RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000285679.10

USP25-201, Transcript of ubiquitin specific peptidase 25, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene USP25, Length 3,973 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP25-201ENST00000285679 H3BQ06 376 aaPredicted RBP14.63□□□□□ -0.07
USP25-201ENST00000285679 CAPN5O15484 640 aaPredicted RBP14.63□□□□□ -0.07
USP25-201ENST00000285679 C8GP07360 202 aa14.63□□□□□ -0.07
USP25-201ENST00000285679 CBLP22681 906 aa14.63□□□□□ -0.07
USP25-201ENST00000285679 KIAA0040Q15053 153 aa14.63□□□□□ -0.07
USP25-201ENST00000285679 ANKRD54Q6NXT1 300 aa14.63□□□□□ -0.07
USP25-201ENST00000285679 SORBS1Q9BX66 1292 aaKnown RBP14.63□□□□□ -0.07
USP25-201ENST00000285679 TBC1D24Q9ULP9 559 aa14.63□□□□□ -0.07
USP25-201ENST00000285679 CFAP20Q9Y6A4 193 aaKnown RBP14.63□□□□□ -0.07
USP25-201ENST00000285679 LOC105369274A0A096LPK9 316 aa14.63□□□□□ -0.07
USP25-201ENST00000285679 SCAMP2O15127 329 aaKnown RBP14.63□□□□□ -0.07
USP25-201ENST00000285679 FAPQ12884 760 aa14.63□□□□□ -0.07
USP25-201ENST00000285679 FUT10Q6P4F1 479 aa14.63□□□□□ -0.07
USP25-201ENST00000285679 IQCHQ86VS3 1027 aa14.63□□□□□ -0.07
USP25-201ENST00000285679 OR4N4Q8N0Y3 316 aa14.63□□□□□ -0.07
USP25-201ENST00000285679 BEST4Q8NFU0 473 aa14.63□□□□□ -0.07
USP25-201ENST00000285679 EXTL2Q9UBQ6 330 aa14.63□□□□□ -0.07
USP25-201ENST00000285679 NAALAD2Q9Y3Q0 740 aa14.63□□□□□ -0.07
USP25-201ENST00000285679 TRBV4-1A0A0J9YWV2 114 aa14.63□□□□□ -0.07
USP25-201ENST00000285679 SNRPD1P62314 119 aaKnown RBP14.63□□□□□ -0.07
USP25-201ENST00000285679 KCNJ10P78508 379 aa14.63□□□□□ -0.07
USP25-201ENST00000285679 SLC5A12Q1EHB4 618 aa14.63□□□□□ -0.07
USP25-201ENST00000285679 LRIF1Q5T3J3 769 aa14.63□□□□□ -0.07
USP25-201ENST00000285679 PXDC1Q5TGL8 231 aa14.63□□□□□ -0.07
USP25-201ENST00000285679 TXNDC8Q6A555 127 aa14.63□□□□□ -0.07
USP25-201ENST00000285679 NCEH1Q6PIU2 408 aa14.63□□□□□ -0.07
USP25-201ENST00000285679 MAP6Q96JE9 813 aa14.63□□□□□ -0.07
USP25-201ENST00000285679 KLK4Q9Y5K2 254 aa14.63□□□□□ -0.07
USP25-201ENST00000285679 SBF1O95248 1867 aa14.62□□□□□ -0.07
USP25-201ENST00000285679 KPNA3O00505 521 aaPredicted RBP14.62□□□□□ -0.07
USP25-201ENST00000285679 LYRM1O43325 122 aa14.62□□□□□ -0.07
USP25-201ENST00000285679 ENDOUP21128 410 aaKnown RBP14.62□□□□□ -0.07
USP25-201ENST00000285679 AP1S1P61966 158 aa14.62□□□□□ -0.07
USP25-201ENST00000285679 GALK2Q01415 458 aa14.62□□□□□ -0.07
USP25-201ENST00000285679 LYPLAL1Q5VWZ2 237 aa14.62□□□□□ -0.07
USP25-201ENST00000285679 IL20RBQ6UXL0 311 aa14.62□□□□□ -0.07
USP25-201ENST00000285679 CFAP206Q8IYR0 622 aa14.62□□□□□ -0.07
USP25-201ENST00000285679 FAM109AQ8N4B1 249 aa14.62□□□□□ -0.07
USP25-201ENST00000285679 SIMC1Q8NDZ2 872 aa14.62□□□□□ -0.07
USP25-201ENST00000285679 NEIL3Q8TAT5 605 aa14.62□□□□□ -0.07
USP25-201ENST00000285679 MRPL39Q9NYK5 338 aaKnown RBP14.62□□□□□ -0.07
USP25-201ENST00000285679 PCDHGB2Q9Y5G2 931 aa14.62□□□□□ -0.07
USP25-201ENST00000285679 SNX11Q9Y5W9 270 aa14.62□□□□□ -0.07
USP25-201ENST00000285679 NPIPB15A6NHN6 443 aaPredicted RBP14.62□□□□□ -0.07
USP25-201ENST00000285679 STC2O76061 302 aa14.62□□□□□ -0.07
USP25-201ENST00000285679 KLKB1P03952 638 aa14.62□□□□□ -0.07
USP25-201ENST00000285679 PTPN2P17706 415 aa14.62□□□□□ -0.07
USP25-201ENST00000285679 SLC9A3P48764 834 aa14.62□□□□□ -0.07
USP25-201ENST00000285679 ZNF157P51786 506 aaPredicted RBP14.62□□□□□ -0.07
USP25-201ENST00000285679 ZNF91Q05481 1191 aa14.62□□□□□ -0.07
USP25-201ENST00000285679 ZNF791Q3KP31 576 aaPredicted RBP14.62□□□□□ -0.07
USP25-201ENST00000285679 FAM205BPQ63HN1 556 aa14.62□□□□□ -0.07
USP25-201ENST00000285679 Q6ZVL8 140 aa14.62□□□□□ -0.07
USP25-201ENST00000285679 OR52P1PQ8NH57 321 aa14.62□□□□□ -0.07
USP25-201ENST00000285679 TESCQ96BS2 214 aa14.62□□□□□ -0.07
USP25-201ENST00000285679 TEFMQ96QE5 360 aaKnown RBP14.62□□□□□ -0.07
USP25-201ENST00000285679 ABCG5Q9H222 651 aa14.62□□□□□ -0.07
USP25-201ENST00000285679 NCKAP1Q9Y2A7 1128 aa14.62□□□□□ -0.07
USP25-201ENST00000285679 CSO75390 466 aaKnown RBP14.62□□□□□ -0.07
USP25-201ENST00000285679 JUPP14923 745 aa14.62□□□□□ -0.07
USP25-201ENST00000285679 GPX2P18283 190 aa14.62□□□□□ -0.07
USP25-201ENST00000285679 DDOSTP39656 456 aa14.62□□□□□ -0.07
USP25-201ENST00000285679 NNMTP40261 264 aa14.62□□□□□ -0.07
USP25-201ENST00000285679 ACLYP53396 1101 aa14.62□□□□□ -0.07
USP25-201ENST00000285679 P2RX3P56373 397 aa14.62□□□□□ -0.07
USP25-201ENST00000285679 DBPQ10586 325 aaPredicted RBP14.62□□□□□ -0.07
USP25-201ENST00000285679 MAP4K2Q12851 820 aa14.62□□□□□ -0.07
USP25-201ENST00000285679 SUZ12Q15022 739 aaKnown RBP14.62□□□□□ -0.07
USP25-201ENST00000285679 EIF4HQ15056 248 aaKnown RBP14.62□□□□□ -0.07
USP25-201ENST00000285679 SLC24A5Q71RS6 500 aa14.62□□□□□ -0.07
USP25-201ENST00000285679 ZNF671Q8TAW3 534 aa14.62□□□□□ -0.07
USP25-201ENST00000285679 TMEM45AQ9NWC5 275 aa14.62□□□□□ -0.07
USP25-201ENST00000285679 ZFR2Q9UPR6 939 aaKnown RBP14.62□□□□□ -0.07
USP25-201ENST00000285679 CACNA1IQ9P0X4 2223 aa14.62□□□□□ -0.07
USP25-201ENST00000285679 B4GALT3O60512 393 aa14.61□□□□□ -0.07
USP25-201ENST00000285679 ATP12AP54707 1039 aa14.61□□□□□ -0.07
USP25-201ENST00000285679 VEZF1Q14119 521 aa14.61□□□□□ -0.07
USP25-201ENST00000285679 ZNF467Q7Z7K2 595 aaPredicted RBP14.61□□□□□ -0.07
USP25-201ENST00000285679 GANCQ8TET4 914 aa14.61□□□□□ -0.07
USP25-201ENST00000285679 AUTS2Q8WXX7 1259 aa14.61□□□□□ -0.07
USP25-201ENST00000285679 RDH8Q9NYR8 311 aa14.61□□□□□ -0.07
USP25-201ENST00000285679 MGAT4AQ9UM21 535 aa14.61□□□□□ -0.07
USP25-201ENST00000285679 PPIEQ9UNP9 301 aaKnown RBP14.61□□□□□ -0.07
USP25-201ENST00000285679 GLOD5A6NK44 160 aa14.61□□□□□ -0.07
USP25-201ENST00000285679 OR6C75A6NL08 312 aa14.61□□□□□ -0.07
USP25-201ENST00000285679 TEX28O15482 410 aa14.61□□□□□ -0.07
USP25-201ENST00000285679 SLC16A8O95907 504 aa14.61□□□□□ -0.07
USP25-201ENST00000285679 AOAHP28039 575 aa14.61□□□□□ -0.07
USP25-201ENST00000285679 TAS2R41P59536 307 aa14.61□□□□□ -0.07
USP25-201ENST00000285679 GPR33Q49SQ1 333 aa14.61□□□□□ -0.07
USP25-201ENST00000285679 BICRALQ6AI39 1079 aa14.61□□□□□ -0.07
USP25-201ENST00000285679 ABI3BPQ7Z7G0 1075 aa14.61□□□□□ -0.07
USP25-201ENST00000285679 CCDC190Q86UF4 302 aa14.61□□□□□ -0.07
USP25-201ENST00000285679 CALHM3Q86XJ0 350 aa14.61□□□□□ -0.07
USP25-201ENST00000285679 SLC38A2Q96QD8 506 aa14.61□□□□□ -0.07
USP25-201ENST00000285679 BBS4Q96RK4 519 aa14.61□□□□□ -0.07
USP25-201ENST00000285679 KCNK12Q9HB15 430 aa14.61□□□□□ -0.07
USP25-201ENST00000285679 TMPRSS11EQ9UL52 423 aa14.61□□□□□ -0.07
USP25-201ENST00000285679 LOC107983988A0A1B0GUW6 1196 aaPredicted RBP14.61□□□□□ -0.07
USP25-201ENST00000285679 CHURC1-FNTBB4DL54 471 aa14.61□□□□□ -0.07
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 39.2 ms