RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000551984.5

FGD4-215, Transcript of FYVE, RhoGEF and PH domain containing 4, human

TSL 5

Gene FGD4, Length 2,435 nt, Biotype nonsense mediated decay.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
FGD4-215	ENST00000551984	CACHD1	Q5VU97	1274 aa		6.19	□□□□□ -1.42
FGD4-215	ENST00000551984	AGAP6	Q5VW22	663 aa		6.19	□□□□□ -1.42
FGD4-215	ENST00000551984	FAM205BP	Q63HN1	556 aa		6.19	□□□□□ -1.42
FGD4-215	ENST00000551984	DARS2	Q6PI48	645 aa	Known RBP	6.19	□□□□□ -1.42
FGD4-215	ENST00000551984	GK5	Q6ZS86	529 aa		6.19	□□□□□ -1.42
FGD4-215	ENST00000551984	GALNT12	Q8IXK2	581 aa		6.19	□□□□□ -1.42
FGD4-215	ENST00000551984	UNC5B	Q8IZJ1	945 aa		6.19	□□□□□ -1.42
FGD4-215	ENST00000551984	SPART	Q8N0X7	666 aa		6.19	□□□□□ -1.42
FGD4-215	ENST00000551984	FAM109A	Q8N4B1	249 aa		6.19	□□□□□ -1.42
FGD4-215	ENST00000551984	POC5	Q8NA72	575 aa		6.19	□□□□□ -1.42
FGD4-215	ENST00000551984	OR13C4	Q8NGS5	318 aa		6.19	□□□□□ -1.42
FGD4-215	ENST00000551984	OR5H6	Q8NGV6	325 aa		6.19	□□□□□ -1.42
FGD4-215	ENST00000551984	RHOXF1	Q8NHV9	184 aa		6.19	□□□□□ -1.42
FGD4-215	ENST00000551984	KIAA1143	Q96AT1	154 aa	Predicted RBP	6.19	□□□□□ -1.42
FGD4-215	ENST00000551984	ULK4	Q96C45	1275 aa		6.19	□□□□□ -1.42
FGD4-215	ENST00000551984	AGAP4	Q96P64	663 aa		6.19	□□□□□ -1.42
FGD4-215	ENST00000551984	FCRL4	Q96PJ5	515 aa		6.19	□□□□□ -1.42
FGD4-215	ENST00000551984	INSM2	Q96T92	566 aa	Predicted RBP	6.19	□□□□□ -1.42
FGD4-215	ENST00000551984	CD180	Q99467	661 aa		6.19	□□□□□ -1.42
FGD4-215	ENST00000551984	OCSTAMP	Q9BR26	566 aa		6.19	□□□□□ -1.42
FGD4-215	ENST00000551984	DGCR6L	Q9BY27	220 aa		6.19	□□□□□ -1.42
FGD4-215	ENST00000551984	ALOXE3	Q9BYJ1	711 aa		6.19	□□□□□ -1.42
FGD4-215	ENST00000551984	SLC25A18	Q9H1K4	315 aa		6.19	□□□□□ -1.42
FGD4-215	ENST00000551984	ASB8	Q9H765	288 aa		6.19	□□□□□ -1.42
FGD4-215	ENST00000551984	SYTL2	Q9HCH5	934 aa		6.19	□□□□□ -1.42
FGD4-215	ENST00000551984	CCM2L	Q9NUG4	571 aa	Predicted RBP	6.19	□□□□□ -1.42
FGD4-215	ENST00000551984	DDX28	Q9NUL7	540 aa	Known RBP	6.19	□□□□□ -1.42
FGD4-215	ENST00000551984	SMPD3	Q9NY59	655 aa	Predicted RBP	6.19	□□□□□ -1.42
FGD4-215	ENST00000551984	IL17B	Q9UHF5	180 aa		6.19	□□□□□ -1.42
FGD4-215	ENST00000551984	COPG1	Q9Y678	874 aa	Known RBP	6.19	□□□□□ -1.42
FGD4-215	ENST00000551984	IGLV3-16	A0A075B6K0	115 aa		6.18	□□□□□ -1.42
FGD4-215	ENST00000551984	IGHV5-51	A0A0C4DH38	117 aa		6.18	□□□□□ -1.42
FGD4-215	ENST00000551984	C17orf113	A0A1B0GUU1	675 aa		6.18	□□□□□ -1.42
FGD4-215	ENST00000551984	OR5K3	A6NET4	321 aa		6.18	□□□□□ -1.42
FGD4-215	ENST00000551984		H7C0S8	307 aa		6.18	□□□□□ -1.42
FGD4-215	ENST00000551984	NKX2-8	O15522	239 aa		6.18	□□□□□ -1.42
FGD4-215	ENST00000551984	SUV39H1	O43463	412 aa		6.18	□□□□□ -1.42
FGD4-215	ENST00000551984	LDB2	O43679	373 aa		6.18	□□□□□ -1.42
FGD4-215	ENST00000551984	TPST1	O60507	370 aa		6.18	□□□□□ -1.42
FGD4-215	ENST00000551984	JUN	P05412	331 aa	Known RBP	6.18	□□□□□ -1.42
FGD4-215	ENST00000551984	CAPN1	P07384	714 aa		6.18	□□□□□ -1.42
FGD4-215	ENST00000551984	HTR1A	P08908	422 aa		6.18	□□□□□ -1.42
FGD4-215	ENST00000551984	F8A1	P23610	371 aa		6.18	□□□□□ -1.42
FGD4-215	ENST00000551984	IL32	P24001	234 aa		6.18	□□□□□ -1.42
FGD4-215	ENST00000551984	AKT1	P31749	480 aa		6.18	□□□□□ -1.42
FGD4-215	ENST00000551984	PTGS2	P35354	604 aa		6.18	□□□□□ -1.42
FGD4-215	ENST00000551984	PRLHR	P49683	370 aa		6.18	□□□□□ -1.42
FGD4-215	ENST00000551984	RNF144A	P50876	292 aa	Predicted RBP	6.18	□□□□□ -1.42
FGD4-215	ENST00000551984	ADARB1	P78563	741 aa	Known RBP	6.18	□□□□□ -1.42
FGD4-215	ENST00000551984	MC1R	Q01726	317 aa		6.18	□□□□□ -1.42
FGD4-215	ENST00000551984	FOXD4	Q12950	439 aa	Predicted RBP	6.18	□□□□□ -1.42
FGD4-215	ENST00000551984	TMEM236	Q5W0B7	351 aa		6.18	□□□□□ -1.42
FGD4-215	ENST00000551984	STEAP3	Q658P3	488 aa		6.18	□□□□□ -1.42
FGD4-215	ENST00000551984	LRRC8E	Q6NSJ5	796 aa		6.18	□□□□□ -1.42
FGD4-215	ENST00000551984	C6orf15	Q6UXA7	325 aa	Predicted RBP	6.18	□□□□□ -1.42
FGD4-215	ENST00000551984	FAM92B	Q6ZTR7	304 aa		6.18	□□□□□ -1.42
FGD4-215	ENST00000551984	SNX20	Q7Z614	316 aa		6.18	□□□□□ -1.42
FGD4-215	ENST00000551984	DHFR2	Q86XF0	187 aa		6.18	□□□□□ -1.42
FGD4-215	ENST00000551984	KMT5C	Q86Y97	462 aa		6.18	□□□□□ -1.42
FGD4-215	ENST00000551984	CARF	Q8N187	725 aa		6.18	□□□□□ -1.42
FGD4-215	ENST00000551984	NXPE1	Q8N323	547 aa		6.18	□□□□□ -1.42
FGD4-215	ENST00000551984	MPP5	Q8N3R9	675 aa		6.18	□□□□□ -1.42
FGD4-215	ENST00000551984	LILRB1	Q8NHL6	650 aa	Predicted RBP	6.18	□□□□□ -1.42
FGD4-215	ENST00000551984	GRPEL2	Q8TAA5	225 aa		6.18	□□□□□ -1.42
FGD4-215	ENST00000551984	NDNF	Q8TB73	568 aa		6.18	□□□□□ -1.42
FGD4-215	ENST00000551984	HEXDC	Q8WVB3	486 aa		6.18	□□□□□ -1.42
FGD4-215	ENST00000551984	MOCOS	Q96EN8	888 aa		6.18	□□□□□ -1.42
FGD4-215	ENST00000551984	SIGLEC10	Q96LC7	697 aa		6.18	□□□□□ -1.42
FGD4-215	ENST00000551984	OR6C1	Q96RD1	312 aa		6.18	□□□□□ -1.42
FGD4-215	ENST00000551984	APOL2	Q9BQE5	337 aa		6.18	□□□□□ -1.42
FGD4-215	ENST00000551984	SLA2	Q9H6Q3	261 aa		6.18	□□□□□ -1.42
FGD4-215	ENST00000551984	AURKC	Q9UQB9	309 aa		6.18	□□□□□ -1.42
FGD4-215	ENST00000551984	POLH	Q9Y253	713 aa		6.18	□□□□□ -1.42
FGD4-215	ENST00000551984	PCDHGA6	Q9Y5G7	932 aa		6.18	□□□□□ -1.42
FGD4-215	ENST00000551984	TLN1	Q9Y490	2541 aa	Known RBP	6.18	□□□□□ -1.42
FGD4-215	ENST00000551984	ASH1L	Q9NR48	2969 aa	Known RBP	6.18	□□□□□ -1.42
FGD4-215	ENST00000551984	TLCD2	A6NGC4	264 aa		6.18	□□□□□ -1.42
FGD4-215	ENST00000551984	MEN1	O00255	615 aa		6.18	□□□□□ -1.42
FGD4-215	ENST00000551984	SHOX	O15266	292 aa		6.18	□□□□□ -1.42
FGD4-215	ENST00000551984	RECK	O95980	971 aa		6.18	□□□□□ -1.42
FGD4-215	ENST00000551984	PTTG1	O95997	202 aa		6.18	□□□□□ -1.42
FGD4-215	ENST00000551984	APRT	P07741	180 aa		6.18	□□□□□ -1.42
FGD4-215	ENST00000551984	CRHBP	P24387	322 aa		6.18	□□□□□ -1.42
FGD4-215	ENST00000551984	PBLD	P30039	288 aa	Predicted RBP	6.18	□□□□□ -1.42
FGD4-215	ENST00000551984	GPC1	P35052	558 aa		6.18	□□□□□ -1.42
FGD4-215	ENST00000551984	MAGEA3	P43357	314 aa		6.18	□□□□□ -1.42
FGD4-215	ENST00000551984	CCR10	P46092	362 aa		6.18	□□□□□ -1.42
FGD4-215	ENST00000551984	TAGLN	Q01995	201 aa	Known RBP	6.18	□□□□□ -1.42
FGD4-215	ENST00000551984	SRSF11	Q05519	484 aa	Known RBP	6.18	□□□□□ -1.42
FGD4-215	ENST00000551984	FOXM1	Q08050	763 aa		6.18	□□□□□ -1.42
FGD4-215	ENST00000551984	KCNAB2	Q13303	367 aa		6.18	□□□□□ -1.42
FGD4-215	ENST00000551984	ACAP2	Q15057	778 aa		6.18	□□□□□ -1.42
FGD4-215	ENST00000551984	DGUOK	Q16854	277 aa		6.18	□□□□□ -1.42
FGD4-215	ENST00000551984	DPY19L1	Q2PZI1	675 aa		6.18	□□□□□ -1.42
FGD4-215	ENST00000551984	ADPRM	Q3LIE5	342 aa		6.18	□□□□□ -1.42
FGD4-215	ENST00000551984	ZFP69	Q49AA0	526 aa		6.18	□□□□□ -1.42
FGD4-215	ENST00000551984	GPR33	Q49SQ1	333 aa		6.18	□□□□□ -1.42
FGD4-215	ENST00000551984		Q5BKY6	102 aa		6.18	□□□□□ -1.42
FGD4-215	ENST00000551984	PXDC1	Q5TGL8	231 aa		6.18	□□□□□ -1.42
FGD4-215	ENST00000551984	NXN	Q6DKJ4	435 aa		6.18	□□□□□ -1.42

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