RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000504294.5

SH3BP2-208, Transcript of SH3 domain binding protein 2, humanhuman

TSL 5

Gene SH3BP2, Length 557 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP2-208ENST00000504294 EEDO75530 441 aaKnown RBP13.65□□□□□ -0.22
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SH3BP2-208ENST00000504294 SNRPNP63162 240 aaKnown RBP13.65□□□□□ -0.22
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SH3BP2-208ENST00000504294 ALOX15P16050 662 aaPredicted RBP13.63□□□□□ -0.23
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SH3BP2-208ENST00000504294 MPP2Q14168 576 aa13.63□□□□□ -0.23
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SH3BP2-208ENST00000504294 TCHHL1Q5QJ38 904 aaPredicted RBP13.63□□□□□ -0.23
SH3BP2-208ENST00000504294 CLEC6AQ6EIG7 209 aa13.63□□□□□ -0.23
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SH3BP2-208ENST00000504294 ASB18Q6ZVZ8 466 aa13.63□□□□□ -0.23
SH3BP2-208ENST00000504294 ST13P4Q8IZP2 240 aaPredicted RBP13.63□□□□□ -0.23
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