RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000326294.3

PTPRCAP-201, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type C associated protein, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene PTPRCAP, Length 1,292 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRCAP-201ENST00000326294 AGPAT4Q9NRZ5 378 aa18.25■□□□□ 0.51
PTPRCAP-201ENST00000326294 LYARQ9NX58 379 aaKnown RBP18.25■□□□□ 0.51
PTPRCAP-201ENST00000326294 MS4A12Q9NXJ0 267 aa18.25■□□□□ 0.51
PTPRCAP-201ENST00000326294 ANKRD10Q9NXR5 420 aa18.25■□□□□ 0.51
PTPRCAP-201ENST00000326294 NOL12Q9UGY1 213 aaKnown RBP eCLIP18.25■□□□□ 0.51
PTPRCAP-201ENST00000326294 TRPS1Q9UHF7 1281 aa18.25■□□□□ 0.51
PTPRCAP-201ENST00000326294 PHF11Q9UIL8 331 aa18.25■□□□□ 0.51
PTPRCAP-201ENST00000326294 V9GYY5 206 aaPredicted RBP18.25■□□□□ 0.51
PTPRCAP-201ENST00000326294 POLEQ07864 2286 aa18.24■□□□□ 0.51
PTPRCAP-201ENST00000326294 FGF17O60258 216 aa18.24■□□□□ 0.51
PTPRCAP-201ENST00000326294 CDH16O75309 829 aa18.24■□□□□ 0.51
PTPRCAP-201ENST00000326294 OR4F21O95013 312 aa18.24■□□□□ 0.51
PTPRCAP-201ENST00000326294 CBX6O95503 412 aa18.24■□□□□ 0.51
PTPRCAP-201ENST00000326294 IFNA16P05015 189 aa18.24■□□□□ 0.51
PTPRCAP-201ENST00000326294 IMPDH1P20839 514 aa18.24■□□□□ 0.51
PTPRCAP-201ENST00000326294 TPP2P29144 1249 aaPredicted RBP18.24■□□□□ 0.51
PTPRCAP-201ENST00000326294 MLF1P58340 268 aa18.24■□□□□ 0.51
PTPRCAP-201ENST00000326294 SGO1Q5FBB7 561 aa18.24■□□□□ 0.51
PTPRCAP-201ENST00000326294 C18orf63Q68DL7 685 aa18.24■□□□□ 0.51
PTPRCAP-201ENST00000326294 FAM180AQ6UWF9 173 aa18.24■□□□□ 0.51
PTPRCAP-201ENST00000326294 SLC22A9Q8IVM8 553 aa18.24■□□□□ 0.51
PTPRCAP-201ENST00000326294 MYRIPQ8NFW9 859 aa18.24■□□□□ 0.51
PTPRCAP-201ENST00000326294 OR2W6PQ8NHA6 318 aa18.24■□□□□ 0.51
PTPRCAP-201ENST00000326294 PTPMT1Q8WUK0 201 aaPredicted RBP18.24■□□□□ 0.51
PTPRCAP-201ENST00000326294 VMP1Q96GC9 406 aa18.24■□□□□ 0.51
PTPRCAP-201ENST00000326294 SIGLEC12Q96PQ1 595 aa18.24■□□□□ 0.51
PTPRCAP-201ENST00000326294 ZNF382Q96SR6 550 aa18.24■□□□□ 0.51
PTPRCAP-201ENST00000326294 UTP23Q9BRU9 249 aaKnown RBP18.24■□□□□ 0.51
PTPRCAP-201ENST00000326294 DEFB126Q9BYW3 111 aa18.24■□□□□ 0.51
PTPRCAP-201ENST00000326294 FARSBQ9NSD9 589 aaKnown RBP18.24■□□□□ 0.51
PTPRCAP-201ENST00000326294 VTI1BQ9UEU0 232 aa18.24■□□□□ 0.51
PTPRCAP-201ENST00000326294 ASB4Q9Y574 426 aa18.24■□□□□ 0.51
PTPRCAP-201ENST00000326294 ESPNB1AK53 854 aa18.23■□□□□ 0.51
PTPRCAP-201ENST00000326294 G3V2L1 256 aa18.23■□□□□ 0.51
PTPRCAP-201ENST00000326294 PROCP04070 461 aa18.23■□□□□ 0.51
PTPRCAP-201ENST00000326294 NUDT17P0C025 328 aa18.23■□□□□ 0.51
PTPRCAP-201ENST00000326294 CD96P40200 585 aa18.23■□□□□ 0.51
PTPRCAP-201ENST00000326294 CLCN2P51788 898 aa18.23■□□□□ 0.51
PTPRCAP-201ENST00000326294 SERTAD2Q14140 314 aa18.23■□□□□ 0.51
PTPRCAP-201ENST00000326294 OR1C1Q15619 314 aa18.23■□□□□ 0.51
PTPRCAP-201ENST00000326294 TCHHL1Q5QJ38 904 aaPredicted RBP18.23■□□□□ 0.51
PTPRCAP-201ENST00000326294 ZNF468Q5VIY5 522 aaPredicted RBP18.23■□□□□ 0.51
PTPRCAP-201ENST00000326294 WDR93Q6P2C0 686 aa18.23■□□□□ 0.51
PTPRCAP-201ENST00000326294 CYP20A1Q6UW02 462 aa18.23■□□□□ 0.51
PTPRCAP-201ENST00000326294 ZYG11AQ6WRX3 759 aa18.23■□□□□ 0.51
PTPRCAP-201ENST00000326294 TMEM132CQ8N3T6 1108 aa18.23■□□□□ 0.51
PTPRCAP-201ENST00000326294 OR14A16Q8NHC5 309 aa18.23■□□□□ 0.51
PTPRCAP-201ENST00000326294 SUN3Q8TAQ9 357 aa18.23■□□□□ 0.51
PTPRCAP-201ENST00000326294 FAR1Q8WVX9 515 aa18.23■□□□□ 0.51
PTPRCAP-201ENST00000326294 SLX1AQ9BQ83 275 aa18.23■□□□□ 0.51
PTPRCAP-201ENST00000326294 MRPL1Q9BYD6 325 aaKnown RBP18.23■□□□□ 0.51
PTPRCAP-201ENST00000326294 RPF2Q9H7B2 306 aaKnown RBP18.23■□□□□ 0.51
PTPRCAP-201ENST00000326294 SETXQ7Z333 2677 aaKnown RBP18.23■□□□□ 0.51
PTPRCAP-201ENST00000326294 SPTAN1Q13813 2472 aaKnown RBP18.23■□□□□ 0.51
PTPRCAP-201ENST00000326294 A0A1W2PR48 441 aa18.22■□□□□ 0.51
PTPRCAP-201ENST00000326294 PROM1O43490 865 aa18.22■□□□□ 0.51
PTPRCAP-201ENST00000326294 PRKNO60260 465 aaPredicted RBP18.22■□□□□ 0.51
PTPRCAP-201ENST00000326294 AIFM1O95831 613 aa18.22■□□□□ 0.51
PTPRCAP-201ENST00000326294 PDYNP01213 254 aa18.22■□□□□ 0.51
PTPRCAP-201ENST00000326294 GBAP04062 536 aa18.22■□□□□ 0.51
PTPRCAP-201ENST00000326294 FAM58BPP0C7Q3 252 aa18.22■□□□□ 0.51
PTPRCAP-201ENST00000326294 NR2F6P10588 404 aa18.22■□□□□ 0.51
PTPRCAP-201ENST00000326294 CRHR1P34998 444 aa18.22■□□□□ 0.51
PTPRCAP-201ENST00000326294 BUD31P41223 144 aaPredicted RBP18.22■□□□□ 0.51
PTPRCAP-201ENST00000326294 UBAP2LQ14157 1087 aaKnown RBP18.22■□□□□ 0.51
PTPRCAP-201ENST00000326294 ZNF766Q5HY98 468 aa18.22■□□□□ 0.51
PTPRCAP-201ENST00000326294 ZNF324BQ6AW86 544 aaPredicted RBP18.22■□□□□ 0.51
PTPRCAP-201ENST00000326294 EMBQ6PCB8 327 aa18.22■□□□□ 0.51
PTPRCAP-201ENST00000326294 GPRIN3Q6ZVF9 776 aa18.22■□□□□ 0.51
PTPRCAP-201ENST00000326294 OR4N5Q8IXE1 308 aa18.22■□□□□ 0.51
PTPRCAP-201ENST00000326294 FAM26EQ8N5C1 309 aa18.22■□□□□ 0.51
PTPRCAP-201ENST00000326294 BCORP1Q8N888 145 aa18.22■□□□□ 0.51
PTPRCAP-201ENST00000326294 CDYL2Q8N8U2 506 aa18.22■□□□□ 0.51
PTPRCAP-201ENST00000326294 SELENOMQ8WWX9 145 aa18.22■□□□□ 0.51
PTPRCAP-201ENST00000326294 DAZLQ92904 295 aaKnown RBP18.22■□□□□ 0.51
PTPRCAP-201ENST00000326294 SCMH1Q96GD3 660 aa18.22■□□□□ 0.51
PTPRCAP-201ENST00000326294 HBEGFQ99075 208 aa18.22■□□□□ 0.51
PTPRCAP-201ENST00000326294 HES7Q9BYE0 225 aa18.22■□□□□ 0.51
PTPRCAP-201ENST00000326294 GSTO2Q9H4Y5 243 aa18.22■□□□□ 0.51
PTPRCAP-201ENST00000326294 SNX6Q9UNH7 406 aa18.22■□□□□ 0.51
PTPRCAP-201ENST00000326294 CLCA3PQ9Y6N3 262 aa18.22■□□□□ 0.51
PTPRCAP-201ENST00000326294 ZGRF1Q86YA3 2104 aa18.22■□□□□ 0.51
PTPRCAP-201ENST00000326294 ANKUB1A6NFN9 424 aa18.21■□□□□ 0.51
PTPRCAP-201ENST00000326294 C17orf105B2RV13 164 aa18.21■□□□□ 0.51
PTPRCAP-201ENST00000326294 PLIN3O60664 434 aa18.21■□□□□ 0.51
PTPRCAP-201ENST00000326294 NEURL1O76050 574 aa18.21■□□□□ 0.51
PTPRCAP-201ENST00000326294 DDAH2O95865 285 aa18.21■□□□□ 0.51
PTPRCAP-201ENST00000326294 MYL2P10916 166 aa18.21■□□□□ 0.51
PTPRCAP-201ENST00000326294 TRHRP34981 398 aaPredicted RBP18.21■□□□□ 0.51
PTPRCAP-201ENST00000326294 STT3AP46977 705 aa18.21■□□□□ 0.51
PTPRCAP-201ENST00000326294 OC90Q02509 493 aaPredicted RBP18.21■□□□□ 0.51
PTPRCAP-201ENST00000326294 FOLH1Q04609 750 aa18.21■□□□□ 0.51
PTPRCAP-201ENST00000326294 LCP2Q13094 533 aa18.21■□□□□ 0.51
PTPRCAP-201ENST00000326294 EIF2S3LQ2VIR3 472 aaKnown RBP18.21■□□□□ 0.51
PTPRCAP-201ENST00000326294 SPINK14Q6IE38 97 aa18.21■□□□□ 0.51
PTPRCAP-201ENST00000326294 C4orf33Q8N1A6 199 aa18.21■□□□□ 0.51
PTPRCAP-201ENST00000326294 METTL4Q8N3J2 472 aa18.21■□□□□ 0.51
PTPRCAP-201ENST00000326294 ZNF321PQ8N8H1 164 aa18.21■□□□□ 0.51
PTPRCAP-201ENST00000326294 MORN4Q8NDC4 146 aa18.21■□□□□ 0.51
PTPRCAP-201ENST00000326294 ST6GALNAC3Q8NDV1 305 aa18.21■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 39 ms