RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000298454.3

VSTM4-201, Transcript of V-set and transmembrane domain containing 4, humanhuman

APPRIS P3 TSL 2 BASIC

Gene VSTM4, Length 2,170 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VSTM4-201ENST00000298454 ERAL1O75616 437 aaKnown RBP21.55■■□□□ 1.04
VSTM4-201ENST00000298454 TNFAIP8O95379 198 aa21.55■■□□□ 1.04
VSTM4-201ENST00000298454 SLC35G6P0C7Q6 338 aa21.55■■□□□ 1.04
VSTM4-201ENST00000298454 PRKACGP22612 351 aa21.55■■□□□ 1.04
VSTM4-201ENST00000298454 PTGER1P34995 402 aa21.55■■□□□ 1.04
VSTM4-201ENST00000298454 DSTNP60981 165 aa21.55■■□□□ 1.04
VSTM4-201ENST00000298454 RPL6Q02878 288 aaKnown RBP21.55■■□□□ 1.04
VSTM4-201ENST00000298454 ZNF750Q32MQ0 723 aa21.55■■□□□ 1.04
VSTM4-201ENST00000298454 CEACAM20Q6UY09 585 aa21.55■■□□□ 1.04
VSTM4-201ENST00000298454 TMEM26Q6ZUK4 368 aa21.55■■□□□ 1.04
VSTM4-201ENST00000298454 ZNF438Q7Z4V0 828 aa21.55■■□□□ 1.04
VSTM4-201ENST00000298454 SVOPLQ8N434 492 aa21.55■■□□□ 1.04
VSTM4-201ENST00000298454 DHRSXQ8N5I4 330 aa21.55■■□□□ 1.04
VSTM4-201ENST00000298454 HORMAD2Q8N7B1 307 aa21.55■■□□□ 1.04
VSTM4-201ENST00000298454 UTP15Q8TED0 518 aaKnown RBP21.55■■□□□ 1.04
VSTM4-201ENST00000298454 AMDHD1Q96NU7 426 aa21.55■■□□□ 1.04
VSTM4-201ENST00000298454 TRAPPC9Q96Q05 1148 aa21.55■■□□□ 1.04
VSTM4-201ENST00000298454 MIR1-1HGQ9H1L0 117 aa21.55■■□□□ 1.04
VSTM4-201ENST00000298454 TBC1D17Q9HA65 648 aa21.55■■□□□ 1.04
VSTM4-201ENST00000298454 GON4LQ3T8J9 2241 aa21.55■■□□□ 1.04
VSTM4-201ENST00000298454 LOC105369274A0A096LPK9 316 aa21.55■■□□□ 1.04
VSTM4-201ENST00000298454 LOC102723532A0A0G2JNH3 316 aa21.55■■□□□ 1.04
VSTM4-201ENST00000298454 NOBOXO60393 691 aa21.55■■□□□ 1.04
VSTM4-201ENST00000298454 SMIM18P0DKX4 95 aa21.55■■□□□ 1.04
VSTM4-201ENST00000298454 KCNJ10P78508 379 aa21.55■■□□□ 1.04
VSTM4-201ENST00000298454 MLC1Q15049 377 aa21.55■■□□□ 1.04
VSTM4-201ENST00000298454 TNFAIP8L2Q6P589 184 aaPredicted RBP21.55■■□□□ 1.04
VSTM4-201ENST00000298454 C6orf120Q7Z4R8 191 aa21.55■■□□□ 1.04
VSTM4-201ENST00000298454 OR4N4Q8N0Y3 316 aa21.55■■□□□ 1.04
VSTM4-201ENST00000298454 OR5K1Q8NHB7 308 aa21.55■■□□□ 1.04
VSTM4-201ENST00000298454 ZCCHC10Q8TBK6 192 aa21.55■■□□□ 1.04
VSTM4-201ENST00000298454 MAPKAP1Q9BPZ7 522 aa21.55■■□□□ 1.04
VSTM4-201ENST00000298454 A0A1W2PS29 197 aa21.54■■□□□ 1.04
VSTM4-201ENST00000298454 GUCY1B2O75343 617 aa21.54■■□□□ 1.04
VSTM4-201ENST00000298454 CSF2P04141 144 aa21.54■■□□□ 1.04
VSTM4-201ENST00000298454 TYRP1P17643 537 aa21.54■■□□□ 1.04
VSTM4-201ENST00000298454 NCBP2P52298 156 aaKnown RBP eCLIP21.54■■□□□ 1.04
VSTM4-201ENST00000298454 TGM3Q08188 693 aa21.54■■□□□ 1.04
VSTM4-201ENST00000298454 ZNF630Q2M218 657 aaPredicted RBP21.54■■□□□ 1.04
VSTM4-201ENST00000298454 OR2T5Q6IEZ7 315 aa21.54■■□□□ 1.04
VSTM4-201ENST00000298454 GPR153Q6NV75 609 aa21.54■■□□□ 1.04
VSTM4-201ENST00000298454 DCP2Q8IU60 420 aaKnown RBP21.54■■□□□ 1.04
VSTM4-201ENST00000298454 OR2T29Q8NH02 315 aa21.54■■□□□ 1.04
VSTM4-201ENST00000298454 CNRIP1Q96F85 164 aaPredicted RBP21.54■■□□□ 1.04
VSTM4-201ENST00000298454 DOHHQ9BU89 302 aa21.54■■□□□ 1.04
VSTM4-201ENST00000298454 OSBPL10Q9BXB5 764 aa21.54■■□□□ 1.04
VSTM4-201ENST00000298454 ZNF696Q9H7X3 374 aa21.54■■□□□ 1.04
VSTM4-201ENST00000298454 PROM1O43490 865 aa21.54■■□□□ 1.04
VSTM4-201ENST00000298454 LINGO3P0C6S8 592 aa21.54■■□□□ 1.04
VSTM4-201ENST00000298454 ARAFP10398 606 aa21.54■■□□□ 1.04
VSTM4-201ENST00000298454 MYF6P23409 242 aa21.54■■□□□ 1.04
VSTM4-201ENST00000298454 CAPGP40121 348 aa21.54■■□□□ 1.04
VSTM4-201ENST00000298454 CCT3P49368 545 aaKnown RBP21.54■■□□□ 1.04
VSTM4-201ENST00000298454 SELENOWP63302 87 aa21.54■■□□□ 1.04
VSTM4-201ENST00000298454 PPP2R2BQ00005 443 aa21.54■■□□□ 1.04
VSTM4-201ENST00000298454 DUSP2Q05923 314 aa21.54■■□□□ 1.04
VSTM4-201ENST00000298454 ZP2Q05996 745 aa21.54■■□□□ 1.04
VSTM4-201ENST00000298454 SPEM1Q8N4L4 309 aa21.54■■□□□ 1.04
VSTM4-201ENST00000298454 CADM4Q8NFZ8 388 aa21.54■■□□□ 1.04
VSTM4-201ENST00000298454 PSMA8Q8TAA3 256 aa21.54■■□□□ 1.04
VSTM4-201ENST00000298454 BAHD1Q8TBE0 780 aaPredicted RBP21.54■■□□□ 1.04
VSTM4-201ENST00000298454 RSC1A1Q92681 617 aa21.54■■□□□ 1.04
VSTM4-201ENST00000298454 TAMM41Q96BW9 452 aa21.54■■□□□ 1.04
VSTM4-201ENST00000298454 BBS4Q96RK4 519 aa21.54■■□□□ 1.04
VSTM4-201ENST00000298454 CHRDQ9H2X0 955 aa21.54■■□□□ 1.04
VSTM4-201ENST00000298454 CES1P1Q9UKY3 287 aa21.54■■□□□ 1.04
VSTM4-201ENST00000298454 TDRD6O60522 2096 aaKnown RBP21.54■■□□□ 1.04
VSTM4-201ENST00000298454 KNL1Q8NG31 2342 aa21.54■■□□□ 1.04
VSTM4-201ENST00000298454 M0QX08 132 aa21.53■■□□□ 1.04
VSTM4-201ENST00000298454 C8orf89P0DMQ9 161 aa21.53■■□□□ 1.04
VSTM4-201ENST00000298454 ALPPL2P10696 532 aa21.53■■□□□ 1.04
VSTM4-201ENST00000298454 GPC1P35052 558 aa21.53■■□□□ 1.04
VSTM4-201ENST00000298454 MAZP56270 477 aaKnown RBP21.53■■□□□ 1.04
VSTM4-201ENST00000298454 PUS10Q3MIT2 529 aaKnown RBP21.53■■□□□ 1.04
VSTM4-201ENST00000298454 RNF220Q5VTB9 566 aa21.53■■□□□ 1.04
VSTM4-201ENST00000298454 OFCC1Q8IZS5 231 aa21.53■■□□□ 1.04
VSTM4-201ENST00000298454 C7orf34Q96L11 122 aa21.53■■□□□ 1.04
VSTM4-201ENST00000298454 ZFYVE21Q9BQ24 234 aa21.53■■□□□ 1.04
VSTM4-201ENST00000298454 ANKMY1Q9P2S6 941 aa21.53■■□□□ 1.04
VSTM4-201ENST00000298454 THRBP10828 461 aa21.53■■□□□ 1.04
VSTM4-201ENST00000298454 NTSP30990 170 aa21.53■■□□□ 1.04
VSTM4-201ENST00000298454 ADARB1P78563 741 aaKnown RBP21.53■■□□□ 1.04
VSTM4-201ENST00000298454 TP53BP2Q13625 1128 aa21.53■■□□□ 1.04
VSTM4-201ENST00000298454 MYBPC3Q14896 1274 aa21.53■■□□□ 1.04
VSTM4-201ENST00000298454 LAPTM4AQ15012 233 aa21.53■■□□□ 1.04
VSTM4-201ENST00000298454 IQCCQ4KMZ1 466 aa21.53■■□□□ 1.04
VSTM4-201ENST00000298454 SLC48A1Q6P1K1 146 aa21.53■■□□□ 1.04
VSTM4-201ENST00000298454 CCDC80Q76M96 950 aa21.53■■□□□ 1.04
VSTM4-201ENST00000298454 SZRD1Q7Z422 152 aa21.53■■□□□ 1.04
VSTM4-201ENST00000298454 SUN3Q8TAQ9 357 aa21.53■■□□□ 1.04
VSTM4-201ENST00000298454 RAB8BQ92930 207 aa21.53■■□□□ 1.04
VSTM4-201ENST00000298454 HSPA12BQ96MM6 686 aa21.53■■□□□ 1.04
VSTM4-201ENST00000298454 BARD1Q99728 777 aaKnown RBP21.53■■□□□ 1.04
VSTM4-201ENST00000298454 TM9SF3Q9HD45 589 aa21.53■■□□□ 1.04
VSTM4-201ENST00000298454 PNPLA3Q9NST1 481 aa21.53■■□□□ 1.04
VSTM4-201ENST00000298454 BAG5Q9UL15 447 aa21.53■■□□□ 1.04
VSTM4-201ENST00000298454 KLK4Q9Y5K2 254 aa21.53■■□□□ 1.04
VSTM4-201ENST00000298454 A0A0J9YY10 115 aa21.52■■□□□ 1.04
VSTM4-201ENST00000298454 OR5K3A6NET4 321 aa21.52■■□□□ 1.04
VSTM4-201ENST00000298454 TLR4O00206 839 aa21.52■■□□□ 1.04
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