RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000563873.5

SNAP23-209, Transcript of synaptosome associated protein 23, humanhuman

TSL 3

Gene SNAP23, Length 368 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNAP23-209ENST00000563873 STAU2Q9NUL3 570 aaKnown RBP eCLIP4.86□□□□□ -1.63
SNAP23-209ENST00000563873 KCMF1Q9P0J7 381 aa4.86□□□□□ -1.63
SNAP23-209ENST00000563873 SPRR3Q9UBC9 169 aa4.86□□□□□ -1.63
SNAP23-209ENST00000563873 KCNS2Q9ULS6 477 aa4.86□□□□□ -1.63
SNAP23-209ENST00000563873 ERVK-11Q9UQG0 969 aa4.86□□□□□ -1.63
SNAP23-209ENST00000563873 LAMP3Q9UQV4 416 aa4.86□□□□□ -1.63
SNAP23-209ENST00000563873 DMRT1Q9Y5R6 373 aa4.86□□□□□ -1.63
SNAP23-209ENST00000563873 SEC23IPQ9Y6Y8 1000 aaKnown RBP4.86□□□□□ -1.63
SNAP23-209ENST00000563873 A0A0G2JMM0 328 aa4.85□□□□□ -1.63
SNAP23-209ENST00000563873 A0A1W2PPB8 328 aa4.85□□□□□ -1.63
SNAP23-209ENST00000563873 A0A1W2PRS3 328 aa4.85□□□□□ -1.63
SNAP23-209ENST00000563873 FEZF1A0PJY2 475 aa4.85□□□□□ -1.63
SNAP23-209ENST00000563873 TMEM89A2RUT3 159 aa4.85□□□□□ -1.63
SNAP23-209ENST00000563873 KIR3DP1A8MWS1 328 aa4.85□□□□□ -1.63
SNAP23-209ENST00000563873 AHRRA9YTQ3 701 aa4.85□□□□□ -1.63
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SNAP23-209ENST00000563873 FKBP9O95302 570 aa4.85□□□□□ -1.63
SNAP23-209ENST00000563873 AP2A1O95782 977 aa4.85□□□□□ -1.63
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SNAP23-209ENST00000563873 PTK6Q13882 451 aa4.85□□□□□ -1.63
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SNAP23-209ENST00000563873 LRRC8BQ6P9F7 803 aa4.85□□□□□ -1.63
SNAP23-209ENST00000563873 Q6ZRM9 215 aa4.85□□□□□ -1.63
SNAP23-209ENST00000563873 CYP4V2Q6ZWL3 525 aaPredicted RBP4.85□□□□□ -1.63
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SNAP23-209ENST00000563873 PHF13Q86YI8 300 aaPredicted RBP4.85□□□□□ -1.63
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SNAP23-209ENST00000563873 ANKRD53Q8N9V6 530 aa4.85□□□□□ -1.63
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SNAP23-209ENST00000563873 NTNG2Q96CW9 530 aa4.85□□□□□ -1.63
SNAP23-209ENST00000563873 WFIKKN1Q96NZ8 548 aa4.85□□□□□ -1.63
SNAP23-209ENST00000563873 QRFPRQ96P65 431 aa4.85□□□□□ -1.63
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SNAP23-209ENST00000563873 RAB11FIP5Q9BXF6 653 aa4.85□□□□□ -1.63
SNAP23-209ENST00000563873 DEFB126Q9BYW3 111 aa4.85□□□□□ -1.63
SNAP23-209ENST00000563873 DRC3Q9H069 523 aa4.85□□□□□ -1.63
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SNAP23-209ENST00000563873 IL1RL2Q9HB29 575 aa4.85□□□□□ -1.63
SNAP23-209ENST00000563873 SH2D2AQ9NP31 389 aa4.85□□□□□ -1.63
SNAP23-209ENST00000563873 KLHL28Q9NXS3 571 aa4.85□□□□□ -1.63
SNAP23-209ENST00000563873 RCOR1Q9UKL0 485 aa4.85□□□□□ -1.63
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SNAP23-209ENST00000563873 MED12LQ86YW9 2145 aa4.84□□□□□ -1.63
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SNAP23-209ENST00000563873 FAM237AA0A1B0GTK4 181 aa4.84□□□□□ -1.63
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SNAP23-209ENST00000563873 A8MVJ9 347 aa4.84□□□□□ -1.63
SNAP23-209ENST00000563873 FAM157AC9JC47 383 aa4.84□□□□□ -1.63
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SNAP23-209ENST00000563873 H0YGG7 62 aa4.84□□□□□ -1.63
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SNAP23-209ENST00000563873 NDST3O95803 873 aa4.84□□□□□ -1.63
SNAP23-209ENST00000563873 IGHV4-39P01824 125 aa4.84□□□□□ -1.63
SNAP23-209ENST00000563873 IGHV4-31P0DP07 118 aa4.84□□□□□ -1.63
SNAP23-209ENST00000563873 ATP1B2P14415 290 aaPredicted RBP4.84□□□□□ -1.63
SNAP23-209ENST00000563873 CHRNB2P17787 502 aa4.84□□□□□ -1.63
SNAP23-209ENST00000563873 CDK11BP21127 795 aaKnown RBP4.84□□□□□ -1.63
SNAP23-209ENST00000563873 CD9P21926 228 aa4.84□□□□□ -1.63
SNAP23-209ENST00000563873 LOXP28300 417 aaPredicted RBP4.84□□□□□ -1.63
SNAP23-209ENST00000563873 ACADLP28330 430 aa4.84□□□□□ -1.63
SNAP23-209ENST00000563873 CPOXP36551 454 aa4.84□□□□□ -1.63
SNAP23-209ENST00000563873 PPP1R2P41236 205 aa4.84□□□□□ -1.63
SNAP23-209ENST00000563873 XCR1P46094 333 aa4.84□□□□□ -1.63
SNAP23-209ENST00000563873 AVPR1BP47901 424 aa4.84□□□□□ -1.63
SNAP23-209ENST00000563873 OR4D2P58180 307 aa4.84□□□□□ -1.63
SNAP23-209ENST00000563873 ARF3P61204 181 aaPredicted RBP4.84□□□□□ -1.63
SNAP23-209ENST00000563873 LOXL1Q08397 574 aaPredicted RBP4.84□□□□□ -1.63
SNAP23-209ENST00000563873 GALNT2Q10471 571 aa4.84□□□□□ -1.63
SNAP23-209ENST00000563873 ABRAXAS2Q15018 415 aa4.84□□□□□ -1.63
SNAP23-209ENST00000563873 SF3B4Q15427 424 aaKnown RBP eCLIP4.84□□□□□ -1.632e-6■■□□□ 13.1
SNAP23-209ENST00000563873 NSDHLQ15738 373 aa4.84□□□□□ -1.63
SNAP23-209ENST00000563873 DPYSL2Q16555 572 aa4.84□□□□□ -1.63
SNAP23-209ENST00000563873 MAN2A1Q16706 1144 aa4.84□□□□□ -1.63
SNAP23-209ENST00000563873 TMEM177Q53S58 311 aa4.84□□□□□ -1.63
SNAP23-209ENST00000563873 GARNL3Q5VVW2 1013 aa4.84□□□□□ -1.63
SNAP23-209ENST00000563873 NSUN5P2Q63ZY6 315 aa4.84□□□□□ -1.63
SNAP23-209ENST00000563873 KCTD11Q693B1 232 aa4.84□□□□□ -1.63
SNAP23-209ENST00000563873 FAM166AQ6J272 317 aa4.84□□□□□ -1.63
SNAP23-209ENST00000563873 MON1BQ7L1V2 547 aa4.84□□□□□ -1.63
SNAP23-209ENST00000563873 GLT6D1Q7Z4J2 308 aa4.84□□□□□ -1.63
SNAP23-209ENST00000563873 SLC26A11Q86WA9 606 aa4.84□□□□□ -1.63
SNAP23-209ENST00000563873 BCL6BQ8N143 479 aaPredicted RBP4.84□□□□□ -1.63
SNAP23-209ENST00000563873 CSNK1A1LQ8N752 337 aa4.84□□□□□ -1.63
SNAP23-209ENST00000563873 ZNF611Q8N823 705 aa4.84□□□□□ -1.63
SNAP23-209ENST00000563873 OR5AN1Q8NGI8 311 aa4.84□□□□□ -1.63
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