RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000516224.1

RNU6-311P-201, Transcript of RNA, U6 small nuclear 311, pseudogene, humanhuman

BASIC

Gene RNU6-311P, Length 102 nt, Biotype snRNA.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNU6-311P-201ENST00000516224 UBLCP1Q8WVY7 318 aaPredicted RBP3.44□□□□□ -1.86
RNU6-311P-201ENST00000516224 NTNG2Q96CW9 530 aa3.44□□□□□ -1.86
RNU6-311P-201ENST00000516224 SNRNP40Q96DI7 357 aaKnown RBP3.44□□□□□ -1.86
RNU6-311P-201ENST00000516224 CDHR1Q96JP9 859 aa3.44□□□□□ -1.86
RNU6-311P-201ENST00000516224 CCDC114Q96M63 670 aa3.44□□□□□ -1.86
RNU6-311P-201ENST00000516224 ZNF559Q9BR84 538 aa3.44□□□□□ -1.86
RNU6-311P-201ENST00000516224 ZNF446Q9NWS9 450 aa3.44□□□□□ -1.86
RNU6-311P-201ENST00000516224 DHRS4-AS1Q9P1J3 65 aa3.44□□□□□ -1.86
RNU6-311P-201ENST00000516224 ARMCX3Q9UH62 379 aaPredicted RBP3.44□□□□□ -1.86
RNU6-311P-201ENST00000516224 MAGEB16A2A368 324 aa3.43□□□□□ -1.86
RNU6-311P-201ENST00000516224 NEDD8-MDP1E9PL57 170 aa3.43□□□□□ -1.86
RNU6-311P-201ENST00000516224 SYT7O43581 403 aa3.43□□□□□ -1.86
RNU6-311P-201ENST00000516224 CSDE1O75534 798 aaKnown RBP3.43□□□□□ -1.86
RNU6-311P-201ENST00000516224 KBTBD11O94819 623 aa3.43□□□□□ -1.86
RNU6-311P-201ENST00000516224 SLC16A8O95907 504 aa3.43□□□□□ -1.86
RNU6-311P-201ENST00000516224 OR9G9P0C7N8 305 aa3.43□□□□□ -1.86
RNU6-311P-201ENST00000516224 GLRA1P23415 457 aa3.43□□□□□ -1.86
RNU6-311P-201ENST00000516224 ID1P41134 155 aa3.43□□□□□ -1.86
RNU6-311P-201ENST00000516224 MAGEB1P43366 347 aa3.43□□□□□ -1.86
RNU6-311P-201ENST00000516224 CCR4P51679 360 aa3.43□□□□□ -1.86
RNU6-311P-201ENST00000516224 NHSL2Q5HYW2 709 aa3.43□□□□□ -1.86
RNU6-311P-201ENST00000516224 CAPN13Q6MZZ7 669 aaPredicted RBP3.43□□□□□ -1.86
RNU6-311P-201ENST00000516224 GALNTL5Q7Z4T8 443 aa3.43□□□□□ -1.86
RNU6-311P-201ENST00000516224 SIAH3Q8IW03 269 aa3.43□□□□□ -1.86
RNU6-311P-201ENST00000516224 KLHDC8AQ8IYD2 350 aa3.43□□□□□ -1.86
RNU6-311P-201ENST00000516224 ZBED8Q8IZ13 594 aa3.43□□□□□ -1.86
RNU6-311P-201ENST00000516224 ZNF444Q8N0Y2 327 aaPredicted RBP3.43□□□□□ -1.86
RNU6-311P-201ENST00000516224 RANBP9Q96S59 729 aa3.43□□□□□ -1.86
RNU6-311P-201ENST00000516224 CUEDC2Q9H467 287 aa3.43□□□□□ -1.86
RNU6-311P-201ENST00000516224 NT5DC2Q9H857 520 aa3.43□□□□□ -1.86
RNU6-311P-201ENST00000516224 SEPT10Q9P0V9 454 aa3.43□□□□□ -1.86
RNU6-311P-201ENST00000516224 SLC6A5Q9Y345 797 aa3.43□□□□□ -1.86
RNU6-311P-201ENST00000516224 KIF25-AS1Q9Y6Z4 181 aa3.43□□□□□ -1.86
RNU6-311P-201ENST00000516224 TMCO5BA8MYB1 307 aa3.42□□□□□ -1.86
RNU6-311P-201ENST00000516224 CCSO14618 274 aa3.42□□□□□ -1.86
RNU6-311P-201ENST00000516224 ATP9AO75110 1047 aa3.42□□□□□ -1.86
RNU6-311P-201ENST00000516224 CSO75390 466 aaKnown RBP3.42□□□□□ -1.86
RNU6-311P-201ENST00000516224 RAD51DO75771 328 aa3.42□□□□□ -1.86
RNU6-311P-201ENST00000516224 SLU7O95391 586 aaKnown RBP3.42□□□□□ -1.86
RNU6-311P-201ENST00000516224 CCDC159P0C7I6 412 aa3.42□□□□□ -1.86
RNU6-311P-201ENST00000516224 KLK2P20151 261 aa3.42□□□□□ -1.86
RNU6-311P-201ENST00000516224 LCP2Q13094 533 aa3.42□□□□□ -1.86
RNU6-311P-201ENST00000516224 SLC17A1Q14916 467 aa3.42□□□□□ -1.86
RNU6-311P-201ENST00000516224 ACKR1Q16570 336 aa3.42□□□□□ -1.86
RNU6-311P-201ENST00000516224 MEP1BQ16820 701 aa3.42□□□□□ -1.86
RNU6-311P-201ENST00000516224 C17orf58Q2M2W7 97 aa3.42□□□□□ -1.86
RNU6-311P-201ENST00000516224 UTF1Q5T230 341 aa3.42□□□□□ -1.86
RNU6-311P-201ENST00000516224 REP15Q6BDI9 236 aa3.42□□□□□ -1.86
RNU6-311P-201ENST00000516224 ALKBH5Q6P6C2 394 aaKnown RBP3.42□□□□□ -1.86
RNU6-311P-201ENST00000516224 CARNMT1Q8N4J0 409 aa3.42□□□□□ -1.86
RNU6-311P-201ENST00000516224 OR7G3Q8NG95 312 aa3.42□□□□□ -1.86
RNU6-311P-201ENST00000516224 ZNF414Q96IQ9 312 aa3.42□□□□□ -1.86
RNU6-311P-201ENST00000516224 RAB40CQ96S21 281 aa3.42□□□□□ -1.86
RNU6-311P-201ENST00000516224 LRRC2Q9BYS8 371 aa3.42□□□□□ -1.86
RNU6-311P-201ENST00000516224 ACPTQ9BZG2 426 aa3.42□□□□□ -1.86
RNU6-311P-201ENST00000516224 TMEM206Q9H813 350 aa3.42□□□□□ -1.86
RNU6-311P-201ENST00000516224 ARMCX1Q9P291 453 aa3.42□□□□□ -1.86
RNU6-311P-201ENST00000516224 B4GALT7Q9UBV7 327 aa3.42□□□□□ -1.86
RNU6-311P-201ENST00000516224 OR1A2Q9Y585 309 aa3.42□□□□□ -1.86
RNU6-311P-201ENST00000516224 SRPX2O60687 465 aaPredicted RBP3.41□□□□□ -1.86
RNU6-311P-201ENST00000516224 OR6A2O95222 327 aa3.41□□□□□ -1.86
RNU6-311P-201ENST00000516224 GH1P01241 217 aa3.41□□□□□ -1.86
RNU6-311P-201ENST00000516224 C8orf89P0DMQ9 161 aa3.41□□□□□ -1.86
RNU6-311P-201ENST00000516224 FOSL2P15408 326 aa3.41□□□□□ -1.86
RNU6-311P-201ENST00000516224 PPP2R1AP30153 589 aa3.41□□□□□ -1.86
RNU6-311P-201ENST00000516224 RPL34P49207 117 aaKnown RBP3.41□□□□□ -1.86
RNU6-311P-201ENST00000516224 ADARP55265 1226 aaKnown RBP3.41□□□□□ -1.86
RNU6-311P-201ENST00000516224 RPL27P61353 136 aaKnown RBP3.41□□□□□ -1.86
RNU6-311P-201ENST00000516224 PPIAP62937 165 aaKnown RBP3.41□□□□□ -1.86
RNU6-311P-201ENST00000516224 TRA2BP62995 288 aaKnown RBP3.41□□□□□ -1.86
RNU6-311P-201ENST00000516224 SPHARQ15513 63 aa3.41□□□□□ -1.86
RNU6-311P-201ENST00000516224 SAMD12Q8N8I0 201 aa3.41□□□□□ -1.86
RNU6-311P-201ENST00000516224 ZNF491Q8N8L2 437 aa3.41□□□□□ -1.86
RNU6-311P-201ENST00000516224 SPATA18Q8TC71 538 aa3.41□□□□□ -1.86
RNU6-311P-201ENST00000516224 PCED1BQ96HM7 432 aa3.41□□□□□ -1.86
RNU6-311P-201ENST00000516224 SPATA17Q96L03 361 aa3.41□□□□□ -1.86
RNU6-311P-201ENST00000516224 CNOT6LQ96LI5 555 aaKnown RBP3.41□□□□□ -1.86
RNU6-311P-201ENST00000516224 SSX3Q99909 188 aa3.41□□□□□ -1.86
RNU6-311P-201ENST00000516224 FAM212BQ9NTI7 297 aaPredicted RBP3.41□□□□□ -1.86
RNU6-311P-201ENST00000516224 TMEM161AQ9NX61 479 aa3.41□□□□□ -1.86
RNU6-311P-201ENST00000516224 PLEK2Q9NYT0 353 aa3.41□□□□□ -1.86
RNU6-311P-201ENST00000516224 ABCD2Q9UBJ2 740 aa3.41□□□□□ -1.86
RNU6-311P-201ENST00000516224 PSORS1C1Q9UIG5 152 aa3.41□□□□□ -1.86
RNU6-311P-201ENST00000516224 ACEP12821 1306 aa3.41□□□□□ -1.86
RNU6-311P-201ENST00000516224 FAM168BA1KXE4 195 aa3.4□□□□□ -1.87
RNU6-311P-201ENST00000516224 GLCEO94923 617 aa3.4□□□□□ -1.87
RNU6-311P-201ENST00000516224 PIGRP01833 764 aa3.4□□□□□ -1.87
RNU6-311P-201ENST00000516224 GIG44P09565 113 aaPredicted RBP3.4□□□□□ -1.87
RNU6-311P-201ENST00000516224 NAAAQ02083 359 aa3.4□□□□□ -1.87
RNU6-311P-201ENST00000516224 SLC34A1Q06495 639 aa3.4□□□□□ -1.87
RNU6-311P-201ENST00000516224 SCARB2Q14108 478 aa3.4□□□□□ -1.87
RNU6-311P-201ENST00000516224 MEF2DQ14814 521 aa3.4□□□□□ -1.87
RNU6-311P-201ENST00000516224 LTB4RQ15722 352 aa3.4□□□□□ -1.87
RNU6-311P-201ENST00000516224 TIMM50Q3ZCQ8 353 aa3.4□□□□□ -1.87
RNU6-311P-201ENST00000516224 SLC22A6Q4U2R8 563 aa3.4□□□□□ -1.87
RNU6-311P-201ENST00000516224 ANKRD20A4Q4UJ75 823 aa3.4□□□□□ -1.87
RNU6-311P-201ENST00000516224 ANKRD20A8PQ5CZ79 823 aa3.4□□□□□ -1.87
RNU6-311P-201ENST00000516224 ANKRD20A2Q5SQ80 823 aa3.4□□□□□ -1.87
RNU6-311P-201ENST00000516224 ANKRD20A1Q5TYW2 823 aa3.4□□□□□ -1.87
RNU6-311P-201ENST00000516224 ANKRD20A3Q5VUR7 823 aa3.4□□□□□ -1.87
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 38.4 ms