RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000517049.1

RNU6-1271P-201, Transcript of RNA, U6 small nuclear 1271, pseudogene, humanhuman

BASIC

Gene RNU6-1271P, Length 105 nt, Biotype snRNA.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNU6-1271P-201ENST00000517049 CFAP61Q8NHU2 1237 aa0.42□□□□□ -2.34
RNU6-1271P-201ENST00000517049 MARC2Q969Z3 335 aa0.42□□□□□ -2.34
RNU6-1271P-201ENST00000517049 ZNF641Q96N77 438 aaPredicted RBP0.42□□□□□ -2.34
RNU6-1271P-201ENST00000517049 FTOQ9C0B1 505 aaKnown RBP eCLIP0.42□□□□□ -2.34
RNU6-1271P-201ENST00000517049 SMARCAD1Q9H4L7 1026 aa0.42□□□□□ -2.34
RNU6-1271P-201ENST00000517049 MRGBPQ9NV56 204 aa0.42□□□□□ -2.34
RNU6-1271P-201ENST00000517049 SUCLA2Q9P2R7 463 aaPredicted RBP0.42□□□□□ -2.34
RNU6-1271P-201ENST00000517049 DPM3Q9P2X0 92 aa0.42□□□□□ -2.34
RNU6-1271P-201ENST00000517049 CRNNQ9UBG3 495 aaPredicted RBP0.42□□□□□ -2.34
RNU6-1271P-201ENST00000517049 PDE10AQ9Y233 779 aa0.42□□□□□ -2.34
RNU6-1271P-201ENST00000517049 CARHSP1Q9Y2V2 147 aaKnown RBP0.42□□□□□ -2.34
RNU6-1271P-201ENST00000517049 AIREO43918 545 aa0.41□□□□□ -2.34
RNU6-1271P-201ENST00000517049 CBR3O75828 277 aa0.41□□□□□ -2.34
RNU6-1271P-201ENST00000517049 MMP23AO75900 390 aa0.41□□□□□ -2.34
RNU6-1271P-201ENST00000517049 DCNP07585 359 aaKnown RBP0.41□□□□□ -2.34
RNU6-1271P-201ENST00000517049 NUDT1P36639 197 aa0.41□□□□□ -2.34
RNU6-1271P-201ENST00000517049 BIRC3Q13489 604 aa0.41□□□□□ -2.34
RNU6-1271P-201ENST00000517049 PRPF4BQ13523 1007 aaKnown RBP0.41□□□□□ -2.34
RNU6-1271P-201ENST00000517049 NOL8Q76FK4 1167 aaKnown RBP0.41□□□□□ -2.34
RNU6-1271P-201ENST00000517049 PYCR2Q96C36 320 aa0.41□□□□□ -2.34
RNU6-1271P-201ENST00000517049 MUS81Q96NY9 551 aa0.41□□□□□ -2.34
RNU6-1271P-201ENST00000517049 UBE2TQ9NPD8 197 aaPredicted RBP0.41□□□□□ -2.34
RNU6-1271P-201ENST00000517049 SLC24A2Q9UI40 661 aa0.41□□□□□ -2.34
RNU6-1271P-201ENST00000517049 TMEM98Q9Y2Y6 226 aa0.41□□□□□ -2.34
RNU6-1271P-201ENST00000517049 RBBP9O75884 186 aa0.4□□□□□ -2.35
RNU6-1271P-201ENST00000517049 MBD4O95243 580 aa0.4□□□□□ -2.35
RNU6-1271P-201ENST00000517049 PENKP01210 267 aaPredicted RBP0.4□□□□□ -2.35
RNU6-1271P-201ENST00000517049 SNRPCP09234 159 aaKnown RBP0.4□□□□□ -2.35
RNU6-1271P-201ENST00000517049 PDGFRAP16234 1089 aa0.4□□□□□ -2.35
RNU6-1271P-201ENST00000517049 IGFBP3P17936 291 aaPredicted RBP0.4□□□□□ -2.35
RNU6-1271P-201ENST00000517049 OR3A4PP47883 348 aa0.4□□□□□ -2.35
RNU6-1271P-201ENST00000517049 ARHGDIAP52565 204 aa0.4□□□□□ -2.35
RNU6-1271P-201ENST00000517049 BECN1Q14457 450 aa0.4□□□□□ -2.35
RNU6-1271P-201ENST00000517049 RPS6KA1Q15418 735 aa0.4□□□□□ -2.35
RNU6-1271P-201ENST00000517049 MAPK11Q15759 364 aa0.4□□□□□ -2.35
RNU6-1271P-201ENST00000517049 Q6ZS52 159 aa0.4□□□□□ -2.35
RNU6-1271P-201ENST00000517049 HMGN2P46Q86SG4 172 aa0.4□□□□□ -2.35
RNU6-1271P-201ENST00000517049 CAMKVQ8NCB2 501 aa0.4□□□□□ -2.35
RNU6-1271P-201ENST00000517049 C8orf46Q8TAG6 207 aa0.4□□□□□ -2.35
RNU6-1271P-201ENST00000517049 BLOC1S5Q8TDH9 187 aa0.4□□□□□ -2.35
RNU6-1271P-201ENST00000517049 CRYGNQ8WXF5 182 aa0.4□□□□□ -2.35
RNU6-1271P-201ENST00000517049 ZNF622Q969S3 477 aaKnown RBP eCLIP0.4□□□□□ -2.35
RNU6-1271P-201ENST00000517049 SNRNP40Q96DI7 357 aaKnown RBP0.4□□□□□ -2.35
RNU6-1271P-201ENST00000517049 GDAP1L1Q96MZ0 367 aa0.4□□□□□ -2.35
RNU6-1271P-201ENST00000517049 ANKZF1Q9H8Y5 726 aa0.4□□□□□ -2.35
RNU6-1271P-201ENST00000517049 GDE1Q9NZC3 331 aa0.4□□□□□ -2.35
RNU6-1271P-201ENST00000517049 PPIAL4AQ9Y536 164 aa0.4□□□□□ -2.35
RNU6-1271P-201ENST00000517049 UBIAD1Q9Y5Z9 338 aa0.4□□□□□ -2.35
RNU6-1271P-201ENST00000517049 FHP07954 510 aa0.39□□□□□ -2.35
RNU6-1271P-201ENST00000517049 GABRR1P24046 479 aa0.39□□□□□ -2.35
RNU6-1271P-201ENST00000517049 PSMB10P40306 273 aa0.39□□□□□ -2.35
RNU6-1271P-201ENST00000517049 OR3A3P47888 321 aa0.39□□□□□ -2.35
RNU6-1271P-201ENST00000517049 UBASH3AP57075 661 aa0.39□□□□□ -2.35
RNU6-1271P-201ENST00000517049 RHBDL3P58872 404 aa0.39□□□□□ -2.35
RNU6-1271P-201ENST00000517049 SERTAD2Q14140 314 aa0.39□□□□□ -2.35
RNU6-1271P-201ENST00000517049 LACTB2Q53H82 288 aaPredicted RBP0.39□□□□□ -2.35
RNU6-1271P-201ENST00000517049 PRR9Q5T870 116 aa0.39□□□□□ -2.35
RNU6-1271P-201ENST00000517049 TSPO2Q5TGU0 170 aa0.39□□□□□ -2.35
RNU6-1271P-201ENST00000517049 WDR25Q64LD2 544 aaPredicted RBP0.39□□□□□ -2.35
RNU6-1271P-201ENST00000517049 NLRP14Q86W24 1093 aa0.39□□□□□ -2.35
RNU6-1271P-201ENST00000517049 ZNF709Q8N972 641 aa0.39□□□□□ -2.35
RNU6-1271P-201ENST00000517049 BBS1Q8NFJ9 593 aa0.39□□□□□ -2.35
RNU6-1271P-201ENST00000517049 CCDC26Q8TAB7 109 aa0.39□□□□□ -2.35
RNU6-1271P-201ENST00000517049 TFB1MQ8WVM0 346 aaKnown RBP0.39□□□□□ -2.35
RNU6-1271P-201ENST00000517049 SMPDL3AQ92484 453 aa0.39□□□□□ -2.35
RNU6-1271P-201ENST00000517049 SLC25A38Q96DW6 304 aa0.39□□□□□ -2.35
RNU6-1271P-201ENST00000517049 TRIM7Q9C029 511 aa0.39□□□□□ -2.35
RNU6-1271P-201ENST00000517049 DPEP3Q9H4B8 488 aa0.39□□□□□ -2.35
RNU6-1271P-201ENST00000517049 RPF1Q9H9Y2 349 aaKnown RBP0.39□□□□□ -2.35
RNU6-1271P-201ENST00000517049 PPCSQ9HAB8 311 aa0.39□□□□□ -2.35
RNU6-1271P-201ENST00000517049 ELL3Q9HB65 397 aaPredicted RBP0.39□□□□□ -2.35
RNU6-1271P-201ENST00000517049 IRAK4Q9NWZ3 460 aa0.39□□□□□ -2.35
RNU6-1271P-201ENST00000517049 DDX25Q9UHL0 483 aaKnown RBP0.39□□□□□ -2.35
RNU6-1271P-201ENST00000517049 FAM166BA8MTA8 275 aa0.38□□□□□ -2.35
RNU6-1271P-201ENST00000517049 CLDN4O14493 209 aa0.38□□□□□ -2.35
RNU6-1271P-201ENST00000517049 P2RX6O15547 441 aa0.38□□□□□ -2.35
RNU6-1271P-201ENST00000517049 AP5Z1O43299 807 aa0.38□□□□□ -2.35
RNU6-1271P-201ENST00000517049 ATP5BP06576 529 aaKnown RBP0.38□□□□□ -2.35
RNU6-1271P-201ENST00000517049 CCDC166P0CW27 439 aa0.38□□□□□ -2.35
RNU6-1271P-201ENST00000517049 CYP11B2P19099 503 aa0.38□□□□□ -2.35
RNU6-1271P-201ENST00000517049 MAPK4P31152 587 aa0.38□□□□□ -2.35
RNU6-1271P-201ENST00000517049 HSD17B3P37058 310 aa0.38□□□□□ -2.35
RNU6-1271P-201ENST00000517049 HADHAP40939 763 aa0.38□□□□□ -2.35
RNU6-1271P-201ENST00000517049 SNTB1Q13884 538 aaKnown RBP0.38□□□□□ -2.35
RNU6-1271P-201ENST00000517049 PDE7AQ13946 482 aa0.38□□□□□ -2.35
RNU6-1271P-201ENST00000517049 ODF2Q5BJF6 829 aa0.38□□□□□ -2.35
RNU6-1271P-201ENST00000517049 ZNF542PQ5EBM4 170 aa0.38□□□□□ -2.35
RNU6-1271P-201ENST00000517049 DDX59Q5T1V6 619 aaKnown RBP eCLIP0.38□□□□□ -2.35
RNU6-1271P-201ENST00000517049 PLPP4Q5VZY2 271 aa0.38□□□□□ -2.35
RNU6-1271P-201ENST00000517049 RFPL4BQ6ZWI9 263 aa0.38□□□□□ -2.35
RNU6-1271P-201ENST00000517049 LAX1Q8IWV1 398 aa0.38□□□□□ -2.35
RNU6-1271P-201ENST00000517049 SLC43A2Q8N370 569 aa0.38□□□□□ -2.35
RNU6-1271P-201ENST00000517049 SPIN2AQ99865 258 aa0.38□□□□□ -2.35
RNU6-1271P-201ENST00000517049 SPIN2BQ9BPZ2 258 aa0.38□□□□□ -2.35
RNU6-1271P-201ENST00000517049 ALKBH7Q9BT30 221 aaPredicted RBP0.38□□□□□ -2.35
RNU6-1271P-201ENST00000517049 GOLPH3LQ9H4A5 285 aa0.38□□□□□ -2.35
RNU6-1271P-201ENST00000517049 NOL11Q9H8H0 719 aaKnown RBP0.38□□□□□ -2.35
RNU6-1271P-201ENST00000517049 SEPT11Q9NVA2 429 aaKnown RBP0.38□□□□□ -2.35
RNU6-1271P-201ENST00000517049 PTRH2Q9Y3E5 179 aaKnown RBP0.38□□□□□ -2.35
RNU6-1271P-201ENST00000517049 COMMD10Q9Y6G5 202 aa0.38□□□□□ -2.35
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 71.3 ms