RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000284617.6

CCSAP-201, Transcript of centriole, cilia and spindle associated protein, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene CCSAP, Length 5,121 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCSAP-201ENST00000284617 MYOCOSA0A1B0GUC4 107 aa20.29■□□□□ 0.84
CCSAP-201ENST00000284617 C1orf226A1L170 272 aa20.29■□□□□ 0.84
CCSAP-201ENST00000284617 NUAK1O60285 661 aa20.29■□□□□ 0.84
CCSAP-201ENST00000284617 PLGP00747 810 aaPredicted RBP20.29■□□□□ 0.84
CCSAP-201ENST00000284617 MYF6P23409 242 aa20.29■□□□□ 0.84
CCSAP-201ENST00000284617 ZNF267Q14586 743 aaPredicted RBP20.29■□□□□ 0.84
CCSAP-201ENST00000284617 OR4D1Q15615 310 aa20.29■□□□□ 0.84
CCSAP-201ENST00000284617 C17orf50Q8WW18 174 aa20.29■□□□□ 0.84
CCSAP-201ENST00000284617 CMKLR1Q99788 373 aa20.29■□□□□ 0.84
CCSAP-201ENST00000284617 TREM1Q9NP99 234 aa20.29■□□□□ 0.84
CCSAP-201ENST00000284617 ABCD2Q9UBJ2 740 aa20.29■□□□□ 0.84
CCSAP-201ENST00000284617 MAB21L2Q9Y586 359 aa20.29■□□□□ 0.84
CCSAP-201ENST00000284617 MYH2Q9UKX2 1941 aa20.28■□□□□ 0.84
CCSAP-201ENST00000284617 GSTM2P28161 218 aa20.28■□□□□ 0.84
CCSAP-201ENST00000284617 ZNF252P-AS1Q0IIN9 211 aa20.28■□□□□ 0.84
CCSAP-201ENST00000284617 PON2Q15165 354 aa20.28■□□□□ 0.84
CCSAP-201ENST00000284617 PRRT3Q5FWE3 981 aa20.28■□□□□ 0.84
CCSAP-201ENST00000284617 KCTD18Q6PI47 426 aaPredicted RBP20.28■□□□□ 0.84
CCSAP-201ENST00000284617 SECISBP2Q96T21 854 aaKnown RBP20.28■□□□□ 0.84
CCSAP-201ENST00000284617 GTPBP2Q9BX10 602 aaKnown RBP20.28■□□□□ 0.84
CCSAP-201ENST00000284617 SH2B3Q9UQQ2 575 aa20.28■□□□□ 0.84
CCSAP-201ENST00000284617 COL14A1Q05707 1796 aaKnown RBP20.28■□□□□ 0.84
CCSAP-201ENST00000284617 HTR3EA5X5Y0 456 aa20.28■□□□□ 0.84
CCSAP-201ENST00000284617 ZNF840PA6NDX5 716 aa20.28■□□□□ 0.84
CCSAP-201ENST00000284617 EIF3FO00303 357 aaPredicted RBP20.28■□□□□ 0.84
CCSAP-201ENST00000284617 PPM1BO75688 479 aa20.28■□□□□ 0.84
CCSAP-201ENST00000284617 PENKP01210 267 aaPredicted RBP20.28■□□□□ 0.84
CCSAP-201ENST00000284617 CYP27C1Q4G0S4 372 aa20.28■□□□□ 0.84
CCSAP-201ENST00000284617 ARMCX6Q7L4S7 300 aa20.28■□□□□ 0.84
CCSAP-201ENST00000284617 KBTBD6Q86V97 674 aa20.28■□□□□ 0.84
CCSAP-201ENST00000284617 FNDC8Q8TC99 324 aa20.28■□□□□ 0.84
CCSAP-201ENST00000284617 HSPA12BQ96MM6 686 aa20.28■□□□□ 0.84
CCSAP-201ENST00000284617 TMEM45AQ9NWC5 275 aa20.28■□□□□ 0.84
CCSAP-201ENST00000284617 TEX13DA0A0J9YY54 714 aaPredicted RBP20.28■□□□□ 0.84
CCSAP-201ENST00000284617 CKMT1AP12532 417 aa20.28■□□□□ 0.84
CCSAP-201ENST00000284617 RPS3P23396 243 aaKnown RBP eCLIP20.28■□□□□ 0.842e-7■■□□□ 11.8
CCSAP-201ENST00000284617 GLP1RP43220 463 aa20.28■□□□□ 0.84
CCSAP-201ENST00000284617 MAP2K3P46734 347 aa20.28■□□□□ 0.84
CCSAP-201ENST00000284617 ISCA2Q86U28 154 aa20.28■□□□□ 0.84
CCSAP-201ENST00000284617 TMEM156Q8N614 296 aa20.28■□□□□ 0.84
CCSAP-201ENST00000284617 NUP43Q8NFH3 380 aa20.28■□□□□ 0.84
CCSAP-201ENST00000284617 OR52B6Q8NGF0 335 aa20.28■□□□□ 0.84
CCSAP-201ENST00000284617 PRR11Q96HE9 360 aaPredicted RBP20.28■□□□□ 0.84
CCSAP-201ENST00000284617 SMG9Q9H0W8 520 aaKnown RBP20.28■□□□□ 0.84
CCSAP-201ENST00000284617 C19orf25Q9UFG5 118 aaPredicted RBP20.28■□□□□ 0.84
CCSAP-201ENST00000284617 SH3PXD2BA1X283 911 aa20.28■□□□□ 0.84
CCSAP-201ENST00000284617 GRXCR1A8MXD5 290 aa20.28■□□□□ 0.84
CCSAP-201ENST00000284617 ARHGEF15O94989 841 aa20.28■□□□□ 0.84
CCSAP-201ENST00000284617 DRD2P14416 443 aa20.28■□□□□ 0.84
CCSAP-201ENST00000284617 PFKLP17858 780 aa20.28■□□□□ 0.84
CCSAP-201ENST00000284617 TBPL1P62380 186 aa20.28■□□□□ 0.84
CCSAP-201ENST00000284617 SH3BP2P78314 561 aa20.28■□□□□ 0.84
CCSAP-201ENST00000284617 HSD17B12Q53GQ0 312 aa20.28■□□□□ 0.84
CCSAP-201ENST00000284617 BAIAP2L2Q6UXY1 529 aa20.28■□□□□ 0.84
CCSAP-201ENST00000284617 ZNF689Q96CS4 500 aaPredicted RBP20.28■□□□□ 0.84
CCSAP-201ENST00000284617 OR2M4Q96R27 311 aa20.28■□□□□ 0.84
CCSAP-201ENST00000284617 SERTAD3Q9UJW9 196 aa20.28■□□□□ 0.84
CCSAP-201ENST00000284617 AKAP12Q02952 1782 aa20.28■□□□□ 0.84
CCSAP-201ENST00000284617 IGKV6D-21A0A0A0MT36 114 aa20.27■□□□□ 0.84
CCSAP-201ENST00000284617 ZCWPW2A0A1B0GU75 182 aa20.27■□□□□ 0.84
CCSAP-201ENST00000284617 CPED1A4D0V7 1026 aa20.27■□□□□ 0.84
CCSAP-201ENST00000284617 M0R233 179 aa20.27■□□□□ 0.84
CCSAP-201ENST00000284617 SOCS2O14508 198 aa20.27■□□□□ 0.84
CCSAP-201ENST00000284617 PRKYO43930 277 aa20.27■□□□□ 0.84
CCSAP-201ENST00000284617 HK3P52790 923 aa20.27■□□□□ 0.84
CCSAP-201ENST00000284617 PIGFQ07326 219 aa20.27■□□□□ 0.84
CCSAP-201ENST00000284617 LSAMPQ13449 338 aa20.27■□□□□ 0.84
CCSAP-201ENST00000284617 PDSS1Q5T2R2 415 aa20.27■□□□□ 0.84
CCSAP-201ENST00000284617 ASPGQ86U10 573 aa20.27■□□□□ 0.84
CCSAP-201ENST00000284617 MOCOSQ96EN8 888 aa20.27■□□□□ 0.84
CCSAP-201ENST00000284617 UNC119BA6NIH7 251 aa20.27■□□□□ 0.84
CCSAP-201ENST00000284617 SLC1A7O00341 560 aa20.27■□□□□ 0.84
CCSAP-201ENST00000284617 STC2O76061 302 aa20.27■□□□□ 0.84
CCSAP-201ENST00000284617 ENDOUP21128 410 aaKnown RBP20.27■□□□□ 0.84
CCSAP-201ENST00000284617 GDI2P50395 445 aaKnown RBP20.27■□□□□ 0.84
CCSAP-201ENST00000284617 TBC1D25Q3MII6 688 aa20.27■□□□□ 0.84
CCSAP-201ENST00000284617 FAM76BQ5HYJ3 339 aa20.27■□□□□ 0.84
CCSAP-201ENST00000284617 NPWQ8N729 165 aa20.27■□□□□ 0.84
CCSAP-201ENST00000284617 DHRS1Q96LJ7 313 aa20.27■□□□□ 0.84
CCSAP-201ENST00000284617 PTGES2Q9H7Z7 377 aa20.27■□□□□ 0.84
CCSAP-201ENST00000284617 PCTPQ9UKL6 214 aa20.27■□□□□ 0.84
CCSAP-201ENST00000284617 LRRC37A3O60309 1634 aa20.27■□□□□ 0.84
CCSAP-201ENST00000284617 TEX13CA0A0J9YWL9 993 aa20.27■□□□□ 0.84
CCSAP-201ENST00000284617 A0A1B0GVC2 190 aa20.27■□□□□ 0.84
CCSAP-201ENST00000284617 C2orf74A8MZ97 194 aa20.27■□□□□ 0.84
CCSAP-201ENST00000284617 GABBR2O75899 941 aa20.27■□□□□ 0.84
CCSAP-201ENST00000284617 PRLP01236 227 aa20.27■□□□□ 0.84
CCSAP-201ENST00000284617 S1PR1P21453 382 aa20.27■□□□□ 0.84
CCSAP-201ENST00000284617 C6orf120Q7Z4R8 191 aa20.27■□□□□ 0.84
CCSAP-201ENST00000284617 TSPYL5Q86VY4 417 aaPredicted RBP20.27■□□□□ 0.84
CCSAP-201ENST00000284617 KCNN1Q92952 543 aa20.27■□□□□ 0.84
CCSAP-201ENST00000284617 TMEM41AQ96HV5 264 aa20.27■□□□□ 0.84
CCSAP-201ENST00000284617 HS6ST2Q96MM7 605 aa20.27■□□□□ 0.84
CCSAP-201ENST00000284617 TEPSINQ96N21 525 aa20.27■□□□□ 0.84
CCSAP-201ENST00000284617 METTL7AQ9H8H3 244 aa20.27■□□□□ 0.84
CCSAP-201ENST00000284617 ZFR2Q9UPR6 939 aaKnown RBP20.27■□□□□ 0.84
CCSAP-201ENST00000284617 KAT6AQ92794 2004 aa20.27■□□□□ 0.84
CCSAP-201ENST00000284617 C13orf42A0A1B0GVH6 325 aa20.27■□□□□ 0.83
CCSAP-201ENST00000284617 SLC35F4A4IF30 521 aa20.27■□□□□ 0.83
CCSAP-201ENST00000284617 GPR32O75388 356 aa20.27■□□□□ 0.83
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 17.6 ms