RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000564343.5

TCF4-223, Transcript of transcription factor 4, human

TSL 4

Gene TCF4, Length 568 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
TCF4-223	ENST00000564343	ZNF37A	P17032	561 aa	Predicted RBP	4.87	□□□□□ -1.63
TCF4-223	ENST00000564343	AGA	P20933	346 aa		4.87	□□□□□ -1.63
TCF4-223	ENST00000564343	GCSH	P23434	173 aa		4.87	□□□□□ -1.63
TCF4-223	ENST00000564343	MSN	P26038	577 aa	Known RBP	4.87	□□□□□ -1.63
TCF4-223	ENST00000564343	SSTR2	P30874	369 aa		4.87	□□□□□ -1.63
TCF4-223	ENST00000564343	FOXN2	P32314	431 aa		4.87	□□□□□ -1.63
TCF4-223	ENST00000564343	ATP5O	P48047	213 aa		4.87	□□□□□ -1.63
TCF4-223	ENST00000564343	CARS	P49589	748 aa	Known RBP	4.87	□□□□□ -1.63
TCF4-223	ENST00000564343	OCA2	Q04671	838 aa		4.87	□□□□□ -1.63
TCF4-223	ENST00000564343	TLE4	Q04727	773 aa		4.87	□□□□□ -1.63
TCF4-223	ENST00000564343	HSPA14	Q0VDF9	509 aa		4.87	□□□□□ -1.63
TCF4-223	ENST00000564343	PRPSAP1	Q14558	356 aa		4.87	□□□□□ -1.63
TCF4-223	ENST00000564343	ZNF267	Q14586	743 aa	Predicted RBP	4.87	□□□□□ -1.63
TCF4-223	ENST00000564343	POU6F1	Q14863	301 aa		4.87	□□□□□ -1.63
TCF4-223	ENST00000564343	SYT16	Q17RD7	645 aa		4.87	□□□□□ -1.63
TCF4-223	ENST00000564343	CCSMST1	Q4G0I0	132 aa		4.87	□□□□□ -1.63
TCF4-223	ENST00000564343	SYTL3	Q4VX76	610 aa		4.87	□□□□□ -1.63
TCF4-223	ENST00000564343	TCTE1	Q5JU00	501 aa		4.87	□□□□□ -1.63
TCF4-223	ENST00000564343	KCTD11	Q693B1	232 aa		4.87	□□□□□ -1.63
TCF4-223	ENST00000564343	ITPRIPL1	Q6GPH6	555 aa		4.87	□□□□□ -1.63
TCF4-223	ENST00000564343	MTFR2	Q6P444	385 aa		4.87	□□□□□ -1.63
TCF4-223	ENST00000564343	PACS1	Q6VY07	963 aa		4.87	□□□□□ -1.63
TCF4-223	ENST00000564343		Q6ZNX1	250 aa		4.87	□□□□□ -1.63
TCF4-223	ENST00000564343		Q6ZPB1	254 aa	Predicted RBP	4.87	□□□□□ -1.63
TCF4-223	ENST00000564343	BBS12	Q6ZW61	710 aa		4.87	□□□□□ -1.63
TCF4-223	ENST00000564343	NEK10	Q6ZWH5	1172 aa		4.87	□□□□□ -1.63
TCF4-223	ENST00000564343	TMTC1	Q8IUR5	882 aa		4.87	□□□□□ -1.63
TCF4-223	ENST00000564343	KLHDC8B	Q8IXV7	354 aa		4.87	□□□□□ -1.63
TCF4-223	ENST00000564343	KATNAL2	Q8IYT4	538 aa		4.87	□□□□□ -1.63
TCF4-223	ENST00000564343	RCOR2	Q8IZ40	523 aa		4.87	□□□□□ -1.63
TCF4-223	ENST00000564343	SLC22A15	Q8IZD6	547 aa		4.87	□□□□□ -1.63
TCF4-223	ENST00000564343	AMER3	Q8N944	861 aa		4.87	□□□□□ -1.63
TCF4-223	ENST00000564343	TTC29	Q8NA56	475 aa	Predicted RBP	4.87	□□□□□ -1.63
TCF4-223	ENST00000564343	ACBD4	Q8NC06	268 aa		4.87	□□□□□ -1.63
TCF4-223	ENST00000564343	OR2L8	Q8NGY9	312 aa		4.87	□□□□□ -1.63
TCF4-223	ENST00000564343	CFAP61	Q8NHU2	1237 aa		4.87	□□□□□ -1.63
TCF4-223	ENST00000564343	ACTL9	Q8TC94	416 aa		4.87	□□□□□ -1.63
TCF4-223	ENST00000564343	LKAAEAR1	Q8TD35	194 aa		4.87	□□□□□ -1.63
TCF4-223	ENST00000564343	STYX	Q8WUJ0	223 aa		4.87	□□□□□ -1.63
TCF4-223	ENST00000564343	KRT35	Q92764	455 aa		4.87	□□□□□ -1.63
TCF4-223	ENST00000564343	SLC22A18	Q96BI1	424 aa		4.87	□□□□□ -1.63
TCF4-223	ENST00000564343	IQCD	Q96DY2	449 aa		4.87	□□□□□ -1.63
TCF4-223	ENST00000564343	VPS50	Q96JG6	964 aa		4.87	□□□□□ -1.63
TCF4-223	ENST00000564343	C10orf90	Q96M02	699 aa		4.87	□□□□□ -1.63
TCF4-223	ENST00000564343	TMEM121	Q9BTD3	319 aa		4.87	□□□□□ -1.63
TCF4-223	ENST00000564343	ADI1	Q9BV57	179 aa		4.87	□□□□□ -1.63
TCF4-223	ENST00000564343	HES7	Q9BYE0	225 aa		4.87	□□□□□ -1.63
TCF4-223	ENST00000564343	MCCC2	Q9HCC0	563 aa		4.87	□□□□□ -1.63
TCF4-223	ENST00000564343	STMN3	Q9NZ72	180 aa		4.87	□□□□□ -1.63
TCF4-223	ENST00000564343	IL1RAPL1	Q9NZN1	696 aa		4.87	□□□□□ -1.63
TCF4-223	ENST00000564343	SCOC	Q9UIL1	159 aa		4.87	□□□□□ -1.63
TCF4-223	ENST00000564343	KCNE5	Q9UJ90	142 aa		4.87	□□□□□ -1.63
TCF4-223	ENST00000564343	TFR2	Q9UP52	801 aa		4.87	□□□□□ -1.63
TCF4-223	ENST00000564343	ZNF835	Q9Y2P0	537 aa		4.87	□□□□□ -1.63
TCF4-223	ENST00000564343	MEMO1	Q9Y316	297 aa		4.87	□□□□□ -1.63
TCF4-223	ENST00000564343	ALG6	Q9Y672	507 aa		4.87	□□□□□ -1.63
TCF4-223	ENST00000564343	SPG11	Q96JI7	2443 aa		4.87	□□□□□ -1.63
TCF4-223	ENST00000564343	ZNF407	Q9C0G0	2248 aa		4.87	□□□□□ -1.63
TCF4-223	ENST00000564343	MAP1A	P78559	2803 aa	Predicted RBP	4.86	□□□□□ -1.63
TCF4-223	ENST00000564343	LOC102723996	A0A087X1L8	192 aa		4.86	□□□□□ -1.63
TCF4-223	ENST00000564343	IGHV3-20	A0A0C4DH32	117 aa		4.86	□□□□□ -1.63
TCF4-223	ENST00000564343		A0A1W2PPV9	198 aa		4.86	□□□□□ -1.63
TCF4-223	ENST00000564343	CCDC162P	A2VCL2	907 aa		4.86	□□□□□ -1.63
TCF4-223	ENST00000564343	TARM1	B6A8C7	271 aa		4.86	□□□□□ -1.63
TCF4-223	ENST00000564343	QSOX1	O00391	747 aa		4.86	□□□□□ -1.63
TCF4-223	ENST00000564343	RASGRF2	O14827	1237 aa		4.86	□□□□□ -1.63
TCF4-223	ENST00000564343	PRAMEF2	O60811	474 aa		4.86	□□□□□ -1.63
TCF4-223	ENST00000564343	GPC4	O75487	556 aa		4.86	□□□□□ -1.63
TCF4-223	ENST00000564343	METTL18	O95568	372 aa		4.86	□□□□□ -1.63
TCF4-223	ENST00000564343	SERPINA7	P05543	415 aa		4.86	□□□□□ -1.63
TCF4-223	ENST00000564343	UQCRH	P07919	91 aa		4.86	□□□□□ -1.63
TCF4-223	ENST00000564343	OR56A5	P0C7T3	313 aa		4.86	□□□□□ -1.63
TCF4-223	ENST00000564343	CAPN3	P20807	821 aa		4.86	□□□□□ -1.63
TCF4-223	ENST00000564343	PSMA3	P25788	255 aa		4.86	□□□□□ -1.63
TCF4-223	ENST00000564343	SLC26A3	P40879	764 aa		4.86	□□□□□ -1.63
TCF4-223	ENST00000564343	EMP2	P54851	167 aa		4.86	□□□□□ -1.63
TCF4-223	ENST00000564343	EIF3E	P60228	445 aa	Known RBP	4.86	□□□□□ -1.63
TCF4-223	ENST00000564343	CSNK1G2	P78368	415 aa		4.86	□□□□□ -1.63
TCF4-223	ENST00000564343	PLOD1	Q02809	727 aa	Predicted RBP	4.86	□□□□□ -1.63
TCF4-223	ENST00000564343	RBPJ	Q06330	500 aa		4.86	□□□□□ -1.63
TCF4-223	ENST00000564343	ZNF33B	Q06732	778 aa		4.86	□□□□□ -1.63
TCF4-223	ENST00000564343	MALL	Q13021	153 aa		4.86	□□□□□ -1.63
TCF4-223	ENST00000564343	FASTK	Q14296	549 aa	Known RBP	4.86	□□□□□ -1.63
TCF4-223	ENST00000564343	SEMA3A	Q14563	771 aa		4.86	□□□□□ -1.63
TCF4-223	ENST00000564343	ITIH4	Q14624	930 aa		4.86	□□□□□ -1.63
TCF4-223	ENST00000564343	HKDC1	Q2TB90	917 aa		4.86	□□□□□ -1.63
TCF4-223	ENST00000564343	CCDC38	Q502W7	563 aa		4.86	□□□□□ -1.63
TCF4-223	ENST00000564343	DNAJC21	Q5F1R6	531 aa	Known RBP	4.86	□□□□□ -1.63
TCF4-223	ENST00000564343	ZNF766	Q5HY98	468 aa		4.86	□□□□□ -1.63
TCF4-223	ENST00000564343	FCRLB	Q6BAA4	426 aa		4.86	□□□□□ -1.63
TCF4-223	ENST00000564343	AADACL2	Q6P093	401 aa		4.86	□□□□□ -1.63
TCF4-223	ENST00000564343	PRMT9	Q6P2P2	845 aa		4.86	□□□□□ -1.63
TCF4-223	ENST00000564343	DARS2	Q6PI48	645 aa	Known RBP	4.86	□□□□□ -1.63
TCF4-223	ENST00000564343	CNST	Q6PJW8	725 aa		4.86	□□□□□ -1.63
TCF4-223	ENST00000564343	C3P1	Q6ZMU1	363 aa		4.86	□□□□□ -1.63
TCF4-223	ENST00000564343	RNF44	Q7L0R7	432 aa		4.86	□□□□□ -1.63
TCF4-223	ENST00000564343	DCUN1D3	Q8IWE4	304 aa		4.86	□□□□□ -1.63
TCF4-223	ENST00000564343	CHERP	Q8IWX8	916 aa	Known RBP	4.86	□□□□□ -1.63
TCF4-223	ENST00000564343	KRT222	Q8N1A0	295 aa		4.86	□□□□□ -1.63
TCF4-223	ENST00000564343	OR2L3	Q8NG85	312 aa		4.86	□□□□□ -1.63

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