RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000620099.1

SNORD39.4-201, humanhuman

BASIC

Gene SNORD39, Length 78 nt, Biotype snoRNA.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNORD39.4-201ENST00000620099 CDKL1Q00532 357 aa3.3□□□□□ -1.88
SNORD39.4-201ENST00000620099 KDSRQ06136 332 aa3.3□□□□□ -1.88
SNORD39.4-201ENST00000620099 GRSF1Q12849 480 aaKnown RBP eCLIP3.3□□□□□ -1.88
SNORD39.4-201ENST00000620099 PRKAA1Q13131 559 aa3.3□□□□□ -1.88
SNORD39.4-201ENST00000620099 OLIG2Q13516 323 aa3.3□□□□□ -1.88
SNORD39.4-201ENST00000620099 PEX6Q13608 980 aa3.3□□□□□ -1.88
SNORD39.4-201ENST00000620099 PCLAFQ15004 111 aa3.3□□□□□ -1.88
SNORD39.4-201ENST00000620099 BAK1Q16611 211 aa3.3□□□□□ -1.88
SNORD39.4-201ENST00000620099 ZSCAN26Q16670 478 aa3.3□□□□□ -1.88
SNORD39.4-201ENST00000620099 LEXMQ3ZCV2 418 aa3.3□□□□□ -1.88
SNORD39.4-201ENST00000620099 TMEM52BQ4KMG9 183 aa3.3□□□□□ -1.88
SNORD39.4-201ENST00000620099 SETMARQ53H47 684 aaPredicted RBP3.3□□□□□ -1.88
SNORD39.4-201ENST00000620099 ZRANB3Q5FWF4 1079 aa3.3□□□□□ -1.88
SNORD39.4-201ENST00000620099 TECRLQ5HYJ1 363 aa3.3□□□□□ -1.88
SNORD39.4-201ENST00000620099 CFAP157Q5JU67 520 aa3.3□□□□□ -1.88
SNORD39.4-201ENST00000620099 EOGTQ5NDL2 527 aa3.3□□□□□ -1.88
SNORD39.4-201ENST00000620099 SH2D4BQ5SQS7 431 aa3.3□□□□□ -1.88
SNORD39.4-201ENST00000620099 PLEKHS1Q5SXH7 462 aa3.3□□□□□ -1.88
SNORD39.4-201ENST00000620099 UBAP2Q5T6F2 1119 aaKnown RBP3.3□□□□□ -1.88
SNORD39.4-201ENST00000620099 C9orf64Q5T6V5 341 aa3.3□□□□□ -1.88
SNORD39.4-201ENST00000620099 HENMT1Q5T8I9 393 aaKnown RBP3.3□□□□□ -1.88
SNORD39.4-201ENST00000620099 N4BP2L1Q5TBK1 243 aaPredicted RBP3.3□□□□□ -1.88
SNORD39.4-201ENST00000620099 FAM91A1Q658Y4 838 aa3.3□□□□□ -1.88
SNORD39.4-201ENST00000620099 LRRC66Q68CR7 880 aa3.3□□□□□ -1.88
SNORD39.4-201ENST00000620099 TMEM215Q68D42 235 aa3.3□□□□□ -1.88
SNORD39.4-201ENST00000620099 ZYG11AQ6WRX3 759 aa3.3□□□□□ -1.88
SNORD39.4-201ENST00000620099 MACC1Q6ZN28 852 aa3.3□□□□□ -1.88
SNORD39.4-201ENST00000620099 ERN2Q76MJ5 926 aaKnown RBP3.3□□□□□ -1.88
SNORD39.4-201ENST00000620099 LPCAT2Q7L5N7 544 aa3.3□□□□□ -1.88
SNORD39.4-201ENST00000620099 SPATA21Q7Z572 469 aa3.3□□□□□ -1.88
SNORD39.4-201ENST00000620099 CRLF3Q8IUI8 442 aa3.3□□□□□ -1.88
SNORD39.4-201ENST00000620099 NUDCD3Q8IVD9 361 aa3.3□□□□□ -1.88
SNORD39.4-201ENST00000620099 DENND6AQ8IWF6 608 aa3.3□□□□□ -1.88
SNORD39.4-201ENST00000620099 CENPLQ8N0S6 344 aaPredicted RBP3.3□□□□□ -1.88
SNORD39.4-201ENST00000620099 GPATCH11Q8N954 259 aa3.3□□□□□ -1.88
SNORD39.4-201ENST00000620099 OR13C4Q8NGS5 318 aa3.3□□□□□ -1.88
SNORD39.4-201ENST00000620099 STAG3L4Q8TBR4 150 aa3.3□□□□□ -1.88
SNORD39.4-201ENST00000620099 CXorf40AQ8TE69 158 aa3.3□□□□□ -1.88
SNORD39.4-201ENST00000620099 ZNF473Q8WTR7 871 aaKnown RBP3.3□□□□□ -1.88
SNORD39.4-201ENST00000620099 HTRA1Q92743 480 aa3.3□□□□□ -1.88
SNORD39.4-201ENST00000620099 FGF14Q92915 247 aa3.3□□□□□ -1.88
SNORD39.4-201ENST00000620099 FAM131CQ96AQ9 280 aa3.3□□□□□ -1.88
SNORD39.4-201ENST00000620099 NUS1Q96E22 293 aa3.3□□□□□ -1.88
SNORD39.4-201ENST00000620099 L3HYPDHQ96EM0 354 aa3.3□□□□□ -1.88
SNORD39.4-201ENST00000620099 DTD2Q96FN9 168 aa3.3□□□□□ -1.88
SNORD39.4-201ENST00000620099 DCUN1D1Q96GG9 259 aa3.3□□□□□ -1.88
SNORD39.4-201ENST00000620099 SERAC1Q96JX3 654 aa3.3□□□□□ -1.88
SNORD39.4-201ENST00000620099 CNDP1Q96KN2 507 aa3.3□□□□□ -1.88
SNORD39.4-201ENST00000620099 ZNF778Q96MU6 729 aa3.3□□□□□ -1.88
SNORD39.4-201ENST00000620099 CCT8L2Q96SF2 557 aa3.3□□□□□ -1.88
SNORD39.4-201ENST00000620099 COPS8Q99627 209 aa3.3□□□□□ -1.88
SNORD39.4-201ENST00000620099 OMDQ99983 421 aa3.3□□□□□ -1.88
SNORD39.4-201ENST00000620099 MACROD1Q9BQ69 325 aa3.3□□□□□ -1.88
SNORD39.4-201ENST00000620099 KXD1Q9BQD3 176 aa3.3□□□□□ -1.88
SNORD39.4-201ENST00000620099 TUBB6Q9BUF5 446 aa3.3□□□□□ -1.88
SNORD39.4-201ENST00000620099 ABHD14AQ9BUJ0 271 aa3.3□□□□□ -1.88
SNORD39.4-201ENST00000620099 PITPNM3Q9BZ71 974 aa3.3□□□□□ -1.88
SNORD39.4-201ENST00000620099 WWP1Q9H0M0 922 aa3.3□□□□□ -1.88
SNORD39.4-201ENST00000620099 RSPH9Q9H1X1 276 aaPredicted RBP3.3□□□□□ -1.88
SNORD39.4-201ENST00000620099 P2RY12Q9H244 342 aa3.3□□□□□ -1.88
SNORD39.4-201ENST00000620099 LINC00597Q9H2U6 94 aa3.3□□□□□ -1.88
SNORD39.4-201ENST00000620099 TFB2MQ9H5Q4 396 aaKnown RBP3.3□□□□□ -1.88
SNORD39.4-201ENST00000620099 ASB8Q9H765 288 aa3.3□□□□□ -1.88
SNORD39.4-201ENST00000620099 UBE2ZQ9H832 354 aaPredicted RBP3.3□□□□□ -1.88
SNORD39.4-201ENST00000620099 RDH14Q9HBH5 336 aa3.3□□□□□ -1.88
SNORD39.4-201ENST00000620099 EML4Q9HC35 981 aaKnown RBP3.3□□□□□ -1.88
SNORD39.4-201ENST00000620099 PREBQ9HCU5 417 aa3.3□□□□□ -1.88
SNORD39.4-201ENST00000620099 SPATS2LQ9NUQ6 558 aaKnown RBP3.3□□□□□ -1.88
SNORD39.4-201ENST00000620099 NUDT4Q9NZJ9 180 aa3.3□□□□□ -1.88
SNORD39.4-201ENST00000620099 SLC2A6Q9UGQ3 507 aa3.3□□□□□ -1.88
SNORD39.4-201ENST00000620099 HAO1Q9UJM8 370 aa3.3□□□□□ -1.88
SNORD39.4-201ENST00000620099 GPR34Q9UPC5 381 aa3.3□□□□□ -1.88
SNORD39.4-201ENST00000620099 ARL2BPQ9Y2Y0 163 aa3.3□□□□□ -1.88
SNORD39.4-201ENST00000620099 DHRS7Q9Y394 339 aa3.3□□□□□ -1.88
SNORD39.4-201ENST00000620099 USH1CQ9Y6N9 552 aa3.3□□□□□ -1.88
SNORD39.4-201ENST00000620099 FER1L5A0AVI2 2057 aa3.3□□□□□ -1.88
SNORD39.4-201ENST00000620099 SEC16AO15027 2179 aa3.29□□□□□ -1.88
SNORD39.4-201ENST00000620099 C17orf113A0A1B0GUU1 675 aa3.29□□□□□ -1.88
SNORD39.4-201ENST00000620099 LRRC3CA6NJW4 275 aa3.29□□□□□ -1.88
SNORD39.4-201ENST00000620099 A6NLC8 198 aa3.29□□□□□ -1.88
SNORD39.4-201ENST00000620099 LINC01548A6NM66 108 aa3.29□□□□□ -1.88
SNORD39.4-201ENST00000620099 TRPC5OSA6NMA1 111 aa3.29□□□□□ -1.88
SNORD39.4-201ENST00000620099 C16orf96A6NNT2 1141 aa3.29□□□□□ -1.88
SNORD39.4-201ENST00000620099 TCP11X1B4DZS4 312 aa3.29□□□□□ -1.88
SNORD39.4-201ENST00000620099 GAPDHSO14556 408 aaPredicted RBP3.29□□□□□ -1.88
SNORD39.4-201ENST00000620099 LIN7AO14910 233 aaPredicted RBP3.29□□□□□ -1.88
SNORD39.4-201ENST00000620099 DSCR3O14972 297 aa3.29□□□□□ -1.88
SNORD39.4-201ENST00000620099 SLC22A2O15244 555 aa3.29□□□□□ -1.88
SNORD39.4-201ENST00000620099 RAD51BO15315 384 aa3.29□□□□□ -1.88
SNORD39.4-201ENST00000620099 SLC16A5O15375 505 aa3.29□□□□□ -1.88
SNORD39.4-201ENST00000620099 UGT1A9O60656 530 aa3.29□□□□□ -1.88
SNORD39.4-201ENST00000620099 UGDHO60701 494 aa3.29□□□□□ -1.88
SNORD39.4-201ENST00000620099 CCDC22O60826 627 aa3.29□□□□□ -1.88
SNORD39.4-201ENST00000620099 TM7SF2O76062 418 aa3.29□□□□□ -1.88
SNORD39.4-201ENST00000620099 CLDN7O95471 211 aa3.29□□□□□ -1.88
SNORD39.4-201ENST00000620099 HSPA4LO95757 839 aa3.29□□□□□ -1.88
SNORD39.4-201ENST00000620099 MLYCDO95822 493 aa3.29□□□□□ -1.88
SNORD39.4-201ENST00000620099 IGLV3-19P01714 112 aa3.29□□□□□ -1.88
SNORD39.4-201ENST00000620099 SLC4A1P02730 911 aa3.29□□□□□ -1.88
SNORD39.4-201ENST00000620099 RPN2P04844 631 aa3.29□□□□□ -1.88
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 57.8 ms