RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000390897.1

RNU6-127P-201, Transcript of RNA, U6 small nuclear 127, pseudogene, humanhuman

BASIC

Gene RNU6-127P, Length 107 nt, Biotype snRNA.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNU6-127P-201ENST00000390897 GOT2P00505 430 aaKnown RBP0.05□□□□□ -2.4
RNU6-127P-201ENST00000390897 CD4P01730 458 aa0.05□□□□□ -2.4
RNU6-127P-201ENST00000390897 IGHV3-23P01764 117 aa0.05□□□□□ -2.4
RNU6-127P-201ENST00000390897 MT-ND2P03891 347 aa0.05□□□□□ -2.4
RNU6-127P-201ENST00000390897 GBAP04062 536 aa0.05□□□□□ -2.4
RNU6-127P-201ENST00000390897 CSF2P04141 144 aa0.05□□□□□ -2.4
RNU6-127P-201ENST00000390897 CLEC3BP05452 202 aa0.05□□□□□ -2.4
RNU6-127P-201ENST00000390897 CENPBP07199 599 aaPredicted RBP0.05□□□□□ -2.4
RNU6-127P-201ENST00000390897 CLTBP09497 229 aa0.05□□□□□ -2.4
RNU6-127P-201ENST00000390897 RHOXF2BP0C7M4 288 aa0.05□□□□□ -2.4
RNU6-127P-201ENST00000390897 CISD3P0C7P0 127 aa0.05□□□□□ -2.4
RNU6-127P-201ENST00000390897 UQCRFS1P1P0C7P4 283 aa0.05□□□□□ -2.4
RNU6-127P-201ENST00000390897 PNMA6AP0CW24 399 aaPredicted RBP0.05□□□□□ -2.4
RNU6-127P-201ENST00000390897 CT45A10P0DMU9 189 aa0.05□□□□□ -2.4
RNU6-127P-201ENST00000390897 PPIAL4FP0DN26 164 aa0.05□□□□□ -2.4
RNU6-127P-201ENST00000390897 PRB4P10163 310 aaPredicted RBP0.05□□□□□ -2.4
RNU6-127P-201ENST00000390897 LAMP1P11279 417 aa0.05□□□□□ -2.4
RNU6-127P-201ENST00000390897 F3P13726 295 aa0.05□□□□□ -2.4
RNU6-127P-201ENST00000390897 PVRP15151 417 aa0.05□□□□□ -2.4
RNU6-127P-201ENST00000390897 FOSL2P15408 326 aa0.05□□□□□ -2.4
RNU6-127P-201ENST00000390897 PFKFB1P16118 471 aa0.05□□□□□ -2.4
RNU6-127P-201ENST00000390897 EPCAMP16422 314 aa0.05□□□□□ -2.4
RNU6-127P-201ENST00000390897 ALOX12P18054 663 aa0.05□□□□□ -2.4
RNU6-127P-201ENST00000390897 GABRB1P18505 474 aa0.05□□□□□ -2.4
RNU6-127P-201ENST00000390897 CELP19835 753 aa0.05□□□□□ -2.4
RNU6-127P-201ENST00000390897 UQCRC2P22695 453 aa0.05□□□□□ -2.4
RNU6-127P-201ENST00000390897 GLRA1P23415 457 aa0.05□□□□□ -2.4
RNU6-127P-201ENST00000390897 DNASE1P24855 282 aa0.05□□□□□ -2.4
RNU6-127P-201ENST00000390897 CNTFP26441 200 aa0.05□□□□□ -2.4
RNU6-127P-201ENST00000390897 CD27P26842 260 aa0.05□□□□□ -2.4
RNU6-127P-201ENST00000390897 CD1BP29016 333 aa0.05□□□□□ -2.4
RNU6-127P-201ENST00000390897 PTPN4P29074 926 aa0.05□□□□□ -2.4
RNU6-127P-201ENST00000390897 SSTR1P30872 391 aa0.05□□□□□ -2.4
RNU6-127P-201ENST00000390897 NTSP30990 170 aa0.05□□□□□ -2.4
RNU6-127P-201ENST00000390897 MAPK4P31152 587 aa0.05□□□□□ -2.4
RNU6-127P-201ENST00000390897 ICAM3P32942 547 aa0.05□□□□□ -2.4
RNU6-127P-201ENST00000390897 NF2P35240 595 aa0.05□□□□□ -2.4
RNU6-127P-201ENST00000390897 HSD17B3P37058 310 aa0.05□□□□□ -2.4
RNU6-127P-201ENST00000390897 HADHAP40939 763 aa0.05□□□□□ -2.4
RNU6-127P-201ENST00000390897 RPS10P46783 165 aaKnown RBP0.05□□□□□ -2.4
RNU6-127P-201ENST00000390897 NRIP1P48552 1158 aa0.05□□□□□ -2.4
RNU6-127P-201ENST00000390897 TRAPPC10P48553 1259 aa0.05□□□□□ -2.4
RNU6-127P-201ENST00000390897 PSMD8P48556 350 aa0.05□□□□□ -2.4
RNU6-127P-201ENST00000390897 CCT5P48643 541 aa0.05□□□□□ -2.4
RNU6-127P-201ENST00000390897 LHX1P48742 406 aa0.05□□□□□ -2.4
RNU6-127P-201ENST00000390897 CCR9P51686 369 aa0.05□□□□□ -2.4
RNU6-127P-201ENST00000390897 EFNA3P52797 238 aa0.05□□□□□ -2.4
RNU6-127P-201ENST00000390897 MRPL12P52815 198 aaKnown RBP0.05□□□□□ -2.4
RNU6-127P-201ENST00000390897 NAGLUP54802 743 aa0.05□□□□□ -2.4
RNU6-127P-201ENST00000390897 CASP6P55212 293 aa0.05□□□□□ -2.4
RNU6-127P-201ENST00000390897 CDH8P55286 799 aa0.05□□□□□ -2.4
RNU6-127P-201ENST00000390897 SH3BGRP55822 239 aaPredicted RBP0.05□□□□□ -2.4
RNU6-127P-201ENST00000390897 NUP107P57740 925 aa0.05□□□□□ -2.4
RNU6-127P-201ENST00000390897 KRTAP12-1P59990 96 aa0.05□□□□□ -2.4
RNU6-127P-201ENST00000390897 BTG1P62324 171 aa0.05□□□□□ -2.4
RNU6-127P-201ENST00000390897 CACNG7P62955 275 aa0.05□□□□□ -2.4
RNU6-127P-201ENST00000390897 ADARB1P78563 741 aaKnown RBP0.05□□□□□ -2.4
RNU6-127P-201ENST00000390897 FLI1Q01543 452 aaPredicted RBP0.05□□□□□ -2.4
RNU6-127P-201ENST00000390897 OC90Q02509 493 aaPredicted RBP0.05□□□□□ -2.4
RNU6-127P-201ENST00000390897 SULT2A1Q06520 285 aa0.05□□□□□ -2.4
RNU6-127P-201ENST00000390897 CXCL9Q07325 125 aa0.05□□□□□ -2.4
RNU6-127P-201ENST00000390897 IL10RBQ08334 325 aa0.05□□□□□ -2.4
RNU6-127P-201ENST00000390897 KLHL30Q0D2K2 578 aa0.05□□□□□ -2.4
RNU6-127P-201ENST00000390897 CNTN1Q12860 1018 aa0.05□□□□□ -2.4
RNU6-127P-201ENST00000390897 DAZ2Q13117 558 aaKnown RBP0.05□□□□□ -2.4
RNU6-127P-201ENST00000390897 AIMP2Q13155 320 aaKnown RBP0.05□□□□□ -2.4
RNU6-127P-201ENST00000390897 BIRC3Q13489 604 aa0.05□□□□□ -2.4
RNU6-127P-201ENST00000390897 ARFRP1Q13795 201 aa0.05□□□□□ -2.4
RNU6-127P-201ENST00000390897 BECN1Q14457 450 aa0.05□□□□□ -2.4
RNU6-127P-201ENST00000390897 ELAVL3Q14576 367 aaKnown RBP0.05□□□□□ -2.4
RNU6-127P-201ENST00000390897 EMC2Q15006 297 aa0.05□□□□□ -2.4
RNU6-127P-201ENST00000390897 KRT31Q15323 416 aa0.05□□□□□ -2.4
RNU6-127P-201ENST00000390897 NSDHLQ15738 373 aa0.05□□□□□ -2.4
RNU6-127P-201ENST00000390897 TBCEQ15813 527 aaPredicted RBP0.05□□□□□ -2.4
RNU6-127P-201ENST00000390897 SNAPC1Q16533 368 aa0.05□□□□□ -2.4
RNU6-127P-201ENST00000390897 CCL14Q16627 93 aa0.05□□□□□ -2.4
RNU6-127P-201ENST00000390897 UBE2SQ16763 222 aa0.05□□□□□ -2.4
RNU6-127P-201ENST00000390897 C17orf58Q2M2W7 97 aa0.05□□□□□ -2.4
RNU6-127P-201ENST00000390897 C15orf59Q2T9L4 293 aaPredicted RBP0.05□□□□□ -2.4
RNU6-127P-201ENST00000390897 DEFB116Q30KQ4 102 aa0.05□□□□□ -2.4
RNU6-127P-201ENST00000390897 ANKRD55Q3KP44 614 aa0.05□□□□□ -2.4
RNU6-127P-201ENST00000390897 GLYR1Q49A26 553 aaPredicted RBP0.05□□□□□ -2.4
RNU6-127P-201ENST00000390897 LRRC37A5PQ49AS3 106 aa0.05□□□□□ -2.4
RNU6-127P-201ENST00000390897 COX19Q49B96 90 aa0.05□□□□□ -2.4
RNU6-127P-201ENST00000390897 KRTAP13-2Q52LG2 175 aa0.05□□□□□ -2.4
RNU6-127P-201ENST00000390897 LINC00483Q53H64 154 aa0.05□□□□□ -2.4
RNU6-127P-201ENST00000390897 ZNF789Q5FWF6 425 aa0.05□□□□□ -2.4
RNU6-127P-201ENST00000390897 NHSL2Q5HYW2 709 aa0.05□□□□□ -2.4
RNU6-127P-201ENST00000390897 SLC10A5Q5PT55 438 aa0.05□□□□□ -2.4
RNU6-127P-201ENST00000390897 ACER2Q5QJU3 275 aa0.05□□□□□ -2.4
RNU6-127P-201ENST00000390897 RABGAP1LQ5R372 815 aa0.05□□□□□ -2.4
RNU6-127P-201ENST00000390897 LY6G6FQ5SQ64 297 aa0.05□□□□□ -2.4
RNU6-127P-201ENST00000390897 TEX35Q5T0J7 233 aa0.05□□□□□ -2.4
RNU6-127P-201ENST00000390897 RNASEH2BQ5TBB1 312 aaKnown RBP0.05□□□□□ -2.4
RNU6-127P-201ENST00000390897 C1orf189Q5VU69 101 aa0.05□□□□□ -2.4
RNU6-127P-201ENST00000390897 RAET1LQ5VY80 246 aa0.05□□□□□ -2.4
RNU6-127P-201ENST00000390897 MEDAGQ5VYS4 303 aa0.05□□□□□ -2.4
RNU6-127P-201ENST00000390897 ZNF57Q68EA5 555 aaPredicted RBP0.05□□□□□ -2.4
RNU6-127P-201ENST00000390897 KIAA0930Q6ICG6 404 aaPredicted RBP0.05□□□□□ -2.4
RNU6-127P-201ENST00000390897 TMEM211Q6ICI0 200 aa0.05□□□□□ -2.4
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 26.4 ms