RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000409088.3

LRRTM4-201, Transcript of leucine rich repeat transmembrane neuronal 4, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene LRRTM4, Length 3,616 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRTM4-201ENST00000409088 TSTD1Q8NFU3 115 aa3.77□□□□□ -1.81
LRRTM4-201ENST00000409088 OR2L5Q8NG80 312 aa3.77□□□□□ -1.81
LRRTM4-201ENST00000409088 RAB8BQ92930 207 aa3.77□□□□□ -1.81
LRRTM4-201ENST00000409088 ZBED6CLQ96FA7 236 aaPredicted RBP3.77□□□□□ -1.81
LRRTM4-201ENST00000409088 BBS4Q96RK4 519 aa3.77□□□□□ -1.81
LRRTM4-201ENST00000409088 FAM192AQ9GZU8 254 aa3.77□□□□□ -1.81
LRRTM4-201ENST00000409088 CLK4Q9HAZ1 481 aaKnown RBP3.77□□□□□ -1.81
LRRTM4-201ENST00000409088 PRDM7Q9NQW5 492 aa3.77□□□□□ -1.81
LRRTM4-201ENST00000409088 PRDM6Q9NQX0 595 aa3.77□□□□□ -1.81
LRRTM4-201ENST00000409088 WSB2Q9NYS7 404 aaPredicted RBP3.77□□□□□ -1.81
LRRTM4-201ENST00000409088 APOBEC3BQ9UH17 382 aaKnown RBP3.77□□□□□ -1.81
LRRTM4-201ENST00000409088 KLF15Q9UIH9 416 aa3.77□□□□□ -1.81
LRRTM4-201ENST00000409088 ADAM29Q9UKF5 820 aa3.77□□□□□ -1.81
LRRTM4-201ENST00000409088 PCOLCE2Q9UKZ9 415 aa3.77□□□□□ -1.81
LRRTM4-201ENST00000409088 RAB23Q9ULC3 237 aa3.77□□□□□ -1.81
LRRTM4-201ENST00000409088 SAMHD1Q9Y3Z3 626 aaKnown RBP3.77□□□□□ -1.81
LRRTM4-201ENST00000409088 ATG4BQ9Y4P1 393 aa3.77□□□□□ -1.81
LRRTM4-201ENST00000409088 SLCO1B1Q9Y6L6 691 aa3.77□□□□□ -1.81
LRRTM4-201ENST00000409088 AP1M2Q9Y6Q5 423 aa3.77□□□□□ -1.81
LRRTM4-201ENST00000409088 ARHGEF17Q96PE2 2063 aaPredicted RBP3.77□□□□□ -1.81
LRRTM4-201ENST00000409088 A0A0A6YYD5 115 aa3.77□□□□□ -1.81
LRRTM4-201ENST00000409088 A0A0J9YVX5 310 aa3.77□□□□□ -1.81
LRRTM4-201ENST00000409088 A6NCN8 305 aa3.77□□□□□ -1.81
LRRTM4-201ENST00000409088 MAN2B1O00754 1011 aa3.77□□□□□ -1.81
LRRTM4-201ENST00000409088 PRAMEF10O60809 474 aa3.77□□□□□ -1.81
LRRTM4-201ENST00000409088 MITFO75030 526 aaPredicted RBP3.77□□□□□ -1.81
LRRTM4-201ENST00000409088 C8orf89P0DMQ9 161 aa3.77□□□□□ -1.81
LRRTM4-201ENST00000409088 HOXB6P17509 224 aaKnown RBP3.77□□□□□ -1.81
LRRTM4-201ENST00000409088 DDX5P17844 614 aaKnown RBP3.77□□□□□ -1.81
LRRTM4-201ENST00000409088 ATP5A1P25705 553 aaKnown RBP3.77□□□□□ -1.81
LRRTM4-201ENST00000409088 CERS1P27544 350 aa3.77□□□□□ -1.81
LRRTM4-201ENST00000409088 CCT3P49368 545 aaKnown RBP3.77□□□□□ -1.81
LRRTM4-201ENST00000409088 PRKAG1P54619 331 aa3.77□□□□□ -1.81
LRRTM4-201ENST00000409088 DSTNP60981 165 aa3.77□□□□□ -1.81
LRRTM4-201ENST00000409088 SELENOWP63302 87 aa3.77□□□□□ -1.81
LRRTM4-201ENST00000409088 BTN3A2P78410 334 aa3.77□□□□□ -1.81
LRRTM4-201ENST00000409088 KCNJ10P78508 379 aa3.77□□□□□ -1.81
LRRTM4-201ENST00000409088 PPP2R2BQ00005 443 aa3.77□□□□□ -1.81
LRRTM4-201ENST00000409088 RBBP4Q09028 425 aa3.77□□□□□ -1.81
LRRTM4-201ENST00000409088 KCNAB2Q13303 367 aa3.77□□□□□ -1.81
LRRTM4-201ENST00000409088 ZNF750Q32MQ0 723 aa3.77□□□□□ -1.81
LRRTM4-201ENST00000409088 FBXO42Q6P3S6 717 aa3.77□□□□□ -1.81
LRRTM4-201ENST00000409088 ABI3BPQ7Z7G0 1075 aa3.77□□□□□ -1.81
LRRTM4-201ENST00000409088 GALNT5Q7Z7M9 940 aa3.77□□□□□ -1.81
LRRTM4-201ENST00000409088 PAQR7Q86WK9 346 aa3.77□□□□□ -1.81
LRRTM4-201ENST00000409088 DCP2Q8IU60 420 aaKnown RBP3.77□□□□□ -1.81
LRRTM4-201ENST00000409088 NATD1Q8N6N6 113 aa3.77□□□□□ -1.81
LRRTM4-201ENST00000409088 METTL25Q8N6Q8 603 aa3.77□□□□□ -1.81
LRRTM4-201ENST00000409088 HORMAD2Q8N7B1 307 aa3.77□□□□□ -1.81
LRRTM4-201ENST00000409088 MFSD9Q8NBP5 474 aa3.77□□□□□ -1.81
LRRTM4-201ENST00000409088 ZNF555Q8NEP9 628 aa3.77□□□□□ -1.81
LRRTM4-201ENST00000409088 SLC22A18Q96BI1 424 aa3.77□□□□□ -1.81
LRRTM4-201ENST00000409088 KCNC2Q96PR1 638 aa3.77□□□□□ -1.81
LRRTM4-201ENST00000409088 DOHHQ9BU89 302 aa3.77□□□□□ -1.81
LRRTM4-201ENST00000409088 FAIM2Q9BWQ8 316 aa3.77□□□□□ -1.81
LRRTM4-201ENST00000409088 ING2Q9H160 280 aa3.77□□□□□ -1.81
LRRTM4-201ENST00000409088 RAD21L1Q9H4I0 556 aa3.77□□□□□ -1.81
LRRTM4-201ENST00000409088 TM9SF3Q9HD45 589 aa3.77□□□□□ -1.81
LRRTM4-201ENST00000409088 SLC35C2Q9NQQ7 365 aa3.77□□□□□ -1.81
LRRTM4-201ENST00000409088 PDP1Q9P0J1 537 aaPredicted RBP3.77□□□□□ -1.81
LRRTM4-201ENST00000409088 IFT80Q9P2H3 777 aaPredicted RBP3.77□□□□□ -1.81
LRRTM4-201ENST00000409088 CPNE7Q9UBL6 633 aa3.77□□□□□ -1.81
LRRTM4-201ENST00000409088 SH3GLB1Q9Y371 365 aa3.77□□□□□ -1.81
LRRTM4-201ENST00000409088 ORC6Q9Y5N6 252 aa3.77□□□□□ -1.81
LRRTM4-201ENST00000409088 GMEB1Q9Y692 573 aa3.77□□□□□ -1.81
LRRTM4-201ENST00000409088 TNRC18O15417 2968 aaPredicted RBP3.77□□□□□ -1.81
LRRTM4-201ENST00000409088 SPTY2D1-AS1A0A0U1RR47 76 aa3.77□□□□□ -1.81
LRRTM4-201ENST00000409088 A0A1W2PR48 441 aa3.77□□□□□ -1.81
LRRTM4-201ENST00000409088 C5orf58C9J3I9 102 aa3.77□□□□□ -1.81
LRRTM4-201ENST00000409088 H0YAE9 185 aa3.77□□□□□ -1.81
LRRTM4-201ENST00000409088 TBX19O60806 448 aa3.77□□□□□ -1.81
LRRTM4-201ENST00000409088 EIF2S1P05198 315 aaKnown RBP3.77□□□□□ -1.81
LRRTM4-201ENST00000409088 PABPC4LP0CB38 370 aaKnown RBP3.77□□□□□ -1.81
LRRTM4-201ENST00000409088 DRD2P14416 443 aa3.77□□□□□ -1.81
LRRTM4-201ENST00000409088 PVRP15151 417 aa3.77□□□□□ -1.81
LRRTM4-201ENST00000409088 MAOBP27338 520 aa3.77□□□□□ -1.81
LRRTM4-201ENST00000409088 ELK4P28324 431 aa3.77□□□□□ -1.81
LRRTM4-201ENST00000409088 CD6P30203 668 aa3.77□□□□□ -1.81
LRRTM4-201ENST00000409088 DNAJA1P31689 397 aaKnown RBP3.77□□□□□ -1.81
LRRTM4-201ENST00000409088 PIGAP37287 484 aa3.77□□□□□ -1.81
LRRTM4-201ENST00000409088 FEN1P39748 380 aaKnown RBP3.77□□□□□ -1.81
LRRTM4-201ENST00000409088 PEX19P40855 299 aa3.77□□□□□ -1.81
LRRTM4-201ENST00000409088 CCR5P51681 352 aa3.77□□□□□ -1.81
LRRTM4-201ENST00000409088 NCBP2P52298 156 aaKnown RBP eCLIP3.77□□□□□ -1.81
LRRTM4-201ENST00000409088 RAD23AP54725 363 aa3.77□□□□□ -1.81
LRRTM4-201ENST00000409088 NR1H2P55055 460 aa3.77□□□□□ -1.81
LRRTM4-201ENST00000409088 PCBP4P57723 403 aaKnown RBP3.77□□□□□ -1.81
LRRTM4-201ENST00000409088 STXBP1P61764 594 aaKnown RBP3.77□□□□□ -1.81
LRRTM4-201ENST00000409088 TRA2BP62995 288 aaKnown RBP3.77□□□□□ -1.81
LRRTM4-201ENST00000409088 EIF2B5Q13144 721 aaKnown RBP3.77□□□□□ -1.81
LRRTM4-201ENST00000409088 APOFQ13790 326 aa3.77□□□□□ -1.81
LRRTM4-201ENST00000409088 KIR2DS3Q14952 304 aa3.77□□□□□ -1.81
LRRTM4-201ENST00000409088 ZNF630Q2M218 657 aaPredicted RBP3.77□□□□□ -1.81
LRRTM4-201ENST00000409088 ADPRMQ3LIE5 342 aa3.77□□□□□ -1.81
LRRTM4-201ENST00000409088 LRIT3Q3SXY7 679 aa3.77□□□□□ -1.81
LRRTM4-201ENST00000409088 TTC23Q5W5X9 447 aa3.77□□□□□ -1.81
LRRTM4-201ENST00000409088 C18orf63Q68DL7 685 aa3.77□□□□□ -1.81
LRRTM4-201ENST00000409088 SHQ1Q6PI26 577 aaKnown RBP3.77□□□□□ -1.81
LRRTM4-201ENST00000409088 FIGLAQ6QHK4 219 aa3.77□□□□□ -1.81
LRRTM4-201ENST00000409088 RBM44Q6ZP01 1051 aaKnown RBP3.77□□□□□ -1.81
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 31 ms