RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000428120.5

FAAP20-209, Transcript of FA core complex associated protein 20, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene FAAP20, Length 2,313 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAAP20-209ENST00000428120 KCTD21Q4G0X4 260 aa21.96■■□□□ 1.11
FAAP20-209ENST00000428120 RBM44Q6ZP01 1051 aaKnown RBP21.96■■□□□ 1.11
FAAP20-209ENST00000428120 CCDC116Q8IYX3 515 aa21.96■■□□□ 1.11
FAAP20-209ENST00000428120 CNRIP1Q96F85 164 aaPredicted RBP21.96■■□□□ 1.11
FAAP20-209ENST00000428120 ZNF764Q96H86 408 aaPredicted RBP21.96■■□□□ 1.11
FAAP20-209ENST00000428120 EVA1BQ9NVM1 165 aa21.96■■□□□ 1.11
FAAP20-209ENST00000428120 EHD3Q9NZN3 535 aa21.96■■□□□ 1.11
FAAP20-209ENST00000428120 PADI2Q9Y2J8 665 aa21.96■■□□□ 1.11
FAAP20-209ENST00000428120 SH3GLB1Q9Y371 365 aa21.96■■□□□ 1.11
FAAP20-209ENST00000428120 TESMINQ9Y4I5 508 aa21.96■■□□□ 1.11
FAAP20-209ENST00000428120 CHURC1-FNTBB4DL54 471 aa21.95■■□□□ 1.1
FAAP20-209ENST00000428120 FPR1P21462 350 aa21.95■■□□□ 1.1
FAAP20-209ENST00000428120 LSSP48449 732 aa21.95■■□□□ 1.1
FAAP20-209ENST00000428120 TPD52P55327 224 aaPredicted RBP21.95■■□□□ 1.1
FAAP20-209ENST00000428120 PPP1CAP62136 330 aa21.95■■□□□ 1.1
FAAP20-209ENST00000428120 FIGLAQ6QHK4 219 aa21.95■■□□□ 1.1
FAAP20-209ENST00000428120 SRFBP1Q8NEF9 429 aaKnown RBP21.95■■□□□ 1.1
FAAP20-209ENST00000428120 LZICQ8WZA0 190 aa21.95■■□□□ 1.1
FAAP20-209ENST00000428120 TBC1D20Q96BZ9 403 aa21.95■■□□□ 1.1
FAAP20-209ENST00000428120 DUSP12Q9UNI6 340 aa21.95■■□□□ 1.1
FAAP20-209ENST00000428120 PCDHGA2Q9Y5H1 932 aa21.95■■□□□ 1.1
FAAP20-209ENST00000428120 ORC6Q9Y5N6 252 aa21.95■■□□□ 1.1
FAAP20-209ENST00000428120 TOR1BO14657 336 aa21.95■■□□□ 1.1
FAAP20-209ENST00000428120 NTSP30990 170 aa21.95■■□□□ 1.1
FAAP20-209ENST00000428120 UBE2IP63279 158 aaKnown RBP21.95■■□□□ 1.1
FAAP20-209ENST00000428120 RGS1Q08116 209 aa21.95■■□□□ 1.1
FAAP20-209ENST00000428120 FOXD4Q12950 439 aaPredicted RBP21.95■■□□□ 1.1
FAAP20-209ENST00000428120 IFI44LQ53G44 452 aa21.95■■□□□ 1.1
FAAP20-209ENST00000428120 CRB2Q5IJ48 1285 aa21.95■■□□□ 1.1
FAAP20-209ENST00000428120 TTC23Q5W5X9 447 aa21.95■■□□□ 1.1
FAAP20-209ENST00000428120 PTCRAQ6ISU1 281 aaPredicted RBP21.95■■□□□ 1.1
FAAP20-209ENST00000428120 REEP3Q6NUK4 255 aa21.95■■□□□ 1.1
FAAP20-209ENST00000428120 CCDC80Q76M96 950 aa21.95■■□□□ 1.1
FAAP20-209ENST00000428120 OR5D16Q8NGK9 328 aa21.95■■□□□ 1.1
FAAP20-209ENST00000428120 TMIGD2Q96BF3 282 aa21.95■■□□□ 1.1
FAAP20-209ENST00000428120 KLHDC7BQ96G42 594 aa21.95■■□□□ 1.1
FAAP20-209ENST00000428120 TMEM19Q96HH6 336 aa21.95■■□□□ 1.1
FAAP20-209ENST00000428120 OR2A5Q96R48 311 aa21.95■■□□□ 1.1
FAAP20-209ENST00000428120 EXD2Q9NVH0 621 aa21.95■■□□□ 1.1
FAAP20-209ENST00000428120 HRASLS2Q9NWW9 162 aa21.95■■□□□ 1.1
FAAP20-209ENST00000428120 PCDHGA8Q9Y5G5 932 aa21.95■■□□□ 1.1
FAAP20-209ENST00000428120 SPEGQ15772 3267 aa21.95■■□□□ 1.1
FAAP20-209ENST00000428120 LOC105369274A0A096LPK9 316 aa21.94■■□□□ 1.1
FAAP20-209ENST00000428120 LOC102723532A0A0G2JNH3 316 aa21.94■■□□□ 1.1
FAAP20-209ENST00000428120 SMIM31A0A1B0GVY4 71 aa21.94■■□□□ 1.1
FAAP20-209ENST00000428120 KRBA1A5PL33 1030 aa21.94■■□□□ 1.1
FAAP20-209ENST00000428120 C5orf58C9J3I9 102 aa21.94■■□□□ 1.1
FAAP20-209ENST00000428120 HMGN4O00479 90 aa21.94■■□□□ 1.1
FAAP20-209ENST00000428120 SLC35G6P0C7Q6 338 aa21.94■■□□□ 1.1
FAAP20-209ENST00000428120 IL9P15248 144 aa21.94■■□□□ 1.1
FAAP20-209ENST00000428120 PRKAG1P54619 331 aa21.94■■□□□ 1.1
FAAP20-209ENST00000428120 FZD5Q13467 585 aa21.94■■□□□ 1.1
FAAP20-209ENST00000428120 FRMPD2BQ6IN97 320 aa21.94■■□□□ 1.1
FAAP20-209ENST00000428120 ZNF438Q7Z4V0 828 aa21.94■■□□□ 1.1
FAAP20-209ENST00000428120 C8orf59Q8N0T1 100 aaPredicted RBP21.94■■□□□ 1.1
FAAP20-209ENST00000428120 OR4N4Q8N0Y3 316 aa21.94■■□□□ 1.1
FAAP20-209ENST00000428120 FAM46DQ8NEK8 389 aa21.94■■□□□ 1.1
FAAP20-209ENST00000428120 HLA-CQ95604 372 aa21.94■■□□□ 1.1
FAAP20-209ENST00000428120 ZCCHC3Q9NUD5 404 aaKnown RBP21.94■■□□□ 1.1
FAAP20-209ENST00000428120 POT1Q9NUX5 634 aa21.94■■□□□ 1.1
FAAP20-209ENST00000428120 ZNF451Q9Y4E5 1061 aa21.94■■□□□ 1.1
FAAP20-209ENST00000428120 SCN2AQ99250 2005 aa21.94■■□□□ 1.1
FAAP20-209ENST00000428120 LOC100130705A0A1B0GUX0 176 aa21.94■■□□□ 1.1
FAAP20-209ENST00000428120 CCDC160A6NGH7 325 aa21.94■■□□□ 1.1
FAAP20-209ENST00000428120 B4DGG1 531 aa21.94■■□□□ 1.1
FAAP20-209ENST00000428120 IL7RP16871 459 aa21.94■■□□□ 1.1
FAAP20-209ENST00000428120 PEX19P40855 299 aa21.94■■□□□ 1.1
FAAP20-209ENST00000428120 GPR19Q15760 415 aa21.94■■□□□ 1.1
FAAP20-209ENST00000428120 DEFB134Q4QY38 66 aa21.94■■□□□ 1.1
FAAP20-209ENST00000428120 OR52J3Q8NH60 311 aa21.94■■□□□ 1.1
FAAP20-209ENST00000428120 SUN3Q8TAQ9 357 aa21.94■■□□□ 1.1
FAAP20-209ENST00000428120 UTP15Q8TED0 518 aaKnown RBP21.94■■□□□ 1.1
FAAP20-209ENST00000428120 GABARAPL1Q9H0R8 117 aa21.94■■□□□ 1.1
FAAP20-209ENST00000428120 RIBC2Q9H4K1 309 aa21.94■■□□□ 1.1
FAAP20-209ENST00000428120 J3KTA2 159 aa21.93■■□□□ 1.1
FAAP20-209ENST00000428120 PROM1O43490 865 aa21.93■■□□□ 1.1
FAAP20-209ENST00000428120 EIF2S1P05198 315 aaKnown RBP21.93■■□□□ 1.1
FAAP20-209ENST00000428120 MAOBP27338 520 aa21.93■■□□□ 1.1
FAAP20-209ENST00000428120 RAD23AP54725 363 aa21.93■■□□□ 1.1
FAAP20-209ENST00000428120 EPS8Q12929 822 aa21.93■■□□□ 1.1
FAAP20-209ENST00000428120 SIM2Q14190 667 aaPredicted RBP21.93■■□□□ 1.1
FAAP20-209ENST00000428120 DUSP7Q16829 419 aa21.93■■□□□ 1.1
FAAP20-209ENST00000428120 THAP5Q7Z6K1 395 aa21.93■■□□□ 1.1
FAAP20-209ENST00000428120 PARGQ86W56 976 aa21.93■■□□□ 1.1
FAAP20-209ENST00000428120 ATG16L2Q8NAA4 619 aa21.93■■□□□ 1.1
FAAP20-209ENST00000428120 PSMA8Q8TAA3 256 aa21.93■■□□□ 1.1
FAAP20-209ENST00000428120 GAL3ST3Q96A11 431 aa21.93■■□□□ 1.1
FAAP20-209ENST00000428120 TSC22D3Q99576 134 aa21.93■■□□□ 1.1
FAAP20-209ENST00000428120 YIPF4Q9BSR8 244 aa21.93■■□□□ 1.1
FAAP20-209ENST00000428120 GPR27Q9NS67 375 aa21.93■■□□□ 1.1
FAAP20-209ENST00000428120 KIF17Q9P2E2 1029 aa21.93■■□□□ 1.1
FAAP20-209ENST00000428120 COLQQ9Y215 455 aaPredicted RBP21.93■■□□□ 1.1
FAAP20-209ENST00000428120 FAM170BA6NMN3 283 aa21.92■■□□□ 1.1
FAAP20-209ENST00000428120 GUCY1B2O75343 617 aa21.92■■□□□ 1.1
FAAP20-209ENST00000428120 TFPTP0C1Z6 253 aa21.92■■□□□ 1.1
FAAP20-209ENST00000428120 OR12D1P0DN82 309 aa21.92■■□□□ 1.1
FAAP20-209ENST00000428120 JUNDP17535 347 aa21.92■■□□□ 1.1
FAAP20-209ENST00000428120 TYRP1P17643 537 aa21.92■■□□□ 1.1
FAAP20-209ENST00000428120 MLC1Q15049 377 aa21.92■■□□□ 1.1
FAAP20-209ENST00000428120 SLC48A1Q6P1K1 146 aa21.92■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 40.6 ms