RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000459627.1

SH3BP5-208, Transcript of SH3 domain binding protein 5, humanhuman

TSL 3

Gene SH3BP5, Length 473 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP5-208ENST00000459627 ZFAND5O76080 213 aa22.23■■□□□ 1.15
SH3BP5-208ENST00000459627 CHN1P15882 459 aa22.23■■□□□ 1.15
SH3BP5-208ENST00000459627 SERTAD2Q14140 314 aa22.23■■□□□ 1.15
SH3BP5-208ENST00000459627 HIST2H2BCQ6DN03 193 aa22.23■■□□□ 1.15
SH3BP5-208ENST00000459627 OR14A16Q8NHC5 309 aa22.23■■□□□ 1.15
SH3BP5-208ENST00000459627 DAZLQ92904 295 aaKnown RBP22.23■■□□□ 1.15
SH3BP5-208ENST00000459627 DGAT2Q96PD7 388 aa22.23■■□□□ 1.15
SH3BP5-208ENST00000459627 PSD3Q9NYI0 1048 aa22.23■■□□□ 1.15
SH3BP5-208ENST00000459627 TLDC2A0PJX2 215 aa22.22■■□□□ 1.15
SH3BP5-208ENST00000459627 G3V2L1 256 aa22.22■■□□□ 1.15
SH3BP5-208ENST00000459627 FCHO1O14526 889 aa22.22■■□□□ 1.15
SH3BP5-208ENST00000459627 PGRMC2O15173 223 aa22.22■■□□□ 1.15
SH3BP5-208ENST00000459627 ZNHIT1O43257 154 aa22.22■■□□□ 1.15
SH3BP5-208ENST00000459627 SLC25A12O75746 678 aa22.22■■□□□ 1.15
SH3BP5-208ENST00000459627 GSTA1P08263 222 aa22.22■■□□□ 1.15
SH3BP5-208ENST00000459627 NR2F6P10588 404 aa22.22■■□□□ 1.15
SH3BP5-208ENST00000459627 IMPDH1P20839 514 aa22.22■■□□□ 1.15
SH3BP5-208ENST00000459627 BUD31P41223 144 aaPredicted RBP22.22■■□□□ 1.15
SH3BP5-208ENST00000459627 CYB561P49447 251 aa22.22■■□□□ 1.15
SH3BP5-208ENST00000459627 HTR6P50406 440 aa22.22■■□□□ 1.15
SH3BP5-208ENST00000459627 HLCSP50747 726 aa22.22■■□□□ 1.15
SH3BP5-208ENST00000459627 PRKAA2P54646 552 aa22.22■■□□□ 1.15
SH3BP5-208ENST00000459627 IGLV3-21P80748 117 aaPredicted RBP22.22■■□□□ 1.15
SH3BP5-208ENST00000459627 INAQ16352 499 aa22.22■■□□□ 1.15
SH3BP5-208ENST00000459627 MMP21Q8N119 569 aa22.22■■□□□ 1.15
SH3BP5-208ENST00000459627 C4orf33Q8N1A6 199 aa22.22■■□□□ 1.15
SH3BP5-208ENST00000459627 CCNYL1Q8N7R7 359 aa22.22■■□□□ 1.15
SH3BP5-208ENST00000459627 MORN4Q8NDC4 146 aa22.22■■□□□ 1.15
SH3BP5-208ENST00000459627 SSC4DQ8WTU2 575 aa22.22■■□□□ 1.15
SH3BP5-208ENST00000459627 KCNA7Q96RP8 456 aa22.22■■□□□ 1.15
SH3BP5-208ENST00000459627 MS4A12Q9NXJ0 267 aa22.22■■□□□ 1.15
SH3BP5-208ENST00000459627 TRPS1Q9UHF7 1281 aa22.22■■□□□ 1.15
SH3BP5-208ENST00000459627 A1L4Q6 167 aa22.21■■□□□ 1.15
SH3BP5-208ENST00000459627 MANBAO00462 879 aa22.21■■□□□ 1.15
SH3BP5-208ENST00000459627 OR2J2O76002 312 aa22.21■■□□□ 1.15
SH3BP5-208ENST00000459627 PROCP04070 461 aa22.21■■□□□ 1.15
SH3BP5-208ENST00000459627 TLX1P31314 330 aaPredicted RBP22.21■■□□□ 1.15
SH3BP5-208ENST00000459627 TRHRP34981 398 aaPredicted RBP22.21■■□□□ 1.15
SH3BP5-208ENST00000459627 STT3AP46977 705 aa22.21■■□□□ 1.15
SH3BP5-208ENST00000459627 SCIMPQ6UWF3 145 aa22.21■■□□□ 1.15
SH3BP5-208ENST00000459627 GFRALQ6UXV0 394 aa22.21■■□□□ 1.15
SH3BP5-208ENST00000459627 HSDL2Q6YN16 418 aa22.21■■□□□ 1.15
SH3BP5-208ENST00000459627 ARMC10Q8N2F6 343 aa22.21■■□□□ 1.15
SH3BP5-208ENST00000459627 TMEM156Q8N614 296 aa22.21■■□□□ 1.15
SH3BP5-208ENST00000459627 ZNF721Q8TF20 911 aa22.21■■□□□ 1.15
SH3BP5-208ENST00000459627 TANKQ92844 425 aa22.21■■□□□ 1.15
SH3BP5-208ENST00000459627 DCDC2Q9UHG0 476 aa22.21■■□□□ 1.15
SH3BP5-208ENST00000459627 PPT2Q9UMR5 302 aa22.21■■□□□ 1.15
SH3BP5-208ENST00000459627 USP9YO00507 2555 aaPredicted RBP22.21■■□□□ 1.15
SH3BP5-208ENST00000459627 ZNF354AO60765 605 aaPredicted RBP22.2■■□□□ 1.14
SH3BP5-208ENST00000459627 GLRA3O75311 464 aa22.2■■□□□ 1.14
SH3BP5-208ENST00000459627 SEMA3DO95025 777 aa22.2■■□□□ 1.14
SH3BP5-208ENST00000459627 UNC5CO95185 931 aa22.2■■□□□ 1.14
SH3BP5-208ENST00000459627 CRYABP02511 175 aaKnown RBP22.2■■□□□ 1.14
SH3BP5-208ENST00000459627 ALOX15P16050 662 aaPredicted RBP22.2■■□□□ 1.14
SH3BP5-208ENST00000459627 RFC3P40938 356 aa22.2■■□□□ 1.14
SH3BP5-208ENST00000459627 HK2P52789 917 aa22.2■■□□□ 1.14
SH3BP5-208ENST00000459627 ARFIP1P53367 373 aa22.2■■□□□ 1.14
SH3BP5-208ENST00000459627 GALNT1Q10472 559 aaPredicted RBP22.2■■□□□ 1.14
SH3BP5-208ENST00000459627 ZNF750Q32MQ0 723 aa22.2■■□□□ 1.14
SH3BP5-208ENST00000459627 CCNYL2Q5T2Q4 361 aa22.2■■□□□ 1.14
SH3BP5-208ENST00000459627 GPRIN3Q6ZVF9 776 aa22.2■■□□□ 1.14
SH3BP5-208ENST00000459627 COMMD6Q7Z4G1 85 aa22.2■■□□□ 1.14
SH3BP5-208ENST00000459627 MDGA2Q7Z553 956 aa22.2■■□□□ 1.14
SH3BP5-208ENST00000459627 LCA5Q86VQ0 697 aa22.2■■□□□ 1.14
SH3BP5-208ENST00000459627 TDRPQ86YL5 185 aa22.2■■□□□ 1.14
SH3BP5-208ENST00000459627 METTL4Q8N3J2 472 aa22.2■■□□□ 1.14
SH3BP5-208ENST00000459627 CPSF7Q8N684 471 aaKnown RBP22.2■■□□□ 1.14
SH3BP5-208ENST00000459627 TMEM178AQ8NBL3 297 aa22.2■■□□□ 1.14
SH3BP5-208ENST00000459627 SENP5Q96HI0 755 aaPredicted RBP22.2■■□□□ 1.14
SH3BP5-208ENST00000459627 PSMG3-AS1Q96PY0 264 aa22.2■■□□□ 1.14
SH3BP5-208ENST00000459627 ZNF382Q96SR6 550 aa22.2■■□□□ 1.14
SH3BP5-208ENST00000459627 GSTO2Q9H4Y5 243 aa22.2■■□□□ 1.14
SH3BP5-208ENST00000459627 SNX6Q9UNH7 406 aa22.2■■□□□ 1.14
SH3BP5-208ENST00000459627 TIMM22Q9Y584 194 aa22.2■■□□□ 1.14
SH3BP5-208ENST00000459627 LRRTM2O43300 516 aa22.19■■□□□ 1.14
SH3BP5-208ENST00000459627 NME2P1O60361 137 aa22.19■■□□□ 1.14
SH3BP5-208ENST00000459627 OR6B1O95007 311 aa22.19■■□□□ 1.14
SH3BP5-208ENST00000459627 GPR75O95800 540 aa22.19■■□□□ 1.14
SH3BP5-208ENST00000459627 MYL2P10916 166 aa22.19■■□□□ 1.14
SH3BP5-208ENST00000459627 NME2P22392 152 aa22.19■■□□□ 1.14
SH3BP5-208ENST00000459627 HMOX2P30519 316 aa22.19■■□□□ 1.14
SH3BP5-208ENST00000459627 SSR4P51571 173 aa22.19■■□□□ 1.14
SH3BP5-208ENST00000459627 RNFT1Q5M7Z0 435 aa22.19■■□□□ 1.14
SH3BP5-208ENST00000459627 C1QL3Q5VWW1 255 aa22.19■■□□□ 1.14
SH3BP5-208ENST00000459627 IL20RBQ6UXL0 311 aa22.19■■□□□ 1.14
SH3BP5-208ENST00000459627 ZYG11AQ6WRX3 759 aa22.19■■□□□ 1.14
SH3BP5-208ENST00000459627 SLC22A9Q8IVM8 553 aa22.19■■□□□ 1.14
SH3BP5-208ENST00000459627 CYP4Z2PQ8N1L4 340 aa22.19■■□□□ 1.14
SH3BP5-208ENST00000459627 HORMAD2Q8N7B1 307 aa22.19■■□□□ 1.14
SH3BP5-208ENST00000459627 DNAJB8Q8NHS0 232 aa22.19■■□□□ 1.14
SH3BP5-208ENST00000459627 METTL6Q8TCB7 284 aa22.19■■□□□ 1.14
SH3BP5-208ENST00000459627 L3HYPDHQ96EM0 354 aa22.19■■□□□ 1.14
SH3BP5-208ENST00000459627 RBM18Q96H35 190 aaKnown RBP22.19■■□□□ 1.14
SH3BP5-208ENST00000459627 FRMD6Q96NE9 622 aa22.19■■□□□ 1.14
SH3BP5-208ENST00000459627 CNPPD1Q9BV87 410 aa22.19■■□□□ 1.14
SH3BP5-208ENST00000459627 TRIM45Q9H8W5 580 aaPredicted RBP22.19■■□□□ 1.14
SH3BP5-208ENST00000459627 SEC14L3Q9UDX4 400 aa22.19■■□□□ 1.14
SH3BP5-208ENST00000459627 SLC5A6Q9Y289 635 aa22.19■■□□□ 1.14
SH3BP5-208ENST00000459627 PCDHGB6Q9Y5F9 930 aa22.19■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 27.8 ms