RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000346562.6

NPAS3-201, Transcript of neuronal PAS domain protein 3, humanhuman

APPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC

Gene NPAS3, Length 5,847 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NPAS3-201ENST00000346562 LATS1O95835 1130 aa22.18■■□□□ 1.14
NPAS3-201ENST00000346562 FXYD6P3P58550 94 aa22.18■■□□□ 1.14
NPAS3-201ENST00000346562 CD83Q01151 205 aa22.18■■□□□ 1.14
NPAS3-201ENST00000346562 PCLAFQ15004 111 aa22.18■■□□□ 1.14
NPAS3-201ENST00000346562 KLHDC10Q6PID8 442 aa22.18■■□□□ 1.14
NPAS3-201ENST00000346562 POGLUT1Q8NBL1 392 aa22.18■■□□□ 1.14
NPAS3-201ENST00000346562 OR13C3Q8NGS6 347 aa22.18■■□□□ 1.14
NPAS3-201ENST00000346562 ZUFSPQ96AP4 578 aa22.18■■□□□ 1.14
NPAS3-201ENST00000346562 KLHL15Q96M94 604 aa22.18■■□□□ 1.14
NPAS3-201ENST00000346562 IFNGR1P15260 489 aa22.17■■□□□ 1.14
NPAS3-201ENST00000346562 FADDQ13158 208 aa22.17■■□□□ 1.14
NPAS3-201ENST00000346562 GINS1Q14691 196 aa22.17■■□□□ 1.14
NPAS3-201ENST00000346562 HSD17B12Q53GQ0 312 aa22.17■■□□□ 1.14
NPAS3-201ENST00000346562 LRRN1Q6UXK5 716 aa22.17■■□□□ 1.14
NPAS3-201ENST00000346562 GALNT12Q8IXK2 581 aa22.17■■□□□ 1.14
NPAS3-201ENST00000346562 GPR137CQ8N3F9 429 aa22.17■■□□□ 1.14
NPAS3-201ENST00000346562 FOXJ1Q92949 421 aa22.17■■□□□ 1.14
NPAS3-201ENST00000346562 OSBPL7Q9BZF2 842 aa22.17■■□□□ 1.14
NPAS3-201ENST00000346562 A6NLC8 198 aa22.17■■□□□ 1.14
NPAS3-201ENST00000346562 PHC1P78364 1004 aa22.17■■□□□ 1.14
NPAS3-201ENST00000346562 SHQ1Q6PI26 577 aaKnown RBP22.17■■□□□ 1.14
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NPAS3-201ENST00000346562 PLXDC1Q8IUK5 500 aa22.17■■□□□ 1.14
NPAS3-201ENST00000346562 TTTY10Q9BZA0 68 aa22.17■■□□□ 1.14
NPAS3-201ENST00000346562 ZNF217O75362 1048 aa22.17■■□□□ 1.14
NPAS3-201ENST00000346562 KIAA0895LQ68EN5 471 aa22.17■■□□□ 1.14
NPAS3-201ENST00000346562 OR8K3Q8NH51 312 aa22.17■■□□□ 1.14
NPAS3-201ENST00000346562 ZNF431Q8TF32 576 aaPredicted RBP22.17■■□□□ 1.14
NPAS3-201ENST00000346562 PEX13Q92968 403 aa22.17■■□□□ 1.14
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NPAS3-201ENST00000346562 PKP2Q99959 881 aa22.17■■□□□ 1.14
NPAS3-201ENST00000346562 A0A0G2JPF8 293 aa22.17■■□□□ 1.14
NPAS3-201ENST00000346562 HNRNPCL3B7ZW38 293 aa22.17■■□□□ 1.14
NPAS3-201ENST00000346562 HNRNPCL4P0DMR1 293 aa22.17■■□□□ 1.14
NPAS3-201ENST00000346562 GGT2P36268 569 aa22.17■■□□□ 1.14
NPAS3-201ENST00000346562 MAGEA8P43361 318 aa22.17■■□□□ 1.14
NPAS3-201ENST00000346562 CATSPEREQ5SY80 951 aa22.17■■□□□ 1.14
NPAS3-201ENST00000346562 HERPUD2Q9BSE4 406 aa22.17■■□□□ 1.14
NPAS3-201ENST00000346562 MEAF6Q9HAF1 191 aa22.17■■□□□ 1.14
NPAS3-201ENST00000346562 KCNJ13O60928 360 aa22.16■■□□□ 1.14
NPAS3-201ENST00000346562 OLIG2Q13516 323 aa22.16■■□□□ 1.14
NPAS3-201ENST00000346562 EIF4HQ15056 248 aaKnown RBP22.16■■□□□ 1.14
NPAS3-201ENST00000346562 TMEM35AQ53FP2 167 aa22.16■■□□□ 1.14
NPAS3-201ENST00000346562 DDIT4LQ96D03 193 aa22.16■■□□□ 1.14
NPAS3-201ENST00000346562 GPR37L1O60883 481 aa22.16■■□□□ 1.14
NPAS3-201ENST00000346562 LCN1P31025 176 aa22.16■■□□□ 1.14
NPAS3-201ENST00000346562 FRKP42685 505 aaPredicted RBP22.16■■□□□ 1.14
NPAS3-201ENST00000346562 LRIT3Q3SXY7 679 aa22.16■■□□□ 1.14
NPAS3-201ENST00000346562 C14orf80Q86SX3 495 aa22.16■■□□□ 1.14
NPAS3-201ENST00000346562 ZFAND4Q86XD8 727 aa22.16■■□□□ 1.14
NPAS3-201ENST00000346562 NANOS1Q8WY41 292 aaKnown RBP22.16■■□□□ 1.14
NPAS3-201ENST00000346562 HOXB13Q92826 284 aaPredicted RBP22.16■■□□□ 1.14
NPAS3-201ENST00000346562 ATG5Q9H1Y0 275 aa22.16■■□□□ 1.14
NPAS3-201ENST00000346562 NFAT5O94916 1531 aa22.16■■□□□ 1.14
NPAS3-201ENST00000346562 PHYHO14832 338 aa22.16■■□□□ 1.14
NPAS3-201ENST00000346562 ZNF648Q5T619 568 aaPredicted RBP22.16■■□□□ 1.14
NPAS3-201ENST00000346562 SLC27A4Q6P1M0 643 aa22.16■■□□□ 1.14
NPAS3-201ENST00000346562 PGM2L1Q6PCE3 622 aa22.16■■□□□ 1.14
NPAS3-201ENST00000346562 PQLC3Q8N755 202 aa22.16■■□□□ 1.14
NPAS3-201ENST00000346562 C16orf58Q96GQ5 468 aa22.16■■□□□ 1.14
NPAS3-201ENST00000346562 KCNN3Q9UGI6 736 aa22.16■■□□□ 1.14
NPAS3-201ENST00000346562 GJE1A6NN92 205 aa22.16■■□□□ 1.14
NPAS3-201ENST00000346562 B8ZZF3 427 aa22.16■■□□□ 1.14
NPAS3-201ENST00000346562 GJB5O95377 273 aa22.16■■□□□ 1.14
NPAS3-201ENST00000346562 GGT5P36269 586 aa22.16■■□□□ 1.14
NPAS3-201ENST00000346562 MEP1AQ16819 746 aa22.16■■□□□ 1.14
NPAS3-201ENST00000346562 FAM69BQ5VUD6 431 aa22.16■■□□□ 1.14
NPAS3-201ENST00000346562 SLC15A3Q8IY34 581 aa22.16■■□□□ 1.14
NPAS3-201ENST00000346562 THAP3Q8WTV1 239 aaPredicted RBP22.16■■□□□ 1.14
NPAS3-201ENST00000346562 CLEC4EQ9ULY5 219 aa22.16■■□□□ 1.14
NPAS3-201ENST00000346562 VSTM2BA6NLU5 285 aa22.16■■□□□ 1.14
NPAS3-201ENST00000346562 DRD2P14416 443 aa22.16■■□□□ 1.14
NPAS3-201ENST00000346562 SOX9P48436 509 aa22.16■■□□□ 1.14
NPAS3-201ENST00000346562 PROKR1Q8TCW9 393 aa22.16■■□□□ 1.14
NPAS3-201ENST00000346562 RANBP9Q96S59 729 aa22.16■■□□□ 1.14
NPAS3-201ENST00000346562 ZNF559Q9BR84 538 aa22.16■■□□□ 1.14
NPAS3-201ENST00000346562 PTNP21246 168 aa22.15■■□□□ 1.14
NPAS3-201ENST00000346562 CFL1P23528 166 aaKnown RBP22.15■■□□□ 1.14
NPAS3-201ENST00000346562 RORAP35398 523 aa22.15■■□□□ 1.14
NPAS3-201ENST00000346562 AGTR2P50052 363 aa22.15■■□□□ 1.14
NPAS3-201ENST00000346562 UBE2NP61088 152 aaKnown RBP22.15■■□□□ 1.14
NPAS3-201ENST00000346562 ELAVL3Q14576 367 aaKnown RBP22.15■■□□□ 1.14
NPAS3-201ENST00000346562 RABL3Q5HYI8 236 aa22.15■■□□□ 1.14
NPAS3-201ENST00000346562 JPH3Q8WXH2 748 aaPredicted RBP22.15■■□□□ 1.14
NPAS3-201ENST00000346562 ZNF689Q96CS4 500 aaPredicted RBP22.15■■□□□ 1.14
NPAS3-201ENST00000346562 ARHGAP39Q9C0H5 1083 aa22.15■■□□□ 1.14
NPAS3-201ENST00000346562 WDR6Q9NNW5 1121 aaKnown RBP22.15■■□□□ 1.14
NPAS3-201ENST00000346562 ICKQ9UPZ9 632 aa22.15■■□□□ 1.14
NPAS3-201ENST00000346562 IFNA5P01569 189 aa22.15■■□□□ 1.14
NPAS3-201ENST00000346562 PRKCAP17252 672 aa22.15■■□□□ 1.14
NPAS3-201ENST00000346562 ACTA2P62736 377 aa22.15■■□□□ 1.14
NPAS3-201ENST00000346562 ACTG2P63267 376 aa22.15■■□□□ 1.14
NPAS3-201ENST00000346562 VMACQ2NL98 169 aa22.15■■□□□ 1.14
NPAS3-201ENST00000346562 OR10Q1Q8NGQ4 319 aa22.15■■□□□ 1.14
NPAS3-201ENST00000346562 ZNF226Q9NYT6 803 aa22.15■■□□□ 1.14
NPAS3-201ENST00000346562 OR4C11Q6IEV9 310 aa22.15■■□□□ 1.14
NPAS3-201ENST00000346562 C3P1Q6ZMU1 363 aa22.15■■□□□ 1.14
NPAS3-201ENST00000346562 TSPEARQ8WU66 669 aa22.15■■□□□ 1.14
NPAS3-201ENST00000346562 SGTBQ96EQ0 304 aa22.15■■□□□ 1.14
NPAS3-201ENST00000346562 MKS1Q9NXB0 559 aa22.15■■□□□ 1.14
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