RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000321895.6

CCDC71-201, Transcript of coiled-coil domain containing 71, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene CCDC71, Length 1,781 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC71-201ENST00000321895 ADA2Q9NZK5 511 aa18.6■□□□□ 0.57
CCDC71-201ENST00000321895 VAPAQ9P0L0 249 aa18.6■□□□□ 0.57
CCDC71-201ENST00000321895 TMEM181Q9P2C4 612 aa18.6■□□□□ 0.57
CCDC71-201ENST00000321895 PSME2Q9UL46 239 aa18.6■□□□□ 0.57
CCDC71-201ENST00000321895 PCDHGB4Q9UN71 923 aa18.6■□□□□ 0.57
CCDC71-201ENST00000321895 SRPK3Q9UPE1 567 aa18.6■□□□□ 0.57
CCDC71-201ENST00000321895 NEUROG3Q9Y4Z2 214 aa18.6■□□□□ 0.57
CCDC71-201ENST00000321895 A0A1W2PRB8 838 aa18.59■□□□□ 0.57
CCDC71-201ENST00000321895 ZNF749O43361 778 aa18.59■□□□□ 0.57
CCDC71-201ENST00000321895 CHST10O43529 356 aa18.59■□□□□ 0.57
CCDC71-201ENST00000321895 ANP32DO95626 131 aa18.59■□□□□ 0.57
CCDC71-201ENST00000321895 EFNA1P20827 205 aaPredicted RBP18.59■□□□□ 0.57
CCDC71-201ENST00000321895 CCKBRP32239 447 aa18.59■□□□□ 0.57
CCDC71-201ENST00000321895 CDKN2CP42773 168 aa18.59■□□□□ 0.57
CCDC71-201ENST00000321895 PCBP4P57723 403 aaKnown RBP18.59■□□□□ 0.57
CCDC71-201ENST00000321895 PGM2L1Q6PCE3 622 aa18.59■□□□□ 0.57
CCDC71-201ENST00000321895 TTLL10Q6ZVT0 673 aa18.59■□□□□ 0.57
CCDC71-201ENST00000321895 MSRB3Q8IXL7 192 aa18.59■□□□□ 0.57
CCDC71-201ENST00000321895 DTWD1Q8N5C7 304 aa18.59■□□□□ 0.57
CCDC71-201ENST00000321895 OR8J3Q8NGG0 315 aa18.59■□□□□ 0.57
CCDC71-201ENST00000321895 GOT1L1Q8NHS2 421 aaPredicted RBP18.59■□□□□ 0.57
CCDC71-201ENST00000321895 ADAMTS18Q8TE60 1221 aa18.59■□□□□ 0.57
CCDC71-201ENST00000321895 ZBED6CLQ96FA7 236 aaPredicted RBP18.59■□□□□ 0.57
CCDC71-201ENST00000321895 CLPTM1LQ96KA5 538 aa18.59■□□□□ 0.57
CCDC71-201ENST00000321895 ANKRD27Q96NW4 1050 aa18.59■□□□□ 0.57
CCDC71-201ENST00000321895 CSF3RQ99062 836 aa18.59■□□□□ 0.57
CCDC71-201ENST00000321895 RPF2Q9H7B2 306 aaKnown RBP18.59■□□□□ 0.57
CCDC71-201ENST00000321895 SLC25A37Q9NYZ2 338 aa18.59■□□□□ 0.57
CCDC71-201ENST00000321895 NIPSNAP3AQ9UFN0 247 aaPredicted RBP18.59■□□□□ 0.57
CCDC71-201ENST00000321895 RARRES3Q9UL19 164 aa18.59■□□□□ 0.57
CCDC71-201ENST00000321895 PCDHB14Q9Y5E9 798 aa18.59■□□□□ 0.57
CCDC71-201ENST00000321895 PCDHGA1Q9Y5H4 931 aa18.59■□□□□ 0.57
CCDC71-201ENST00000321895 CYR61O00622 381 aa18.58■□□□□ 0.57
CCDC71-201ENST00000321895 CPSF4O95639 269 aaKnown RBP18.58■□□□□ 0.57
CCDC71-201ENST00000321895 ZCCHC18P0CG32 403 aa18.58■□□□□ 0.57
CCDC71-201ENST00000321895 RNH1P13489 461 aaKnown RBP18.58■□□□□ 0.57
CCDC71-201ENST00000321895 NTSP30990 170 aa18.58■□□□□ 0.57
CCDC71-201ENST00000321895 SHC2P98077 582 aa18.58■□□□□ 0.57
CCDC71-201ENST00000321895 COL9A2Q14055 689 aaPredicted RBP18.58■□□□□ 0.57
CCDC71-201ENST00000321895 C16orf72Q14CZ0 275 aa18.58■□□□□ 0.57
CCDC71-201ENST00000321895 PIGGQ5H8A4 983 aa18.58■□□□□ 0.57
CCDC71-201ENST00000321895 BPHLQ86WA6 291 aaPredicted RBP18.58■□□□□ 0.57
CCDC71-201ENST00000321895 SLC15A3Q8IY34 581 aa18.58■□□□□ 0.57
CCDC71-201ENST00000321895 OR4A15Q8NGL6 344 aa18.58■□□□□ 0.57
CCDC71-201ENST00000321895 TMEM125Q96AQ2 219 aa18.58■□□□□ 0.57
CCDC71-201ENST00000321895 MMABQ96EY8 250 aaPredicted RBP18.58■□□□□ 0.57
CCDC71-201ENST00000321895 PHF12Q96QT6 1004 aa18.58■□□□□ 0.57
CCDC71-201ENST00000321895 SLC6A13Q9NSD5 602 aa18.58■□□□□ 0.57
CCDC71-201ENST00000321895 GIMAP4Q9NUV9 329 aa18.58■□□□□ 0.57
CCDC71-201ENST00000321895 CDC14AQ9UNH5 594 aa18.58■□□□□ 0.57
CCDC71-201ENST00000321895 CLCA2Q9UQC9 943 aa18.58■□□□□ 0.57
CCDC71-201ENST00000321895 ENTPD4Q9Y227 616 aa18.58■□□□□ 0.57
CCDC71-201ENST00000321895 PCNX2A6NKB5 2137 aa18.58■□□□□ 0.56
CCDC71-201ENST00000321895 DSCR3O14972 297 aa18.58■□□□□ 0.56
CCDC71-201ENST00000321895 C6orf47O95873 294 aa18.58■□□□□ 0.56
CCDC71-201ENST00000321895 HBA1P69905 142 aa18.58■□□□□ 0.56
CCDC71-201ENST00000321895 MLC1Q15049 377 aa18.58■□□□□ 0.56
CCDC71-201ENST00000321895 SPATS1Q496A3 300 aa18.58■□□□□ 0.56
CCDC71-201ENST00000321895 GTDC1Q4AE62 458 aa18.58■□□□□ 0.56
CCDC71-201ENST00000321895 RUNDC3AQ59EK9 446 aa18.58■□□□□ 0.56
CCDC71-201ENST00000321895 SAMD4BQ5PRF9 694 aaKnown RBP18.58■□□□□ 0.56
CCDC71-201ENST00000321895 SAMD14Q8IZD0 417 aaPredicted RBP18.58■□□□□ 0.56
CCDC71-201ENST00000321895 FBXW8Q8N3Y1 598 aa18.58■□□□□ 0.56
CCDC71-201ENST00000321895 OR5P2Q8WZ92 322 aa18.58■□□□□ 0.56
CCDC71-201ENST00000321895 SH3GL1Q99961 368 aa18.58■□□□□ 0.56
CCDC71-201ENST00000321895 SLAMF7Q9NQ25 335 aa18.58■□□□□ 0.56
CCDC71-201ENST00000321895 TAS2R9Q9NYW1 312 aa18.58■□□□□ 0.56
CCDC71-201ENST00000321895 HCN3Q9P1Z3 774 aa18.58■□□□□ 0.56
CCDC71-201ENST00000321895 VPS4AQ9UN37 437 aa18.58■□□□□ 0.56
CCDC71-201ENST00000321895 ERVK-11Q9UQG0 969 aa18.58■□□□□ 0.56
CCDC71-201ENST00000321895 L3MBTL1Q9Y468 752 aa18.58■□□□□ 0.56
CCDC71-201ENST00000321895 A0A1B0GX78 115 aa18.57■□□□□ 0.56
CCDC71-201ENST00000321895 BLACEA4D250 179 aa18.57■□□□□ 0.56
CCDC71-201ENST00000321895 NME4O00746 187 aa18.57■□□□□ 0.56
CCDC71-201ENST00000321895 ERAL1O75616 437 aaKnown RBP18.57■□□□□ 0.56
CCDC71-201ENST00000321895 PDE5AO76074 875 aa18.57■□□□□ 0.56
CCDC71-201ENST00000321895 GSNP06396 782 aa18.57■□□□□ 0.56
CCDC71-201ENST00000321895 MANFP55145 182 aaKnown RBP18.57■□□□□ 0.56
CCDC71-201ENST00000321895 CEACAM7Q14002 265 aa18.57■□□□□ 0.56
CCDC71-201ENST00000321895 CEBPEQ15744 281 aa18.57■□□□□ 0.56
CCDC71-201ENST00000321895 RABL3Q5HYI8 236 aa18.57■□□□□ 0.56
CCDC71-201ENST00000321895 FAM180BQ6P0A1 224 aa18.57■□□□□ 0.56
CCDC71-201ENST00000321895 ZNF621Q6ZSS3 439 aa18.57■□□□□ 0.56
CCDC71-201ENST00000321895 GLRX5Q86SX6 157 aa18.57■□□□□ 0.56
CCDC71-201ENST00000321895 BBS4Q96RK4 519 aa18.57■□□□□ 0.56
CCDC71-201ENST00000321895 NEUROD4Q9HD90 331 aa18.57■□□□□ 0.56
CCDC71-201ENST00000321895 CMTM6Q9NX76 183 aa18.57■□□□□ 0.56
CCDC71-201ENST00000321895 ZNF282Q9UDV7 671 aaPredicted RBP18.57■□□□□ 0.56
CCDC71-201ENST00000321895 NDOR1Q9UHB4 597 aa18.57■□□□□ 0.56
CCDC71-201ENST00000321895 SLC7A8Q9UHI5 535 aa18.57■□□□□ 0.56
CCDC71-201ENST00000321895 SEC16AO15027 2179 aa18.57■□□□□ 0.56
CCDC71-201ENST00000321895 WASHC1A8K0Z3 465 aa18.56■□□□□ 0.56
CCDC71-201ENST00000321895 EFCAB7A8K855 629 aa18.56■□□□□ 0.56
CCDC71-201ENST00000321895 MYO1GB0I1T2 1018 aa18.56■□□□□ 0.56
CCDC71-201ENST00000321895 NVLO15381 856 aaKnown RBP18.56■□□□□ 0.56
CCDC71-201ENST00000321895 CSNK2A2P19784 350 aaPredicted RBP18.56■□□□□ 0.56
CCDC71-201ENST00000321895 ALAS2P22557 587 aa18.56■□□□□ 0.56
CCDC71-201ENST00000321895 IL11RAQ14626 422 aa18.56■□□□□ 0.56
CCDC71-201ENST00000321895 CCDC157Q569K6 752 aa18.56■□□□□ 0.56
CCDC71-201ENST00000321895 PRAMEF17Q5VTA0 474 aa18.56■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 52.5 ms