RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000614059.4

RPS6KC1-208, Transcript of ribosomal protein S6 kinase C1, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene RPS6KC1, Length 4,188 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPS6KC1-208ENST00000614059 ULK3Q6PHR2 472 aa13.4□□□□□ -0.26
RPS6KC1-208ENST00000614059 PRSS48Q7RTY5 328 aa13.4□□□□□ -0.26
RPS6KC1-208ENST00000614059 LSMEM2Q8N112 164 aa13.4□□□□□ -0.26
RPS6KC1-208ENST00000614059 MZB1Q8WU39 189 aa13.4□□□□□ -0.26
RPS6KC1-208ENST00000614059 COQ8BQ96D53 544 aa13.4□□□□□ -0.26
RPS6KC1-208ENST00000614059 F2RL3Q96RI0 385 aa13.4□□□□□ -0.26
RPS6KC1-208ENST00000614059 GNG8Q9UK08 70 aa13.4□□□□□ -0.26
RPS6KC1-208ENST00000614059 POU2F3Q9UKI9 436 aa13.4□□□□□ -0.26
RPS6KC1-208ENST00000614059 A8MUA0 341 aa13.4□□□□□ -0.26
RPS6KC1-208ENST00000614059 ARL6IP5O75915 188 aa13.4□□□□□ -0.26
RPS6KC1-208ENST00000614059 PRH1P02810 166 aa13.4□□□□□ -0.26
RPS6KC1-208ENST00000614059 FGF4P08620 206 aa13.4□□□□□ -0.26
RPS6KC1-208ENST00000614059 FAM163BP0C2L3 166 aa13.4□□□□□ -0.26
RPS6KC1-208ENST00000614059 ACRP10323 421 aa13.4□□□□□ -0.26
RPS6KC1-208ENST00000614059 LAG3P18627 525 aa13.4□□□□□ -0.26
RPS6KC1-208ENST00000614059 CRHBPP24387 322 aa13.4□□□□□ -0.26
RPS6KC1-208ENST00000614059 SOX3P41225 446 aa13.4□□□□□ -0.26
RPS6KC1-208ENST00000614059 GRIA2P42262 883 aa13.4□□□□□ -0.26
RPS6KC1-208ENST00000614059 GHRHRQ02643 423 aa13.4□□□□□ -0.26
RPS6KC1-208ENST00000614059 SELPLGQ14242 412 aa13.4□□□□□ -0.26
RPS6KC1-208ENST00000614059 ZNF792Q3KQV3 632 aa13.4□□□□□ -0.26
RPS6KC1-208ENST00000614059 C22orf39Q6P5X5 142 aa13.4□□□□□ -0.26
RPS6KC1-208ENST00000614059 TMEM102Q8N9M5 508 aaPredicted RBP13.4□□□□□ -0.26
RPS6KC1-208ENST00000614059 CHDHQ8NE62 594 aaPredicted RBP13.4□□□□□ -0.26
RPS6KC1-208ENST00000614059 OR8S1Q8NH09 359 aa13.4□□□□□ -0.26
RPS6KC1-208ENST00000614059 NUS1Q96E22 293 aa13.4□□□□□ -0.26
RPS6KC1-208ENST00000614059 PIP5K1AQ99755 562 aa13.4□□□□□ -0.26
RPS6KC1-208ENST00000614059 P2RY13Q9BPV8 354 aa13.4□□□□□ -0.26
RPS6KC1-208ENST00000614059 CARS2Q9HA77 564 aaKnown RBP13.4□□□□□ -0.26
RPS6KC1-208ENST00000614059 BLOC1S5-TXNDC5H3BN57 136 aa13.39□□□□□ -0.27
RPS6KC1-208ENST00000614059 CLDN4O14493 209 aa13.39□□□□□ -0.27
RPS6KC1-208ENST00000614059 PON3Q15166 354 aa13.39□□□□□ -0.27
RPS6KC1-208ENST00000614059 KCNJ8Q15842 424 aa13.39□□□□□ -0.27
RPS6KC1-208ENST00000614059 LY6G5CQ5SRR4 150 aa13.39□□□□□ -0.27
RPS6KC1-208ENST00000614059 PM20D1Q6GTS8 502 aa13.39□□□□□ -0.27
RPS6KC1-208ENST00000614059 JAGN1Q8N5M9 183 aa13.39□□□□□ -0.27
RPS6KC1-208ENST00000614059 Q8N9G6 341 aaPredicted RBP13.39□□□□□ -0.27
RPS6KC1-208ENST00000614059 MFSD2AQ8NA29 543 aa13.39□□□□□ -0.27
RPS6KC1-208ENST00000614059 FBXO15Q8NCQ5 510 aaPredicted RBP13.39□□□□□ -0.27
RPS6KC1-208ENST00000614059 SORCS1Q8WY21 1168 aa13.39□□□□□ -0.27
RPS6KC1-208ENST00000614059 ANKHQ9HCJ1 492 aa13.39□□□□□ -0.27
RPS6KC1-208ENST00000614059 SARDHQ9UL12 918 aa13.39□□□□□ -0.27
RPS6KC1-208ENST00000614059 BOLA1Q9Y3E2 137 aa13.39□□□□□ -0.27
RPS6KC1-208ENST00000614059 COLEC10Q9Y6Z7 277 aa13.39□□□□□ -0.27
RPS6KC1-208ENST00000614059 CLCA1A8K7I4 914 aa13.39□□□□□ -0.27
RPS6KC1-208ENST00000614059 PGAM2P15259 253 aa13.39□□□□□ -0.27
RPS6KC1-208ENST00000614059 NAA10P41227 235 aaPredicted RBP13.39□□□□□ -0.27
RPS6KC1-208ENST00000614059 ILF3Q12906 894 aaKnown RBP eCLIP13.39□□□□□ -0.272e-6■■■□□ 17.5
RPS6KC1-208ENST00000614059 TMEM44Q2T9K0 475 aa13.39□□□□□ -0.27
RPS6KC1-208ENST00000614059 ZNF367Q7RTV3 350 aa13.39□□□□□ -0.27
RPS6KC1-208ENST00000614059 RNF175Q8N4F7 328 aa13.39□□□□□ -0.27
RPS6KC1-208ENST00000614059 SPERTQ8NA61 448 aa13.39□□□□□ -0.27
RPS6KC1-208ENST00000614059 PROKR1Q8TCW9 393 aa13.39□□□□□ -0.27
RPS6KC1-208ENST00000614059 CASTOR1Q8WTX7 329 aa13.39□□□□□ -0.27
RPS6KC1-208ENST00000614059 SMPDL3AQ92484 453 aa13.39□□□□□ -0.27
RPS6KC1-208ENST00000614059 ZNF514Q96K75 400 aaPredicted RBP13.39□□□□□ -0.27
RPS6KC1-208ENST00000614059 PCDHGB5Q9Y5G0 923 aa13.39□□□□□ -0.27
RPS6KC1-208ENST00000614059 GPR45Q9Y5Y3 372 aa13.39□□□□□ -0.27
RPS6KC1-208ENST00000614059 C13orf42A0A1B0GVH6 325 aa13.39□□□□□ -0.27
RPS6KC1-208ENST00000614059 RAB36O95755 333 aa13.39□□□□□ -0.27
RPS6KC1-208ENST00000614059 APOC3P02656 99 aa13.39□□□□□ -0.27
RPS6KC1-208ENST00000614059 LCN1P31025 176 aa13.39□□□□□ -0.27
RPS6KC1-208ENST00000614059 PTGER1P34995 402 aa13.39□□□□□ -0.27
RPS6KC1-208ENST00000614059 PPP3R1P63098 170 aa13.39□□□□□ -0.27
RPS6KC1-208ENST00000614059 PTPRRQ15256 657 aa13.39□□□□□ -0.27
RPS6KC1-208ENST00000614059 PAQR7Q86WK9 346 aa13.39□□□□□ -0.27
RPS6KC1-208ENST00000614059 GPR135Q8IZ08 494 aa13.39□□□□□ -0.27
RPS6KC1-208ENST00000614059 OR2L5Q8NG80 312 aa13.39□□□□□ -0.27
RPS6KC1-208ENST00000614059 OR4E2Q8NGC2 313 aa13.39□□□□□ -0.27
RPS6KC1-208ENST00000614059 HUS1BQ8NHY5 278 aa13.39□□□□□ -0.27
RPS6KC1-208ENST00000614059 CD99L2Q8TCZ2 262 aa13.39□□□□□ -0.27
RPS6KC1-208ENST00000614059 RFT1Q96AA3 541 aa13.39□□□□□ -0.27
RPS6KC1-208ENST00000614059 ADAD1Q96M93 576 aaKnown RBP13.39□□□□□ -0.27
RPS6KC1-208ENST00000614059 OR2B2Q9GZK3 357 aa13.39□□□□□ -0.27
RPS6KC1-208ENST00000614059 NEUROD4Q9HD90 331 aa13.39□□□□□ -0.27
RPS6KC1-208ENST00000614059 TREM1Q9NP99 234 aa13.39□□□□□ -0.27
RPS6KC1-208ENST00000614059 MKKSQ9NPJ1 570 aaPredicted RBP13.39□□□□□ -0.27
RPS6KC1-208ENST00000614059 NUP205Q92621 2012 aa13.39□□□□□ -0.27
RPS6KC1-208ENST00000614059 NUPL2O15504 423 aaKnown RBP13.39□□□□□ -0.27
RPS6KC1-208ENST00000614059 FMO6PO60774 539 aa13.39□□□□□ -0.27
RPS6KC1-208ENST00000614059 ZNF3P17036 446 aa13.39□□□□□ -0.27
RPS6KC1-208ENST00000614059 TIA1P31483 386 aaKnown RBP eCLIP13.39□□□□□ -0.272e-6■■■■□ 24.7
RPS6KC1-208ENST00000614059 BMP8BP34820 402 aa13.39□□□□□ -0.27
RPS6KC1-208ENST00000614059 HMGCLP35914 325 aa13.39□□□□□ -0.27
RPS6KC1-208ENST00000614059 PSMA6P60900 246 aaKnown RBP13.39□□□□□ -0.27
RPS6KC1-208ENST00000614059 GALNT1Q10472 559 aaPredicted RBP13.39□□□□□ -0.27
RPS6KC1-208ENST00000614059 SNTB2Q13425 540 aaKnown RBP13.39□□□□□ -0.27
RPS6KC1-208ENST00000614059 ARFRP1Q13795 201 aa13.39□□□□□ -0.27
RPS6KC1-208ENST00000614059 DSG2Q14126 1118 aa13.39□□□□□ -0.27
RPS6KC1-208ENST00000614059 FOXB2Q5VYV0 432 aa13.39□□□□□ -0.27
RPS6KC1-208ENST00000614059 ALKBH2Q6NS38 261 aa13.39□□□□□ -0.27
RPS6KC1-208ENST00000614059 BMP8AQ7Z5Y6 402 aa13.39□□□□□ -0.27
RPS6KC1-208ENST00000614059 POGLUT1Q8NBL1 392 aa13.39□□□□□ -0.27
RPS6KC1-208ENST00000614059 THEM6Q8WUY1 208 aa13.39□□□□□ -0.27
RPS6KC1-208ENST00000614059 CACNG6Q9BXT2 260 aa13.39□□□□□ -0.27
RPS6KC1-208ENST00000614059 CXCL16Q9H2A7 254 aa13.39□□□□□ -0.27
RPS6KC1-208ENST00000614059 TRPV4Q9HBA0 871 aa13.39□□□□□ -0.27
RPS6KC1-208ENST00000614059 NUDT15Q9NV35 164 aa13.39□□□□□ -0.27
RPS6KC1-208ENST00000614059 ENPP5Q9UJA9 477 aa13.39□□□□□ -0.27
RPS6KC1-208ENST00000614059 OARD1Q9Y530 152 aa13.39□□□□□ -0.27
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 29.3 ms