RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000567479.1

KIFC3-231, Transcript of kinesin family member C3, human

TSL 4

Gene KIFC3, Length 534 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
KIFC3-231	ENST00000567479	MYOT	Q9UBF9	498 aa		8.75	□□□□□ -1.01
KIFC3-231	ENST00000567479	SH3BGRL2	Q9UJC5	107 aa		8.75	□□□□□ -1.01
KIFC3-231	ENST00000567479	TMCO1	Q9UM00	188 aa		8.75	□□□□□ -1.01
KIFC3-231	ENST00000567479	RNF11	Q9Y3C5	154 aa		8.75	□□□□□ -1.01
KIFC3-231	ENST00000567479		A0A087WUV0	522 aa	Predicted RBP	8.74	□□□□□ -1.01
KIFC3-231	ENST00000567479		A8MVJ9	347 aa		8.74	□□□□□ -1.01
KIFC3-231	ENST00000567479	C17orf105	B2RV13	164 aa		8.74	□□□□□ -1.01
KIFC3-231	ENST00000567479	FOXE1	O00358	373 aa	Predicted RBP	8.74	□□□□□ -1.01
KIFC3-231	ENST00000567479	PLPP1	O14494	284 aa		8.74	□□□□□ -1.01
KIFC3-231	ENST00000567479	DYRK3	O43781	588 aa		8.74	□□□□□ -1.01
KIFC3-231	ENST00000567479	PEX1	O43933	1283 aa		8.74	□□□□□ -1.01
KIFC3-231	ENST00000567479	PRKN	O60260	465 aa	Predicted RBP	8.74	□□□□□ -1.01
KIFC3-231	ENST00000567479	SMIM24	O75264	130 aa		8.74	□□□□□ -1.01
KIFC3-231	ENST00000567479	OR2J2	O76002	312 aa		8.74	□□□□□ -1.01
KIFC3-231	ENST00000567479	SIX3	O95343	332 aa	Predicted RBP	8.74	□□□□□ -1.01
KIFC3-231	ENST00000567479	ESRRA	P11474	423 aa	Predicted RBP	8.74	□□□□□ -1.01
KIFC3-231	ENST00000567479	COX7A2	P14406	83 aa		8.74	□□□□□ -1.01
KIFC3-231	ENST00000567479	ZNF24	P17028	368 aa		8.74	□□□□□ -1.01
KIFC3-231	ENST00000567479	ECHS1	P30084	290 aa		8.74	□□□□□ -1.01
KIFC3-231	ENST00000567479	ARL1	P40616	181 aa	Predicted RBP	8.74	□□□□□ -1.01
KIFC3-231	ENST00000567479	MAGEA12	P43365	314 aa		8.74	□□□□□ -1.01
KIFC3-231	ENST00000567479	NEK2	P51955	445 aa		8.74	□□□□□ -1.01
KIFC3-231	ENST00000567479	ID2	Q02363	134 aa		8.74	□□□□□ -1.01
KIFC3-231	ENST00000567479	CUL3	Q13618	768 aa		8.74	□□□□□ -1.01
KIFC3-231	ENST00000567479	C3AR1	Q16581	482 aa		8.74	□□□□□ -1.01
KIFC3-231	ENST00000567479	TSNAXIP1	Q2TAA8	658 aa		8.74	□□□□□ -1.01
KIFC3-231	ENST00000567479	TECRL	Q5HYJ1	363 aa		8.74	□□□□□ -1.01
KIFC3-231	ENST00000567479	SP5	Q6BEB4	398 aa	Predicted RBP	8.74	□□□□□ -1.01
KIFC3-231	ENST00000567479	IL20RB	Q6UXL0	311 aa		8.74	□□□□□ -1.01
KIFC3-231	ENST00000567479	C16orf47	Q6ZP98	133 aa	Predicted RBP	8.74	□□□□□ -1.01
KIFC3-231	ENST00000567479	OR4N5	Q8IXE1	308 aa		8.74	□□□□□ -1.01
KIFC3-231	ENST00000567479	GPALPP1	Q8IXQ4	340 aa		8.74	□□□□□ -1.01
KIFC3-231	ENST00000567479	IFT20	Q8IY31	132 aa		8.74	□□□□□ -1.01
KIFC3-231	ENST00000567479	SLC34A3	Q8N130	599 aa		8.74	□□□□□ -1.01
KIFC3-231	ENST00000567479	CYP4Z2P	Q8N1L4	340 aa		8.74	□□□□□ -1.01
KIFC3-231	ENST00000567479	GHDC	Q8N2G8	530 aa		8.74	□□□□□ -1.01
KIFC3-231	ENST00000567479	ZCCHC7	Q8N3Z6	543 aa	Known RBP	8.74	□□□□□ -1.01
KIFC3-231	ENST00000567479	CEP112	Q8N8E3	955 aa		8.74	□□□□□ -1.01
KIFC3-231	ENST00000567479	PTGR2	Q8N8N7	351 aa	Predicted RBP	8.74	□□□□□ -1.01
KIFC3-231	ENST00000567479	L3MBTL4	Q8NA19	623 aa		8.74	□□□□□ -1.01
KIFC3-231	ENST00000567479	OR5L2	Q8NGL0	311 aa		8.74	□□□□□ -1.01
KIFC3-231	ENST00000567479	KIF18A	Q8NI77	898 aa		8.74	□□□□□ -1.01
KIFC3-231	ENST00000567479	UHMK1	Q8TAS1	419 aa	Known RBP	8.74	□□□□□ -1.01
KIFC3-231	ENST00000567479	WDR20	Q8TBZ3	569 aa		8.74	□□□□□ -1.01
KIFC3-231	ENST00000567479	ASB15	Q8WXK1	588 aa		8.74	□□□□□ -1.01
KIFC3-231	ENST00000567479	ISL2	Q96A47	359 aa		8.74	□□□□□ -1.01
KIFC3-231	ENST00000567479	MTFMT	Q96DP5	389 aa	Known RBP	8.74	□□□□□ -1.01
KIFC3-231	ENST00000567479	MAGED4	Q96JG8	741 aa		8.74	□□□□□ -1.01
KIFC3-231	ENST00000567479	DGAT2	Q96PD7	388 aa		8.74	□□□□□ -1.01
KIFC3-231	ENST00000567479	OR8D2	Q9GZM6	311 aa		8.74	□□□□□ -1.01
KIFC3-231	ENST00000567479	TIMMDC1	Q9NPL8	285 aa		8.74	□□□□□ -1.01
KIFC3-231	ENST00000567479	HPF1	Q9NWY4	346 aa		8.74	□□□□□ -1.01
KIFC3-231	ENST00000567479	COPS7A	Q9UBW8	275 aa		8.74	□□□□□ -1.01
KIFC3-231	ENST00000567479	PHF11	Q9UIL8	331 aa		8.74	□□□□□ -1.01
KIFC3-231	ENST00000567479	ZNF180	Q9UJW8	692 aa		8.74	□□□□□ -1.01
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KIFC3-231	ENST00000567479	SCN2A	Q99250	2005 aa		8.74	□□□□□ -1.01
KIFC3-231	ENST00000567479	POLE	Q07864	2286 aa		8.74	□□□□□ -1.01
KIFC3-231	ENST00000567479	UTP20	O75691	2785 aa	Known RBP	8.73	□□□□□ -1.01
KIFC3-231	ENST00000567479	ICE1	Q9Y2F5	2266 aa		8.73	□□□□□ -1.01
KIFC3-231	ENST00000567479	TMEM200C	A6NKL6	621 aa		8.73	□□□□□ -1.01
KIFC3-231	ENST00000567479	TRIM49D1	C9J1S8	452 aa		8.73	□□□□□ -1.01
KIFC3-231	ENST00000567479	STX16-NPEPL1	H3BU86	382 aa		8.73	□□□□□ -1.01
KIFC3-231	ENST00000567479	WWP2	O00308	870 aa		8.73	□□□□□ -1.01
KIFC3-231	ENST00000567479	OR7A17	O14581	309 aa		8.73	□□□□□ -1.01
KIFC3-231	ENST00000567479	STX16	O14662	325 aa		8.73	□□□□□ -1.01
KIFC3-231	ENST00000567479	PROM1	O43490	865 aa		8.73	□□□□□ -1.01
KIFC3-231	ENST00000567479	ETHE1	O95571	254 aa		8.73	□□□□□ -1.01
KIFC3-231	ENST00000567479	SNRPA	P09012	282 aa	Known RBP	8.73	□□□□□ -1.01
KIFC3-231	ENST00000567479	ABO	P16442	354 aa		8.73	□□□□□ -1.01
KIFC3-231	ENST00000567479	BUD31	P41223	144 aa	Predicted RBP	8.73	□□□□□ -1.01
KIFC3-231	ENST00000567479	STT3A	P46977	705 aa		8.73	□□□□□ -1.01
KIFC3-231	ENST00000567479	MEOX1	P50221	254 aa		8.73	□□□□□ -1.01
KIFC3-231	ENST00000567479	CCNG1	P51959	295 aa		8.73	□□□□□ -1.01
KIFC3-231	ENST00000567479	RNF4	P78317	190 aa		8.73	□□□□□ -1.01
KIFC3-231	ENST00000567479	RNFT1	Q5M7Z0	435 aa		8.73	□□□□□ -1.01
KIFC3-231	ENST00000567479	C18orf63	Q68DL7	685 aa		8.73	□□□□□ -1.01
KIFC3-231	ENST00000567479	TTC19	Q6DKK2	380 aa	Predicted RBP	8.73	□□□□□ -1.01
KIFC3-231	ENST00000567479	CYP20A1	Q6UW02	462 aa		8.73	□□□□□ -1.01
KIFC3-231	ENST00000567479	BNC2	Q6ZN30	1099 aa	Predicted RBP	8.73	□□□□□ -1.01
KIFC3-231	ENST00000567479		Q6ZPB1	254 aa	Predicted RBP	8.73	□□□□□ -1.01
KIFC3-231	ENST00000567479	MDGA2	Q7Z553	956 aa		8.73	□□□□□ -1.01
KIFC3-231	ENST00000567479	MRGPRG	Q86SM5	289 aa		8.73	□□□□□ -1.01
KIFC3-231	ENST00000567479	SIAH3	Q8IW03	269 aa		8.73	□□□□□ -1.01
KIFC3-231	ENST00000567479	ZNF321P	Q8N8H1	164 aa		8.73	□□□□□ -1.01
KIFC3-231	ENST00000567479	OR8K3	Q8NH51	312 aa		8.73	□□□□□ -1.01
KIFC3-231	ENST00000567479	C16orf52	Q8NHV5	167 aa		8.73	□□□□□ -1.01
KIFC3-231	ENST00000567479	SLC2A12	Q8TD20	617 aa		8.73	□□□□□ -1.01
KIFC3-231	ENST00000567479	DCAKD	Q8WVC6	231 aa		8.73	□□□□□ -1.01
KIFC3-231	ENST00000567479	SREK1	Q8WXA9	508 aa	Known RBP	8.73	□□□□□ -1.01
KIFC3-231	ENST00000567479	PPWD1	Q96BP3	646 aa	Known RBP	8.73	□□□□□ -1.01
KIFC3-231	ENST00000567479	CCDC120	Q96HB5	630 aa		8.73	□□□□□ -1.01
KIFC3-231	ENST00000567479	SENP5	Q96HI0	755 aa	Predicted RBP	8.73	□□□□□ -1.01
KIFC3-231	ENST00000567479	CDK15	Q96Q40	435 aa		8.73	□□□□□ -1.01
KIFC3-231	ENST00000567479	RASL10B	Q96S79	203 aa		8.73	□□□□□ -1.01
KIFC3-231	ENST00000567479	SERPINI1	Q99574	410 aa		8.73	□□□□□ -1.01
KIFC3-231	ENST00000567479	MRPL57	Q9BQC6	102 aa	Known RBP	8.73	□□□□□ -1.01
KIFC3-231	ENST00000567479	NTMT1	Q9BV86	223 aa		8.73	□□□□□ -1.01
KIFC3-231	ENST00000567479	DDX31	Q9H8H2	851 aa	Known RBP	8.73	□□□□□ -1.01

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