RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000397396.5

TSPAN4-202, Transcript of tetraspanin 4, humanhuman

TSL 5 BASIC

Gene TSPAN4, Length 1,332 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TSPAN4-202ENST00000397396 FBP2O00757 339 aa22.18■■□□□ 1.14
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TSPAN4-202ENST00000397396 PGRMC2O15173 223 aa22.18■■□□□ 1.14
TSPAN4-202ENST00000397396 CTNSO60931 367 aa22.18■■□□□ 1.14
TSPAN4-202ENST00000397396 DNAJB6O75190 326 aa22.18■■□□□ 1.14
TSPAN4-202ENST00000397396 ERN1O75460 977 aaKnown RBP22.18■■□□□ 1.14
TSPAN4-202ENST00000397396 GPR75O95800 540 aa22.18■■□□□ 1.14
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TSPAN4-202ENST00000397396 ITGAXP20702 1163 aa22.18■■□□□ 1.14
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TSPAN4-202ENST00000397396 C6orf10Q5SRN2 563 aa22.18■■□□□ 1.14
TSPAN4-202ENST00000397396 SLC38A9Q8NBW4 561 aa22.18■■□□□ 1.14
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TSPAN4-202ENST00000397396 PTPRZ1P23471 2315 aaPredicted RBP22.18■■□□□ 1.14
TSPAN4-202ENST00000397396 C15orf38-AP3S2A0A0A6YYH1 394 aa22.17■■□□□ 1.14
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TSPAN4-202ENST00000397396 SLC2A7Q6PXP3 512 aa22.17■■□□□ 1.14
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TSPAN4-202ENST00000397396 DHDDSQ86SQ9 333 aa22.17■■□□□ 1.14
TSPAN4-202ENST00000397396 LRRC25Q8N386 305 aaPredicted RBP22.17■■□□□ 1.14
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TSPAN4-202ENST00000397396 PANX1Q96RD7 426 aa22.17■■□□□ 1.14
TSPAN4-202ENST00000397396 C5AR2Q9P296 337 aa22.17■■□□□ 1.14
TSPAN4-202ENST00000397396 A0A096LPI6 279 aa22.16■■□□□ 1.14
TSPAN4-202ENST00000397396 MYO1GB0I1T2 1018 aa22.16■■□□□ 1.14
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TSPAN4-202ENST00000397396 FAM117AQ9C073 453 aa22.16■■□□□ 1.14
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TSPAN4-202ENST00000397396 ERICH4A6NGS2 130 aa22.15■■□□□ 1.14
TSPAN4-202ENST00000397396 C9orf172C9J069 976 aa22.15■■□□□ 1.14
TSPAN4-202ENST00000397396 FAM227AF5H4B4 570 aa22.15■■□□□ 1.14
TSPAN4-202ENST00000397396 NVLO15381 856 aaKnown RBP22.15■■□□□ 1.14
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TSPAN4-202ENST00000397396 PORP16435 677 aaPredicted RBP22.15■■□□□ 1.14
TSPAN4-202ENST00000397396 RBMS1P29558 406 aaKnown RBP22.15■■□□□ 1.14
TSPAN4-202ENST00000397396 XKP51811 444 aa22.15■■□□□ 1.14
TSPAN4-202ENST00000397396 NCBP2P52298 156 aaKnown RBP eCLIP22.15■■□□□ 1.148e-7■■■□□ 17.1
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TSPAN4-202ENST00000397396 CNRIP1Q96F85 164 aaPredicted RBP22.15■■□□□ 1.14
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TSPAN4-202ENST00000397396 SEMA3GQ9NS98 782 aa22.15■■□□□ 1.14
TSPAN4-202ENST00000397396 TAS2R9Q9NYW1 312 aa22.15■■□□□ 1.14
TSPAN4-202ENST00000397396 CROTQ9UKG9 612 aa22.15■■□□□ 1.14
TSPAN4-202ENST00000397396 VPS4AQ9UN37 437 aa22.15■■□□□ 1.14
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