RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000442447.5

RBM39-215, Transcript of RNA binding motif protein 39, humanhuman

TSL 2

Gene RBM39, Length 644 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RBM39-215ENST00000442447 TMEM156Q8N614 296 aa15.06■□□□□ 0
RBM39-215ENST00000442447 TANKQ92844 425 aa15.06■□□□□ 0
RBM39-215ENST00000442447 TMEM125Q96AQ2 219 aa15.06■□□□□ 0
RBM39-215ENST00000442447 FRMD6Q96NE9 622 aa15.06■□□□□ 0
RBM39-215ENST00000442447 DGAT2Q96PD7 388 aa15.06■□□□□ 0
RBM39-215ENST00000442447 MRPL1Q9BYD6 325 aaKnown RBP15.06■□□□□ 0
RBM39-215ENST00000442447 ANKZF1Q9H8Y5 726 aa15.06■□□□□ 0
RBM39-215ENST00000442447 SEC14L3Q9UDX4 400 aa15.06■□□□□ 0
RBM39-215ENST00000442447 SVILO95425 2214 aa15.05■□□□□ 0
RBM39-215ENST00000442447 USP9YO00507 2555 aaPredicted RBP15.05■□□□□ 0
RBM39-215ENST00000442447 ASPDHA6ND91 283 aa15.05■□□□□ -0
RBM39-215ENST00000442447 TMEM200CA6NKL6 621 aa15.05■□□□□ -0
RBM39-215ENST00000442447 WASHC1A8K0Z3 465 aa15.05■□□□□ -0
RBM39-215ENST00000442447 CYSRT1A8MQ03 144 aa15.05■□□□□ -0
RBM39-215ENST00000442447 NME2P1O60361 137 aa15.05■□□□□ -0
RBM39-215ENST00000442447 OR4F21O95013 312 aa15.05■□□□□ -0
RBM39-215ENST00000442447 UNC5CO95185 931 aa15.05■□□□□ -0
RBM39-215ENST00000442447 AIFM1O95831 613 aa15.05■□□□□ -0
RBM39-215ENST00000442447 LDLRP01130 860 aa15.05■□□□□ -0
RBM39-215ENST00000442447 GSTA1P08263 222 aa15.05■□□□□ -0
RBM39-215ENST00000442447 GP1BBP13224 206 aa15.05■□□□□ -0
RBM39-215ENST00000442447 COX7A2P14406 83 aa15.05■□□□□ -0
RBM39-215ENST00000442447 NME2P22392 152 aa15.05■□□□□ -0
RBM39-215ENST00000442447 PLIN5Q00G26 463 aa15.05■□□□□ -0
RBM39-215ENST00000442447 C4orf17Q53FE4 359 aa15.05■□□□□ -0
RBM39-215ENST00000442447 HSDL2Q6YN16 418 aa15.05■□□□□ -0
RBM39-215ENST00000442447 DGAT2L6Q6ZPD8 337 aa15.05■□□□□ -0
RBM39-215ENST00000442447 CYP4Z2PQ8N1L4 340 aa15.05■□□□□ -0
RBM39-215ENST00000442447 FAM98AQ8NCA5 519 aaKnown RBP15.05■□□□□ -0
RBM39-215ENST00000442447 SELENOMQ8WWX9 145 aa15.05■□□□□ -0
RBM39-215ENST00000442447 UCN3Q969E3 161 aa15.05■□□□□ -0
RBM39-215ENST00000442447 PPWD1Q96BP3 646 aaKnown RBP15.05■□□□□ -0
RBM39-215ENST00000442447 TSPAN10Q9H1Z9 355 aaPredicted RBP15.05■□□□□ -0
RBM39-215ENST00000442447 TRPS1Q9UHF7 1281 aa15.05■□□□□ -0
RBM39-215ENST00000442447 ZNF225Q9UK10 706 aa15.05■□□□□ -0
RBM39-215ENST00000442447 SNX6Q9UNH7 406 aa15.05■□□□□ -0
RBM39-215ENST00000442447 SLC12A4Q9UP95 1085 aa15.05■□□□□ -0
RBM39-215ENST00000442447 YARS2Q9Y2Z4 477 aaKnown RBP15.05■□□□□ -0
RBM39-215ENST00000442447 POLEQ07864 2286 aa15.05■□□□□ -0
RBM39-215ENST00000442447 A1L4Q6 167 aa15.04■□□□□ -0
RBM39-215ENST00000442447 WWP2O00308 870 aa15.04■□□□□ -0
RBM39-215ENST00000442447 LRRTM2O43300 516 aa15.04■□□□□ -0
RBM39-215ENST00000442447 OR2J2O76002 312 aa15.04■□□□□ -0
RBM39-215ENST00000442447 PDYNP01213 254 aa15.04■□□□□ -0
RBM39-215ENST00000442447 KLK1P06870 262 aa15.04■□□□□ -0
RBM39-215ENST00000442447 STSP08842 583 aa15.04■□□□□ -0
RBM39-215ENST00000442447 ALOX15P16050 662 aaPredicted RBP15.04■□□□□ -0
RBM39-215ENST00000442447 SSR4P51571 173 aa15.04■□□□□ -0
RBM39-215ENST00000442447 HK2P52789 917 aa15.04■□□□□ -0
RBM39-215ENST00000442447 PRKAA2P54646 552 aa15.04■□□□□ -0
RBM39-215ENST00000442447 ALDH6A1Q02252 535 aaKnown RBP15.04■□□□□ -0
RBM39-215ENST00000442447 TCHHL1Q5QJ38 904 aaPredicted RBP15.04■□□□□ -0
RBM39-215ENST00000442447 SLC22A9Q8IVM8 553 aa15.04■□□□□ -0
RBM39-215ENST00000442447 CNPY4Q8N129 248 aa15.04■□□□□ -0
RBM39-215ENST00000442447 CDYL2Q8N8U2 506 aa15.04■□□□□ -0
RBM39-215ENST00000442447 C7orf57Q8NEG2 295 aa15.04■□□□□ -0
RBM39-215ENST00000442447 MYRIPQ8NFW9 859 aa15.04■□□□□ -0
RBM39-215ENST00000442447 EPS8L3Q8TE67 593 aaKnown RBP15.04■□□□□ -0
RBM39-215ENST00000442447 DOK4Q8TEW6 326 aa15.04■□□□□ -0
RBM39-215ENST00000442447 ZNF721Q8TF20 911 aa15.04■□□□□ -0
RBM39-215ENST00000442447 ZNF382Q96SR6 550 aa15.04■□□□□ -0
RBM39-215ENST00000442447 HBEGFQ99075 208 aa15.04■□□□□ -0
RBM39-215ENST00000442447 WDR41Q9HAD4 459 aa15.04■□□□□ -0
RBM39-215ENST00000442447 TEX10Q9NXF1 929 aaPredicted RBP15.04■□□□□ -0
RBM39-215ENST00000442447 AHSPQ9NZD4 102 aa15.04■□□□□ -0
RBM39-215ENST00000442447 MYOTQ9UBF9 498 aa15.04■□□□□ -0
RBM39-215ENST00000442447 COPS7AQ9UBW8 275 aa15.04■□□□□ -0
RBM39-215ENST00000442447 DCDC2Q9UHG0 476 aa15.04■□□□□ -0
RBM39-215ENST00000442447 EMCNQ9ULC0 261 aa15.04■□□□□ -0
RBM39-215ENST00000442447 UTP20O75691 2785 aaKnown RBP15.03■□□□□ -0
RBM39-215ENST00000442447 ARHGAP10A1A4S6 786 aa15.03■□□□□ -0
RBM39-215ENST00000442447 WIPF3A6NGB9 483 aa15.03■□□□□ -0
RBM39-215ENST00000442447 HRKO00198 91 aa15.03■□□□□ -0
RBM39-215ENST00000442447 DYRK3O43781 588 aa15.03■□□□□ -0
RBM39-215ENST00000442447 OR10H2O60403 315 aa15.03■□□□□ -0
RBM39-215ENST00000442447 GLRA3O75311 464 aa15.03■□□□□ -0
RBM39-215ENST00000442447 GPR75O95800 540 aa15.03■□□□□ -0
RBM39-215ENST00000442447 KRT15P19012 456 aa15.03■□□□□ -0
RBM39-215ENST00000442447 IMPDH1P20839 514 aa15.03■□□□□ -0
RBM39-215ENST00000442447 RNF4P78317 190 aa15.03■□□□□ -0
RBM39-215ENST00000442447 RASA2Q15283 850 aa15.03■□□□□ -0
RBM39-215ENST00000442447 C1QL3Q5VWW1 255 aa15.03■□□□□ -0
RBM39-215ENST00000442447 GPRIN3Q6ZVF9 776 aa15.03■□□□□ -0
RBM39-215ENST00000442447 PAGE2Q7Z2X7 111 aa15.03■□□□□ -0
RBM39-215ENST00000442447 COMMD6Q7Z4G1 85 aa15.03■□□□□ -0
RBM39-215ENST00000442447 MDGA2Q7Z553 956 aa15.03■□□□□ -0
RBM39-215ENST00000442447 ZGRF1Q86YA3 2104 aa15.03■□□□□ -0
RBM39-215ENST00000442447 TDRPQ86YL5 185 aa15.03■□□□□ -0
RBM39-215ENST00000442447 ST13P4Q8IZP2 240 aaPredicted RBP15.03■□□□□ -0
RBM39-215ENST00000442447 METTL4Q8N3J2 472 aa15.03■□□□□ -0
RBM39-215ENST00000442447 CPSF7Q8N684 471 aaKnown RBP15.03■□□□□ -0
RBM39-215ENST00000442447 ASB15Q8WXK1 588 aa15.03■□□□□ -0
RBM39-215ENST00000442447 DGCR8Q8WYQ5 773 aaKnown RBP eCLIP15.03■□□□□ -0
RBM39-215ENST00000442447 RBM18Q96H35 190 aaKnown RBP15.03■□□□□ -0
RBM39-215ENST00000442447 SENP5Q96HI0 755 aaPredicted RBP15.03■□□□□ -0
RBM39-215ENST00000442447 RASL10BQ96S79 203 aa15.03■□□□□ -0
RBM39-215ENST00000442447 PPCSQ9HAB8 311 aa15.03■□□□□ -0
RBM39-215ENST00000442447 PLEKHB1Q9UF11 243 aaPredicted RBP15.03■□□□□ -0
RBM39-215ENST00000442447 ADAM29Q9UKF5 820 aa15.03■□□□□ -0
RBM39-215ENST00000442447 ERVK-11Q9UQG0 969 aa15.03■□□□□ -0
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 40.3 ms