RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000361731.3

SFT2D1-201, Transcript of SFT2 domain containing 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene SFT2D1, Length 1,079 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SFT2D1-201ENST00000361731 LRIT2A6NDA9 550 aa14.64□□□□□ -0.07
SFT2D1-201ENST00000361731 MBD3L4A6NDZ8 208 aaPredicted RBP14.64□□□□□ -0.07
SFT2D1-201ENST00000361731 MBD3L3A6NE82 208 aaPredicted RBP14.64□□□□□ -0.07
SFT2D1-201ENST00000361731 MBD3L5A6NJ08 208 aaPredicted RBP14.64□□□□□ -0.07
SFT2D1-201ENST00000361731 NRDCO43847 1150 aa14.64□□□□□ -0.07
SFT2D1-201ENST00000361731 CTNSO60931 367 aa14.64□□□□□ -0.07
SFT2D1-201ENST00000361731 IGKV3-11P04433 115 aa14.64□□□□□ -0.07
SFT2D1-201ENST00000361731 MLNP12872 115 aa14.64□□□□□ -0.07
SFT2D1-201ENST00000361731 ANP32AP39687 249 aaKnown RBP14.64□□□□□ -0.07
SFT2D1-201ENST00000361731 KCNJ1P48048 391 aa14.64□□□□□ -0.07
SFT2D1-201ENST00000361731 RGS4P49798 205 aa14.64□□□□□ -0.07
SFT2D1-201ENST00000361731 SLC13A2Q13183 592 aa14.64□□□□□ -0.07
SFT2D1-201ENST00000361731 THOC5Q13769 683 aaKnown RBP14.64□□□□□ -0.07
SFT2D1-201ENST00000361731 RBM20Q5T481 1227 aaKnown RBP14.64□□□□□ -0.07
SFT2D1-201ENST00000361731 SBSNQ6UWP8 590 aa14.64□□□□□ -0.07
SFT2D1-201ENST00000361731 CAPN12Q6ZSI9 719 aa14.64□□□□□ -0.07
SFT2D1-201ENST00000361731 VN1R5Q7Z5H4 357 aa14.64□□□□□ -0.07
SFT2D1-201ENST00000361731 CLNKQ7Z7G1 428 aa14.64□□□□□ -0.07
SFT2D1-201ENST00000361731 SUPV3L1Q8IYB8 786 aaKnown RBP eCLIP14.64□□□□□ -0.07
SFT2D1-201ENST00000361731 MYO1HQ8N1T3 1032 aa14.64□□□□□ -0.07
SFT2D1-201ENST00000361731 C2CD4AQ8NCU7 369 aaPredicted RBP14.64□□□□□ -0.07
SFT2D1-201ENST00000361731 MBD3L2Q8NHZ7 208 aaPredicted RBP14.64□□□□□ -0.07
SFT2D1-201ENST00000361731 NTNG2Q96CW9 530 aa14.64□□□□□ -0.07
SFT2D1-201ENST00000361731 LINGO1Q96FE5 620 aa14.64□□□□□ -0.07
SFT2D1-201ENST00000361731 TIMP4Q99727 224 aa14.64□□□□□ -0.07
SFT2D1-201ENST00000361731 AIF1LQ9BQI0 150 aa14.64□□□□□ -0.07
SFT2D1-201ENST00000361731 CNOT11Q9UKZ1 510 aaKnown RBP14.64□□□□□ -0.07
SFT2D1-201ENST00000361731 CLCA3PQ9Y6N3 262 aa14.64□□□□□ -0.07
SFT2D1-201ENST00000361731 A0A0G2JN53 185 aa14.63□□□□□ -0.07
SFT2D1-201ENST00000361731 MAGEB16A2A368 324 aa14.63□□□□□ -0.07
SFT2D1-201ENST00000361731 CD8B2A6NJW9 211 aa14.63□□□□□ -0.07
SFT2D1-201ENST00000361731 SIAH2O43255 324 aa14.63□□□□□ -0.07
SFT2D1-201ENST00000361731 ARHGEF9O43307 516 aa14.63□□□□□ -0.07
SFT2D1-201ENST00000361731 TRIM3O75382 744 aaPredicted RBP14.63□□□□□ -0.07
SFT2D1-201ENST00000361731 ETHE1O95571 254 aa14.63□□□□□ -0.07
SFT2D1-201ENST00000361731 IL18BPO95998 194 aa14.63□□□□□ -0.07
SFT2D1-201ENST00000361731 LIM2P55344 173 aa14.63□□□□□ -0.07
SFT2D1-201ENST00000361731 KRTAP1-1Q07627 177 aa14.63□□□□□ -0.07
SFT2D1-201ENST00000361731 BMPR2Q13873 1038 aa14.63□□□□□ -0.07
SFT2D1-201ENST00000361731 C9orf40Q8IXQ3 194 aa14.63□□□□□ -0.07
SFT2D1-201ENST00000361731 KLHDC8AQ8IYD2 350 aa14.63□□□□□ -0.07
SFT2D1-201ENST00000361731 NUBPLQ8TB37 319 aa14.63□□□□□ -0.07
SFT2D1-201ENST00000361731 DACH2Q96NX9 599 aa14.63□□□□□ -0.07
SFT2D1-201ENST00000361731 OR8D2Q9GZM6 311 aa14.63□□□□□ -0.07
SFT2D1-201ENST00000361731 UBQLN3Q9H347 655 aa14.63□□□□□ -0.07
SFT2D1-201ENST00000361731 TAS2R13Q9NYV9 303 aa14.63□□□□□ -0.07
SFT2D1-201ENST00000361731 DAPP1Q9UN19 280 aa14.63□□□□□ -0.07
SFT2D1-201ENST00000361731 ZKSCAN5Q9Y2L8 839 aa14.63□□□□□ -0.07
SFT2D1-201ENST00000361731 IKBKGQ9Y6K9 419 aa14.63□□□□□ -0.07
SFT2D1-201ENST00000361731 NINQ8N4C6 2090 aa14.62□□□□□ -0.07
SFT2D1-201ENST00000361731 SONP18583 2426 aaKnown RBP14.62□□□□□ -0.07
SFT2D1-201ENST00000361731 MYOCOSA0A1B0GUC4 107 aa14.62□□□□□ -0.07
SFT2D1-201ENST00000361731 SDR42E2A6NKP2 422 aa14.62□□□□□ -0.07
SFT2D1-201ENST00000361731 ERI3O43414 337 aaKnown RBP14.62□□□□□ -0.07
SFT2D1-201ENST00000361731 IPO7O95373 1038 aaKnown RBP14.62□□□□□ -0.07
SFT2D1-201ENST00000361731 HIST1H2AGP0C0S8 130 aaPredicted RBP14.62□□□□□ -0.07
SFT2D1-201ENST00000361731 HIST1H2ADP20671 130 aa14.62□□□□□ -0.07
SFT2D1-201ENST00000361731 PGGT1BP53609 377 aa14.62□□□□□ -0.07
SFT2D1-201ENST00000361731 STXBP1P61764 594 aaKnown RBP14.62□□□□□ -0.07
SFT2D1-201ENST00000361731 IGLV3-21P80748 117 aaPredicted RBP14.62□□□□□ -0.07
SFT2D1-201ENST00000361731 ASPHQ12797 758 aa14.62□□□□□ -0.07
SFT2D1-201ENST00000361731 DUSP8Q13202 625 aa14.62□□□□□ -0.07
SFT2D1-201ENST00000361731 POU4F3Q15319 338 aa14.62□□□□□ -0.07
SFT2D1-201ENST00000361731 NHSL2Q5HYW2 709 aa14.62□□□□□ -0.07
SFT2D1-201ENST00000361731 SLC22A10Q63ZE4 541 aa14.62□□□□□ -0.07
SFT2D1-201ENST00000361731 CASC4Q6P4E1 433 aa14.62□□□□□ -0.07
SFT2D1-201ENST00000361731 TMPRSS11BQ86T26 416 aa14.62□□□□□ -0.07
SFT2D1-201ENST00000361731 THOC6Q86W42 341 aaKnown RBP14.62□□□□□ -0.07
SFT2D1-201ENST00000361731 VWA5B2Q8N398 1253 aa14.62□□□□□ -0.07
SFT2D1-201ENST00000361731 MCUQ8NE86 351 aa14.62□□□□□ -0.07
SFT2D1-201ENST00000361731 OR5L2Q8NGL0 311 aa14.62□□□□□ -0.07
SFT2D1-201ENST00000361731 PPP1R14CQ8TAE6 165 aa14.62□□□□□ -0.07
SFT2D1-201ENST00000361731 ATL1Q8WXF7 558 aa14.62□□□□□ -0.07
SFT2D1-201ENST00000361731 SPACA9Q96E40 222 aaPredicted RBP14.62□□□□□ -0.07
SFT2D1-201ENST00000361731 HIST1H2AHQ96KK5 128 aa14.62□□□□□ -0.07
SFT2D1-201ENST00000361731 SIGLEC10Q96LC7 697 aa14.62□□□□□ -0.07
SFT2D1-201ENST00000361731 Q96MF0 132 aa14.62□□□□□ -0.07
SFT2D1-201ENST00000361731 SERPINB12Q96P63 405 aa14.62□□□□□ -0.07
SFT2D1-201ENST00000361731 HIST1H2AJQ99878 128 aa14.62□□□□□ -0.07
SFT2D1-201ENST00000361731 H2AFJQ9BTM1 129 aa14.62□□□□□ -0.07
SFT2D1-201ENST00000361731 ALOXE3Q9BYJ1 711 aa14.62□□□□□ -0.07
SFT2D1-201ENST00000361731 EPB41L4BQ9H329 900 aa14.62□□□□□ -0.07
SFT2D1-201ENST00000361731 EXO5Q9H790 373 aa14.62□□□□□ -0.07
SFT2D1-201ENST00000361731 C20orf96Q9NUD7 363 aaPredicted RBP14.62□□□□□ -0.07
SFT2D1-201ENST00000361731 TRPS1Q9UHF7 1281 aa14.62□□□□□ -0.07
SFT2D1-201ENST00000361731 BOKQ9UMX3 212 aaPredicted RBP14.62□□□□□ -0.07
SFT2D1-201ENST00000361731 C17orf105B2RV13 164 aa14.61□□□□□ -0.07
SFT2D1-201ENST00000361731 IL2RAP01589 272 aa14.61□□□□□ -0.07
SFT2D1-201ENST00000361731 C1QAP02745 245 aa14.61□□□□□ -0.07
SFT2D1-201ENST00000361731 ENO2P09104 434 aaPredicted RBP14.61□□□□□ -0.07
SFT2D1-201ENST00000361731 FBXO45P0C2W1 286 aa14.61□□□□□ -0.07
SFT2D1-201ENST00000361731 CTSSP25774 331 aa14.61□□□□□ -0.07
SFT2D1-201ENST00000361731 TRPC1P48995 793 aa14.61□□□□□ -0.07
SFT2D1-201ENST00000361731 TBL3Q12788 808 aaKnown RBP14.61□□□□□ -0.07
SFT2D1-201ENST00000361731 RBBP5Q15291 538 aaKnown RBP14.61□□□□□ -0.07
SFT2D1-201ENST00000361731 HSP90AA5PQ58FG0 334 aa14.61□□□□□ -0.07
SFT2D1-201ENST00000361731 PRAMEF20Q5VT98 475 aa14.61□□□□□ -0.07
SFT2D1-201ENST00000361731 FNDC7Q5VTL7 733 aa14.61□□□□□ -0.07
SFT2D1-201ENST00000361731 FBXW10Q5XX13 1052 aa14.61□□□□□ -0.07
SFT2D1-201ENST00000361731 VASNQ6EMK4 673 aa14.61□□□□□ -0.07
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 82.7 ms