RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000627440.2

SNAP23-223, Transcript of synaptosome associated protein 23, human

TSL 5 BASIC

Gene SNAP23, Length 210 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
SNAP23-223	ENST00000627440	DUX4L9	Q6RFH8	374 aa	Predicted RBP	5.49	□□□□□ -1.53
SNAP23-223	ENST00000627440	SLC22A25	Q6T423	547 aa		5.49	□□□□□ -1.53
SNAP23-223	ENST00000627440	OLFML1	Q6UWY5	402 aa		5.49	□□□□□ -1.53
SNAP23-223	ENST00000627440	FAM183BP	Q6ZVS7	135 aa		5.49	□□□□□ -1.53
SNAP23-223	ENST00000627440	SV2B	Q7L1I2	683 aa		5.49	□□□□□ -1.53
SNAP23-223	ENST00000627440	SLC46A3	Q7Z3Q1	461 aa		5.49	□□□□□ -1.53
SNAP23-223	ENST00000627440	UMODL1-AS1	Q8N2C9	162 aa		5.49	□□□□□ -1.53
SNAP23-223	ENST00000627440	GPR26	Q8NDV2	337 aa		5.49	□□□□□ -1.53
SNAP23-223	ENST00000627440	PLPP5	Q8NEB5	264 aa		5.49	□□□□□ -1.53
SNAP23-223	ENST00000627440	PPHLN1	Q8NEY8	458 aa	Known RBP	5.49	□□□□□ -1.53
SNAP23-223	ENST00000627440	OR2L2	Q8NH16	312 aa		5.49	□□□□□ -1.53
SNAP23-223	ENST00000627440	RHBDF1	Q96CC6	855 aa		5.49	□□□□□ -1.53
SNAP23-223	ENST00000627440	R3HDM4	Q96D70	268 aa		5.49	□□□□□ -1.53
SNAP23-223	ENST00000627440	VPS35	Q96QK1	796 aa		5.49	□□□□□ -1.53
SNAP23-223	ENST00000627440	RASL10B	Q96S79	203 aa		5.49	□□□□□ -1.53
SNAP23-223	ENST00000627440	SCRT2	Q9NQ03	307 aa		5.49	□□□□□ -1.53
SNAP23-223	ENST00000627440	EIF2B3	Q9NR50	452 aa	Known RBP	5.49	□□□□□ -1.53
SNAP23-223	ENST00000627440	DUX4	Q9UBX2	424 aa		5.49	□□□□□ -1.53
SNAP23-223	ENST00000627440	OPN4	Q9UHM6	478 aa		5.49	□□□□□ -1.53
SNAP23-223	ENST00000627440	MYO6	Q9UM54	1294 aa		5.49	□□□□□ -1.53
SNAP23-223	ENST00000627440	RUVBL1	Q9Y265	456 aa	Known RBP	5.49	□□□□□ -1.53
SNAP23-223	ENST00000627440	FAT4	Q6V0I7	4981 aa		5.49	□□□□□ -1.53
SNAP23-223	ENST00000627440	ARHGAP42	A6NI28	874 aa		5.48	□□□□□ -1.53
SNAP23-223	ENST00000627440	MPZL1	O95297	269 aa		5.48	□□□□□ -1.53
SNAP23-223	ENST00000627440	ACTL6A	O96019	429 aa		5.48	□□□□□ -1.53
SNAP23-223	ENST00000627440	INAFM2	P0DMQ5	153 aa		5.48	□□□□□ -1.53
SNAP23-223	ENST00000627440	SAG	P10523	405 aa	Predicted RBP	5.48	□□□□□ -1.53
SNAP23-223	ENST00000627440	AOAH	P28039	575 aa		5.48	□□□□□ -1.53
SNAP23-223	ENST00000627440	HSPA9	P38646	679 aa	Known RBP	5.48	□□□□□ -1.53
SNAP23-223	ENST00000627440	CDK9	P50750	372 aa	Known RBP	5.48	□□□□□ -1.53
SNAP23-223	ENST00000627440	HK2	P52789	917 aa		5.48	□□□□□ -1.53
SNAP23-223	ENST00000627440	RHAG	Q02094	409 aa		5.48	□□□□□ -1.53
SNAP23-223	ENST00000627440	MAP4K2	Q12851	820 aa		5.48	□□□□□ -1.53
SNAP23-223	ENST00000627440	RIN1	Q13671	783 aa		5.48	□□□□□ -1.53
SNAP23-223	ENST00000627440	DPYS	Q14117	519 aa		5.48	□□□□□ -1.53
SNAP23-223	ENST00000627440	TOMM20	Q15388	145 aa		5.48	□□□□□ -1.53
SNAP23-223	ENST00000627440	CTU2	Q2VPK5	515 aa	Known RBP	5.48	□□□□□ -1.53
SNAP23-223	ENST00000627440	SLC25A52	Q3SY17	297 aa		5.48	□□□□□ -1.53
SNAP23-223	ENST00000627440	XKR6	Q5GH73	641 aa		5.48	□□□□□ -1.53
SNAP23-223	ENST00000627440	KRT39	Q6A163	491 aa		5.48	□□□□□ -1.53
SNAP23-223	ENST00000627440	LRRC8B	Q6P9F7	803 aa		5.48	□□□□□ -1.53
SNAP23-223	ENST00000627440	LCTL	Q6UWM7	567 aa		5.48	□□□□□ -1.53
SNAP23-223	ENST00000627440	PIANP	Q8IYJ0	282 aa		5.48	□□□□□ -1.53
SNAP23-223	ENST00000627440	CFAP206	Q8IYR0	622 aa		5.48	□□□□□ -1.53
SNAP23-223	ENST00000627440	PYROXD2	Q8N2H3	581 aa		5.48	□□□□□ -1.53
SNAP23-223	ENST00000627440	LILRA3	Q8N6C8	439 aa	Predicted RBP	5.48	□□□□□ -1.53
SNAP23-223	ENST00000627440	FBXL13	Q8NEE6	735 aa		5.48	□□□□□ -1.53
SNAP23-223	ENST00000627440	OR4F17	Q8NGA8	305 aa		5.48	□□□□□ -1.53
SNAP23-223	ENST00000627440	OR51Q1	Q8NH59	317 aa		5.48	□□□□□ -1.53
SNAP23-223	ENST00000627440	HSD17B8	Q92506	261 aa		5.48	□□□□□ -1.53
SNAP23-223	ENST00000627440	SYN2	Q92777	582 aa	Predicted RBP	5.48	□□□□□ -1.53
SNAP23-223	ENST00000627440	NT5C3B	Q969T7	300 aa		5.48	□□□□□ -1.53
SNAP23-223	ENST00000627440	OR4F4	Q96R69	305 aa		5.48	□□□□□ -1.53
SNAP23-223	ENST00000627440	LYSMD1	Q96S90	227 aa		5.48	□□□□□ -1.53
SNAP23-223	ENST00000627440	G6PC3	Q9BUM1	346 aa		5.48	□□□□□ -1.53
SNAP23-223	ENST00000627440	CHID1	Q9BWS9	393 aa		5.48	□□□□□ -1.53
SNAP23-223	ENST00000627440	MMP28	Q9H239	520 aa		5.48	□□□□□ -1.53
SNAP23-223	ENST00000627440	LIN28A	Q9H9Z2	209 aa	Known RBP	5.48	□□□□□ -1.53
SNAP23-223	ENST00000627440	EDA2R	Q9HAV5	297 aa		5.48	□□□□□ -1.53
SNAP23-223	ENST00000627440	SLC6A13	Q9NSD5	602 aa		5.48	□□□□□ -1.53
SNAP23-223	ENST00000627440	RAB20	Q9NX57	234 aa		5.48	□□□□□ -1.53
SNAP23-223	ENST00000627440	TREM2	Q9NZC2	230 aa		5.48	□□□□□ -1.53
SNAP23-223	ENST00000627440	HEY2	Q9UBP5	337 aa		5.48	□□□□□ -1.53
SNAP23-223	ENST00000627440	FBXO9	Q9UK97	447 aa	Predicted RBP	5.48	□□□□□ -1.53
SNAP23-223	ENST00000627440	NENF	Q9UMX5	172 aa		5.48	□□□□□ -1.53
SNAP23-223	ENST00000627440	PLA2G2D	Q9UNK4	145 aa		5.48	□□□□□ -1.53
SNAP23-223	ENST00000627440	ARFGEF3	Q5TH69	2177 aa		5.48	□□□□□ -1.53
SNAP23-223	ENST00000627440	SLC22A20	A6NK97	555 aa		5.47	□□□□□ -1.53
SNAP23-223	ENST00000627440	GFY	I3L273	518 aa		5.47	□□□□□ -1.53
SNAP23-223	ENST00000627440	WWP2	O00308	870 aa		5.47	□□□□□ -1.53
SNAP23-223	ENST00000627440	FZD6	O60353	706 aa		5.47	□□□□□ -1.53
SNAP23-223	ENST00000627440	HPN	P05981	417 aa		5.47	□□□□□ -1.53
SNAP23-223	ENST00000627440	GATA3	P23771	443 aa		5.47	□□□□□ -1.53
SNAP23-223	ENST00000627440	CHAT	P28329	748 aa		5.47	□□□□□ -1.53
SNAP23-223	ENST00000627440	PCK1	P35558	622 aa		5.47	□□□□□ -1.53
SNAP23-223	ENST00000627440	RFX3	P48380	749 aa		5.47	□□□□□ -1.53
SNAP23-223	ENST00000627440	PAPOLA	P51003	745 aa	Known RBP	5.47	□□□□□ -1.53
SNAP23-223	ENST00000627440	NAGLU	P54802	743 aa		5.47	□□□□□ -1.53
SNAP23-223	ENST00000627440	SNRPD2	P62316	118 aa	Known RBP	5.47	□□□□□ -1.53
SNAP23-223	ENST00000627440	SLC35A2	P78381	396 aa		5.47	□□□□□ -1.53
SNAP23-223	ENST00000627440	MYBPC1	Q00872	1141 aa		5.47	□□□□□ -1.53
SNAP23-223	ENST00000627440	TBL3	Q12788	808 aa	Known RBP	5.47	□□□□□ -1.53
SNAP23-223	ENST00000627440	BOP1	Q14137	746 aa	Known RBP	5.47	□□□□□ -1.53
SNAP23-223	ENST00000627440	TSC22D1	Q15714	1073 aa		5.47	□□□□□ -1.53
SNAP23-223	ENST00000627440	LONRF2	Q1L5Z9	754 aa		5.47	□□□□□ -1.53
SNAP23-223	ENST00000627440	NSUN5P1	Q3KNT7	163 aa		5.47	□□□□□ -1.53
SNAP23-223	ENST00000627440	EIPR1	Q53HC9	387 aa		5.47	□□□□□ -1.53
SNAP23-223	ENST00000627440	ZNF628	Q5EBL2	1059 aa		5.47	□□□□□ -1.53
SNAP23-223	ENST00000627440	FAM205BP	Q63HN1	556 aa		5.47	□□□□□ -1.53
SNAP23-223	ENST00000627440	SLC22A10	Q63ZE4	541 aa		5.47	□□□□□ -1.53
SNAP23-223	ENST00000627440	SBSN	Q6UWP8	590 aa		5.47	□□□□□ -1.53
SNAP23-223	ENST00000627440	B3GLCT	Q6Y288	498 aa		5.47	□□□□□ -1.53
SNAP23-223	ENST00000627440	EPM2AIP1	Q7L775	607 aa	Predicted RBP	5.47	□□□□□ -1.53
SNAP23-223	ENST00000627440	PCGF5	Q86SE9	256 aa		5.47	□□□□□ -1.53
SNAP23-223	ENST00000627440	GRAMD1C	Q8IYS0	662 aa		5.47	□□□□□ -1.53
SNAP23-223	ENST00000627440	CSNK1A1L	Q8N752	337 aa		5.47	□□□□□ -1.53
SNAP23-223	ENST00000627440	C11orf44	Q8N8P7	122 aa		5.47	□□□□□ -1.53
SNAP23-223	ENST00000627440	APCDD1L	Q8NCL9	501 aa		5.47	□□□□□ -1.53
SNAP23-223	ENST00000627440	DDHD1	Q8NEL9	900 aa		5.47	□□□□□ -1.53
SNAP23-223	ENST00000627440	GABPB2	Q8TAK5	448 aa	Predicted RBP	5.47	□□□□□ -1.53

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