RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000425989.5

HDLBP-211, Transcript of high density lipoprotein binding protein, humanhuman

TSL 5

Gene HDLBP, Length 530 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HDLBP-211ENST00000425989 HOXB3P14651 431 aaPredicted RBP9.07□□□□□ -0.96
HDLBP-211ENST00000425989 TCN1P20061 433 aaPredicted RBP9.07□□□□□ -0.96
HDLBP-211ENST00000425989 CERS1P27544 350 aa9.07□□□□□ -0.96
HDLBP-211ENST00000425989 SLC7A1P30825 629 aa9.07□□□□□ -0.96
HDLBP-211ENST00000425989 CHI3L1P36222 383 aaPredicted RBP9.07□□□□□ -0.96
HDLBP-211ENST00000425989 CCT3P49368 545 aaKnown RBP9.07□□□□□ -0.96
HDLBP-211ENST00000425989 PRIM2P49643 509 aa9.07□□□□□ -0.96
HDLBP-211ENST00000425989 GZMMP51124 257 aa9.07□□□□□ -0.96
HDLBP-211ENST00000425989 XKP51811 444 aa9.07□□□□□ -0.96
HDLBP-211ENST00000425989 HSD17B7P56937 341 aa9.07□□□□□ -0.96
HDLBP-211ENST00000425989 PPP1CAP62136 330 aa9.07□□□□□ -0.96
HDLBP-211ENST00000425989 CCL7P80098 99 aa9.07□□□□□ -0.96
HDLBP-211ENST00000425989 CFHR1Q03591 330 aa9.07□□□□□ -0.96
HDLBP-211ENST00000425989 SLC34A1Q06495 639 aa9.07□□□□□ -0.96
HDLBP-211ENST00000425989 TP53BP2Q13625 1128 aa9.07□□□□□ -0.96
HDLBP-211ENST00000425989 RGNQ15493 299 aa9.07□□□□□ -0.96
HDLBP-211ENST00000425989 ZNF630Q2M218 657 aaPredicted RBP9.07□□□□□ -0.96
HDLBP-211ENST00000425989 ZNF385BQ569K4 471 aa9.07□□□□□ -0.96
HDLBP-211ENST00000425989 GUSBP11Q6P575 273 aa9.07□□□□□ -0.96
HDLBP-211ENST00000425989 ZCCHC12Q6PEW1 402 aa9.07□□□□□ -0.96
HDLBP-211ENST00000425989 IFNEQ86WN2 208 aa9.07□□□□□ -0.96
HDLBP-211ENST00000425989 MSRB3Q8IXL7 192 aa9.07□□□□□ -0.96
HDLBP-211ENST00000425989 CA13Q8N1Q1 262 aa9.07□□□□□ -0.96
HDLBP-211ENST00000425989 EFCAB3Q8N7B9 438 aa9.07□□□□□ -0.96
HDLBP-211ENST00000425989 AMER3Q8N944 861 aa9.07□□□□□ -0.96
HDLBP-211ENST00000425989 OR56A1Q8NGH5 318 aa9.07□□□□□ -0.96
HDLBP-211ENST00000425989 IFI44Q8TCB0 444 aa9.07□□□□□ -0.96
HDLBP-211ENST00000425989 RHBDD1Q8TEB9 315 aa9.07□□□□□ -0.96
HDLBP-211ENST00000425989 PMM1Q92871 262 aa9.07□□□□□ -0.96
HDLBP-211ENST00000425989 NCLNQ969V3 563 aa9.07□□□□□ -0.96
HDLBP-211ENST00000425989 EXOSC8Q96B26 276 aaKnown RBP9.07□□□□□ -0.96
HDLBP-211ENST00000425989 CCDC124Q96CT7 223 aaKnown RBP9.07□□□□□ -0.96
HDLBP-211ENST00000425989 NEURL3Q96EH8 262 aa9.07□□□□□ -0.96
HDLBP-211ENST00000425989 CNDP2Q96KP4 475 aaKnown RBP9.07□□□□□ -0.96
HDLBP-211ENST00000425989 NSMCE2Q96MF7 247 aa9.07□□□□□ -0.96
HDLBP-211ENST00000425989 ZNF681Q96N22 645 aa9.07□□□□□ -0.96
HDLBP-211ENST00000425989 OR1F2PQ96R84 312 aa9.07□□□□□ -0.96
HDLBP-211ENST00000425989 GFM1Q96RP9 751 aaKnown RBP9.07□□□□□ -0.96
HDLBP-211ENST00000425989 SLC39A3Q9BRY0 314 aa9.07□□□□□ -0.96
HDLBP-211ENST00000425989 SLC35A5Q9BS91 424 aa9.07□□□□□ -0.96
HDLBP-211ENST00000425989 KLHL25Q9H0H3 589 aa9.07□□□□□ -0.96
HDLBP-211ENST00000425989 VCX3BQ9H321 246 aa9.07□□□□□ -0.96
HDLBP-211ENST00000425989 TMEM38AQ9H6F2 299 aa9.07□□□□□ -0.96
HDLBP-211ENST00000425989 OLAHQ9NV23 265 aa9.07□□□□□ -0.96
HDLBP-211ENST00000425989 ARMC1Q9NVT9 282 aa9.07□□□□□ -0.96
HDLBP-211ENST00000425989 IRAK4Q9NWZ3 460 aa9.07□□□□□ -0.96
HDLBP-211ENST00000425989 TEX10Q9NXF1 929 aaPredicted RBP9.07□□□□□ -0.96
HDLBP-211ENST00000425989 AKAP7Q9P0M2 348 aaPredicted RBP9.07□□□□□ -0.96
HDLBP-211ENST00000425989 C6orf203Q9P0P8 240 aaPredicted RBP9.07□□□□□ -0.96
HDLBP-211ENST00000425989 NTMQ9P121 344 aa9.07□□□□□ -0.96
HDLBP-211ENST00000425989 PTGFRNQ9P2B2 879 aa9.07□□□□□ -0.96
HDLBP-211ENST00000425989 RPS6KA6Q9UK32 745 aa9.07□□□□□ -0.96
HDLBP-211ENST00000425989 CLCA2Q9UQC9 943 aa9.07□□□□□ -0.96
HDLBP-211ENST00000425989 AP4S1Q9Y587 144 aa9.07□□□□□ -0.96
HDLBP-211ENST00000425989 U3KQA8 63 aa9.07□□□□□ -0.96
HDLBP-211ENST00000425989 A0A087WV62 115 aa9.06□□□□□ -0.96
HDLBP-211ENST00000425989 A0A0G2JN53 185 aa9.06□□□□□ -0.96
HDLBP-211ENST00000425989 H3BMH7 237 aa9.06□□□□□ -0.96
HDLBP-211ENST00000425989 DSCR3O14972 297 aa9.06□□□□□ -0.96
HDLBP-211ENST00000425989 CHST10O43529 356 aa9.06□□□□□ -0.96
HDLBP-211ENST00000425989 PRAMEF10O60809 474 aa9.06□□□□□ -0.96
HDLBP-211ENST00000425989 ERAL1O75616 437 aaKnown RBP9.06□□□□□ -0.96
HDLBP-211ENST00000425989 ONECUT2O95948 504 aa9.06□□□□□ -0.96
HDLBP-211ENST00000425989 GSNP06396 782 aa9.06□□□□□ -0.96
HDLBP-211ENST00000425989 FHP07954 510 aa9.06□□□□□ -0.96
HDLBP-211ENST00000425989 CD63P08962 238 aa9.06□□□□□ -0.96
HDLBP-211ENST00000425989 SLC35E2P0CK97 266 aa9.06□□□□□ -0.96
HDLBP-211ENST00000425989 SPTBP11277 2137 aa9.06□□□□□ -0.96
HDLBP-211ENST00000425989 FCGR1AP12314 374 aa9.06□□□□□ -0.96
HDLBP-211ENST00000425989 GGT1P19440 569 aa9.06□□□□□ -0.96
HDLBP-211ENST00000425989 PSMA4P25789 261 aaKnown RBP9.06□□□□□ -0.96
HDLBP-211ENST00000425989 GPC1P35052 558 aa9.06□□□□□ -0.96
HDLBP-211ENST00000425989 CDKN2CP42773 168 aa9.06□□□□□ -0.96
HDLBP-211ENST00000425989 NCBP2P52298 156 aaKnown RBP eCLIP9.06□□□□□ -0.964e-8■■■■□ 22.1
HDLBP-211ENST00000425989 POLE2P56282 527 aa9.06□□□□□ -0.96
HDLBP-211ENST00000425989 MTPNP58546 118 aa9.06□□□□□ -0.96
HDLBP-211ENST00000425989 PLIN5Q00G26 463 aa9.06□□□□□ -0.96
HDLBP-211ENST00000425989 CCNIQ14094 377 aa9.06□□□□□ -0.96
HDLBP-211ENST00000425989 SERTAD2Q14140 314 aa9.06□□□□□ -0.96
HDLBP-211ENST00000425989 CSRP2Q16527 193 aa9.06□□□□□ -0.96
HDLBP-211ENST00000425989 MPEG1Q2M385 716 aa9.06□□□□□ -0.96
HDLBP-211ENST00000425989 VMACQ2NL98 169 aa9.06□□□□□ -0.96
HDLBP-211ENST00000425989 PERM1Q5SV97 790 aa9.06□□□□□ -0.96
HDLBP-211ENST00000425989 FBXW10Q5XX13 1052 aa9.06□□□□□ -0.96
HDLBP-211ENST00000425989 SAXO2Q658L1 398 aa9.06□□□□□ -0.96
HDLBP-211ENST00000425989 C18orf63Q68DL7 685 aa9.06□□□□□ -0.96
HDLBP-211ENST00000425989 ANKRD26P1Q6NSI1 321 aa9.06□□□□□ -0.96
HDLBP-211ENST00000425989 ZNF574Q6ZN55 896 aaPredicted RBP9.06□□□□□ -0.96
HDLBP-211ENST00000425989 C6orf120Q7Z4R8 191 aa9.06□□□□□ -0.96
HDLBP-211ENST00000425989 SPATA24Q86W54 205 aa9.06□□□□□ -0.96
HDLBP-211ENST00000425989 CCDC116Q8IYX3 515 aa9.06□□□□□ -0.96
HDLBP-211ENST00000425989 CLECL1Q8IZS7 167 aa9.06□□□□□ -0.96
HDLBP-211ENST00000425989 LRRC25Q8N386 305 aaPredicted RBP9.06□□□□□ -0.96
HDLBP-211ENST00000425989 RNF148Q8N7C7 305 aa9.06□□□□□ -0.96
HDLBP-211ENST00000425989 SUMF1Q8NBK3 374 aa9.06□□□□□ -0.96
HDLBP-211ENST00000425989 C11orf65Q8NCR3 313 aa9.06□□□□□ -0.96
HDLBP-211ENST00000425989 PAPD5Q8NDF8 572 aaKnown RBP9.06□□□□□ -0.96
HDLBP-211ENST00000425989 BHLHE22Q8NFJ8 381 aaPredicted RBP9.06□□□□□ -0.96
HDLBP-211ENST00000425989 ZCCHC10Q8TBK6 192 aa9.06□□□□□ -0.96
HDLBP-211ENST00000425989 MIPOL1Q8TD10 442 aa9.06□□□□□ -0.96
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