RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000233025.11

SPCS1-201, Transcript of signal peptidase complex subunit 1, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene SPCS1, Length 1,082 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPCS1-201ENST00000233025 GFYI3L273 518 aa15□□□□□ -0.01
SPCS1-201ENST00000233025 CCKARP32238 428 aa15□□□□□ -0.01
SPCS1-201ENST00000233025 CXCR5P32302 372 aa15□□□□□ -0.01
SPCS1-201ENST00000233025 SLCO1A2P46721 670 aa15□□□□□ -0.01
SPCS1-201ENST00000233025 VPS41P49754 854 aa15□□□□□ -0.01
SPCS1-201ENST00000233025 CLCN7P51798 805 aa15□□□□□ -0.01
SPCS1-201ENST00000233025 RNF4P78317 190 aa15□□□□□ -0.01
SPCS1-201ENST00000233025 ELAVL1Q15717 326 aaKnown RBP15□□□□□ -0.01
SPCS1-201ENST00000233025 ZNF791Q3KP31 576 aaPredicted RBP15□□□□□ -0.01
SPCS1-201ENST00000233025 SLC22A10Q63ZE4 541 aa15□□□□□ -0.01
SPCS1-201ENST00000233025 TRIM58Q8NG06 486 aa15□□□□□ -0.01
SPCS1-201ENST00000233025 WDYHV1Q96HA8 205 aa15□□□□□ -0.01
SPCS1-201ENST00000233025 ZFP3Q96NJ6 502 aa15□□□□□ -0.01
SPCS1-201ENST00000233025 ZCWPW2A0A1B0GU75 182 aa14.99□□□□□ -0.01
SPCS1-201ENST00000233025 SMIM10L1P0DMW3 83 aa14.99□□□□□ -0.01
SPCS1-201ENST00000233025 GDF1P27539 372 aa14.99□□□□□ -0.01
SPCS1-201ENST00000233025 SOX18P35713 384 aa14.99□□□□□ -0.01
SPCS1-201ENST00000233025 CPOXP36551 454 aa14.99□□□□□ -0.01
SPCS1-201ENST00000233025 PCYT1AP49585 367 aa14.99□□□□□ -0.01
SPCS1-201ENST00000233025 HNRNPFP52597 415 aaKnown RBP14.99□□□□□ -0.01
SPCS1-201ENST00000233025 HSD17B7P56937 341 aa14.99□□□□□ -0.01
SPCS1-201ENST00000233025 RAB8AP61006 207 aa14.99□□□□□ -0.01
SPCS1-201ENST00000233025 RGS1Q08116 209 aa14.99□□□□□ -0.01
SPCS1-201ENST00000233025 GPS1Q13098 491 aa14.99□□□□□ -0.01
SPCS1-201ENST00000233025 ETFDHQ16134 617 aa14.99□□□□□ -0.01
SPCS1-201ENST00000233025 BBS9Q3SYG4 887 aa14.99□□□□□ -0.01
SPCS1-201ENST00000233025 NHSL2Q5HYW2 709 aa14.99□□□□□ -0.01
SPCS1-201ENST00000233025 C6orf52Q5T4I8 152 aa14.99□□□□□ -0.01
SPCS1-201ENST00000233025 ZNF470Q6ECI4 717 aa14.99□□□□□ -0.01
SPCS1-201ENST00000233025 NEPROQ6NW34 567 aa14.99□□□□□ -0.01
SPCS1-201ENST00000233025 ZNF549Q6P9A3 640 aa14.99□□□□□ -0.01
SPCS1-201ENST00000233025 LYPD8Q6UX82 237 aa14.99□□□□□ -0.01
SPCS1-201ENST00000233025 STRA8Q7Z7C7 330 aa14.99□□□□□ -0.01
SPCS1-201ENST00000233025 DENND6AQ8IWF6 608 aa14.99□□□□□ -0.01
SPCS1-201ENST00000233025 AGGF1Q8N302 714 aaeCLIP14.99□□□□□ -0.01
SPCS1-201ENST00000233025 TMEM132CQ8N3T6 1108 aa14.99□□□□□ -0.01
SPCS1-201ENST00000233025 TMEM52Q8NDY8 209 aa14.99□□□□□ -0.01
SPCS1-201ENST00000233025 SMIM10Q96HG1 83 aa14.99□□□□□ -0.01
SPCS1-201ENST00000233025 PIGMQ9H3S5 423 aa14.99□□□□□ -0.01
SPCS1-201ENST00000233025 INTS10Q9NVR2 710 aaKnown RBP14.99□□□□□ -0.01
SPCS1-201ENST00000233025 NOTCH1P46531 2555 aa14.98□□□□□ -0.01
SPCS1-201ENST00000233025 OR1F1O43749 312 aa14.98□□□□□ -0.01
SPCS1-201ENST00000233025 SERPIND1P05546 499 aa14.98□□□□□ -0.01
SPCS1-201ENST00000233025 PAMP19021 973 aa14.98□□□□□ -0.01
SPCS1-201ENST00000233025 MAGEA3P43357 314 aa14.98□□□□□ -0.01
SPCS1-201ENST00000233025 FAM27E3Q08E93 113 aa14.98□□□□□ -0.01
SPCS1-201ENST00000233025 TBL3Q12788 808 aaKnown RBP14.98□□□□□ -0.01
SPCS1-201ENST00000233025 CUL1Q13616 776 aa14.98□□□□□ -0.01
SPCS1-201ENST00000233025 BMPR2Q13873 1038 aa14.98□□□□□ -0.01
SPCS1-201ENST00000233025 MPEG1Q2M385 716 aa14.98□□□□□ -0.01
SPCS1-201ENST00000233025 ABHD11Q8NFV4 315 aa14.98□□□□□ -0.01
SPCS1-201ENST00000233025 OR4K1Q8NGD4 311 aa14.98□□□□□ -0.01
SPCS1-201ENST00000233025 PTPMT1Q8WUK0 201 aaPredicted RBP14.98□□□□□ -0.01
SPCS1-201ENST00000233025 SLC44A1Q8WWI5 657 aa14.98□□□□□ -0.01
SPCS1-201ENST00000233025 ZNF669Q96BR6 464 aaPredicted RBP14.98□□□□□ -0.01
SPCS1-201ENST00000233025 MED18Q9BUE0 208 aa14.98□□□□□ -0.01
SPCS1-201ENST00000233025 UGT2B28Q9BY64 529 aa14.98□□□□□ -0.01
SPCS1-201ENST00000233025 LRTM1Q9HBL6 345 aa14.98□□□□□ -0.01
SPCS1-201ENST00000233025 PRTFDC1Q9NRG1 225 aa14.98□□□□□ -0.01
SPCS1-201ENST00000233025 HOMER3Q9NSC5 361 aa14.98□□□□□ -0.01
SPCS1-201ENST00000233025 PSD3Q9NYI0 1048 aa14.98□□□□□ -0.01
SPCS1-201ENST00000233025 SLC6A5Q9Y345 797 aa14.98□□□□□ -0.01
SPCS1-201ENST00000233025 CHCHD2Q9Y6H1 151 aaPredicted RBP14.98□□□□□ -0.01
SPCS1-201ENST00000233025 UQCRHLA0A096LP55 91 aa14.97□□□□□ -0.01
SPCS1-201ENST00000233025 TRBC2A0A5B9 178 aa14.97□□□□□ -0.01
SPCS1-201ENST00000233025 CTAGE15A4D2H0 777 aa14.97□□□□□ -0.01
SPCS1-201ENST00000233025 CTAGE9A4FU28 777 aa14.97□□□□□ -0.01
SPCS1-201ENST00000233025 E5RI56 91 aa14.97□□□□□ -0.01
SPCS1-201ENST00000233025 PFDN6O15212 129 aa14.97□□□□□ -0.01
SPCS1-201ENST00000233025 URI1O94763 535 aaPredicted RBP14.97□□□□□ -0.01
SPCS1-201ENST00000233025 RCBTB2O95199 551 aa14.97□□□□□ -0.01
SPCS1-201ENST00000233025 C1QAP02745 245 aa14.97□□□□□ -0.01
SPCS1-201ENST00000233025 MLNP12872 115 aa14.97□□□□□ -0.01
SPCS1-201ENST00000233025 SLC1A2P43004 574 aa14.97□□□□□ -0.01
SPCS1-201ENST00000233025 DHX34Q14147 1143 aaKnown RBP14.97□□□□□ -0.01
SPCS1-201ENST00000233025 PIGGQ5H8A4 983 aa14.97□□□□□ -0.01
SPCS1-201ENST00000233025 CASC4Q6P4E1 433 aa14.97□□□□□ -0.01
SPCS1-201ENST00000233025 LCTLQ6UWM7 567 aa14.97□□□□□ -0.01
SPCS1-201ENST00000233025 CTAGE6Q86UF2 777 aa14.97□□□□□ -0.01
SPCS1-201ENST00000233025 MORN4Q8NDC4 146 aa14.97□□□□□ -0.01
SPCS1-201ENST00000233025 ZPLD1Q8TCW7 415 aa14.97□□□□□ -0.01
SPCS1-201ENST00000233025 KCNJ9Q92806 393 aa14.97□□□□□ -0.01
SPCS1-201ENST00000233025 SPACA9Q96E40 222 aaPredicted RBP14.97□□□□□ -0.01
SPCS1-201ENST00000233025 JSRP1Q96MG2 331 aaPredicted RBP14.97□□□□□ -0.01
SPCS1-201ENST00000233025 SERPINB12Q96P63 405 aa14.97□□□□□ -0.01
SPCS1-201ENST00000233025 SGPP1Q9BX95 441 aa14.97□□□□□ -0.01
SPCS1-201ENST00000233025 ANGPTL4Q9BY76 406 aa14.97□□□□□ -0.01
SPCS1-201ENST00000233025 OR8D2Q9GZM6 311 aa14.97□□□□□ -0.01
SPCS1-201ENST00000233025 AICDAQ9GZX7 198 aa14.97□□□□□ -0.01
SPCS1-201ENST00000233025 SPNS1Q9H2V7 528 aa14.97□□□□□ -0.01
SPCS1-201ENST00000233025 UBQLN3Q9H347 655 aa14.97□□□□□ -0.01
SPCS1-201ENST00000233025 FBXO6Q9NRD1 293 aaPredicted RBP14.97□□□□□ -0.01
SPCS1-201ENST00000233025 TMEM160Q9NX00 188 aa14.97□□□□□ -0.01
SPCS1-201ENST00000233025 KLHL42Q9P2K6 505 aa14.97□□□□□ -0.01
SPCS1-201ENST00000233025 ZFP69BQ9UJL9 534 aa14.97□□□□□ -0.01
SPCS1-201ENST00000233025 PACSIN3Q9UKS6 424 aa14.97□□□□□ -0.01
SPCS1-201ENST00000233025 CLCA3PQ9Y6N3 262 aa14.97□□□□□ -0.01
SPCS1-201ENST00000233025 ZBTB14O43829 449 aa14.96□□□□□ -0.01
SPCS1-201ENST00000233025 TRIM3O75382 744 aaPredicted RBP14.96□□□□□ -0.01
SPCS1-201ENST00000233025 KRT14P02533 472 aa14.96□□□□□ -0.01
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 33.5 ms