRB-202ENST00000466636 PRKD3O94806 890 aa8.99□□□□□ -0.97
SRPRB-202ENST00000466636 ZBTB11O95625 1053 aaPredicted RBP8.99□□□□□ -0.97
SRPRB-202ENST00000466636 SERPINA1P01009 418 aa8.99□□□□□ -0.97
SRPRB-202ENST00000466636 C8orf89P0DMQ9 161 aa8.99□□□□□ -0.97
SRPRB-202ENST00000466636 ARAFP10398 606 aa8.99□□□□□ -0.97
SRPRB-202ENST00000466636 KDELR2P33947 212 aa8.99□□□□□ -0.97
SRPRB-202ENST00000466636 FEN1P39748 380 aaKnown RBP8.99□□□□□ -0.97
SRPRB-202ENST00000466636 CRATP43155 626 aa8.99□□□□□ -0.97
SRPRB-202ENST00000466636 CCT3P49368 545 aaKnown RBP8.99□□□□□ -0.97
SRPRB-202ENST00000466636 PPM1FP49593 454 aaPredicted RBP8.99□□□□□ -0.97
SRPRB-202ENST00000466636 RAB38P57729 211 aa8.99□□□□□ -0.97
SRPRB-202ENST00000466636 SIM1P81133 766 aaPredicted RBP8.99□□□□□ -0.97
SRPRB-202ENST00000466636 RBBP4Q09028 425 aa8.99□□□□□ -0.97
SRPRB-202ENST00000466636 SQSTM1Q13501 440 aa8.99□□□□□ -0.97
SRPRB-202ENST00000466636 ANGPT1Q15389 498 aa8.99□□□□□ -0.97
SRPRB-202ENST00000466636 ATP6AP1Q15904 470 aa8.99□□□□□ -0.97
SRPRB-202ENST00000466636 AMZ1Q400G9 498 aa8.99□□□□□ -0.97
SRPRB-202ENST00000466636 TRIM61Q5EBN2 209 aa8.99□□□□□ -0.97
SRPRB-202ENST00000466636 PERM1Q5SV97 790 aa8.99□□□□□ -0.97
SRPRB-202ENST00000466636 GUSBP11Q6P575 273 aa8.99□□□□□ -0.97
SRPRB-202ENST00000466636 WDR74Q6RFH5 385 aaPredicted RBP8.99□□□□□ -0.97
SRPRB-202ENST00000466636 ENPP6Q6UWR7 440 aa8.99□□□□□ -0.97
SRPRB-202ENST00000466636 PLXDC1Q8IUK5 500 aa8.99□□□□□ -0.97
SRPRB-202ENST00000466636 EID3Q8N140 333 aa8.99□□□□□ -0.97
SRPRB-202ENST00000466636 ANKFN1Q8N957 763 aa8.99□□□□□ -0.97
SRPRB-202ENST00000466636 C11orf65Q8NCR3 313 aa8.99□□□□□ -0.97
SRPRB-202ENST00000466636 TMEM52Q8NDY8 209 aa8.99□□□□□ -0.97
SRPRB-202ENST00000466636 ADCY4Q8NFM4 1077 aa8.99□□□□□ -0.97
SRPRB-202ENST00000466636 OR6C4Q8NGE1 309 aa8.99□□□□□ -0.97
SRPRB-202ENST00000466636 OR5T3Q8NGG3 340 aa8.99□□□□□ -0.97
SRPRB-202ENST00000466636 OR9A4Q8NGU2 314 aa8.99□□□□□ -0.97
SRPRB-202ENST00000466636 OR2I1PQ8NGU4 316 aa8.99□□□□□ -0.97
SRPRB-202ENST00000466636 FBXO30Q8TB52 745 aa8.99□□□□□ -0.97
SRPRB-202ENST00000466636 SFXN5Q8TD22 340 aa8.99□□□□□ -0.97
SRPRB-202ENST00000466636 POP5Q969H6 163 aaKnown RBP8.99□□□□□ -0.97
SRPRB-202ENST00000466636 SLC41A2Q96JW4 573 aa8.99□□□□□ -0.97
SRPRB-202ENST00000466636 KLHL4Q9C0H6 718 aa8.99□□□□□ -0.97
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 23.5 ms