RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000239461.10

PRRX1-201, Transcript of paired related homeobox 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene PRRX1, Length 4,284 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRRX1-201ENST00000239461 CLVS1Q8IUQ0 354 aaPredicted RBP10.14□□□□□ -0.79
PRRX1-201ENST00000239461 OR5AK3PQ8NH89 298 aa10.14□□□□□ -0.79
PRRX1-201ENST00000239461 CHTF18Q8WVB6 975 aa10.14□□□□□ -0.79
PRRX1-201ENST00000239461 FANCEQ9HB96 536 aa10.14□□□□□ -0.79
PRRX1-201ENST00000239461 PRDM6Q9NQX0 595 aa10.14□□□□□ -0.79
PRRX1-201ENST00000239461 ZSCAN32Q9NX65 697 aa10.14□□□□□ -0.79
PRRX1-201ENST00000239461 FBXW2Q9UKT8 454 aa10.14□□□□□ -0.79
PRRX1-201ENST00000239461 SLC9A8Q9Y2E8 581 aa10.14□□□□□ -0.79
PRRX1-201ENST00000239461 PCDHGB3Q9Y5G1 929 aa10.14□□□□□ -0.79
PRRX1-201ENST00000239461 A0A0G2JN53 185 aa10.14□□□□□ -0.79
PRRX1-201ENST00000239461 NOBOXO60393 691 aa10.14□□□□□ -0.79
PRRX1-201ENST00000239461 IFNW1P05000 195 aa10.14□□□□□ -0.79
PRRX1-201ENST00000239461 BMP1P13497 986 aa10.14□□□□□ -0.79
PRRX1-201ENST00000239461 TYRP1P17643 537 aa10.14□□□□□ -0.79
PRRX1-201ENST00000239461 FPR1P21462 350 aa10.14□□□□□ -0.79
PRRX1-201ENST00000239461 UGT8Q16880 541 aa10.14□□□□□ -0.79
PRRX1-201ENST00000239461 SMUG1Q53HV7 270 aa10.14□□□□□ -0.79
PRRX1-201ENST00000239461 DDX59Q5T1V6 619 aaKnown RBP eCLIP10.14□□□□□ -0.79
PRRX1-201ENST00000239461 SYCE2Q6PIF2 218 aa10.14□□□□□ -0.79
PRRX1-201ENST00000239461 METTL4Q8N3J2 472 aa10.14□□□□□ -0.79
PRRX1-201ENST00000239461 SVOPQ8N4V2 548 aa10.14□□□□□ -0.79
PRRX1-201ENST00000239461 ANKRD60Q9BZ19 345 aa10.14□□□□□ -0.79
PRRX1-201ENST00000239461 OR52A5Q9H2C5 316 aa10.14□□□□□ -0.79
PRRX1-201ENST00000239461 POLR1BQ9H9Y6 1135 aa10.14□□□□□ -0.79
PRRX1-201ENST00000239461 FTSJ1Q9UET6 329 aa10.14□□□□□ -0.79
PRRX1-201ENST00000239461 AP1M2Q9Y6Q5 423 aa10.14□□□□□ -0.79
PRRX1-201ENST00000239461 ARID1BQ8NFD5 2236 aaPredicted RBP10.13□□□□□ -0.79
PRRX1-201ENST00000239461 KCNE1BA0A087WTH5 132 aa10.13□□□□□ -0.79
PRRX1-201ENST00000239461 ZNF26P17031 533 aaPredicted RBP10.13□□□□□ -0.79
PRRX1-201ENST00000239461 GSTM2P28161 218 aa10.13□□□□□ -0.79
PRRX1-201ENST00000239461 RGS19P49795 217 aa10.13□□□□□ -0.79
PRRX1-201ENST00000239461 PRR5P85299 388 aa10.13□□□□□ -0.79
PRRX1-201ENST00000239461 DUS1LQ6P1R4 473 aaKnown RBP10.13□□□□□ -0.79
PRRX1-201ENST00000239461 C8orf82Q6P1X6 216 aaPredicted RBP10.13□□□□□ -0.79
PRRX1-201ENST00000239461 EIF3MQ7L2H7 374 aaKnown RBP10.13□□□□□ -0.79
PRRX1-201ENST00000239461 NETO1Q8TDF5 533 aa10.13□□□□□ -0.79
PRRX1-201ENST00000239461 UTP15Q8TED0 518 aaKnown RBP10.13□□□□□ -0.79
PRRX1-201ENST00000239461 XAGE5Q8WWM1 108 aa10.13□□□□□ -0.79
PRRX1-201ENST00000239461 SLC35G5Q96KT7 338 aa10.13□□□□□ -0.79
PRRX1-201ENST00000239461 MBD1Q9UIS9 605 aaPredicted RBP10.13□□□□□ -0.79
PRRX1-201ENST00000239461 ASPDHA6ND91 283 aa10.13□□□□□ -0.79
PRRX1-201ENST00000239461 PTGES3LE9PB15 166 aa10.13□□□□□ -0.79
PRRX1-201ENST00000239461 LATO43561 262 aa10.13□□□□□ -0.79
PRRX1-201ENST00000239461 FAM20BO75063 409 aa10.13□□□□□ -0.79
PRRX1-201ENST00000239461 TEAD1P28347 426 aa10.13□□□□□ -0.79
PRRX1-201ENST00000239461 TXNL4AP83876 142 aaKnown RBP10.13□□□□□ -0.79
PRRX1-201ENST00000239461 FOXC1Q12948 553 aa10.13□□□□□ -0.79
PRRX1-201ENST00000239461 CYBRD1Q53TN4 286 aa10.13□□□□□ -0.79
PRRX1-201ENST00000239461 TOR1AIP1Q5JTV8 583 aa10.13□□□□□ -0.79
PRRX1-201ENST00000239461 LYSMD4Q5XG99 296 aa10.13□□□□□ -0.79
PRRX1-201ENST00000239461 UGT2A3Q6UWM9 527 aa10.13□□□□□ -0.79
PRRX1-201ENST00000239461 USP30Q70CQ3 517 aa10.13□□□□□ -0.79
PRRX1-201ENST00000239461 CHMP1BQ7LBR1 199 aa10.13□□□□□ -0.79
PRRX1-201ENST00000239461 SATL1Q86VE3 508 aa10.13□□□□□ -0.79
PRRX1-201ENST00000239461 AMIGO1Q86WK6 493 aa10.13□□□□□ -0.79
PRRX1-201ENST00000239461 FAM122AQ96E09 287 aa10.13□□□□□ -0.79
PRRX1-201ENST00000239461 PLA2G2FQ9BZM2 168 aa10.13□□□□□ -0.79
PRRX1-201ENST00000239461 ACTL8Q9H568 366 aa10.13□□□□□ -0.79
PRRX1-201ENST00000239461 KCNK12Q9HB15 430 aa10.13□□□□□ -0.79
PRRX1-201ENST00000239461 MBNL1Q9NR56 388 aaKnown RBP10.13□□□□□ -0.79
PRRX1-201ENST00000239461 USE1Q9NZ43 259 aa10.13□□□□□ -0.79
PRRX1-201ENST00000239461 SEC14L3Q9UDX4 400 aa10.13□□□□□ -0.79
PRRX1-201ENST00000239461 FEZF1A0PJY2 475 aa10.13□□□□□ -0.79
PRRX1-201ENST00000239461 OTOL1A6NHN0 477 aaPredicted RBP10.13□□□□□ -0.79
PRRX1-201ENST00000239461 ANKRD28O15084 1053 aa10.13□□□□□ -0.79
PRRX1-201ENST00000239461 CROCCP3Q8IVE0 287 aa10.13□□□□□ -0.79
PRRX1-201ENST00000239461 SLC7A5P1Q8MH63 180 aa10.13□□□□□ -0.79
PRRX1-201ENST00000239461 BPIFB6Q8NFQ5 453 aa10.13□□□□□ -0.79
PRRX1-201ENST00000239461 OR52N2Q8NGI0 321 aa10.13□□□□□ -0.79
PRRX1-201ENST00000239461 INSM2Q96T92 566 aaPredicted RBP10.13□□□□□ -0.79
PRRX1-201ENST00000239461 C17orf62Q9BQA9 187 aa10.13□□□□□ -0.79
PRRX1-201ENST00000239461 DPH7Q9BTV6 452 aa10.13□□□□□ -0.79
PRRX1-201ENST00000239461 C1QTNF2Q9BXJ5 285 aa10.13□□□□□ -0.79
PRRX1-201ENST00000239461 RSL24D1Q9UHA3 163 aaKnown RBP10.13□□□□□ -0.79
PRRX1-201ENST00000239461 USP22Q9UPT9 525 aa10.13□□□□□ -0.79
PRRX1-201ENST00000239461 A6NCN8 305 aa10.13□□□□□ -0.79
PRRX1-201ENST00000239461 DRD2P14416 443 aa10.13□□□□□ -0.79
PRRX1-201ENST00000239461 CSNK2A2P19784 350 aaPredicted RBP10.13□□□□□ -0.79
PRRX1-201ENST00000239461 POU1F1P28069 291 aa10.13□□□□□ -0.79
PRRX1-201ENST00000239461 NCBP2P52298 156 aaKnown RBP eCLIP10.13□□□□□ -0.79
PRRX1-201ENST00000239461 ADAM15Q13444 863 aa10.13□□□□□ -0.79
PRRX1-201ENST00000239461 GAB4Q2WGN9 574 aa10.13□□□□□ -0.79
PRRX1-201ENST00000239461 GPAT3Q53EU6 434 aa10.13□□□□□ -0.79
PRRX1-201ENST00000239461 IER5LQ5T953 404 aa10.13□□□□□ -0.79
PRRX1-201ENST00000239461 TNFAIP8L2Q6P589 184 aaPredicted RBP10.13□□□□□ -0.79
PRRX1-201ENST00000239461 GALNT5Q7Z7M9 940 aa10.13□□□□□ -0.79
PRRX1-201ENST00000239461 SLC9B2Q86UD5 537 aa10.13□□□□□ -0.79
PRRX1-201ENST00000239461 RNF130Q86XS8 419 aa10.13□□□□□ -0.79
PRRX1-201ENST00000239461 PLD3Q8IV08 490 aa10.13□□□□□ -0.79
PRRX1-201ENST00000239461 LAS2Q8IYD9 372 aa10.13□□□□□ -0.79
PRRX1-201ENST00000239461 DEPDC4Q8N2C3 294 aa10.13□□□□□ -0.79
PRRX1-201ENST00000239461 DENND6BQ8NEG7 585 aa10.13□□□□□ -0.79
PRRX1-201ENST00000239461 NFKBIDQ8NI38 313 aa10.13□□□□□ -0.79
PRRX1-201ENST00000239461 GEMIN6Q8WXD5 167 aaKnown RBP10.13□□□□□ -0.79
PRRX1-201ENST00000239461 KCNC2Q96PR1 638 aa10.13□□□□□ -0.79
PRRX1-201ENST00000239461 OR4K3Q96R72 315 aa10.13□□□□□ -0.79
PRRX1-201ENST00000239461 SLC2A4RGQ9NR83 387 aa10.13□□□□□ -0.79
PRRX1-201ENST00000239461 ZCCHC3Q9NUD5 404 aaKnown RBP10.13□□□□□ -0.79
PRRX1-201ENST00000239461 UTS2RQ9UKP6 389 aa10.13□□□□□ -0.79
PRRX1-201ENST00000239461 M0QX08 132 aa10.12□□□□□ -0.79
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 54.2 ms