RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000545607.5

QKI-217, Transcript of QKI, KH domain containing RNA binding, human

TSL 5

Gene QKI, Length 846 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

Download Table

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
QKI-217	ENST00000545607	FEZ2	Q9UHY8	353 aa	Predicted RBP	4.56	□□□□□ -1.68
QKI-217	ENST00000545607	ERVK-11	Q9UQG0	969 aa		4.56	□□□□□ -1.68
QKI-217	ENST00000545607	ZNF148	Q9UQR1	794 aa		4.56	□□□□□ -1.68
QKI-217	ENST00000545607	TESMIN	Q9Y4I5	508 aa		4.56	□□□□□ -1.68
QKI-217	ENST00000545607	PCDHA9	Q9Y5H5	950 aa		4.56	□□□□□ -1.68
QKI-217	ENST00000545607	NFS1	Q9Y697	457 aa		4.56	□□□□□ -1.68
QKI-217	ENST00000545607	DOCK7	Q96N67	2140 aa		4.55	□□□□□ -1.68
QKI-217	ENST00000545607	TG	P01266	2768 aa		4.55	□□□□□ -1.68
QKI-217	ENST00000545607	PRPF8	Q6P2Q9	2335 aa	Known RBP eCLIP	4.55	□□□□□ -1.68	4e-8	■■■□□ 15.2
QKI-217	ENST00000545607	TRGV5	A0A0B4J1U4	118 aa		4.55	□□□□□ -1.68
QKI-217	ENST00000545607	OR2W5	A6NFC9	320 aa		4.55	□□□□□ -1.68
QKI-217	ENST00000545607	HACD1	B0YJ81	288 aa		4.55	□□□□□ -1.68
QKI-217	ENST00000545607	KDM4E	B2RXH2	506 aa	Predicted RBP	4.55	□□□□□ -1.68
QKI-217	ENST00000545607		H0YGG7	62 aa		4.55	□□□□□ -1.68
QKI-217	ENST00000545607	LIN7A	O14910	233 aa	Predicted RBP	4.55	□□□□□ -1.68
QKI-217	ENST00000545607	LIAS	O43766	372 aa		4.55	□□□□□ -1.68
QKI-217	ENST00000545607	ITGA10	O75578	1167 aa		4.55	□□□□□ -1.68
QKI-217	ENST00000545607	SRP72	O76094	671 aa	Known RBP	4.55	□□□□□ -1.68
QKI-217	ENST00000545607	IFNB1	P01574	187 aa		4.55	□□□□□ -1.68
QKI-217	ENST00000545607	PECAM1	P16284	738 aa	Predicted RBP	4.55	□□□□□ -1.68
QKI-217	ENST00000545607	ITGAL	P20701	1170 aa		4.55	□□□□□ -1.68
QKI-217	ENST00000545607	CD9	P21926	228 aa		4.55	□□□□□ -1.68
QKI-217	ENST00000545607	PTPN3	P26045	913 aa		4.55	□□□□□ -1.68
QKI-217	ENST00000545607	RBL1	P28749	1068 aa		4.55	□□□□□ -1.68
QKI-217	ENST00000545607	STIP1	P31948	543 aa	Known RBP	4.55	□□□□□ -1.68
QKI-217	ENST00000545607	THBS2	P35442	1172 aa		4.55	□□□□□ -1.68
QKI-217	ENST00000545607	COIL	P38432	576 aa	Predicted RBP	4.55	□□□□□ -1.68
QKI-217	ENST00000545607	XCR1	P46094	333 aa		4.55	□□□□□ -1.68
QKI-217	ENST00000545607	AVPR1B	P47901	424 aa		4.55	□□□□□ -1.68
QKI-217	ENST00000545607	GYS2	P54840	703 aa		4.55	□□□□□ -1.68
QKI-217	ENST00000545607	CSE1L	P55060	971 aa	Known RBP	4.55	□□□□□ -1.68
QKI-217	ENST00000545607	OR4D2	P58180	307 aa		4.55	□□□□□ -1.68
QKI-217	ENST00000545607	ARF3	P61204	181 aa	Predicted RBP	4.55	□□□□□ -1.68
QKI-217	ENST00000545607	ACTG1	P63261	375 aa		4.55	□□□□□ -1.68
QKI-217	ENST00000545607	MAP4K2	Q12851	820 aa		4.55	□□□□□ -1.68
QKI-217	ENST00000545607	KLF1	Q13351	362 aa	Predicted RBP	4.55	□□□□□ -1.68
QKI-217	ENST00000545607	PTPRCAP	Q14761	206 aa		4.55	□□□□□ -1.68
QKI-217	ENST00000545607	ABRAXAS2	Q15018	415 aa		4.55	□□□□□ -1.68
QKI-217	ENST00000545607	PPP1R7	Q15435	360 aa		4.55	□□□□□ -1.68
QKI-217	ENST00000545607	SLC14A2	Q15849	920 aa		4.55	□□□□□ -1.68
QKI-217	ENST00000545607	CYP1B1	Q16678	543 aa		4.55	□□□□□ -1.68
QKI-217	ENST00000545607	PRTG	Q2VWP7	1150 aa		4.55	□□□□□ -1.68
QKI-217	ENST00000545607	ACSF3	Q4G176	576 aa	Predicted RBP	4.55	□□□□□ -1.68
QKI-217	ENST00000545607	ZNF658B	Q4V348	819 aa	Predicted RBP	4.55	□□□□□ -1.68
QKI-217	ENST00000545607	TEX35	Q5T0J7	233 aa		4.55	□□□□□ -1.68
QKI-217	ENST00000545607	NDUFAF5	Q5TEU4	345 aa		4.55	□□□□□ -1.68
QKI-217	ENST00000545607	FBXO42	Q6P3S6	717 aa		4.55	□□□□□ -1.68
QKI-217	ENST00000545607	CCDC137	Q6PK04	289 aa	Known RBP	4.55	□□□□□ -1.68
QKI-217	ENST00000545607	RGS9BP	Q6ZS82	235 aa		4.55	□□□□□ -1.68
QKI-217	ENST00000545607	KIAA0408	Q6ZU52	694 aa		4.55	□□□□□ -1.68
QKI-217	ENST00000545607	PID1	Q7Z2X4	250 aa		4.55	□□□□□ -1.68
QKI-217	ENST00000545607	LACC1	Q8IV20	430 aa		4.55	□□□□□ -1.68
QKI-217	ENST00000545607	CDKL3	Q8IVW4	592 aa	Predicted RBP	4.55	□□□□□ -1.68
QKI-217	ENST00000545607	DCUN1D3	Q8IWE4	304 aa		4.55	□□□□□ -1.68
QKI-217	ENST00000545607	CNTD1	Q8N815	330 aa		4.55	□□□□□ -1.68
QKI-217	ENST00000545607	PRELID2	Q8N945	189 aa		4.55	□□□□□ -1.68
QKI-217	ENST00000545607	CCDC89	Q8N998	374 aa		4.55	□□□□□ -1.68
QKI-217	ENST00000545607	OR2M7	Q8NG81	312 aa		4.55	□□□□□ -1.68
QKI-217	ENST00000545607	SPATA22	Q8NHS9	363 aa		4.55	□□□□□ -1.68
QKI-217	ENST00000545607	SLC22A8	Q8TCC7	542 aa		4.55	□□□□□ -1.68
QKI-217	ENST00000545607	ELP5	Q8TE02	316 aa		4.55	□□□□□ -1.68
QKI-217	ENST00000545607	GRK7	Q8WTQ7	553 aa		4.55	□□□□□ -1.68
QKI-217	ENST00000545607	ATG4A	Q8WYN0	398 aa		4.55	□□□□□ -1.68
QKI-217	ENST00000545607	TSLP	Q969D9	159 aa		4.55	□□□□□ -1.68
QKI-217	ENST00000545607	FATE1	Q969F0	183 aa		4.55	□□□□□ -1.68
QKI-217	ENST00000545607	IMP4	Q96G21	291 aa	Known RBP	4.55	□□□□□ -1.68
QKI-217	ENST00000545607	WDR83	Q9BRX9	315 aa	Known RBP	4.55	□□□□□ -1.68
QKI-217	ENST00000545607	EPB41L4B	Q9H329	900 aa		4.55	□□□□□ -1.68
QKI-217	ENST00000545607	FAM96A	Q9H5X1	160 aa		4.55	□□□□□ -1.68
QKI-217	ENST00000545607	C10orf88	Q9H8K7	445 aa		4.55	□□□□□ -1.68
QKI-217	ENST00000545607	CHODL	Q9H9P2	273 aa		4.55	□□□□□ -1.68
QKI-217	ENST00000545607	L2HGDH	Q9H9P8	463 aa		4.55	□□□□□ -1.68
QKI-217	ENST00000545607	C19orf73	Q9NVV2	129 aa		4.55	□□□□□ -1.68
QKI-217	ENST00000545607	TMEM160	Q9NX00	188 aa		4.55	□□□□□ -1.68
QKI-217	ENST00000545607	HACD3	Q9P035	362 aa		4.55	□□□□□ -1.68
QKI-217	ENST00000545607	KCMF1	Q9P0J7	381 aa		4.55	□□□□□ -1.68
QKI-217	ENST00000545607	NDRG3	Q9UGV2	375 aa		4.55	□□□□□ -1.68
QKI-217	ENST00000545607	SLC39A10	Q9ULF5	831 aa		4.55	□□□□□ -1.68
QKI-217	ENST00000545607	R3HDM2	Q9Y2K5	976 aa	Known RBP	4.55	□□□□□ -1.68
QKI-217	ENST00000545607	RYR3	Q15413	4870 aa		4.54	□□□□□ -1.68
QKI-217	ENST00000545607	TRBV11-1	A0A0K0K1C0	115 aa		4.54	□□□□□ -1.68
QKI-217	ENST00000545607		A0A1B0GVC2	190 aa		4.54	□□□□□ -1.68
QKI-217	ENST00000545607	C7orf72	A4D263	438 aa		4.54	□□□□□ -1.68
QKI-217	ENST00000545607	C2orf81	A6NN90	581 aa		4.54	□□□□□ -1.68
QKI-217	ENST00000545607		A8MVJ9	347 aa		4.54	□□□□□ -1.68
QKI-217	ENST00000545607	DEFB108A	A8MXU0	73 aa		4.54	□□□□□ -1.68
QKI-217	ENST00000545607	TARM1	B6A8C7	271 aa		4.54	□□□□□ -1.68
QKI-217	ENST00000545607	P2RX6	O15547	441 aa		4.54	□□□□□ -1.68
QKI-217	ENST00000545607	CTIF	O43310	598 aa	Known RBP	4.54	□□□□□ -1.68
QKI-217	ENST00000545607	FOXS1	O43638	330 aa		4.54	□□□□□ -1.68
QKI-217	ENST00000545607	TCF21	O43680	179 aa		4.54	□□□□□ -1.68
QKI-217	ENST00000545607	GPRIN2	O60269	458 aa		4.54	□□□□□ -1.68
QKI-217	ENST00000545607	PSPN	O60542	156 aa		4.54	□□□□□ -1.68
QKI-217	ENST00000545607	ZNF189	O75820	626 aa	Predicted RBP	4.54	□□□□□ -1.68
QKI-217	ENST00000545607	FKBP9	O95302	570 aa		4.54	□□□□□ -1.68
QKI-217	ENST00000545607	GAS8	O95995	478 aa		4.54	□□□□□ -1.68
QKI-217	ENST00000545607	KRT14	P02533	472 aa		4.54	□□□□□ -1.68
QKI-217	ENST00000545607	RPN2	P04844	631 aa		4.54	□□□□□ -1.68
QKI-217	ENST00000545607	SCG5	P05408	212 aa		4.54	□□□□□ -1.68
QKI-217	ENST00000545607	RHOXF2B	P0C7M4	288 aa		4.54	□□□□□ -1.68

Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 46.5 ms