RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000298527.10

CLEC1B-201, Transcript of C-type lectin domain family 1 member B, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene CLEC1B, Length 952 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLEC1B-201ENST00000298527 SERPINB12Q96P63 405 aa14.91□□□□□ -0.02
CLEC1B-201ENST00000298527 AICDAQ9GZX7 198 aa14.91□□□□□ -0.02
CLEC1B-201ENST00000298527 PELI2Q9HAT8 420 aa14.91□□□□□ -0.02
CLEC1B-201ENST00000298527 MRPS33Q9Y291 106 aaKnown RBP14.91□□□□□ -0.02
CLEC1B-201ENST00000298527 CLCA3PQ9Y6N3 262 aa14.91□□□□□ -0.02
CLEC1B-201ENST00000298527 HIVEP2P31629 2446 aa14.91□□□□□ -0.02
CLEC1B-201ENST00000298527 CLCA1A8K7I4 914 aa14.9□□□□□ -0.02
CLEC1B-201ENST00000298527 MLNP12872 115 aa14.9□□□□□ -0.02
CLEC1B-201ENST00000298527 CEACAM8P31997 349 aaPredicted RBP14.9□□□□□ -0.02
CLEC1B-201ENST00000298527 PAFAH1B1P43034 410 aa14.9□□□□□ -0.02
CLEC1B-201ENST00000298527 MAGEA6P43360 314 aa14.9□□□□□ -0.02
CLEC1B-201ENST00000298527 CDKN2DP55273 166 aa14.9□□□□□ -0.02
CLEC1B-201ENST00000298527 IL2P60568 153 aa14.9□□□□□ -0.02
CLEC1B-201ENST00000298527 STXBP1P61764 594 aaKnown RBP14.9□□□□□ -0.02
CLEC1B-201ENST00000298527 ELAVL1Q15717 326 aaKnown RBP14.9□□□□□ -0.02
CLEC1B-201ENST00000298527 SEM1Q6ZVN7 128 aa14.9□□□□□ -0.02
CLEC1B-201ENST00000298527 THOC6Q86W42 341 aaKnown RBP14.9□□□□□ -0.02
CLEC1B-201ENST00000298527 P3H2Q8IVL5 708 aa14.9□□□□□ -0.02
CLEC1B-201ENST00000298527 LRRC75A-AS1Q8N1F1 130 aa14.9□□□□□ -0.02
CLEC1B-201ENST00000298527 GAL3ST3Q96A11 431 aa14.9□□□□□ -0.02
CLEC1B-201ENST00000298527 YIPF4Q9BSR8 244 aa14.9□□□□□ -0.02
CLEC1B-201ENST00000298527 BDH2Q9BUT1 245 aa14.9□□□□□ -0.02
CLEC1B-201ENST00000298527 OR8D2Q9GZM6 311 aa14.9□□□□□ -0.02
CLEC1B-201ENST00000298527 XAB2Q9HCS7 855 aaKnown RBP14.9□□□□□ -0.02
CLEC1B-201ENST00000298527 SEMA4BQ9NPR2 832 aaPredicted RBP14.9□□□□□ -0.02
CLEC1B-201ENST00000298527 SPRR3Q9UBC9 169 aa14.9□□□□□ -0.02
CLEC1B-201ENST00000298527 CLDN16Q9Y5I7 305 aa14.9□□□□□ -0.02
CLEC1B-201ENST00000298527 SEC23IPQ9Y6Y8 1000 aaKnown RBP14.9□□□□□ -0.02
CLEC1B-201ENST00000298527 TRBV21OR9-2A0A075B6F4 123 aaPredicted RBP14.89□□□□□ -0.03
CLEC1B-201ENST00000298527 AHRRA9YTQ3 701 aa14.89□□□□□ -0.03
CLEC1B-201ENST00000298527 ERI3O43414 337 aaKnown RBP14.89□□□□□ -0.03
CLEC1B-201ENST00000298527 B3GALT2O43825 422 aa14.89□□□□□ -0.03
CLEC1B-201ENST00000298527 KRT14P02533 472 aa14.89□□□□□ -0.03
CLEC1B-201ENST00000298527 CTAGE8P0CG41 777 aa14.89□□□□□ -0.03
CLEC1B-201ENST00000298527 CCL3P10147 92 aa14.89□□□□□ -0.03
CLEC1B-201ENST00000298527 TNNI3P19429 210 aa14.89□□□□□ -0.03
CLEC1B-201ENST00000298527 ENDOUP21128 410 aaKnown RBP14.89□□□□□ -0.03
CLEC1B-201ENST00000298527 TIMP3P35625 211 aa14.89□□□□□ -0.03
CLEC1B-201ENST00000298527 PDAP1Q13442 181 aaKnown RBP14.89□□□□□ -0.03
CLEC1B-201ENST00000298527 Q5PR19 223 aa14.89□□□□□ -0.03
CLEC1B-201ENST00000298527 OPN5Q6U736 354 aa14.89□□□□□ -0.03
CLEC1B-201ENST00000298527 NXPE4Q6UWF7 544 aa14.89□□□□□ -0.03
CLEC1B-201ENST00000298527 CAPN12Q6ZSI9 719 aa14.89□□□□□ -0.03
CLEC1B-201ENST00000298527 CXorf67Q86X51 503 aaPredicted RBP14.89□□□□□ -0.03
CLEC1B-201ENST00000298527 CTAGE4Q8IX94 777 aa14.89□□□□□ -0.03
CLEC1B-201ENST00000298527 ZNF595Q8IYB9 648 aa14.89□□□□□ -0.03
CLEC1B-201ENST00000298527 ZNF321PQ8N8H1 164 aa14.89□□□□□ -0.03
CLEC1B-201ENST00000298527 C2CD4AQ8NCU7 369 aaPredicted RBP14.89□□□□□ -0.03
CLEC1B-201ENST00000298527 NAXEQ8NCW5 288 aa14.89□□□□□ -0.03
CLEC1B-201ENST00000298527 OR8K3Q8NH51 312 aa14.89□□□□□ -0.03
CLEC1B-201ENST00000298527 DAZLQ92904 295 aaKnown RBP14.89□□□□□ -0.03
CLEC1B-201ENST00000298527 NPLQ9BXD5 320 aaPredicted RBP14.89□□□□□ -0.03
CLEC1B-201ENST00000298527 SLC22A14Q9Y267 594 aa14.89□□□□□ -0.03
CLEC1B-201ENST00000298527 ATG4BQ9Y4P1 393 aa14.89□□□□□ -0.03
CLEC1B-201ENST00000298527 NINQ8N4C6 2090 aa14.89□□□□□ -0.03
CLEC1B-201ENST00000298527 ATRQ13535 2644 aa14.89□□□□□ -0.03
CLEC1B-201ENST00000298527 A0A088AWK7 358 aa14.88□□□□□ -0.03
CLEC1B-201ENST00000298527 EFCAB8A8MWE9 144 aa14.88□□□□□ -0.03
CLEC1B-201ENST00000298527 H7C1Q1 480 aa14.88□□□□□ -0.03
CLEC1B-201ENST00000298527 CTIFO43310 598 aaKnown RBP14.88□□□□□ -0.03
CLEC1B-201ENST00000298527 ZNF354AO60765 605 aaPredicted RBP14.88□□□□□ -0.03
CLEC1B-201ENST00000298527 EPPINO95925 133 aa14.88□□□□□ -0.03
CLEC1B-201ENST00000298527 IL2RAP01589 272 aa14.88□□□□□ -0.03
CLEC1B-201ENST00000298527 ZNF10P21506 573 aaPredicted RBP14.88□□□□□ -0.03
CLEC1B-201ENST00000298527 PIGAP37287 484 aa14.88□□□□□ -0.03
CLEC1B-201ENST00000298527 PGGT1BP53609 377 aa14.88□□□□□ -0.03
CLEC1B-201ENST00000298527 RNF4P78317 190 aa14.88□□□□□ -0.03
CLEC1B-201ENST00000298527 TBL3Q12788 808 aaKnown RBP14.88□□□□□ -0.03
CLEC1B-201ENST00000298527 STX4Q12846 297 aa14.88□□□□□ -0.03
CLEC1B-201ENST00000298527 PRSS57Q6UWY2 283 aa14.88□□□□□ -0.03
CLEC1B-201ENST00000298527 LACC1Q8IV20 430 aa14.88□□□□□ -0.03
CLEC1B-201ENST00000298527 SUPV3L1Q8IYB8 786 aaKnown RBP eCLIP14.88□□□□□ -0.03
CLEC1B-201ENST00000298527 KLHDC8AQ8IYD2 350 aa14.88□□□□□ -0.03
CLEC1B-201ENST00000298527 AGGF1Q8N302 714 aaeCLIP14.88□□□□□ -0.03
CLEC1B-201ENST00000298527 MORN4Q8NDC4 146 aa14.88□□□□□ -0.03
CLEC1B-201ENST00000298527 MCUQ8NE86 351 aa14.88□□□□□ -0.03
CLEC1B-201ENST00000298527 SPATA4Q8NEY3 305 aa14.88□□□□□ -0.03
CLEC1B-201ENST00000298527 TNIP2Q8NFZ5 429 aa14.88□□□□□ -0.03
CLEC1B-201ENST00000298527 LINC01560Q8TB33 94 aa14.88□□□□□ -0.03
CLEC1B-201ENST00000298527 CSF3RQ99062 836 aa14.88□□□□□ -0.03
CLEC1B-201ENST00000298527 NAP1L3Q99457 506 aaPredicted RBP14.88□□□□□ -0.03
CLEC1B-201ENST00000298527 PIP5K1AQ99755 562 aa14.88□□□□□ -0.03
CLEC1B-201ENST00000298527 KCNE2Q9Y6J6 123 aa14.88□□□□□ -0.03
CLEC1B-201ENST00000298527 FBN1P35555 2871 aaKnown RBP14.87□□□□□ -0.03
CLEC1B-201ENST00000298527 HRGP04196 525 aa14.87□□□□□ -0.03
CLEC1B-201ENST00000298527 ENO2P09104 434 aaPredicted RBP14.87□□□□□ -0.03
CLEC1B-201ENST00000298527 HNRNPH1P31943 449 aaKnown RBP14.87□□□□□ -0.03
CLEC1B-201ENST00000298527 PLA2G16P53816 162 aa14.87□□□□□ -0.03
CLEC1B-201ENST00000298527 WNT3P56703 355 aa14.87□□□□□ -0.03
CLEC1B-201ENST00000298527 SF3B4Q15427 424 aaKnown RBP eCLIP14.87□□□□□ -0.03
CLEC1B-201ENST00000298527 POMZP3Q6PJE2 187 aa14.87□□□□□ -0.03
CLEC1B-201ENST00000298527 LIX1Q8N485 282 aa14.87□□□□□ -0.03
CLEC1B-201ENST00000298527 OR5L2Q8NGL0 311 aa14.87□□□□□ -0.03
CLEC1B-201ENST00000298527 OR14A16Q8NHC5 309 aa14.87□□□□□ -0.03
CLEC1B-201ENST00000298527 GABPB2Q8TAK5 448 aaPredicted RBP14.87□□□□□ -0.03
CLEC1B-201ENST00000298527 NEIL3Q8TAT5 605 aa14.87□□□□□ -0.03
CLEC1B-201ENST00000298527 PTPMT1Q8WUK0 201 aaPredicted RBP14.87□□□□□ -0.03
CLEC1B-201ENST00000298527 MS4A6EQ96DS6 147 aa14.87□□□□□ -0.03
CLEC1B-201ENST00000298527 SIGLEC10Q96LC7 697 aa14.87□□□□□ -0.03
CLEC1B-201ENST00000298527 RUNDC3BQ96NL0 473 aa14.87□□□□□ -0.03
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 32.2 ms