RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000439415.1

CBX1P4-201, Transcript of chromobox 1 pseudogene 4, humanhuman

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Gene CBX1P4, Length 457 nt, Biotype processed pseudogene.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CBX1P4-201ENST00000439415 FAM240BA0A1B0GVZ2 78 aa4.25□□□□□ -1.73
CBX1P4-201ENST00000439415 A0A1W2PN81 502 aa4.25□□□□□ -1.73
CBX1P4-201ENST00000439415 RPS10-NUDT3A0A1W2PQS6 291 aa4.25□□□□□ -1.73
CBX1P4-201ENST00000439415 RNF222A6NCQ9 220 aa4.25□□□□□ -1.73
CBX1P4-201ENST00000439415 ZNF732B4DXR9 585 aa4.25□□□□□ -1.73
CBX1P4-201ENST00000439415 E5RJQ4 531 aa4.25□□□□□ -1.73
CBX1P4-201ENST00000439415 E9PMD0 336 aa4.25□□□□□ -1.73
CBX1P4-201ENST00000439415 SGK494L7N484 410 aa4.25□□□□□ -1.73
CBX1P4-201ENST00000439415 SDHDO14521 159 aa4.25□□□□□ -1.73
CBX1P4-201ENST00000439415 CTAGE5O15320 804 aa4.25□□□□□ -1.73
CBX1P4-201ENST00000439415 ECE2O60344 883 aa4.25□□□□□ -1.73
CBX1P4-201ENST00000439415 BCAS1O75363 584 aaPredicted RBP4.25□□□□□ -1.73
CBX1P4-201ENST00000439415 C1QL1O75973 258 aa4.25□□□□□ -1.73
CBX1P4-201ENST00000439415 ZNF44P15621 663 aa4.25□□□□□ -1.73
CBX1P4-201ENST00000439415 NCF2P19878 526 aaPredicted RBP4.25□□□□□ -1.73
CBX1P4-201ENST00000439415 HNF1AP20823 631 aa4.25□□□□□ -1.73
CBX1P4-201ENST00000439415 MPGP29372 298 aa4.25□□□□□ -1.73
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CBX1P4-201ENST00000439415 RPL23AP62750 156 aaKnown RBP4.25□□□□□ -1.73
CBX1P4-201ENST00000439415 HSPA14Q0VDF9 509 aa4.25□□□□□ -1.73
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CBX1P4-201ENST00000439415 GPR50Q13585 617 aa4.25□□□□□ -1.73
CBX1P4-201ENST00000439415 ITGA9Q13797 1035 aa4.25□□□□□ -1.73
CBX1P4-201ENST00000439415 CALCRLQ16602 461 aa4.25□□□□□ -1.73
CBX1P4-201ENST00000439415 EXOC3L2Q2M3D2 409 aa4.25□□□□□ -1.73
CBX1P4-201ENST00000439415 ZNF528Q3MIS6 628 aa4.25□□□□□ -1.73
CBX1P4-201ENST00000439415 C10orf25Q5T742 122 aa4.25□□□□□ -1.73
CBX1P4-201ENST00000439415 C1orf185Q5T7R7 199 aa4.25□□□□□ -1.73
CBX1P4-201ENST00000439415 RTL6Q6ICC9 239 aa4.25□□□□□ -1.73
CBX1P4-201ENST00000439415 CDC42EP5Q6NZY7 148 aa4.25□□□□□ -1.73
CBX1P4-201ENST00000439415 DHRS11Q6UWP2 260 aa4.25□□□□□ -1.73
CBX1P4-201ENST00000439415 CEACAM20Q6UY09 585 aa4.25□□□□□ -1.73
CBX1P4-201ENST00000439415 CENPUQ71F23 418 aa4.25□□□□□ -1.73
CBX1P4-201ENST00000439415 SLC22A16Q86VW1 577 aa4.25□□□□□ -1.73
CBX1P4-201ENST00000439415 UBQLNLQ8IYU4 475 aa4.25□□□□□ -1.73
CBX1P4-201ENST00000439415 CLIP4Q8N3C7 705 aa4.25□□□□□ -1.73
CBX1P4-201ENST00000439415 OR52K1Q8NGK4 314 aa4.25□□□□□ -1.73
CBX1P4-201ENST00000439415 SPATA22Q8NHS9 363 aa4.25□□□□□ -1.73
CBX1P4-201ENST00000439415 GRHL3Q8TE85 626 aa4.25□□□□□ -1.73
CBX1P4-201ENST00000439415 ANKRD49Q8WVL7 239 aa4.25□□□□□ -1.73
CBX1P4-201ENST00000439415 PIK3R3Q92569 461 aa4.25□□□□□ -1.73
CBX1P4-201ENST00000439415 P3H4Q92791 437 aa4.25□□□□□ -1.73
CBX1P4-201ENST00000439415 EMG1Q92979 244 aaKnown RBP4.25□□□□□ -1.73
CBX1P4-201ENST00000439415 LRR1Q96L50 414 aa4.25□□□□□ -1.73
CBX1P4-201ENST00000439415 DEFB118Q96PH6 123 aa4.25□□□□□ -1.73
CBX1P4-201ENST00000439415 FCRL4Q96PJ5 515 aa4.25□□□□□ -1.73
CBX1P4-201ENST00000439415 CCM2Q9BSQ5 444 aa4.25□□□□□ -1.73
CBX1P4-201ENST00000439415 RBM24Q9BX46 236 aaKnown RBP4.25□□□□□ -1.73
CBX1P4-201ENST00000439415 VIPAS39Q9H9C1 493 aa4.25□□□□□ -1.73
CBX1P4-201ENST00000439415 RNF186Q9NXI6 227 aa4.25□□□□□ -1.73
CBX1P4-201ENST00000439415 SMARCAL1Q9NZC9 954 aa4.25□□□□□ -1.73
CBX1P4-201ENST00000439415 CRLS1Q9UJA2 301 aa4.25□□□□□ -1.73
CBX1P4-201ENST00000439415 NIP7Q9Y221 180 aaKnown RBP eCLIP4.25□□□□□ -1.73
CBX1P4-201ENST00000439415 CHTOPQ9Y3Y2 248 aaKnown RBP4.25□□□□□ -1.73
CBX1P4-201ENST00000439415 SLCO1B1Q9Y6L6 691 aa4.25□□□□□ -1.73
CBX1P4-201ENST00000439415 UGGT2Q9NYU1 1516 aa4.25□□□□□ -1.73
CBX1P4-201ENST00000439415 KANK1Q14678 1352 aa4.25□□□□□ -1.73
CBX1P4-201ENST00000439415 EP400Q96L91 3159 aa4.24□□□□□ -1.73
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CBX1P4-201ENST00000439415 TRAPPC8Q9Y2L5 1435 aa4.24□□□□□ -1.73
CBX1P4-201ENST00000439415 GOLGA6L7A0A1B0GV03 622 aa4.24□□□□□ -1.73
CBX1P4-201ENST00000439415 NCF1BA6NI72 391 aaPredicted RBP4.24□□□□□ -1.73
CBX1P4-201ENST00000439415 ASB14A6NK59 587 aa4.24□□□□□ -1.73
CBX1P4-201ENST00000439415 PCP4L1A6NKN8 68 aa4.24□□□□□ -1.73
CBX1P4-201ENST00000439415 DBX1A6NMT0 343 aa4.24□□□□□ -1.73
CBX1P4-201ENST00000439415 YJEFN3A6XGL0 299 aa4.24□□□□□ -1.73
CBX1P4-201ENST00000439415 C4orf47A7E2U8 309 aa4.24□□□□□ -1.73
CBX1P4-201ENST00000439415 NCF1CA8MVU1 366 aaPredicted RBP4.24□□□□□ -1.73
CBX1P4-201ENST00000439415 PPIAL4DF5H284 164 aa4.24□□□□□ -1.73
CBX1P4-201ENST00000439415 CASC3O15234 703 aaKnown RBP4.24□□□□□ -1.73
CBX1P4-201ENST00000439415 NARSO43776 548 aaKnown RBP4.24□□□□□ -1.73
CBX1P4-201ENST00000439415 SLC28A2O43868 658 aa4.24□□□□□ -1.73
CBX1P4-201ENST00000439415 NDUFA7O95182 113 aa4.24□□□□□ -1.73
CBX1P4-201ENST00000439415 GCP02774 474 aa4.24□□□□□ -1.73
CBX1P4-201ENST00000439415 FGF4P08620 206 aa4.24□□□□□ -1.73
CBX1P4-201ENST00000439415 ANXA8P13928 327 aa4.24□□□□□ -1.73
CBX1P4-201ENST00000439415 LHCGRP22888 699 aa4.24□□□□□ -1.73
CBX1P4-201ENST00000439415 HOXD3P31249 432 aaPredicted RBP4.24□□□□□ -1.73
CBX1P4-201ENST00000439415 CCR4P51679 360 aa4.24□□□□□ -1.73
CBX1P4-201ENST00000439415 SUCLG1P53597 346 aaKnown RBP4.24□□□□□ -1.73
CBX1P4-201ENST00000439415 MAP2K1Q02750 393 aaPredicted RBP4.24□□□□□ -1.73
CBX1P4-201ENST00000439415 SLC20A2Q08357 652 aa4.24□□□□□ -1.73
CBX1P4-201ENST00000439415 NCBP1Q09161 790 aaKnown RBP4.24□□□□□ -1.73
CBX1P4-201ENST00000439415 NFATC2Q13469 925 aa4.24□□□□□ -1.73
CBX1P4-201ENST00000439415 MEF2DQ14814 521 aa4.24□□□□□ -1.73
CBX1P4-201ENST00000439415 EFTUD2Q15029 972 aaKnown RBP eCLIP4.24□□□□□ -1.73
CBX1P4-201ENST00000439415 GPR33Q49SQ1 333 aa4.24□□□□□ -1.73
CBX1P4-201ENST00000439415 ATF7IP2Q5U623 682 aa4.24□□□□□ -1.73
CBX1P4-201ENST00000439415 ANXA8L1Q5VT79 327 aa4.24□□□□□ -1.73
CBX1P4-201ENST00000439415 TAF3Q5VWG9 929 aa4.24□□□□□ -1.73
CBX1P4-201ENST00000439415 LYPLAL1Q5VWZ2 237 aa4.24□□□□□ -1.73
CBX1P4-201ENST00000439415 TTC23Q5W5X9 447 aa4.24□□□□□ -1.73
CBX1P4-201ENST00000439415 CWC27Q6UX04 472 aaKnown RBP4.24□□□□□ -1.73
CBX1P4-201ENST00000439415 GFRALQ6UXV0 394 aa4.24□□□□□ -1.73
CBX1P4-201ENST00000439415 TMEM64Q6YI46 380 aa4.24□□□□□ -1.73
CBX1P4-201ENST00000439415 LCNL1Q6ZST4 164 aa4.24□□□□□ -1.73
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