RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000467435.1

HDLBP-231, Transcript of high density lipoprotein binding protein, human

TSL 2

Gene HDLBP, Length 639 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
HDLBP-231	ENST00000467435	MRPS2	Q9Y399	296 aa	Known RBP	11.64	□□□□□ -0.55
HDLBP-231	ENST00000467435	LRRC42	Q9Y546	428 aa		11.64	□□□□□ -0.55
HDLBP-231	ENST00000467435	ZNF860	A6NHJ4	632 aa		11.63	□□□□□ -0.55
HDLBP-231	ENST00000467435	PGRMC2	O15173	223 aa		11.63	□□□□□ -0.55
HDLBP-231	ENST00000467435	HCRTR1	O43613	425 aa		11.63	□□□□□ -0.55
HDLBP-231	ENST00000467435	NUDT21	O43809	227 aa	Known RBP	11.63	□□□□□ -0.55
HDLBP-231	ENST00000467435	ERAL1	O75616	437 aa	Known RBP	11.63	□□□□□ -0.55
HDLBP-231	ENST00000467435	MT-ND1	P03886	318 aa		11.63	□□□□□ -0.55
HDLBP-231	ENST00000467435	GIMD1	P0DJR0	217 aa		11.63	□□□□□ -0.55
HDLBP-231	ENST00000467435	RAP2A	P10114	183 aa		11.63	□□□□□ -0.55
HDLBP-231	ENST00000467435	ETFA	P13804	333 aa		11.63	□□□□□ -0.55
HDLBP-231	ENST00000467435	ATP6V1C1	P21283	382 aa		11.63	□□□□□ -0.55
HDLBP-231	ENST00000467435	MLLT3	P42568	568 aa	Predicted RBP	11.63	□□□□□ -0.55
HDLBP-231	ENST00000467435	NCBP2	P52298	156 aa	Known RBP eCLIP	11.63	□□□□□ -0.55
HDLBP-231	ENST00000467435	AQP4	P55087	323 aa		11.63	□□□□□ -0.55
HDLBP-231	ENST00000467435	CASP9	P55211	416 aa		11.63	□□□□□ -0.55
HDLBP-231	ENST00000467435	LIM2	P55344	173 aa		11.63	□□□□□ -0.55
HDLBP-231	ENST00000467435	OLR1	P78380	273 aa		11.63	□□□□□ -0.55
HDLBP-231	ENST00000467435	CHRNB3	Q05901	458 aa		11.63	□□□□□ -0.55
HDLBP-231	ENST00000467435	VAC14	Q08AM6	782 aa		11.63	□□□□□ -0.55
HDLBP-231	ENST00000467435	SPIDR	Q14159	915 aa		11.63	□□□□□ -0.55
HDLBP-231	ENST00000467435	ADRM1	Q16186	407 aa		11.63	□□□□□ -0.55
HDLBP-231	ENST00000467435	PEAR1	Q5VY43	1037 aa	Predicted RBP	11.63	□□□□□ -0.55
HDLBP-231	ENST00000467435	SAXO2	Q658L1	398 aa		11.63	□□□□□ -0.55
HDLBP-231	ENST00000467435	OR52E8	Q6IFG1	317 aa		11.63	□□□□□ -0.55
HDLBP-231	ENST00000467435	ENPP6	Q6UWR7	440 aa		11.63	□□□□□ -0.55
HDLBP-231	ENST00000467435	CEP68	Q76N32	757 aa		11.63	□□□□□ -0.55
HDLBP-231	ENST00000467435	ANKFN1	Q8N957	763 aa		11.63	□□□□□ -0.55
HDLBP-231	ENST00000467435	DTWD2	Q8NBA8	298 aa		11.63	□□□□□ -0.55
HDLBP-231	ENST00000467435	C11orf65	Q8NCR3	313 aa		11.63	□□□□□ -0.55
HDLBP-231	ENST00000467435	ICA1L	Q8NDH6	482 aa		11.63	□□□□□ -0.55
HDLBP-231	ENST00000467435	POP5	Q969H6	163 aa	Known RBP	11.63	□□□□□ -0.55
HDLBP-231	ENST00000467435	EME1	Q96AY2	570 aa		11.63	□□□□□ -0.55
HDLBP-231	ENST00000467435	CNRIP1	Q96F85	164 aa	Predicted RBP	11.63	□□□□□ -0.55
HDLBP-231	ENST00000467435	TCTN2	Q96GX1	697 aa		11.63	□□□□□ -0.55
HDLBP-231	ENST00000467435	AHCYL2	Q96HN2	611 aa	Known RBP	11.63	□□□□□ -0.55
HDLBP-231	ENST00000467435	ZNF570	Q96NI8	536 aa		11.63	□□□□□ -0.55
HDLBP-231	ENST00000467435	AMDHD1	Q96NU7	426 aa		11.63	□□□□□ -0.55
HDLBP-231	ENST00000467435	CD180	Q99467	661 aa		11.63	□□□□□ -0.55
HDLBP-231	ENST00000467435	RAB33B	Q9H082	229 aa		11.63	□□□□□ -0.55
HDLBP-231	ENST00000467435	VCX	Q9H320	206 aa		11.63	□□□□□ -0.55
HDLBP-231	ENST00000467435	GLIPR2	Q9H4G4	154 aa		11.63	□□□□□ -0.55
HDLBP-231	ENST00000467435	EPS8L2	Q9H6S3	715 aa		11.63	□□□□□ -0.55
HDLBP-231	ENST00000467435	AGPAT4	Q9NRZ5	378 aa		11.63	□□□□□ -0.55
HDLBP-231	ENST00000467435	DCAF13	Q9NV06	445 aa	Known RBP	11.63	□□□□□ -0.55
HDLBP-231	ENST00000467435	GPATCH2	Q9NW75	528 aa		11.63	□□□□□ -0.55
HDLBP-231	ENST00000467435	ZSCAN32	Q9NX65	697 aa		11.63	□□□□□ -0.55
HDLBP-231	ENST00000467435	FBXO4	Q9UKT5	387 aa		11.63	□□□□□ -0.55
HDLBP-231	ENST00000467435	DAPP1	Q9UN19	280 aa		11.63	□□□□□ -0.55
HDLBP-231	ENST00000467435	FAF1	Q9UNN5	650 aa	Predicted RBP	11.63	□□□□□ -0.55
HDLBP-231	ENST00000467435	SAMD4A	Q9UPU9	718 aa	Known RBP	11.63	□□□□□ -0.55
HDLBP-231	ENST00000467435	MAP4K5	Q9Y4K4	846 aa		11.63	□□□□□ -0.55
HDLBP-231	ENST00000467435	PCDH15	Q96QU1	1955 aa		11.63	□□□□□ -0.55
HDLBP-231	ENST00000467435		A0A1B0GTQ1	180 aa		11.62	□□□□□ -0.55
HDLBP-231	ENST00000467435	FAM149A	A5PLN7	773 aa		11.62	□□□□□ -0.55
HDLBP-231	ENST00000467435	WASHC1	A8K0Z3	465 aa		11.62	□□□□□ -0.55
HDLBP-231	ENST00000467435	MYO1G	B0I1T2	1018 aa		11.62	□□□□□ -0.55
HDLBP-231	ENST00000467435	TXNDC9	O14530	226 aa		11.62	□□□□□ -0.55
HDLBP-231	ENST00000467435	HR	O43593	1189 aa		11.62	□□□□□ -0.55
HDLBP-231	ENST00000467435	DUX1	O43812	170 aa		11.62	□□□□□ -0.55
HDLBP-231	ENST00000467435	KIF1C	O43896	1103 aa	Known RBP	11.62	□□□□□ -0.55
HDLBP-231	ENST00000467435	GALR3	O60755	368 aa	Predicted RBP	11.62	□□□□□ -0.55
HDLBP-231	ENST00000467435	TNFRSF21	O75509	655 aa		11.62	□□□□□ -0.55
HDLBP-231	ENST00000467435	PRKD3	O94806	890 aa		11.62	□□□□□ -0.55
HDLBP-231	ENST00000467435	C9	P02748	559 aa		11.62	□□□□□ -0.55
HDLBP-231	ENST00000467435	CAPNS1	P04632	268 aa		11.62	□□□□□ -0.55
HDLBP-231	ENST00000467435	GLB1	P16278	677 aa		11.62	□□□□□ -0.55
HDLBP-231	ENST00000467435	ALDH4A1	P30038	563 aa		11.62	□□□□□ -0.55
HDLBP-231	ENST00000467435	OR1D5	P58170	312 aa		11.62	□□□□□ -0.55
HDLBP-231	ENST00000467435	DSTN	P60981	165 aa		11.62	□□□□□ -0.55
HDLBP-231	ENST00000467435	RUNX2	Q13950	521 aa		11.62	□□□□□ -0.55
HDLBP-231	ENST00000467435	VEZF1	Q14119	521 aa		11.62	□□□□□ -0.55
HDLBP-231	ENST00000467435	C16orf72	Q14CZ0	275 aa		11.62	□□□□□ -0.55
HDLBP-231	ENST00000467435	ATP6AP1	Q15904	470 aa		11.62	□□□□□ -0.55
HDLBP-231	ENST00000467435	NKAIN2	Q5VXU1	208 aa		11.62	□□□□□ -0.55
HDLBP-231	ENST00000467435	PRSS41	Q7RTY9	318 aa		11.62	□□□□□ -0.55
HDLBP-231	ENST00000467435	MCAT	Q8IVS2	390 aa	Known RBP	11.62	□□□□□ -0.55
HDLBP-231	ENST00000467435	EID3	Q8N140	333 aa		11.62	□□□□□ -0.55
HDLBP-231	ENST00000467435	DNAJC22	Q8N4W6	341 aa		11.62	□□□□□ -0.55
HDLBP-231	ENST00000467435	PSMA8	Q8TAA3	256 aa		11.62	□□□□□ -0.55
HDLBP-231	ENST00000467435	NCSTN	Q92542	709 aa		11.62	□□□□□ -0.55
HDLBP-231	ENST00000467435	MAL2	Q969L2	176 aa		11.62	□□□□□ -0.55
HDLBP-231	ENST00000467435	NEURL3	Q96EH8	262 aa		11.62	□□□□□ -0.55
HDLBP-231	ENST00000467435	ZDHHC12	Q96GR4	267 aa		11.62	□□□□□ -0.55
HDLBP-231	ENST00000467435	NAF1	Q96HR8	494 aa	Known RBP	11.62	□□□□□ -0.55
HDLBP-231	ENST00000467435	SLC35G5	Q96KT7	338 aa		11.62	□□□□□ -0.55
HDLBP-231	ENST00000467435	CSF3R	Q99062	836 aa		11.62	□□□□□ -0.55
HDLBP-231	ENST00000467435	CHID1	Q9BWS9	393 aa		11.62	□□□□□ -0.55
HDLBP-231	ENST00000467435	EPB41L1	Q9H4G0	881 aa		11.62	□□□□□ -0.55
HDLBP-231	ENST00000467435	MAGIX	Q9H6Y5	334 aa		11.62	□□□□□ -0.55
HDLBP-231	ENST00000467435	YY1AP1	Q9H869	796 aa		11.62	□□□□□ -0.55
HDLBP-231	ENST00000467435	LYRM4	Q9HD34	91 aa		11.62	□□□□□ -0.55
HDLBP-231	ENST00000467435	FSCN3	Q9NQT6	498 aa		11.62	□□□□□ -0.55
HDLBP-231	ENST00000467435	STARD5	Q9NSY2	213 aa		11.62	□□□□□ -0.55
HDLBP-231	ENST00000467435	SOHLH2	Q9NX45	425 aa		11.62	□□□□□ -0.55
HDLBP-231	ENST00000467435	NLGN3	Q9NZ94	848 aa		11.62	□□□□□ -0.55
HDLBP-231	ENST00000467435	KCMF1	Q9P0J7	381 aa		11.62	□□□□□ -0.55
HDLBP-231	ENST00000467435	EPHA6	Q9UF33	1036 aa		11.62	□□□□□ -0.55
HDLBP-231	ENST00000467435	CES1P1	Q9UKY3	287 aa		11.62	□□□□□ -0.55
HDLBP-231	ENST00000467435	PADI4	Q9UM07	663 aa		11.62	□□□□□ -0.55

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