RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000534106.2

CHMP4A-208, Transcript of charged multivesicular body protein 4A, humanhuman

TSL 5

Gene CHMP4A, Length 370 nt, Biotype nonsense mediated decay.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHMP4A-208ENST00000534106 FAM222BQ8WU58 562 aa2.76□□□□□ -1.97
CHMP4A-208ENST00000534106 MAML1Q92585 1016 aa2.76□□□□□ -1.97
CHMP4A-208ENST00000534106 TFGQ92734 400 aaPredicted RBP2.76□□□□□ -1.97
CHMP4A-208ENST00000534106 FATE1Q969F0 183 aa2.76□□□□□ -1.97
CHMP4A-208ENST00000534106 TBRG4Q969Z0 631 aaKnown RBP eCLIP2.76□□□□□ -1.97
CHMP4A-208ENST00000534106 HSPBAP1Q96EW2 488 aa2.76□□□□□ -1.97
CHMP4A-208ENST00000534106 BOD1Q96IK1 185 aa2.76□□□□□ -1.97
CHMP4A-208ENST00000534106 ZNF354BQ96LW1 612 aa2.76□□□□□ -1.97
CHMP4A-208ENST00000534106 CCDC138Q96M89 665 aa2.76□□□□□ -1.97
CHMP4A-208ENST00000534106 VPS35Q96QK1 796 aa2.76□□□□□ -1.97
CHMP4A-208ENST00000534106 CYTH2Q99418 400 aa2.76□□□□□ -1.97
CHMP4A-208ENST00000534106 MACROD1Q9BQ69 325 aa2.76□□□□□ -1.97
CHMP4A-208ENST00000534106 TP63Q9H3D4 680 aaPredicted RBP2.76□□□□□ -1.97
CHMP4A-208ENST00000534106 KCNK13Q9HB14 408 aa2.76□□□□□ -1.97
CHMP4A-208ENST00000534106 MAGEE1Q9HCI5 957 aa2.76□□□□□ -1.97
CHMP4A-208ENST00000534106 NLRC4Q9NPP4 1024 aa2.76□□□□□ -1.97
CHMP4A-208ENST00000534106 DEPPQ9NTK1 212 aa2.76□□□□□ -1.97
CHMP4A-208ENST00000534106 ZNF282Q9UDV7 671 aaPredicted RBP2.76□□□□□ -1.97
CHMP4A-208ENST00000534106 NXT1Q9UKK6 140 aaKnown RBP2.76□□□□□ -1.97
CHMP4A-208ENST00000534106 ACSL5Q9ULC5 683 aa2.76□□□□□ -1.97
CHMP4A-208ENST00000534106 EDARQ9UNE0 448 aa2.76□□□□□ -1.97
CHMP4A-208ENST00000534106 RPL26L1Q9UNX3 145 aaKnown RBP2.76□□□□□ -1.97
CHMP4A-208ENST00000534106 WIF1Q9Y5W5 379 aa2.76□□□□□ -1.97
CHMP4A-208ENST00000534106 PRSS21Q9Y6M0 314 aa2.76□□□□□ -1.97
CHMP4A-208ENST00000534106 USF3Q68DE3 2245 aa2.75□□□□□ -1.97
CHMP4A-208ENST00000534106 TRGV11A0A075B6L2 103 aa2.75□□□□□ -1.97
CHMP4A-208ENST00000534106 LOC102723996A0A087X1L8 192 aa2.75□□□□□ -1.97
CHMP4A-208ENST00000534106 A0A0A6YYC8 382 aaPredicted RBP2.75□□□□□ -1.97
CHMP4A-208ENST00000534106 A0A0G2JMM0 328 aa2.75□□□□□ -1.97
CHMP4A-208ENST00000534106 GLYATL1P3A0A0U1RQE8 302 aa2.75□□□□□ -1.97
CHMP4A-208ENST00000534106 A0A0U1RQJ8 604 aa2.75□□□□□ -1.97
CHMP4A-208ENST00000534106 A0A1W2PPB8 328 aa2.75□□□□□ -1.97
CHMP4A-208ENST00000534106 A0A1W2PRS3 328 aa2.75□□□□□ -1.97
CHMP4A-208ENST00000534106 BICDL2A1A5D9 508 aa2.75□□□□□ -1.97
CHMP4A-208ENST00000534106 TUBAL3A6NHL2 446 aa2.75□□□□□ -1.97
CHMP4A-208ENST00000534106 A8MUA0 341 aa2.75□□□□□ -1.97
CHMP4A-208ENST00000534106 KIR3DP1A8MWS1 328 aa2.75□□□□□ -1.97
CHMP4A-208ENST00000534106 H0YGG7 62 aa2.75□□□□□ -1.97
CHMP4A-208ENST00000534106 I3L1I5 382 aaPredicted RBP2.75□□□□□ -1.97
CHMP4A-208ENST00000534106 PES1O00541 588 aaKnown RBP2.75□□□□□ -1.97
CHMP4A-208ENST00000534106 TFECO14948 347 aaPredicted RBP2.75□□□□□ -1.97
CHMP4A-208ENST00000534106 GPRIN2O60269 458 aa2.75□□□□□ -1.97
CHMP4A-208ENST00000534106 NME2P1O60361 137 aa2.75□□□□□ -1.97
CHMP4A-208ENST00000534106 SLC25A12O75746 678 aa2.75□□□□□ -1.97
CHMP4A-208ENST00000534106 MLYCDO95822 493 aa2.75□□□□□ -1.97
CHMP4A-208ENST00000534106 IFNA2P01563 188 aa2.75□□□□□ -1.97
CHMP4A-208ENST00000534106 CALB1P05937 261 aa2.75□□□□□ -1.97
CHMP4A-208ENST00000534106 EGR1P18146 543 aa2.75□□□□□ -1.97
CHMP4A-208ENST00000534106 CCNCP24863 283 aa2.75□□□□□ -1.97
CHMP4A-208ENST00000534106 ACVR2AP27037 513 aa2.75□□□□□ -1.97
CHMP4A-208ENST00000534106 PSMB5P28074 263 aa2.75□□□□□ -1.97
CHMP4A-208ENST00000534106 MTNR1BP49286 362 aa2.75□□□□□ -1.97
CHMP4A-208ENST00000534106 ITGA8P53708 1063 aa2.75□□□□□ -1.97
CHMP4A-208ENST00000534106 AIF1P55008 147 aa2.75□□□□□ -1.97
CHMP4A-208ENST00000534106 ARF3P61204 181 aaPredicted RBP2.75□□□□□ -1.97
CHMP4A-208ENST00000534106 POLR2FP61218 127 aaKnown RBP2.75□□□□□ -1.97
CHMP4A-208ENST00000534106 PPIAP62937 165 aaKnown RBP2.75□□□□□ -1.97
CHMP4A-208ENST00000534106 GALNT2Q10471 571 aa2.75□□□□□ -1.97
CHMP4A-208ENST00000534106 STIM1Q13586 685 aa2.75□□□□□ -1.97
CHMP4A-208ENST00000534106 TAZQ16635 292 aa2.75□□□□□ -1.97
CHMP4A-208ENST00000534106 MEP1AQ16819 746 aa2.75□□□□□ -1.97
CHMP4A-208ENST00000534106 MUM1Q2TAK8 710 aa2.75□□□□□ -1.97
CHMP4A-208ENST00000534106 HKDC1Q2TB90 917 aa2.75□□□□□ -1.97
CHMP4A-208ENST00000534106 CCSMST1Q4G0I0 132 aa2.75□□□□□ -1.97
CHMP4A-208ENST00000534106 FLYWCH1Q4VC44 716 aa2.75□□□□□ -1.97
CHMP4A-208ENST00000534106 TOR2AQ5JU69 321 aa2.75□□□□□ -1.97
CHMP4A-208ENST00000534106 LDLRAP1Q5SW96 308 aa2.75□□□□□ -1.97
CHMP4A-208ENST00000534106 CCDC122Q5T0U0 273 aa2.75□□□□□ -1.97
CHMP4A-208ENST00000534106 TSTD2Q5T7W7 516 aa2.75□□□□□ -1.97
CHMP4A-208ENST00000534106 NCBP2-AS2Q69YL0 99 aa2.75□□□□□ -1.97
CHMP4A-208ENST00000534106 PDPK2PQ6A1A2 396 aa2.75□□□□□ -1.97
CHMP4A-208ENST00000534106 ATL3Q6DD88 541 aa2.75□□□□□ -1.97
CHMP4A-208ENST00000534106 HEPHL1Q6MZM0 1159 aa2.75□□□□□ -1.97
CHMP4A-208ENST00000534106 H3F3CQ6NXT2 135 aa2.75□□□□□ -1.97
CHMP4A-208ENST00000534106 SARM1Q6SZW1 724 aa2.75□□□□□ -1.97
CHMP4A-208ENST00000534106 SASS6Q6UVJ0 657 aa2.75□□□□□ -1.97
CHMP4A-208ENST00000534106 PLXDC2Q6UX71 529 aa2.75□□□□□ -1.97
CHMP4A-208ENST00000534106 NPNTQ6UXI9 565 aa2.75□□□□□ -1.97
CHMP4A-208ENST00000534106 B3GNT6Q6ZMB0 384 aa2.75□□□□□ -1.97
CHMP4A-208ENST00000534106 CPEB2Q7Z5Q1 589 aaKnown RBP2.75□□□□□ -1.97
CHMP4A-208ENST00000534106 ANKRD37Q7Z713 158 aa2.75□□□□□ -1.97
CHMP4A-208ENST00000534106 HIPK1Q86Z02 1210 aa2.75□□□□□ -1.97
CHMP4A-208ENST00000534106 PQLC3Q8N755 202 aa2.75□□□□□ -1.97
CHMP4A-208ENST00000534106 ARIH2OSQ8N7S6 290 aa2.75□□□□□ -1.97
CHMP4A-208ENST00000534106 AMER3Q8N944 861 aa2.75□□□□□ -1.97
CHMP4A-208ENST00000534106 TTC29Q8NA56 475 aaPredicted RBP2.75□□□□□ -1.97
CHMP4A-208ENST00000534106 TMEM178AQ8NBL3 297 aa2.75□□□□□ -1.97
CHMP4A-208ENST00000534106 SPC24Q8NBT2 197 aa2.75□□□□□ -1.97
CHMP4A-208ENST00000534106 CCNYQ8ND76 341 aa2.75□□□□□ -1.97
CHMP4A-208ENST00000534106 DDHD1Q8NEL9 900 aa2.75□□□□□ -1.97
CHMP4A-208ENST00000534106 MYRIPQ8NFW9 859 aa2.75□□□□□ -1.97
CHMP4A-208ENST00000534106 TNIP2Q8NFZ5 429 aa2.75□□□□□ -1.97
CHMP4A-208ENST00000534106 BLOC1S5Q8TDH9 187 aa2.75□□□□□ -1.97
CHMP4A-208ENST00000534106 STON2Q8WXE9 905 aa2.75□□□□□ -1.97
CHMP4A-208ENST00000534106 MMABQ96EY8 250 aaPredicted RBP2.75□□□□□ -1.97
CHMP4A-208ENST00000534106 IMP4Q96G21 291 aaKnown RBP2.75□□□□□ -1.97
CHMP4A-208ENST00000534106 PDLIM2Q96JY6 352 aa2.75□□□□□ -1.97
CHMP4A-208ENST00000534106 FAM81BQ96LP2 452 aa2.75□□□□□ -1.97
CHMP4A-208ENST00000534106 C10orf90Q96M02 699 aa2.75□□□□□ -1.97
CHMP4A-208ENST00000534106 ZNF830Q96NB3 372 aaPredicted RBP2.75□□□□□ -1.97
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