RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000557065.1

COCH-211, Transcript of cochlin, humanhuman

TSL 5

Gene COCH, Length 654 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COCH-211ENST00000557065 MSH2P43246 934 aa7.56□□□□□ -1.2
COCH-211ENST00000557065 RPL21P46778 160 aaKnown RBP7.56□□□□□ -1.2
COCH-211ENST00000557065 HK2P52789 917 aa7.56□□□□□ -1.2
COCH-211ENST00000557065 CALCOCO2Q13137 446 aa7.56□□□□□ -1.2
COCH-211ENST00000557065 OR4D1Q15615 310 aa7.56□□□□□ -1.2
COCH-211ENST00000557065 FBXO48Q5FWF7 155 aa7.56□□□□□ -1.2
COCH-211ENST00000557065 PIGGQ5H8A4 983 aa7.56□□□□□ -1.2
COCH-211ENST00000557065 PRAMEF9Q5VWM5 478 aa7.56□□□□□ -1.2
COCH-211ENST00000557065 CES4AQ5XG92 561 aa7.56□□□□□ -1.2
COCH-211ENST00000557065 C3orf62Q6ZUJ4 267 aa7.56□□□□□ -1.2
COCH-211ENST00000557065 VN1R5Q7Z5H4 357 aa7.56□□□□□ -1.2
COCH-211ENST00000557065 UBE3DQ7Z6J8 389 aa7.56□□□□□ -1.2
COCH-211ENST00000557065 CCDC71Q8IV32 467 aaPredicted RBP7.56□□□□□ -1.2
COCH-211ENST00000557065 DMRTC2Q8IXT2 367 aaPredicted RBP7.56□□□□□ -1.2
COCH-211ENST00000557065 CLYBLQ8N0X4 340 aa7.56□□□□□ -1.2
COCH-211ENST00000557065 GOLM1Q8NBJ4 401 aa7.56□□□□□ -1.2
COCH-211ENST00000557065 OR5M9Q8NGP3 310 aa7.56□□□□□ -1.2
COCH-211ENST00000557065 OR5M3Q8NGP4 307 aa7.56□□□□□ -1.2
COCH-211ENST00000557065 STAG3L4Q8TBR4 150 aa7.56□□□□□ -1.2
COCH-211ENST00000557065 SLC2A12Q8TD20 617 aa7.56□□□□□ -1.2
COCH-211ENST00000557065 WDR34Q96EX3 536 aa7.56□□□□□ -1.2
COCH-211ENST00000557065 CMTM7Q96FZ5 175 aa7.56□□□□□ -1.2
COCH-211ENST00000557065 SCYL1Q96KG9 808 aa7.56□□□□□ -1.2
COCH-211ENST00000557065 CSF3RQ99062 836 aa7.56□□□□□ -1.2
COCH-211ENST00000557065 CPNE1Q99829 537 aa7.56□□□□□ -1.2
COCH-211ENST00000557065 MAPKAP1Q9BPZ7 522 aa7.56□□□□□ -1.2
COCH-211ENST00000557065 TMEM79Q9BSE2 394 aa7.56□□□□□ -1.2
COCH-211ENST00000557065 TTTY12Q9BZ98 90 aa7.56□□□□□ -1.2
COCH-211ENST00000557065 CD244Q9BZW8 370 aa7.56□□□□□ -1.2
COCH-211ENST00000557065 PHACTR1Q9C0D0 580 aa7.56□□□□□ -1.2
COCH-211ENST00000557065 LDAHQ9H6V9 325 aa7.56□□□□□ -1.2
COCH-211ENST00000557065 ZDHHC11Q9H8X9 412 aa7.56□□□□□ -1.2
COCH-211ENST00000557065 CAB39LQ9H9S4 337 aa7.56□□□□□ -1.2
COCH-211ENST00000557065 IL1RL2Q9HB29 575 aa7.56□□□□□ -1.2
COCH-211ENST00000557065 SAYSD1Q9NPB0 183 aa7.56□□□□□ -1.2
COCH-211ENST00000557065 SACM1LQ9NTJ5 587 aa7.56□□□□□ -1.2
COCH-211ENST00000557065 MS4A12Q9NXJ0 267 aa7.56□□□□□ -1.2
COCH-211ENST00000557065 RNF14Q9UBS8 474 aa7.56□□□□□ -1.2
COCH-211ENST00000557065 ADGRE2Q9UHX3 823 aa7.56□□□□□ -1.2
COCH-211ENST00000557065 RNF112Q9ULX5 631 aa7.56□□□□□ -1.2
COCH-211ENST00000557065 DCHS2Q6V1P9 2916 aa7.55□□□□□ -1.2
COCH-211ENST00000557065 CSMD1Q96PZ7 3565 aa7.55□□□□□ -1.2
COCH-211ENST00000557065 F8P00451 2351 aa7.55□□□□□ -1.2
COCH-211ENST00000557065 A0A1B0GVC2 190 aa7.55□□□□□ -1.2
COCH-211ENST00000557065 ATP6AP2A0A1C7CYW4 349 aa7.55□□□□□ -1.2
COCH-211ENST00000557065 PINLYPA6NC86 204 aa7.55□□□□□ -1.2
COCH-211ENST00000557065 FAM90A27PA6NNH2 459 aa7.55□□□□□ -1.2
COCH-211ENST00000557065 CXorf49A8MYA2 514 aaPredicted RBP7.55□□□□□ -1.2
COCH-211ENST00000557065 FAM47E-STBD1D6RA91 191 aa7.55□□□□□ -1.2
COCH-211ENST00000557065 EIF3HO15372 352 aaKnown RBP eCLIP7.55□□□□□ -1.2
COCH-211ENST00000557065 PHGDHO43175 533 aaKnown RBP7.55□□□□□ -1.2
COCH-211ENST00000557065 ATP6AP2O75787 350 aa7.55□□□□□ -1.2
COCH-211ENST00000557065 GLSO94925 669 aaPredicted RBP7.55□□□□□ -1.2
COCH-211ENST00000557065 WISP3O95389 354 aaPredicted RBP7.55□□□□□ -1.2
COCH-211ENST00000557065 ETHE1O95571 254 aa7.55□□□□□ -1.2
COCH-211ENST00000557065 TGFB1P01137 390 aa7.55□□□□□ -1.2
COCH-211ENST00000557065 IGHG3P01860 377 aa7.55□□□□□ -1.2
COCH-211ENST00000557065 HOXD4P09016 255 aaPredicted RBP7.55□□□□□ -1.2
COCH-211ENST00000557065 GSTA2P09210 222 aa7.55□□□□□ -1.2
COCH-211ENST00000557065 PCNAP12004 261 aa7.55□□□□□ -1.2
COCH-211ENST00000557065 CD1DP15813 335 aa7.55□□□□□ -1.2
COCH-211ENST00000557065 CD22P20273 847 aa7.55□□□□□ -1.2
COCH-211ENST00000557065 HIST1H1TP22492 207 aaPredicted RBP7.55□□□□□ -1.2
COCH-211ENST00000557065 ACVR2AP27037 513 aa7.55□□□□□ -1.2
COCH-211ENST00000557065 MSX1P28360 303 aa7.55□□□□□ -1.2
COCH-211ENST00000557065 SERPINB1P30740 379 aa7.55□□□□□ -1.2
COCH-211ENST00000557065 SSTR1P30872 391 aa7.55□□□□□ -1.2
COCH-211ENST00000557065 GP5P40197 560 aa7.55□□□□□ -1.2
COCH-211ENST00000557065 MAN2A2P49641 1150 aa7.55□□□□□ -1.2
COCH-211ENST00000557065 NUP107P57740 925 aa7.55□□□□□ -1.2
COCH-211ENST00000557065 RAB10P61026 200 aa7.55□□□□□ -1.2
COCH-211ENST00000557065 ID2Q02363 134 aa7.55□□□□□ -1.2
COCH-211ENST00000557065 TBL3Q12788 808 aaKnown RBP7.55□□□□□ -1.2
COCH-211ENST00000557065 ASPHQ12797 758 aa7.55□□□□□ -1.2
COCH-211ENST00000557065 SLAMF1Q13291 335 aa7.55□□□□□ -1.2
COCH-211ENST00000557065 TESK1Q15569 626 aa7.55□□□□□ -1.2
COCH-211ENST00000557065 MPEG1Q2M385 716 aa7.55□□□□□ -1.2
COCH-211ENST00000557065 DEPDC1Q5TB30 811 aa7.55□□□□□ -1.2
COCH-211ENST00000557065 GRTP1Q5TC63 336 aa7.55□□□□□ -1.2
COCH-211ENST00000557065 SLC22A10Q63ZE4 541 aa7.55□□□□□ -1.2
COCH-211ENST00000557065 OR4C11Q6IEV9 310 aa7.55□□□□□ -1.2
COCH-211ENST00000557065 MED27Q6P2C8 311 aa7.55□□□□□ -1.2
COCH-211ENST00000557065 ZNF585AQ6P3V2 769 aa7.55□□□□□ -1.2
COCH-211ENST00000557065 B3GNT6Q6ZMB0 384 aa7.55□□□□□ -1.2
COCH-211ENST00000557065 SPNS3Q6ZMD2 512 aa7.55□□□□□ -1.2
COCH-211ENST00000557065 RAPH1Q70E73 1250 aa7.55□□□□□ -1.2
COCH-211ENST00000557065 TRILQ7L0X0 811 aa7.55□□□□□ -1.2
COCH-211ENST00000557065 MAATS1Q7Z4T9 603 aa7.55□□□□□ -1.2
COCH-211ENST00000557065 CTAGE3PQ8IX95 158 aa7.55□□□□□ -1.2
COCH-211ENST00000557065 OR4N5Q8IXE1 308 aa7.55□□□□□ -1.2
COCH-211ENST00000557065 LAS2Q8IYD9 372 aa7.55□□□□□ -1.2
COCH-211ENST00000557065 SLC15A4Q8N697 577 aa7.55□□□□□ -1.2
COCH-211ENST00000557065 ZNF321PQ8N8H1 164 aa7.55□□□□□ -1.2
COCH-211ENST00000557065 PDPRQ8NCN5 879 aa7.55□□□□□ -1.2
COCH-211ENST00000557065 MYRIPQ8NFW9 859 aa7.55□□□□□ -1.2
COCH-211ENST00000557065 OR7G3Q8NG95 312 aa7.55□□□□□ -1.2
COCH-211ENST00000557065 ZNF473Q8WTR7 871 aaKnown RBP7.55□□□□□ -1.2
COCH-211ENST00000557065 TANKQ92844 425 aa7.55□□□□□ -1.2
COCH-211ENST00000557065 RGMAQ96B86 450 aa7.55□□□□□ -1.2
COCH-211ENST00000557065 ANKRD9Q96BM1 317 aaPredicted RBP7.55□□□□□ -1.2
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 65.4 ms