RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000403441.1

PRAME-204, Transcript of preferentially expressed antigen in melanoma, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 3

Gene PRAME, Length 567 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRAME-204ENST00000403441 ANKZF1Q9H8Y5 726 aa11.45□□□□□ -0.58
PRAME-204ENST00000403441 COPS7BQ9H9Q2 264 aaPredicted RBP11.45□□□□□ -0.58
PRAME-204ENST00000403441 PNPLA3Q9NST1 481 aa11.45□□□□□ -0.58
PRAME-204ENST00000403441 DNAJC11Q9NVH1 559 aa11.45□□□□□ -0.58
PRAME-204ENST00000403441 ZNF407Q9C0G0 2248 aa11.44□□□□□ -0.58
PRAME-204ENST00000403441 PHF3Q92576 2039 aaKnown RBP11.44□□□□□ -0.58
PRAME-204ENST00000403441 A0A0G2JMM0 328 aa11.44□□□□□ -0.58
PRAME-204ENST00000403441 A0A0G2JN53 185 aa11.44□□□□□ -0.58
PRAME-204ENST00000403441 A0A1W2PPB8 328 aa11.44□□□□□ -0.58
PRAME-204ENST00000403441 A0A1W2PRS3 328 aa11.44□□□□□ -0.58
PRAME-204ENST00000403441 PINLYPA6NC86 204 aa11.44□□□□□ -0.58
PRAME-204ENST00000403441 NCF1BA6NI72 391 aaPredicted RBP11.44□□□□□ -0.58
PRAME-204ENST00000403441 NCF1CA8MVU1 366 aaPredicted RBP11.44□□□□□ -0.58
PRAME-204ENST00000403441 KIR3DP1A8MWS1 328 aa11.44□□□□□ -0.58
PRAME-204ENST00000403441 FAM47E-STBD1D6RA91 191 aa11.44□□□□□ -0.58
PRAME-204ENST00000403441 UBXN8O00124 270 aa11.44□□□□□ -0.58
PRAME-204ENST00000403441 WWP2O00308 870 aa11.44□□□□□ -0.58
PRAME-204ENST00000403441 PRKNO60260 465 aaPredicted RBP11.44□□□□□ -0.58
PRAME-204ENST00000403441 DIAPH2O60879 1101 aa11.44□□□□□ -0.58
PRAME-204ENST00000403441 NCF1P14598 390 aaPredicted RBP11.44□□□□□ -0.58
PRAME-204ENST00000403441 CD22P20273 847 aa11.44□□□□□ -0.58
PRAME-204ENST00000403441 TYK2P29597 1187 aa11.44□□□□□ -0.58
PRAME-204ENST00000403441 DNAJA1P31689 397 aaKnown RBP11.44□□□□□ -0.58
PRAME-204ENST00000403441 HNRNPH1P31943 449 aaKnown RBP11.44□□□□□ -0.58
PRAME-204ENST00000403441 SOX3P41225 446 aa11.44□□□□□ -0.58
PRAME-204ENST00000403441 MSH2P43246 934 aa11.44□□□□□ -0.58
PRAME-204ENST00000403441 HSPA7P48741 367 aa11.44□□□□□ -0.58
PRAME-204ENST00000403441 GPR143P51810 404 aa11.44□□□□□ -0.58
PRAME-204ENST00000403441 FOLH1Q04609 750 aa11.44□□□□□ -0.58
PRAME-204ENST00000403441 RUNX2Q13950 521 aa11.44□□□□□ -0.58
PRAME-204ENST00000403441 SLBPQ14493 270 aaKnown RBP eCLIP11.44□□□□□ -0.58
PRAME-204ENST00000403441 SLC29A2Q14542 456 aa11.44□□□□□ -0.58
PRAME-204ENST00000403441 SETDB1Q15047 1291 aa11.44□□□□□ -0.58
PRAME-204ENST00000403441 UAP1Q16222 522 aaPredicted RBP11.44□□□□□ -0.58
PRAME-204ENST00000403441 ADPRMQ3LIE5 342 aa11.44□□□□□ -0.58
PRAME-204ENST00000403441 GXYLT1Q4G148 440 aa11.44□□□□□ -0.58
PRAME-204ENST00000403441 XKR6Q5GH73 641 aa11.44□□□□□ -0.58
PRAME-204ENST00000403441 ZNF585AQ6P3V2 769 aa11.44□□□□□ -0.58
PRAME-204ENST00000403441 TRIM40Q6P9F5 258 aa11.44□□□□□ -0.58
PRAME-204ENST00000403441 B3GNT6Q6ZMB0 384 aa11.44□□□□□ -0.58
PRAME-204ENST00000403441 C16orf47Q6ZP98 133 aaPredicted RBP11.44□□□□□ -0.58
PRAME-204ENST00000403441 CLNKQ7Z7G1 428 aa11.44□□□□□ -0.58
PRAME-204ENST00000403441 CNPY4Q8N129 248 aa11.44□□□□□ -0.58
PRAME-204ENST00000403441 KRT78Q8N1N4 520 aa11.44□□□□□ -0.58
PRAME-204ENST00000403441 FAM109AQ8N4B1 249 aa11.44□□□□□ -0.58
PRAME-204ENST00000403441 TMEM151AQ8N4L1 468 aa11.44□□□□□ -0.58
PRAME-204ENST00000403441 CHDHQ8NE62 594 aaPredicted RBP11.44□□□□□ -0.58
PRAME-204ENST00000403441 MZB1Q8WU39 189 aa11.44□□□□□ -0.58
PRAME-204ENST00000403441 ESAMQ96AP7 390 aa11.44□□□□□ -0.58
PRAME-204ENST00000403441 MS4A6EQ96DS6 147 aa11.44□□□□□ -0.58
PRAME-204ENST00000403441 MRRFQ96E11 262 aaKnown RBP11.44□□□□□ -0.58
PRAME-204ENST00000403441 RASL10BQ96S79 203 aa11.44□□□□□ -0.58
PRAME-204ENST00000403441 LIN28AQ9H9Z2 209 aaKnown RBP11.44□□□□□ -0.58
PRAME-204ENST00000403441 WWOXQ9NZC7 414 aa11.44□□□□□ -0.58
PRAME-204ENST00000403441 CD274Q9NZQ7 290 aa11.44□□□□□ -0.58
PRAME-204ENST00000403441 DNAJC13O75165 2243 aa11.44□□□□□ -0.58
PRAME-204ENST00000403441 EXOC1LA0A1B0GW35 172 aa11.43□□□□□ -0.58
PRAME-204ENST00000403441 LRIT2A6NDA9 550 aa11.43□□□□□ -0.58
PRAME-204ENST00000403441 ANKDD1BA6NHY2 528 aa11.43□□□□□ -0.58
PRAME-204ENST00000403441 SYCE1LA8MT33 242 aa11.43□□□□□ -0.58
PRAME-204ENST00000403441 G3V3Y1 287 aa11.43□□□□□ -0.58
PRAME-204ENST00000403441 TGFBR3LH3BV60 316 aa11.43□□□□□ -0.58
PRAME-204ENST00000403441 K7EPI3 171 aa11.43□□□□□ -0.58
PRAME-204ENST00000403441 GLSO94925 669 aaPredicted RBP11.43□□□□□ -0.58
PRAME-204ENST00000403441 IGHG3P01860 377 aa11.43□□□□□ -0.58
PRAME-204ENST00000403441 SBK3P0C264 359 aa11.43□□□□□ -0.58
PRAME-204ENST00000403441 CD99P14209 185 aa11.43□□□□□ -0.58
PRAME-204ENST00000403441 HNRNPFP52597 415 aaKnown RBP11.43□□□□□ -0.58
PRAME-204ENST00000403441 PLA2G16P53816 162 aa11.43□□□□□ -0.58
PRAME-204ENST00000403441 ALDH18A1P54886 795 aaKnown RBP11.43□□□□□ -0.58
PRAME-204ENST00000403441 TGM3Q08188 693 aa11.43□□□□□ -0.58
PRAME-204ENST00000403441 STX4Q12846 297 aa11.43□□□□□ -0.58
PRAME-204ENST00000403441 RASA2Q15283 850 aa11.43□□□□□ -0.58
PRAME-204ENST00000403441 PCBP2Q15366 365 aaKnown RBP eCLIP11.43□□□□□ -0.58
PRAME-204ENST00000403441 PDK4Q16654 411 aa11.43□□□□□ -0.58
PRAME-204ENST00000403441 SLC25A35Q3KQZ1 300 aa11.43□□□□□ -0.58
PRAME-204ENST00000403441 FBXO48Q5FWF7 155 aa11.43□□□□□ -0.58
PRAME-204ENST00000403441 FAM47EQ6ZV65 393 aa11.43□□□□□ -0.58
PRAME-204ENST00000403441 TAOK1Q7L7X3 1001 aa11.43□□□□□ -0.58
PRAME-204ENST00000403441 VN1R5Q7Z5H4 357 aa11.43□□□□□ -0.58
PRAME-204ENST00000403441 GSPT2Q8IYD1 628 aaKnown RBP11.43□□□□□ -0.58
PRAME-204ENST00000403441 GOLM1Q8NBJ4 401 aa11.43□□□□□ -0.58
PRAME-204ENST00000403441 MORN4Q8NDC4 146 aa11.43□□□□□ -0.58
PRAME-204ENST00000403441 TMEM52Q8NDY8 209 aa11.43□□□□□ -0.58
PRAME-204ENST00000403441 OR2L5Q8NG80 312 aa11.43□□□□□ -0.58
PRAME-204ENST00000403441 OR14A16Q8NHC5 309 aa11.43□□□□□ -0.58
PRAME-204ENST00000403441 SREK1Q8WXA9 508 aaKnown RBP11.43□□□□□ -0.58
PRAME-204ENST00000403441 NINJ1Q92982 152 aa11.43□□□□□ -0.58
PRAME-204ENST00000403441 PTCD3Q96EY7 689 aaKnown RBP11.43□□□□□ -0.58
PRAME-204ENST00000403441 POM121Q96HA1 1249 aa11.43□□□□□ -0.58
PRAME-204ENST00000403441 SGCZQ96LD1 299 aa11.43□□□□□ -0.58
PRAME-204ENST00000403441 SERINC2Q96SA4 455 aa11.43□□□□□ -0.58
PRAME-204ENST00000403441 TTYH2Q9BSA4 534 aa11.43□□□□□ -0.58
PRAME-204ENST00000403441 EFCAB11Q9BUY7 163 aa11.43□□□□□ -0.58
PRAME-204ENST00000403441 OR8D2Q9GZM6 311 aa11.43□□□□□ -0.58
PRAME-204ENST00000403441 REXO4Q9GZR2 422 aaKnown RBP11.43□□□□□ -0.58
PRAME-204ENST00000403441 IL1RL2Q9HB29 575 aa11.43□□□□□ -0.58
PRAME-204ENST00000403441 COPS7AQ9UBW8 275 aa11.43□□□□□ -0.58
PRAME-204ENST00000403441 ACAD8Q9UKU7 415 aa11.43□□□□□ -0.58
PRAME-204ENST00000403441 ZNF490Q9ULM2 529 aaPredicted RBP11.43□□□□□ -0.58
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 20.4 ms