RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000331462.5

HOXD1-201, Transcript of homeobox D1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene HOXD1, Length 1,975 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXD1-201ENST00000331462 SEC23BQ15437 767 aa21.44■■□□□ 1.02
HOXD1-201ENST00000331462 POM121L1PQ3SYA9 428 aa21.44■■□□□ 1.02
HOXD1-201ENST00000331462 RPS26P11Q5JNZ5 115 aaPredicted RBP21.44■■□□□ 1.02
HOXD1-201ENST00000331462 ADGRF3Q8IZF5 1079 aa21.44■■□□□ 1.02
HOXD1-201ENST00000331462 ST13P5Q8NFI4 369 aaPredicted RBP21.44■■□□□ 1.02
HOXD1-201ENST00000331462 TMEM19Q96HH6 336 aa21.44■■□□□ 1.02
HOXD1-201ENST00000331462 SORBS1Q9BX66 1292 aaKnown RBP21.44■■□□□ 1.02
HOXD1-201ENST00000331462 SEC14L4Q9UDX3 406 aa21.44■■□□□ 1.02
HOXD1-201ENST00000331462 PLPP1O14494 284 aa21.43■■□□□ 1.02
HOXD1-201ENST00000331462 TBX6O95947 436 aaPredicted RBP21.43■■□□□ 1.02
HOXD1-201ENST00000331462 TRIM60Q495X7 471 aa21.43■■□□□ 1.02
HOXD1-201ENST00000331462 ARHGAP15Q53QZ3 475 aa21.43■■□□□ 1.02
HOXD1-201ENST00000331462 IL17RDQ8NFM7 739 aa21.43■■□□□ 1.02
HOXD1-201ENST00000331462 OR2L2Q8NH16 312 aa21.43■■□□□ 1.02
HOXD1-201ENST00000331462 TMEM80Q96HE8 168 aa21.43■■□□□ 1.02
HOXD1-201ENST00000331462 RSPO3Q9BXY4 272 aaPredicted RBP21.43■■□□□ 1.02
HOXD1-201ENST00000331462 C11orf16Q9NQ32 467 aa21.43■■□□□ 1.02
HOXD1-201ENST00000331462 POU2F3Q9UKI9 436 aa21.43■■□□□ 1.02
HOXD1-201ENST00000331462 GPR34Q9UPC5 381 aa21.43■■□□□ 1.02
HOXD1-201ENST00000331462 SNX8Q9Y5X2 465 aa21.43■■□□□ 1.02
HOXD1-201ENST00000331462 CTDSP2O14595 271 aa21.43■■□□□ 1.02
HOXD1-201ENST00000331462 MMP20O60882 483 aa21.43■■□□□ 1.02
HOXD1-201ENST00000331462 H1F0P07305 194 aaKnown RBP21.43■■□□□ 1.02
HOXD1-201ENST00000331462 POU1F1P28069 291 aa21.43■■□□□ 1.02
HOXD1-201ENST00000331462 OCLNQ16625 522 aa21.43■■□□□ 1.02
HOXD1-201ENST00000331462 LEXMQ3ZCV2 418 aa21.43■■□□□ 1.02
HOXD1-201ENST00000331462 DCST1Q5T197 706 aa21.43■■□□□ 1.02
HOXD1-201ENST00000331462 TRMT11Q7Z4G4 463 aaKnown RBP21.43■■□□□ 1.02
HOXD1-201ENST00000331462 OR8J1Q8NGP2 316 aa21.43■■□□□ 1.02
HOXD1-201ENST00000331462 RASSF5Q8WWW0 418 aa21.43■■□□□ 1.02
HOXD1-201ENST00000331462 NUS1Q96E22 293 aa21.43■■□□□ 1.02
HOXD1-201ENST00000331462 WDFY2Q96P53 400 aa21.43■■□□□ 1.02
HOXD1-201ENST00000331462 TEFMQ96QE5 360 aaKnown RBP21.43■■□□□ 1.02
HOXD1-201ENST00000331462 MND1Q9BWT6 205 aa21.43■■□□□ 1.02
HOXD1-201ENST00000331462 ASPNQ9BXN1 380 aa21.43■■□□□ 1.02
HOXD1-201ENST00000331462 KLHL3Q9UH77 587 aa21.43■■□□□ 1.02
HOXD1-201ENST00000331462 RPL36Q9Y3U8 105 aaKnown RBP21.43■■□□□ 1.02
HOXD1-201ENST00000331462 SLC35F4A4IF30 521 aa21.42■■□□□ 1.02
HOXD1-201ENST00000331462 K7ESM1 405 aa21.42■■□□□ 1.02
HOXD1-201ENST00000331462 PDPK1O15530 556 aa21.42■■□□□ 1.02
HOXD1-201ENST00000331462 CSO75390 466 aaKnown RBP21.42■■□□□ 1.02
HOXD1-201ENST00000331462 ERGP11308 486 aa21.42■■□□□ 1.02
HOXD1-201ENST00000331462 ITGB7P26010 798 aa21.42■■□□□ 1.02
HOXD1-201ENST00000331462 KCNJ5P48544 419 aa21.42■■□□□ 1.02
HOXD1-201ENST00000331462 PCYT1AP49585 367 aa21.42■■□□□ 1.02
HOXD1-201ENST00000331462 SMIM11AP58511 58 aa21.42■■□□□ 1.02
HOXD1-201ENST00000331462 ALDH6A1Q02252 535 aaKnown RBP21.42■■□□□ 1.02
HOXD1-201ENST00000331462 DPTQ07507 201 aa21.42■■□□□ 1.02
HOXD1-201ENST00000331462 SPHARQ15513 63 aa21.42■■□□□ 1.02
HOXD1-201ENST00000331462 MFSD4BQ5TF39 518 aa21.42■■□□□ 1.02
HOXD1-201ENST00000331462 AGAP6Q5VW22 663 aa21.42■■□□□ 1.02
HOXD1-201ENST00000331462 KHDRBS2Q5VWX1 349 aaKnown RBP21.42■■□□□ 1.02
HOXD1-201ENST00000331462 TM4SF18Q96CE8 201 aa21.42■■□□□ 1.02
HOXD1-201ENST00000331462 TMCO6Q96DC7 493 aa21.42■■□□□ 1.02
HOXD1-201ENST00000331462 CEP19Q96LK0 163 aa21.42■■□□□ 1.02
HOXD1-201ENST00000331462 ZNF354BQ96LW1 612 aa21.42■■□□□ 1.02
HOXD1-201ENST00000331462 SLC6A18Q96N87 628 aa21.42■■□□□ 1.02
HOXD1-201ENST00000331462 AGAP4Q96P64 663 aa21.42■■□□□ 1.02
HOXD1-201ENST00000331462 IL4I1Q96RQ9 567 aa21.42■■□□□ 1.02
HOXD1-201ENST00000331462 MS4A8Q9BY19 250 aa21.42■■□□□ 1.02
HOXD1-201ENST00000331462 OR52A5Q9H2C5 316 aa21.42■■□□□ 1.02
HOXD1-201ENST00000331462 PELI2Q9HAT8 420 aa21.42■■□□□ 1.02
HOXD1-201ENST00000331462 NDUFB11Q9NX14 153 aa21.42■■□□□ 1.02
HOXD1-201ENST00000331462 NUP210Q8TEM1 1887 aaPredicted RBP21.42■■□□□ 1.02
HOXD1-201ENST00000331462 CXCL14O95715 111 aa21.41■■□□□ 1.02
HOXD1-201ENST00000331462 TNFSF8P32971 234 aa21.41■■□□□ 1.02
HOXD1-201ENST00000331462 OPRD1P41143 372 aa21.41■■□□□ 1.02
HOXD1-201ENST00000331462 MAPK12P53778 367 aa21.41■■□□□ 1.02
HOXD1-201ENST00000331462 PCBP4P57723 403 aaKnown RBP21.41■■□□□ 1.02
HOXD1-201ENST00000331462 WDR5P61964 334 aaKnown RBP21.41■■□□□ 1.02
HOXD1-201ENST00000331462 RPS26P62854 115 aaKnown RBP21.41■■□□□ 1.02
HOXD1-201ENST00000331462 PGBD2Q6P3X8 592 aa21.41■■□□□ 1.02
HOXD1-201ENST00000331462 TNFAIP8L2Q6P589 184 aaPredicted RBP21.41■■□□□ 1.02
HOXD1-201ENST00000331462 TMC5Q6UXY8 1006 aa21.41■■□□□ 1.02
HOXD1-201ENST00000331462 PROKR2Q8NFJ6 384 aa21.41■■□□□ 1.02
HOXD1-201ENST00000331462 RAD51AP1Q96B01 352 aa21.41■■□□□ 1.02
HOXD1-201ENST00000331462 MIR1-1HGQ9H1L0 117 aa21.41■■□□□ 1.02
HOXD1-201ENST00000331462 SIRT3Q9NTG7 399 aaPredicted RBP21.41■■□□□ 1.02
HOXD1-201ENST00000331462 WNT6Q9Y6F9 365 aa21.41■■□□□ 1.02
HOXD1-201ENST00000331462 ZNF670-ZNF695F2Z2N8 137 aa21.41■■□□□ 1.02
HOXD1-201ENST00000331462 H3BQ06 376 aaPredicted RBP21.41■■□□□ 1.02
HOXD1-201ENST00000331462 KPNA3O00505 521 aaPredicted RBP21.41■■□□□ 1.02
HOXD1-201ENST00000331462 POP7O75817 140 aaKnown RBP21.41■■□□□ 1.02
HOXD1-201ENST00000331462 PRNPP04156 253 aa21.41■■□□□ 1.02
HOXD1-201ENST00000331462 KELP23276 732 aa21.41■■□□□ 1.02
HOXD1-201ENST00000331462 BSGP35613 385 aa21.41■■□□□ 1.02
HOXD1-201ENST00000331462 CRYBB2P43320 205 aa21.41■■□□□ 1.02
HOXD1-201ENST00000331462 GSTM5P46439 218 aa21.41■■□□□ 1.02
HOXD1-201ENST00000331462 XKP51811 444 aa21.41■■□□□ 1.02
HOXD1-201ENST00000331462 ZNF91Q05481 1191 aa21.41■■□□□ 1.02
HOXD1-201ENST00000331462 CCDC92Q53HC0 331 aaPredicted RBP21.41■■□□□ 1.02
HOXD1-201ENST00000331462 SLC25A30Q5SVS4 291 aa21.41■■□□□ 1.02
HOXD1-201ENST00000331462 NANOGP1Q8N7R0 232 aa21.41■■□□□ 1.02
HOXD1-201ENST00000331462 WFIKKN2Q8TEU8 576 aa21.41■■□□□ 1.02
HOXD1-201ENST00000331462 DEFB118Q96PH6 123 aa21.41■■□□□ 1.02
HOXD1-201ENST00000331462 OR2A14Q96R47 310 aa21.41■■□□□ 1.02
HOXD1-201ENST00000331462 TBC1D24Q9ULP9 559 aa21.41■■□□□ 1.02
HOXD1-201ENST00000331462 STUB1Q9UNE7 303 aa21.41■■□□□ 1.02
HOXD1-201ENST00000331462 HYKKA2RU49 373 aa21.4■■□□□ 1.02
HOXD1-201ENST00000331462 HMGN4O00479 90 aa21.4■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 26 ms