RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000587928.5

ILF3-208, Transcript of interleukin enhancer binding factor 3, human

TSL 2

Gene ILF3, Length 4,230 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
ILF3-208	ENST00000587928	RPS9	P46781	194 aa	Known RBP	10.44	□□□□□ -0.74
ILF3-208	ENST00000587928	ARHGDIB	P52566	201 aa		10.44	□□□□□ -0.74
ILF3-208	ENST00000587928	CHRNA6	Q15825	494 aa		10.44	□□□□□ -0.74
ILF3-208	ENST00000587928	ATP13A5	Q4VNC0	1218 aa		10.44	□□□□□ -0.74
ILF3-208	ENST00000587928	COLEC12	Q5KU26	742 aa		10.44	□□□□□ -0.74
ILF3-208	ENST00000587928	CFAP77	Q6ZQR2	320 aa		10.44	□□□□□ -0.74
ILF3-208	ENST00000587928	VN1R5	Q7Z5H4	357 aa		10.44	□□□□□ -0.74
ILF3-208	ENST00000587928	CYP4Z1	Q86W10	505 aa		10.44	□□□□□ -0.74
ILF3-208	ENST00000587928	KRT78	Q8N1N4	520 aa		10.44	□□□□□ -0.74
ILF3-208	ENST00000587928	ZBTB2	Q8N680	514 aa		10.44	□□□□□ -0.74
ILF3-208	ENST00000587928	SETD9	Q8NE22	299 aa		10.44	□□□□□ -0.74
ILF3-208	ENST00000587928	OR2A12	Q8NGT7	310 aa		10.44	□□□□□ -0.74
ILF3-208	ENST00000587928	HYLS1	Q96M11	299 aa		10.44	□□□□□ -0.74
ILF3-208	ENST00000587928	MOGAT1	Q96PD6	335 aa		10.44	□□□□□ -0.74
ILF3-208	ENST00000587928	NAA50	Q9GZZ1	169 aa	Known RBP	10.44	□□□□□ -0.74
ILF3-208	ENST00000587928	PRRC2B	Q5JSZ5	2229 aa	Known RBP	10.44	□□□□□ -0.74
ILF3-208	ENST00000587928		A8MVJ9	347 aa		10.44	□□□□□ -0.74
ILF3-208	ENST00000587928	ARHGAP33	O14559	1287 aa		10.44	□□□□□ -0.74
ILF3-208	ENST00000587928	ETHE1	O95571	254 aa		10.44	□□□□□ -0.74
ILF3-208	ENST00000587928	FGB	P02675	491 aa		10.44	□□□□□ -0.74
ILF3-208	ENST00000587928	IL6	P05231	212 aa		10.44	□□□□□ -0.74
ILF3-208	ENST00000587928	COTL1	Q14019	142 aa		10.44	□□□□□ -0.74
ILF3-208	ENST00000587928	TOMM20	Q15388	145 aa		10.44	□□□□□ -0.74
ILF3-208	ENST00000587928	TAGAP	Q8N103	731 aa		10.44	□□□□□ -0.74
ILF3-208	ENST00000587928	KRTCAP2	Q8N6L1	136 aa		10.44	□□□□□ -0.74
ILF3-208	ENST00000587928	WDR36	Q8NI36	951 aa	Known RBP	10.44	□□□□□ -0.74
ILF3-208	ENST00000587928	SLC13A3	Q8WWT9	602 aa		10.44	□□□□□ -0.74
ILF3-208	ENST00000587928	PPP3R2	Q96LZ3	170 aa		10.44	□□□□□ -0.74
ILF3-208	ENST00000587928	P2RY13	Q9BPV8	354 aa		10.44	□□□□□ -0.74
ILF3-208	ENST00000587928	KLHL31	Q9H511	634 aa		10.44	□□□□□ -0.74
ILF3-208	ENST00000587928	ARL15	Q9NXU5	204 aa		10.44	□□□□□ -0.74
ILF3-208	ENST00000587928	DMD	P11532	3685 aa		10.43	□□□□□ -0.74
ILF3-208	ENST00000587928	LZTS3	O60299	673 aa	Predicted RBP	10.43	□□□□□ -0.74
ILF3-208	ENST00000587928	ZNF780A	O75290	641 aa	Predicted RBP	10.43	□□□□□ -0.74
ILF3-208	ENST00000587928	POP4	O95707	220 aa	Known RBP	10.43	□□□□□ -0.74
ILF3-208	ENST00000587928	EPB42	P16452	691 aa		10.43	□□□□□ -0.74
ILF3-208	ENST00000587928	SPINT3	P49223	89 aa		10.43	□□□□□ -0.74
ILF3-208	ENST00000587928	PRKG2	Q13237	762 aa		10.43	□□□□□ -0.74
ILF3-208	ENST00000587928	BTN1A1	Q13410	526 aa		10.43	□□□□□ -0.74
ILF3-208	ENST00000587928	CARD16	Q5EG05	197 aa		10.43	□□□□□ -0.74
ILF3-208	ENST00000587928	PLET1	Q6UQ28	207 aa		10.43	□□□□□ -0.74
ILF3-208	ENST00000587928	SCIMP	Q6UWF3	145 aa		10.43	□□□□□ -0.74
ILF3-208	ENST00000587928	MBOAT1	Q6ZNC8	495 aa		10.43	□□□□□ -0.74
ILF3-208	ENST00000587928	TPRG1	Q6ZUI0	275 aa		10.43	□□□□□ -0.74
ILF3-208	ENST00000587928	UFD1	Q92890	307 aa		10.43	□□□□□ -0.74
ILF3-208	ENST00000587928	NARS2	Q96I59	477 aa	Known RBP	10.43	□□□□□ -0.74
ILF3-208	ENST00000587928	LRRC3B	Q96PB8	259 aa		10.43	□□□□□ -0.74
ILF3-208	ENST00000587928	NODAL	Q96S42	347 aa		10.43	□□□□□ -0.74
ILF3-208	ENST00000587928	RAD18	Q9NS91	495 aa		10.43	□□□□□ -0.74
ILF3-208	ENST00000587928	ZDHHC3	Q9NYG2	299 aa		10.43	□□□□□ -0.74
ILF3-208	ENST00000587928	CCL26	Q9Y258	94 aa		10.43	□□□□□ -0.74
ILF3-208	ENST00000587928	CEP250	Q9BV73	2442 aa		10.43	□□□□□ -0.74
ILF3-208	ENST00000587928		A0A1W2PRU2	124 aa		10.43	□□□□□ -0.74
ILF3-208	ENST00000587928	SSX2	Q16385	188 aa		10.43	□□□□□ -0.74
ILF3-208	ENST00000587928	YIF1B	Q5BJH7	314 aa		10.43	□□□□□ -0.74
ILF3-208	ENST00000587928	PLEKHS1	Q5SXH7	462 aa		10.43	□□□□□ -0.74
ILF3-208	ENST00000587928	TPRG1L	Q5T0D9	272 aa		10.43	□□□□□ -0.74
ILF3-208	ENST00000587928	ZNF770	Q6IQ21	691 aa	Predicted RBP	10.43	□□□□□ -0.74
ILF3-208	ENST00000587928	LRRC17	Q8N6Y2	441 aa		10.43	□□□□□ -0.74
ILF3-208	ENST00000587928	CHTF18	Q8WVB6	975 aa		10.43	□□□□□ -0.74
ILF3-208	ENST00000587928	COQ10A	Q96MF6	247 aa		10.43	□□□□□ -0.74
ILF3-208	ENST00000587928	SLC46A2	Q9BY10	475 aa		10.43	□□□□□ -0.74
ILF3-208	ENST00000587928	IPPK	Q9H8X2	491 aa		10.43	□□□□□ -0.74
ILF3-208	ENST00000587928	ACTR10	Q9NZ32	417 aa		10.43	□□□□□ -0.74
ILF3-208	ENST00000587928	REV1	Q9UBZ9	1251 aa		10.43	□□□□□ -0.74
ILF3-208	ENST00000587928	CCL16	O15467	120 aa		10.43	□□□□□ -0.74
ILF3-208	ENST00000587928	PGR	P06401	933 aa		10.43	□□□□□ -0.74
ILF3-208	ENST00000587928	MAPK1	P28482	360 aa		10.43	□□□□□ -0.74
ILF3-208	ENST00000587928	CTNNB1	P35222	781 aa		10.43	□□□□□ -0.74
ILF3-208	ENST00000587928	DCT	P40126	519 aa		10.43	□□□□□ -0.74
ILF3-208	ENST00000587928	EFNB1	P98172	346 aa		10.43	□□□□□ -0.74
ILF3-208	ENST00000587928	ADAM15	Q13444	863 aa		10.43	□□□□□ -0.74
ILF3-208	ENST00000587928	DAG1	Q14118	895 aa		10.43	□□□□□ -0.74
ILF3-208	ENST00000587928	IRF3	Q14653	427 aa		10.43	□□□□□ -0.74
ILF3-208	ENST00000587928	GTDC1	Q4AE62	458 aa		10.43	□□□□□ -0.74
ILF3-208	ENST00000587928	PSRC1	Q6PGN9	363 aa	Predicted RBP	10.43	□□□□□ -0.74
ILF3-208	ENST00000587928	GLRX5	Q86SX6	157 aa		10.43	□□□□□ -0.74
ILF3-208	ENST00000587928	LYSMD2	Q8IV50	215 aa		10.43	□□□□□ -0.74
ILF3-208	ENST00000587928	OR2AP1	Q8NGE2	309 aa		10.43	□□□□□ -0.74
ILF3-208	ENST00000587928	NETO1	Q8TDF5	533 aa		10.43	□□□□□ -0.74
ILF3-208	ENST00000587928	AP2M1	Q96CW1	435 aa		10.43	□□□□□ -0.74
ILF3-208	ENST00000587928	LINC00615	Q96LM1	132 aa	Predicted RBP	10.43	□□□□□ -0.74
ILF3-208	ENST00000587928	INPP5K	Q9BT40	448 aa		10.43	□□□□□ -0.74
ILF3-208	ENST00000587928	FUNDC2	Q9BWH2	189 aa		10.43	□□□□□ -0.74
ILF3-208	ENST00000587928	DPY30	Q9C005	99 aa		10.43	□□□□□ -0.74
ILF3-208	ENST00000587928	EPHX3	Q9H6B9	360 aa		10.43	□□□□□ -0.74
ILF3-208	ENST00000587928	UBQLN2	Q9UHD9	624 aa		10.43	□□□□□ -0.74
ILF3-208	ENST00000587928	CACNG2	Q9Y698	323 aa		10.43	□□□□□ -0.74
ILF3-208	ENST00000587928	CSNK1G3	Q9Y6M4	447 aa		10.43	□□□□□ -0.74
ILF3-208	ENST00000587928	TNRC18	O15417	2968 aa	Predicted RBP	10.43	□□□□□ -0.74
ILF3-208	ENST00000587928	PI15	O43692	258 aa		10.42	□□□□□ -0.74
ILF3-208	ENST00000587928	CNP	P09543	421 aa	Known RBP	10.42	□□□□□ -0.74
ILF3-208	ENST00000587928	BMP4	P12644	408 aa		10.42	□□□□□ -0.74
ILF3-208	ENST00000587928	S100P	P25815	95 aa		10.42	□□□□□ -0.74
ILF3-208	ENST00000587928	PTX3	P26022	381 aa	Predicted RBP	10.42	□□□□□ -0.74
ILF3-208	ENST00000587928	GK	P32189	559 aa		10.42	□□□□□ -0.74
ILF3-208	ENST00000587928	PCBP3	P57721	371 aa	Known RBP	10.42	□□□□□ -0.74
ILF3-208	ENST00000587928	KCNJ10	P78508	379 aa		10.42	□□□□□ -0.74
ILF3-208	ENST00000587928	GPAT3	Q53EU6	434 aa		10.42	□□□□□ -0.74
ILF3-208	ENST00000587928	TMBIM1	Q969X1	311 aa		10.42	□□□□□ -0.74

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