RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000523636.5

PABPC1-223, Transcript of poly(A) binding protein cytoplasmic 1, human

TSL 5

Gene PABPC1, Length 818 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
PABPC1-223	ENST00000523636	SLC43A1	O75387	559 aa		4.87	□□□□□ -1.63
PABPC1-223	ENST00000523636	LRCH4	O75427	683 aa		4.87	□□□□□ -1.63
PABPC1-223	ENST00000523636	RHBDL1	O75783	438 aa		4.87	□□□□□ -1.63
PABPC1-223	ENST00000523636	STK17B	O94768	372 aa		4.87	□□□□□ -1.63
PABPC1-223	ENST00000523636	CD1A	P06126	327 aa		4.87	□□□□□ -1.63
PABPC1-223	ENST00000523636	CDH2	P19022	906 aa	Predicted RBP	4.87	□□□□□ -1.63
PABPC1-223	ENST00000523636	CPN2	P22792	545 aa		4.87	□□□□□ -1.63
PABPC1-223	ENST00000523636	CASP1	P29466	404 aa		4.87	□□□□□ -1.63
PABPC1-223	ENST00000523636	EVI2B	P34910	448 aa		4.87	□□□□□ -1.63
PABPC1-223	ENST00000523636	NUDT1	P36639	197 aa		4.87	□□□□□ -1.63
PABPC1-223	ENST00000523636	HTR2B	P41595	481 aa		4.87	□□□□□ -1.63
PABPC1-223	ENST00000523636	PSMD7	P51665	324 aa		4.87	□□□□□ -1.63
PABPC1-223	ENST00000523636	SGSH	P51688	502 aa		4.87	□□□□□ -1.63
PABPC1-223	ENST00000523636	MNAT1	P51948	309 aa		4.87	□□□□□ -1.63
PABPC1-223	ENST00000523636	THOP1	P52888	689 aa		4.87	□□□□□ -1.63
PABPC1-223	ENST00000523636	B2M	P61769	119 aa		4.87	□□□□□ -1.63
PABPC1-223	ENST00000523636	FKBP3	Q00688	224 aa	Known RBP	4.87	□□□□□ -1.63
PABPC1-223	ENST00000523636	B4GALNT1	Q00973	533 aa		4.87	□□□□□ -1.63
PABPC1-223	ENST00000523636	DR1	Q01658	176 aa		4.87	□□□□□ -1.63
PABPC1-223	ENST00000523636	TNFRSF17	Q02223	184 aa		4.87	□□□□□ -1.63
PABPC1-223	ENST00000523636	FOLH1	Q04609	750 aa		4.87	□□□□□ -1.63
PABPC1-223	ENST00000523636	LCP2	Q13094	533 aa		4.87	□□□□□ -1.63
PABPC1-223	ENST00000523636	GNA13	Q14344	377 aa		4.87	□□□□□ -1.63
PABPC1-223	ENST00000523636	ZNF273	Q14593	569 aa		4.87	□□□□□ -1.63
PABPC1-223	ENST00000523636	CHRNA6	Q15825	494 aa		4.87	□□□□□ -1.63
PABPC1-223	ENST00000523636	AANAT	Q16613	207 aa		4.87	□□□□□ -1.63
PABPC1-223	ENST00000523636	FASTKD1	Q53R41	847 aa	Known RBP	4.87	□□□□□ -1.63
PABPC1-223	ENST00000523636	FBLN7	Q53RD9	439 aa		4.87	□□□□□ -1.63
PABPC1-223	ENST00000523636	EEF1AKMT2	Q5JPI9	291 aa	Known RBP	4.87	□□□□□ -1.63
PABPC1-223	ENST00000523636	LCE1D	Q5T752	114 aa		4.87	□□□□□ -1.63
PABPC1-223	ENST00000523636	PRAMEF20	Q5VT98	475 aa		4.87	□□□□□ -1.63
PABPC1-223	ENST00000523636	ZNF529	Q6P280	563 aa		4.87	□□□□□ -1.63
PABPC1-223	ENST00000523636	CES3	Q6UWW8	571 aa		4.87	□□□□□ -1.63
PABPC1-223	ENST00000523636	ZNF813	Q6ZN06	617 aa		4.87	□□□□□ -1.63
PABPC1-223	ENST00000523636		Q6ZSN1	163 aa		4.87	□□□□□ -1.63
PABPC1-223	ENST00000523636	PARG	Q86W56	976 aa		4.87	□□□□□ -1.63
PABPC1-223	ENST00000523636	GSPT2	Q8IYD1	628 aa	Known RBP	4.87	□□□□□ -1.63
PABPC1-223	ENST00000523636	FAM185A	Q8N0U4	392 aa		4.87	□□□□□ -1.63
PABPC1-223	ENST00000523636	STK40	Q8N2I9	435 aa		4.87	□□□□□ -1.63
PABPC1-223	ENST00000523636	FSTL5	Q8N475	847 aa	Predicted RBP	4.87	□□□□□ -1.63
PABPC1-223	ENST00000523636	NHLRC2	Q8NBF2	726 aa		4.87	□□□□□ -1.63
PABPC1-223	ENST00000523636	MCPH1	Q8NEM0	835 aa		4.87	□□□□□ -1.63
PABPC1-223	ENST00000523636	ZCCHC10	Q8TBK6	192 aa		4.87	□□□□□ -1.63
PABPC1-223	ENST00000523636	ZNF483	Q8TF39	744 aa	Predicted RBP	4.87	□□□□□ -1.63
PABPC1-223	ENST00000523636	CPT1B	Q92523	772 aa		4.87	□□□□□ -1.63
PABPC1-223	ENST00000523636	LARP4B	Q92615	738 aa	Known RBP	4.87	□□□□□ -1.63
PABPC1-223	ENST00000523636	KAT2A	Q92830	837 aa		4.87	□□□□□ -1.63
PABPC1-223	ENST00000523636	BCL2L2	Q92843	193 aa	Predicted RBP	4.87	□□□□□ -1.63
PABPC1-223	ENST00000523636	SLAMF9	Q96A28	289 aa		4.87	□□□□□ -1.63
PABPC1-223	ENST00000523636	PCED1B	Q96HM7	432 aa		4.87	□□□□□ -1.63
PABPC1-223	ENST00000523636	SMC6	Q96SB8	1091 aa		4.87	□□□□□ -1.63
PABPC1-223	ENST00000523636	PLIN2	Q99541	437 aa		4.87	□□□□□ -1.63
PABPC1-223	ENST00000523636	ZBTB18	Q99592	522 aa		4.87	□□□□□ -1.63
PABPC1-223	ENST00000523636	TRIM62	Q9BVG3	475 aa		4.87	□□□□□ -1.63
PABPC1-223	ENST00000523636	TBC1D10A	Q9BXI6	508 aa		4.87	□□□□□ -1.63
PABPC1-223	ENST00000523636	TLR10	Q9BXR5	811 aa		4.87	□□□□□ -1.63
PABPC1-223	ENST00000523636	NHEJ1	Q9H9Q4	299 aa	Predicted RBP	4.87	□□□□□ -1.63
PABPC1-223	ENST00000523636	FAM212B	Q9NTI7	297 aa	Predicted RBP	4.87	□□□□□ -1.63
PABPC1-223	ENST00000523636	ZNF446	Q9NWS9	450 aa		4.87	□□□□□ -1.63
PABPC1-223	ENST00000523636	SLC39A1	Q9NY26	324 aa		4.87	□□□□□ -1.63
PABPC1-223	ENST00000523636	KCND2	Q9NZV8	630 aa		4.87	□□□□□ -1.63
PABPC1-223	ENST00000523636	JKAMP	Q9P055	326 aa		4.87	□□□□□ -1.63
PABPC1-223	ENST00000523636	TMEM9	Q9P0T7	183 aa		4.87	□□□□□ -1.63
PABPC1-223	ENST00000523636	DNAJB11	Q9UBS4	358 aa		4.87	□□□□□ -1.63
PABPC1-223	ENST00000523636	MID2	Q9UJV3	735 aa		4.87	□□□□□ -1.63
PABPC1-223	ENST00000523636	ZDHHC8	Q9ULC8	765 aa		4.87	□□□□□ -1.63
PABPC1-223	ENST00000523636	PLEKHA6	Q9Y2H5	1048 aa		4.87	□□□□□ -1.63
PABPC1-223	ENST00000523636	TDRKH	Q9Y2W6	561 aa	Known RBP	4.87	□□□□□ -1.63
PABPC1-223	ENST00000523636	MRPS2	Q9Y399	296 aa	Known RBP	4.87	□□□□□ -1.63
PABPC1-223	ENST00000523636	STRAP	Q9Y3F4	350 aa	Known RBP	4.87	□□□□□ -1.63
PABPC1-223	ENST00000523636	ADAM18	Q9Y3Q7	739 aa		4.87	□□□□□ -1.63
PABPC1-223	ENST00000523636	CSAG2	Q9Y5P2	127 aa		4.87	□□□□□ -1.63
PABPC1-223	ENST00000523636		U3KQV3	271 aa		4.87	□□□□□ -1.63
PABPC1-223	ENST00000523636	DNAH9	Q9NYC9	4486 aa		4.86	□□□□□ -1.63
PABPC1-223	ENST00000523636	OR2A25	A4D2G3	310 aa		4.86	□□□□□ -1.63
PABPC1-223	ENST00000523636	MBD3L4	A6NDZ8	208 aa	Predicted RBP	4.86	□□□□□ -1.63
PABPC1-223	ENST00000523636	MBD3L3	A6NE82	208 aa	Predicted RBP	4.86	□□□□□ -1.63
PABPC1-223	ENST00000523636	ARGFX	A6NJG6	315 aa		4.86	□□□□□ -1.63
PABPC1-223	ENST00000523636	ZNF716	A6NP11	495 aa		4.86	□□□□□ -1.63
PABPC1-223	ENST00000523636		A8MZ25	164 aa		4.86	□□□□□ -1.63
PABPC1-223	ENST00000523636	MAP2K7	O14733	419 aa		4.86	□□□□□ -1.63
PABPC1-223	ENST00000523636	ZNF185	O15231	689 aa		4.86	□□□□□ -1.63
PABPC1-223	ENST00000523636	HDAC3	O15379	428 aa		4.86	□□□□□ -1.63
PABPC1-223	ENST00000523636	TTI1	O43156	1089 aa		4.86	□□□□□ -1.63
PABPC1-223	ENST00000523636	TOM1L1	O75674	476 aa		4.86	□□□□□ -1.63
PABPC1-223	ENST00000523636	CIB2	O75838	187 aa		4.86	□□□□□ -1.63
PABPC1-223	ENST00000523636	SEC14L2	O76054	403 aa		4.86	□□□□□ -1.63
PABPC1-223	ENST00000523636	HAUS5	O94927	633 aa		4.86	□□□□□ -1.63
PABPC1-223	ENST00000523636	RASAL1	O95294	804 aa		4.86	□□□□□ -1.63
PABPC1-223	ENST00000523636	ABHD16A	O95870	558 aa		4.86	□□□□□ -1.63
PABPC1-223	ENST00000523636	IGHE	P01854	428 aa		4.86	□□□□□ -1.63
PABPC1-223	ENST00000523636	KRT6B	P04259	564 aa		4.86	□□□□□ -1.63
PABPC1-223	ENST00000523636	PCCB	P05166	539 aa		4.86	□□□□□ -1.63
PABPC1-223	ENST00000523636	KRT8	P05787	483 aa		4.86	□□□□□ -1.63
PABPC1-223	ENST00000523636	CLTA	P09496	248 aa		4.86	□□□□□ -1.63
PABPC1-223	ENST00000523636	ZNF735	P0CB33	412 aa		4.86	□□□□□ -1.63
PABPC1-223	ENST00000523636	THRB	P10828	461 aa		4.86	□□□□□ -1.63
PABPC1-223	ENST00000523636	TCP1	P17987	556 aa	Known RBP	4.86	□□□□□ -1.63
PABPC1-223	ENST00000523636	GABRB1	P18505	474 aa		4.86	□□□□□ -1.63
PABPC1-223	ENST00000523636	CALB2	P22676	271 aa		4.86	□□□□□ -1.63

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