RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000497511.5

SKAP2-209, Transcript of src kinase associated phosphoprotein 2, human

TSL 4

Gene SKAP2, Length 585 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Nucleus .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
SKAP2-209	ENST00000497511	SREK1	Q8WXA9	508 aa	Known RBP	10.05	□□□□□ -0.8
SKAP2-209	ENST00000497511	SLCO2A1	Q92959	643 aa		10.05	□□□□□ -0.8
SKAP2-209	ENST00000497511	TM4SF19	Q96DZ7	209 aa		10.05	□□□□□ -0.8
SKAP2-209	ENST00000497511	TTTY12	Q9BZ98	90 aa		10.05	□□□□□ -0.8
SKAP2-209	ENST00000497511	PNO1	Q9NRX1	252 aa	Known RBP	10.05	□□□□□ -0.8
SKAP2-209	ENST00000497511	B4GALT7	Q9UBV7	327 aa		10.05	□□□□□ -0.8
SKAP2-209	ENST00000497511	YARS2	Q9Y2Z4	477 aa	Known RBP	10.05	□□□□□ -0.8
SKAP2-209	ENST00000497511	HCFC1	P51610	2035 aa		10.05	□□□□□ -0.8
SKAP2-209	ENST00000497511	ATP6AP2	A0A1C7CYW4	349 aa		10.04	□□□□□ -0.8
SKAP2-209	ENST00000497511	TCRBV16S1A1N1	A0A5B0	115 aa		10.04	□□□□□ -0.8
SKAP2-209	ENST00000497511	GRID2IP	A4D2P6	1211 aa		10.04	□□□□□ -0.8
SKAP2-209	ENST00000497511	PINLYP	A6NC86	204 aa		10.04	□□□□□ -0.8
SKAP2-209	ENST00000497511	DNAJB6	O75190	326 aa		10.04	□□□□□ -0.8
SKAP2-209	ENST00000497511	ATP6AP2	O75787	350 aa		10.04	□□□□□ -0.8
SKAP2-209	ENST00000497511	ZFAND5	O76080	213 aa		10.04	□□□□□ -0.8
SKAP2-209	ENST00000497511	FTCD	O95954	541 aa		10.04	□□□□□ -0.8
SKAP2-209	ENST00000497511	ZNF888	P0CJ79	500 aa	Predicted RBP	10.04	□□□□□ -0.8
SKAP2-209	ENST00000497511	RNH1	P13489	461 aa	Known RBP	10.04	□□□□□ -0.8
SKAP2-209	ENST00000497511	CCND1	P24385	295 aa		10.04	□□□□□ -0.8
SKAP2-209	ENST00000497511	SKIV2L2	P42285	1042 aa	Known RBP	10.04	□□□□□ -0.8
SKAP2-209	ENST00000497511	CCR8	P51685	355 aa		10.04	□□□□□ -0.8
SKAP2-209	ENST00000497511	RAB8A	P61006	207 aa		10.04	□□□□□ -0.8
SKAP2-209	ENST00000497511	NAE1	Q13564	534 aa		10.04	□□□□□ -0.8
SKAP2-209	ENST00000497511	THOC5	Q13769	683 aa	Known RBP	10.04	□□□□□ -0.8
SKAP2-209	ENST00000497511	PHKG1	Q16816	387 aa		10.04	□□□□□ -0.8
SKAP2-209	ENST00000497511	SEL1L2	Q5TEA6	688 aa		10.04	□□□□□ -0.8
SKAP2-209	ENST00000497511	NDUFAF5	Q5TEU4	345 aa		10.04	□□□□□ -0.8
SKAP2-209	ENST00000497511	CASC4	Q6P4E1	433 aa		10.04	□□□□□ -0.8
SKAP2-209	ENST00000497511	PIWIL4	Q7Z3Z4	852 aa	Known RBP	10.04	□□□□□ -0.8
SKAP2-209	ENST00000497511	GPALPP1	Q8IXQ4	340 aa		10.04	□□□□□ -0.8
SKAP2-209	ENST00000497511	LRRC56	Q8IYG6	542 aa	Predicted RBP	10.04	□□□□□ -0.8
SKAP2-209	ENST00000497511	FAM109A	Q8N4B1	249 aa		10.04	□□□□□ -0.8
SKAP2-209	ENST00000497511	NFAM1	Q8NET5	270 aa	Predicted RBP	10.04	□□□□□ -0.8
SKAP2-209	ENST00000497511	FAM222B	Q8WU58	562 aa		10.04	□□□□□ -0.8
SKAP2-209	ENST00000497511	C1orf54	Q8WWF1	131 aa		10.04	□□□□□ -0.8
SKAP2-209	ENST00000497511	SARAF	Q96BY9	339 aa		10.04	□□□□□ -0.8
SKAP2-209	ENST00000497511	VMP1	Q96GC9	406 aa		10.04	□□□□□ -0.8
SKAP2-209	ENST00000497511	DHRS1	Q96LJ7	313 aa		10.04	□□□□□ -0.8
SKAP2-209	ENST00000497511	FRMD8P1	Q9BZ68	369 aa	Predicted RBP	10.04	□□□□□ -0.8
SKAP2-209	ENST00000497511	TSGA10	Q9BZW7	698 aa		10.04	□□□□□ -0.8
SKAP2-209	ENST00000497511	ZDHHC11	Q9H8X9	412 aa		10.04	□□□□□ -0.8
SKAP2-209	ENST00000497511	DEPP	Q9NTK1	212 aa		10.04	□□□□□ -0.8
SKAP2-209	ENST00000497511	INTS10	Q9NVR2	710 aa	Known RBP	10.04	□□□□□ -0.8
SKAP2-209	ENST00000497511	SYBU	Q9NX95	663 aa		10.04	□□□□□ -0.8
SKAP2-209	ENST00000497511	SH2B3	Q9UQQ2	575 aa		10.04	□□□□□ -0.8
SKAP2-209	ENST00000497511	FAM215A	Q9Y5M1	114 aa		10.04	□□□□□ -0.8
SKAP2-209	ENST00000497511	LIPG	Q9Y5X9	500 aa		10.04	□□□□□ -0.8
SKAP2-209	ENST00000497511	URAD	A6NGE7	173 aa		10.03	□□□□□ -0.8
SKAP2-209	ENST00000497511	GFY	I3L273	518 aa		10.03	□□□□□ -0.8
SKAP2-209	ENST00000497511	OR2J2	O76002	312 aa		10.03	□□□□□ -0.8
SKAP2-209	ENST00000497511	HEXA	P06865	529 aa		10.03	□□□□□ -0.8
SKAP2-209	ENST00000497511	HIST1H2AG	P0C0S8	130 aa	Predicted RBP	10.03	□□□□□ -0.8
SKAP2-209	ENST00000497511	ZSCAN5DP	P0CG00	497 aa		10.03	□□□□□ -0.8
SKAP2-209	ENST00000497511	GABRA1	P14867	456 aa		10.03	□□□□□ -0.8
SKAP2-209	ENST00000497511	HIST1H2AD	P20671	130 aa		10.03	□□□□□ -0.8
SKAP2-209	ENST00000497511	BMP5	P22003	454 aa		10.03	□□□□□ -0.8
SKAP2-209	ENST00000497511	PCSK6	P29122	969 aa		10.03	□□□□□ -0.8
SKAP2-209	ENST00000497511	MAGEA5	P43359	124 aa		10.03	□□□□□ -0.8
SKAP2-209	ENST00000497511	BMPR2	Q13873	1038 aa		10.03	□□□□□ -0.8
SKAP2-209	ENST00000497511	PCBP2	Q15366	365 aa	Known RBP eCLIP	10.03	□□□□□ -0.8	2e-6	■■■■□ 24.6
SKAP2-209	ENST00000497511	OASL	Q15646	514 aa	Known RBP	10.03	□□□□□ -0.8
SKAP2-209	ENST00000497511	ZNF470	Q6ECI4	717 aa		10.03	□□□□□ -0.8
SKAP2-209	ENST00000497511	NEPRO	Q6NW34	567 aa		10.03	□□□□□ -0.8
SKAP2-209	ENST00000497511	AGTRAP	Q6RW13	159 aa		10.03	□□□□□ -0.8
SKAP2-209	ENST00000497511	C16orf47	Q6ZP98	133 aa	Predicted RBP	10.03	□□□□□ -0.8
SKAP2-209	ENST00000497511	KIAA0408	Q6ZU52	694 aa		10.03	□□□□□ -0.8
SKAP2-209	ENST00000497511	FAM47E	Q6ZV65	393 aa		10.03	□□□□□ -0.8
SKAP2-209	ENST00000497511	GSTA5	Q7RTV2	222 aa		10.03	□□□□□ -0.8
SKAP2-209	ENST00000497511	KIAA1328	Q86T90	577 aa		10.03	□□□□□ -0.8
SKAP2-209	ENST00000497511	CILP2	Q8IUL8	1156 aa		10.03	□□□□□ -0.8
SKAP2-209	ENST00000497511	CPNE9	Q8IYJ1	553 aa		10.03	□□□□□ -0.8
SKAP2-209	ENST00000497511	AFAP1L2	Q8N4X5	818 aa		10.03	□□□□□ -0.8
SKAP2-209	ENST00000497511	LRRC57	Q8N9N7	239 aa		10.03	□□□□□ -0.8
SKAP2-209	ENST00000497511	APCDD1L	Q8NCL9	501 aa		10.03	□□□□□ -0.8
SKAP2-209	ENST00000497511	KCNJ9	Q92806	393 aa		10.03	□□□□□ -0.8
SKAP2-209	ENST00000497511	NCLN	Q969V3	563 aa		10.03	□□□□□ -0.8
SKAP2-209	ENST00000497511	PDLIM2	Q96JY6	352 aa		10.03	□□□□□ -0.8
SKAP2-209	ENST00000497511	HIST1H2AH	Q96KK5	128 aa		10.03	□□□□□ -0.8
SKAP2-209	ENST00000497511	HIST1H2AJ	Q99878	128 aa		10.03	□□□□□ -0.8
SKAP2-209	ENST00000497511	FAM173A	Q9BQD7	235 aa		10.03	□□□□□ -0.8
SKAP2-209	ENST00000497511	HAUS8	Q9BT25	410 aa		10.03	□□□□□ -0.8
SKAP2-209	ENST00000497511	H2AFJ	Q9BTM1	129 aa		10.03	□□□□□ -0.8
SKAP2-209	ENST00000497511	KIFC1	Q9BW19	673 aa		10.03	□□□□□ -0.8
SKAP2-209	ENST00000497511	LIN28A	Q9H9Z2	209 aa	Known RBP	10.03	□□□□□ -0.8
SKAP2-209	ENST00000497511	NECTIN3	Q9NQS3	549 aa		10.03	□□□□□ -0.8
SKAP2-209	ENST00000497511	EIF2B3	Q9NR50	452 aa	Known RBP	10.03	□□□□□ -0.8
SKAP2-209	ENST00000497511	FBXO6	Q9NRD1	293 aa	Predicted RBP	10.03	□□□□□ -0.8
SKAP2-209	ENST00000497511	CBLC	Q9ULV8	474 aa		10.03	□□□□□ -0.8
SKAP2-209	ENST00000497511	EPB41L3	Q9Y2J2	1087 aa	Predicted RBP	10.03	□□□□□ -0.8
SKAP2-209	ENST00000497511	EPN1	Q9Y6I3	576 aa	Predicted RBP	10.03	□□□□□ -0.8
SKAP2-209	ENST00000497511	JMJD1C	Q15652	2540 aa		10.03	□□□□□ -0.8
SKAP2-209	ENST00000497511	SCN3A	Q9NY46	2000 aa		10.02	□□□□□ -0.8
SKAP2-209	ENST00000497511	HEATR5B	Q9P2D3	2071 aa		10.02	□□□□□ -0.81
SKAP2-209	ENST00000497511		A0A0G2JMM0	328 aa		10.02	□□□□□ -0.81
SKAP2-209	ENST00000497511		A0A1W2PPB8	328 aa		10.02	□□□□□ -0.81
SKAP2-209	ENST00000497511		A0A1W2PRS3	328 aa		10.02	□□□□□ -0.81
SKAP2-209	ENST00000497511	HSPB2	A8KAH6	182 aa		10.02	□□□□□ -0.81
SKAP2-209	ENST00000497511	KIR3DP1	A8MWS1	328 aa		10.02	□□□□□ -0.81
SKAP2-209	ENST00000497511	WWP2	O00308	870 aa		10.02	□□□□□ -0.81
SKAP2-209	ENST00000497511	SYT5	O00445	386 aa		10.02	□□□□□ -0.81

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