RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000545887.1

GABARAPL1-217, Transcript of GABA type A receptor associated protein like 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 3 BASIC

Gene GABARAPL1, Length 571 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GABARAPL1-217ENST00000545887 HSD17B7P56937 341 aa14.6□□□□□ -0.07
GABARAPL1-217ENST00000545887 C2orf80Q0P641 193 aa14.6□□□□□ -0.07
GABARAPL1-217ENST00000545887 STX4Q12846 297 aa14.6□□□□□ -0.07
GABARAPL1-217ENST00000545887 SF3A3Q12874 501 aaKnown RBP eCLIP14.6□□□□□ -0.07
GABARAPL1-217ENST00000545887 NSDHLQ15738 373 aa14.6□□□□□ -0.07
GABARAPL1-217ENST00000545887 OR52E8Q6IFG1 317 aa14.6□□□□□ -0.07
GABARAPL1-217ENST00000545887 QSOX2Q6ZRP7 698 aa14.6□□□□□ -0.07
GABARAPL1-217ENST00000545887 RIPOR1Q6ZS17 1223 aa14.6□□□□□ -0.07
GABARAPL1-217ENST00000545887 IKBIPQ70UQ0 350 aa14.6□□□□□ -0.07
GABARAPL1-217ENST00000545887 LARP4Q71RC2 724 aaKnown RBP eCLIP14.6□□□□□ -0.07
GABARAPL1-217ENST00000545887 SPATA19Q7Z5L4 167 aa14.6□□□□□ -0.07
GABARAPL1-217ENST00000545887 PARP9Q8IXQ6 854 aa14.6□□□□□ -0.07
GABARAPL1-217ENST00000545887 CEP70Q8NHQ1 597 aa14.6□□□□□ -0.07
GABARAPL1-217ENST00000545887 RFWD2Q8NHY2 731 aa14.6□□□□□ -0.07
GABARAPL1-217ENST00000545887 TANKQ92844 425 aa14.6□□□□□ -0.07
GABARAPL1-217ENST00000545887 SLC45A3Q96JT2 553 aa14.6□□□□□ -0.07
GABARAPL1-217ENST00000545887 FCRL1Q96LA6 429 aa14.6□□□□□ -0.07
GABARAPL1-217ENST00000545887 RILPQ96NA2 401 aa14.6□□□□□ -0.07
GABARAPL1-217ENST00000545887 CNTNAP3BQ96NU0 1288 aa14.6□□□□□ -0.07
GABARAPL1-217ENST00000545887 OR52B2Q96RD2 323 aa14.6□□□□□ -0.07
GABARAPL1-217ENST00000545887 CNTNAP3Q9BZ76 1288 aa14.6□□□□□ -0.07
GABARAPL1-217ENST00000545887 MYNNQ9NPC7 610 aa14.6□□□□□ -0.07
GABARAPL1-217ENST00000545887 TCF7L2Q9NQB0 619 aa14.6□□□□□ -0.07
GABARAPL1-217ENST00000545887 MIEF1Q9NQG6 463 aa14.6□□□□□ -0.07
GABARAPL1-217ENST00000545887 C19orf25Q9UFG5 118 aaPredicted RBP14.6□□□□□ -0.07
GABARAPL1-217ENST00000545887 BAIAP2L1Q9UHR4 511 aa14.6□□□□□ -0.07
GABARAPL1-217ENST00000545887 WBP11Q9Y2W2 641 aaKnown RBP14.6□□□□□ -0.07
GABARAPL1-217ENST00000545887 MMACHCQ9Y4U1 282 aa14.6□□□□□ -0.07
GABARAPL1-217ENST00000545887 SCN3AQ9NY46 2000 aa14.59□□□□□ -0.07
GABARAPL1-217ENST00000545887 KMT2BQ9UMN6 2715 aaPredicted RBP14.59□□□□□ -0.07
GABARAPL1-217ENST00000545887 FREM2Q5SZK8 3169 aa14.59□□□□□ -0.07
GABARAPL1-217ENST00000545887 CDC14CA4D256 554 aa14.59□□□□□ -0.07
GABARAPL1-217ENST00000545887 AKAP10O43572 662 aa14.59□□□□□ -0.07
GABARAPL1-217ENST00000545887 CTNSO60931 367 aa14.59□□□□□ -0.07
GABARAPL1-217ENST00000545887 LRATO95237 230 aa14.59□□□□□ -0.07
GABARAPL1-217ENST00000545887 UMODP07911 640 aa14.59□□□□□ -0.07
GABARAPL1-217ENST00000545887 CYC1P08574 325 aa14.59□□□□□ -0.07
GABARAPL1-217ENST00000545887 PRR35P0CG20 571 aa14.59□□□□□ -0.07
GABARAPL1-217ENST00000545887 PRKAR1AP10644 381 aa14.59□□□□□ -0.07
GABARAPL1-217ENST00000545887 DRD2P14416 443 aa14.59□□□□□ -0.07
GABARAPL1-217ENST00000545887 TACR1P25103 407 aa14.59□□□□□ -0.07
GABARAPL1-217ENST00000545887 HPCAL1P37235 193 aa14.59□□□□□ -0.07
GABARAPL1-217ENST00000545887 HNRNPFP52597 415 aaKnown RBP14.59□□□□□ -0.07
GABARAPL1-217ENST00000545887 BTG2P78543 158 aa14.59□□□□□ -0.07
GABARAPL1-217ENST00000545887 RHAGQ02094 409 aa14.59□□□□□ -0.07
GABARAPL1-217ENST00000545887 ID2Q02363 134 aa14.59□□□□□ -0.07
GABARAPL1-217ENST00000545887 ACTN3Q08043 901 aaPredicted RBP14.59□□□□□ -0.07
GABARAPL1-217ENST00000545887 SSPNQ14714 243 aa14.59□□□□□ -0.07
GABARAPL1-217ENST00000545887 RPS6KA2Q15349 733 aa14.59□□□□□ -0.07
GABARAPL1-217ENST00000545887 CCDC81Q6ZN84 652 aa14.59□□□□□ -0.07
GABARAPL1-217ENST00000545887 CPLX4Q7Z7G2 160 aa14.59□□□□□ -0.07
GABARAPL1-217ENST00000545887 MMP21Q8N119 569 aa14.59□□□□□ -0.07
GABARAPL1-217ENST00000545887 TMEM52Q8NDY8 209 aa14.59□□□□□ -0.07
GABARAPL1-217ENST00000545887 TSLPQ969D9 159 aa14.59□□□□□ -0.07
GABARAPL1-217ENST00000545887 GFM2Q969S9 779 aaKnown RBP14.59□□□□□ -0.07
GABARAPL1-217ENST00000545887 VPS50Q96JG6 964 aa14.59□□□□□ -0.07
GABARAPL1-217ENST00000545887 MAELQ96JY0 434 aaKnown RBP14.59□□□□□ -0.07
GABARAPL1-217ENST00000545887 ZNF317Q96PQ6 595 aaPredicted RBP14.59□□□□□ -0.07
GABARAPL1-217ENST00000545887 PSME2Q9UL46 239 aa14.59□□□□□ -0.07
GABARAPL1-217ENST00000545887 G3BP2Q9UN86 482 aaKnown RBP14.59□□□□□ -0.07
GABARAPL1-217ENST00000545887 PCDHA9Q9Y5H5 950 aa14.59□□□□□ -0.07
GABARAPL1-217ENST00000545887 AHCTF1Q8WYP5 2266 aa14.59□□□□□ -0.07
GABARAPL1-217ENST00000545887 GMNCA6NCL1 334 aa14.58□□□□□ -0.08
GABARAPL1-217ENST00000545887 E9PBE3 544 aa14.58□□□□□ -0.08
GABARAPL1-217ENST00000545887 PEX12O00623 359 aa14.58□□□□□ -0.08
GABARAPL1-217ENST00000545887 PGRMC2O15173 223 aa14.58□□□□□ -0.08
GABARAPL1-217ENST00000545887 UBDO15205 165 aa14.58□□□□□ -0.08
GABARAPL1-217ENST00000545887 KLHL41O60662 606 aa14.58□□□□□ -0.08
GABARAPL1-217ENST00000545887 LDB3O75112 727 aa14.58□□□□□ -0.08
GABARAPL1-217ENST00000545887 RECKO95980 971 aa14.58□□□□□ -0.08
GABARAPL1-217ENST00000545887 IFNA16P05015 189 aa14.58□□□□□ -0.08
GABARAPL1-217ENST00000545887 G6PDP11413 515 aa14.58□□□□□ -0.08
GABARAPL1-217ENST00000545887 MMP11P24347 488 aa14.58□□□□□ -0.08
GABARAPL1-217ENST00000545887 PIK3R1P27986 724 aa14.58□□□□□ -0.08
GABARAPL1-217ENST00000545887 SEC24CP53992 1094 aa14.58□□□□□ -0.08
GABARAPL1-217ENST00000545887 UCNP55089 124 aa14.58□□□□□ -0.08
GABARAPL1-217ENST00000545887 TLE3Q04726 772 aa14.58□□□□□ -0.08
GABARAPL1-217ENST00000545887 IL10RAQ13651 578 aa14.58□□□□□ -0.08
GABARAPL1-217ENST00000545887 LSM12Q3MHD2 195 aaKnown RBP14.58□□□□□ -0.08
GABARAPL1-217ENST00000545887 OGFOD2Q6N063 350 aa14.58□□□□□ -0.08
GABARAPL1-217ENST00000545887 TMEM151BQ8IW70 566 aa14.58□□□□□ -0.08
GABARAPL1-217ENST00000545887 OR4N5Q8IXE1 308 aa14.58□□□□□ -0.08
GABARAPL1-217ENST00000545887 FAM9CQ8IZT9 166 aa14.58□□□□□ -0.08
GABARAPL1-217ENST00000545887 KDF1Q8NAX2 398 aaPredicted RBP14.58□□□□□ -0.08
GABARAPL1-217ENST00000545887 PLPP5Q8NEB5 264 aa14.58□□□□□ -0.08
GABARAPL1-217ENST00000545887 KLHL29Q96CT2 875 aa14.58□□□□□ -0.08
GABARAPL1-217ENST00000545887 EBF4Q9BQW3 602 aa14.58□□□□□ -0.08
GABARAPL1-217ENST00000545887 CCDC28BQ9BUN5 200 aa14.58□□□□□ -0.08
GABARAPL1-217ENST00000545887 TMEM120AQ9BXJ8 343 aa14.58□□□□□ -0.08
GABARAPL1-217ENST00000545887 GIMAP4Q9NUV9 329 aa14.58□□□□□ -0.08
GABARAPL1-217ENST00000545887 ASIC5Q9NY37 505 aa14.58□□□□□ -0.08
GABARAPL1-217ENST00000545887 MYOCOSA0A1B0GUC4 107 aa14.57□□□□□ -0.08
GABARAPL1-217ENST00000545887 SYNDIG1LA6NDD5 238 aa14.57□□□□□ -0.08
GABARAPL1-217ENST00000545887 PCDH17O14917 1159 aa14.57□□□□□ -0.08
GABARAPL1-217ENST00000545887 NKX2-8O15522 239 aa14.57□□□□□ -0.08
GABARAPL1-217ENST00000545887 EFSO43281 561 aa14.57□□□□□ -0.08
GABARAPL1-217ENST00000545887 FGF17O60258 216 aa14.57□□□□□ -0.08
GABARAPL1-217ENST00000545887 ERAL1O75616 437 aaKnown RBP14.57□□□□□ -0.08
GABARAPL1-217ENST00000545887 DDX5P17844 614 aaKnown RBP14.57□□□□□ -0.08
GABARAPL1-217ENST00000545887 DDCP20711 480 aa14.57□□□□□ -0.08
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 63.5 ms