RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000543658.5

DDB1-223, Transcript of damage specific DNA binding protein 1, human

TSL 4

Gene DDB1, Length 571 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus, Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
DDB1-223	ENST00000543658	SAMD14	Q8IZD0	417 aa	Predicted RBP	11.21	□□□□□ -0.61
DDB1-223	ENST00000543658	CPSF7	Q8N684	471 aa	Known RBP	11.21	□□□□□ -0.61
DDB1-223	ENST00000543658	NATD1	Q8N6N6	113 aa		11.21	□□□□□ -0.61
DDB1-223	ENST00000543658	IL22RA1	Q8N6P7	574 aa		11.21	□□□□□ -0.61
DDB1-223	ENST00000543658	VPS37A	Q8NEZ2	397 aa		11.21	□□□□□ -0.61
DDB1-223	ENST00000543658	ZFP28	Q8NHY6	868 aa		11.21	□□□□□ -0.61
DDB1-223	ENST00000543658	STT3B	Q8TCJ2	826 aa		11.21	□□□□□ -0.61
DDB1-223	ENST00000543658	TANK	Q92844	425 aa		11.21	□□□□□ -0.61
DDB1-223	ENST00000543658	KIAA1143	Q96AT1	154 aa	Predicted RBP	11.21	□□□□□ -0.61
DDB1-223	ENST00000543658	EXOSC8	Q96B26	276 aa	Known RBP	11.21	□□□□□ -0.61
DDB1-223	ENST00000543658	ERP27	Q96DN0	273 aa		11.21	□□□□□ -0.61
DDB1-223	ENST00000543658	CHST8	Q9H2A9	424 aa		11.21	□□□□□ -0.61
DDB1-223	ENST00000543658	SAR1A	Q9NR31	198 aa		11.21	□□□□□ -0.61
DDB1-223	ENST00000543658	TMEM45A	Q9NWC5	275 aa		11.21	□□□□□ -0.61
DDB1-223	ENST00000543658	EHD3	Q9NZN3	535 aa		11.21	□□□□□ -0.61
DDB1-223	ENST00000543658	KCMF1	Q9P0J7	381 aa		11.21	□□□□□ -0.61
DDB1-223	ENST00000543658	MMACHC	Q9Y4U1	282 aa		11.21	□□□□□ -0.61
DDB1-223	ENST00000543658	NEUROG3	Q9Y4Z2	214 aa		11.21	□□□□□ -0.61
DDB1-223	ENST00000543658	DYTN	A2CJ06	578 aa		11.2	□□□□□ -0.62
DDB1-223	ENST00000543658	FAM234B	A2RU67	622 aa		11.2	□□□□□ -0.62
DDB1-223	ENST00000543658	CCDC154	A6NI56	674 aa		11.2	□□□□□ -0.62
DDB1-223	ENST00000543658	GLOD5	A6NK44	160 aa		11.2	□□□□□ -0.62
DDB1-223	ENST00000543658	CDRT15L2	A8MXV6	281 aa		11.2	□□□□□ -0.62
DDB1-223	ENST00000543658	CFLAR	O15519	480 aa		11.2	□□□□□ -0.62
DDB1-223	ENST00000543658	PDPK1	O15530	556 aa		11.2	□□□□□ -0.62
DDB1-223	ENST00000543658	PRKRA	O75569	313 aa	Known RBP	11.2	□□□□□ -0.62
DDB1-223	ENST00000543658	DXO	O77932	396 aa	Known RBP	11.2	□□□□□ -0.62
DDB1-223	ENST00000543658	BMP10	O95393	424 aa		11.2	□□□□□ -0.62
DDB1-223	ENST00000543658	IL6	P05231	212 aa		11.2	□□□□□ -0.62
DDB1-223	ENST00000543658	HEXB	P07686	556 aa		11.2	□□□□□ -0.62
DDB1-223	ENST00000543658	ZGLP1	P0C6A0	271 aa		11.2	□□□□□ -0.62
DDB1-223	ENST00000543658	TCN2	P20062	427 aa		11.2	□□□□□ -0.62
DDB1-223	ENST00000543658	GPX3	P22352	226 aa		11.2	□□□□□ -0.62
DDB1-223	ENST00000543658	S100A3	P33764	101 aa		11.2	□□□□□ -0.62
DDB1-223	ENST00000543658	FOLR3	P41439	243 aa		11.2	□□□□□ -0.62
DDB1-223	ENST00000543658	KIR3DL1	P43629	444 aa		11.2	□□□□□ -0.62
DDB1-223	ENST00000543658	HSD17B7	P56937	341 aa		11.2	□□□□□ -0.62
DDB1-223	ENST00000543658	C21orf58	P58505	322 aa		11.2	□□□□□ -0.62
DDB1-223	ENST00000543658	MC1R	Q01726	317 aa		11.2	□□□□□ -0.62
DDB1-223	ENST00000543658	GABPB1	Q06547	395 aa	Predicted RBP	11.2	□□□□□ -0.62
DDB1-223	ENST00000543658	KLF10	Q13118	480 aa		11.2	□□□□□ -0.62
DDB1-223	ENST00000543658	NCF4	Q15080	339 aa		11.2	□□□□□ -0.62
DDB1-223	ENST00000543658	FAM174B	Q3ZCQ3	159 aa		11.2	□□□□□ -0.62
DDB1-223	ENST00000543658	MMEL1	Q495T6	779 aa		11.2	□□□□□ -0.62
DDB1-223	ENST00000543658	SLC48A1	Q6P1K1	146 aa		11.2	□□□□□ -0.62
DDB1-223	ENST00000543658	FAM199X	Q6PEV8	388 aa	Predicted RBP	11.2	□□□□□ -0.62
DDB1-223	ENST00000543658	RIPOR1	Q6ZS17	1223 aa		11.2	□□□□□ -0.62
DDB1-223	ENST00000543658	COX15	Q7KZN9	410 aa		11.2	□□□□□ -0.62
DDB1-223	ENST00000543658	CLNK	Q7Z7G1	428 aa		11.2	□□□□□ -0.62
DDB1-223	ENST00000543658	ZC3H7A	Q8IWR0	971 aa	Known RBP	11.2	□□□□□ -0.62
DDB1-223	ENST00000543658	KRTCAP2	Q8N6L1	136 aa		11.2	□□□□□ -0.62
DDB1-223	ENST00000543658	OR4K14	Q8NGD5	310 aa		11.2	□□□□□ -0.62
DDB1-223	ENST00000543658	OR9I1	Q8NGQ6	314 aa		11.2	□□□□□ -0.62
DDB1-223	ENST00000543658	METTL21A	Q8WXB1	218 aa		11.2	□□□□□ -0.62
DDB1-223	ENST00000543658	TESC	Q96BS2	214 aa		11.2	□□□□□ -0.62
DDB1-223	ENST00000543658	ZNF578	Q96N58	590 aa	Predicted RBP	11.2	□□□□□ -0.62
DDB1-223	ENST00000543658	BBS4	Q96RK4	519 aa		11.2	□□□□□ -0.62
DDB1-223	ENST00000543658	DUSP26	Q9BV47	211 aa		11.2	□□□□□ -0.62
DDB1-223	ENST00000543658	ZNF385D	Q9H6B1	395 aa		11.2	□□□□□ -0.62
DDB1-223	ENST00000543658	CLMP	Q9H6B4	373 aa		11.2	□□□□□ -0.62
DDB1-223	ENST00000543658	SOX17	Q9H6I2	414 aa	Predicted RBP	11.2	□□□□□ -0.62
DDB1-223	ENST00000543658	RMND5A	Q9H871	391 aa		11.2	□□□□□ -0.62
DDB1-223	ENST00000543658	ARMCX1	Q9P291	453 aa		11.2	□□□□□ -0.62
DDB1-223	ENST00000543658	CTSF	Q9UBX1	484 aa		11.2	□□□□□ -0.62
DDB1-223	ENST00000543658	ATP6V1H	Q9UI12	483 aa		11.2	□□□□□ -0.62
DDB1-223	ENST00000543658	MKL2	Q9ULH7	1088 aa		11.2	□□□□□ -0.62
DDB1-223	ENST00000543658	TRABD2B	A6NFA1	517 aa		11.19	□□□□□ -0.62
DDB1-223	ENST00000543658		C9JVG2	144 aa		11.19	□□□□□ -0.62
DDB1-223	ENST00000543658	FAM227A	F5H4B4	570 aa		11.19	□□□□□ -0.62
DDB1-223	ENST00000543658	CYR61	O00622	381 aa		11.19	□□□□□ -0.62
DDB1-223	ENST00000543658	ANGPT2	O15123	496 aa		11.19	□□□□□ -0.62
DDB1-223	ENST00000543658	TBX19	O60806	448 aa		11.19	□□□□□ -0.62
DDB1-223	ENST00000543658	LDB3	O75112	727 aa		11.19	□□□□□ -0.62
DDB1-223	ENST00000543658	DNAJB6	O75190	326 aa		11.19	□□□□□ -0.62
DDB1-223	ENST00000543658	ONECUT2	O95948	504 aa		11.19	□□□□□ -0.62
DDB1-223	ENST00000543658	RAB40AL	P0C0E4	278 aa		11.19	□□□□□ -0.62
DDB1-223	ENST00000543658	LIPC	P11150	499 aa		11.19	□□□□□ -0.62
DDB1-223	ENST00000543658	SPINK2	P20155	84 aa		11.19	□□□□□ -0.62
DDB1-223	ENST00000543658	DLST	P36957	453 aa		11.19	□□□□□ -0.62
DDB1-223	ENST00000543658	PLIN5	Q00G26	463 aa		11.19	□□□□□ -0.62
DDB1-223	ENST00000543658	FOLH1	Q04609	750 aa		11.19	□□□□□ -0.62
DDB1-223	ENST00000543658	LRRC74A	Q0VAA2	488 aa		11.19	□□□□□ -0.62
DDB1-223	ENST00000543658	BIK	Q13323	160 aa		11.19	□□□□□ -0.62
DDB1-223	ENST00000543658	CAMK2B	Q13554	666 aa		11.19	□□□□□ -0.62
DDB1-223	ENST00000543658	PDE7A	Q13946	482 aa		11.19	□□□□□ -0.62
DDB1-223	ENST00000543658	SERTAD2	Q14140	314 aa		11.19	□□□□□ -0.62
DDB1-223	ENST00000543658	ERV3-1	Q14264	604 aa		11.19	□□□□□ -0.62
DDB1-223	ENST00000543658	NKG7	Q16617	165 aa		11.19	□□□□□ -0.62
DDB1-223	ENST00000543658	UGT8	Q16880	541 aa		11.19	□□□□□ -0.62
DDB1-223	ENST00000543658	TIGD2	Q4W5G0	525 aa		11.19	□□□□□ -0.62
DDB1-223	ENST00000543658	VWA2	Q5GFL6	755 aa		11.19	□□□□□ -0.62
DDB1-223	ENST00000543658	SPANXN4	Q5MJ08	99 aa		11.19	□□□□□ -0.62
DDB1-223	ENST00000543658	ANXA8L1	Q5VT79	327 aa		11.19	□□□□□ -0.62
DDB1-223	ENST00000543658	ANKRD26P1	Q6NSI1	321 aa		11.19	□□□□□ -0.62
DDB1-223	ENST00000543658	FAM198B	Q6UWH4	519 aa		11.19	□□□□□ -0.62
DDB1-223	ENST00000543658	QSOX2	Q6ZRP7	698 aa		11.19	□□□□□ -0.62
DDB1-223	ENST00000543658	GK5	Q6ZS86	529 aa		11.19	□□□□□ -0.62
DDB1-223	ENST00000543658	MMP21	Q8N119	569 aa		11.19	□□□□□ -0.62
DDB1-223	ENST00000543658	OR7A2P	Q8NGA2	310 aa		11.19	□□□□□ -0.62
DDB1-223	ENST00000543658	PUM2	Q8TB72	1066 aa	Known RBP eCLIP	11.19	□□□□□ -0.62

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