RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000604516.1

HMGN3-AS1-201, HMGN3 antisense RNA 1, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene HMGN3-AS1, Length 2,946 nt, Biotype antisense RNA.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 CHFRQ96EP1 664 aa11.24□□□□□ -0.61
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 LHX9Q9NQ69 397 aa11.24□□□□□ -0.61
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 TEX10Q9NXF1 929 aaPredicted RBP11.24□□□□□ -0.61
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 PCDHGA2Q9Y5H1 932 aa11.24□□□□□ -0.61
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 E9PQ18 207 aa11.23□□□□□ -0.61
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 OR1F1O43749 312 aa11.23□□□□□ -0.61
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 TMPRSS11DO60235 418 aa11.23□□□□□ -0.61
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 SH3BP5O60239 455 aa11.23□□□□□ -0.61
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 PRKRAO75569 313 aaKnown RBP11.23□□□□□ -0.61
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 ARAFP10398 606 aa11.23□□□□□ -0.61
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 ACP5P13686 325 aa11.23□□□□□ -0.61
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 BSGP35613 385 aa11.23□□□□□ -0.61
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 GGT2P36268 569 aa11.23□□□□□ -0.61
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 OPRD1P41143 372 aa11.23□□□□□ -0.61
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 CRISP3P54108 245 aa11.23□□□□□ -0.61
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 PCBP3P57721 371 aaKnown RBP11.23□□□□□ -0.61
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 DSTNP60981 165 aa11.23□□□□□ -0.61
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 LEXMQ3ZCV2 418 aa11.23□□□□□ -0.61
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 METRNLQ641Q3 311 aa11.23□□□□□ -0.61
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 UNC5DQ6UXZ4 953 aa11.23□□□□□ -0.61
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 LRRTM4Q86VH4 590 aa11.23□□□□□ -0.61
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 CENPSQ8N2Z9 138 aa11.23□□□□□ -0.61
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 OR5K2Q8NHB8 316 aa11.23□□□□□ -0.61
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 TRUB1Q8WWH5 349 aaKnown RBP11.23□□□□□ -0.61
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 NLNQ9BYT8 704 aa11.23□□□□□ -0.61
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 FAIMQ9NVQ4 179 aa11.23□□□□□ -0.61
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 ZNF226Q9NYT6 803 aa11.23□□□□□ -0.61
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 TAS2R16Q9NYV7 291 aa11.23□□□□□ -0.61
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 PLEKHM1Q9Y4G2 1056 aa11.23□□□□□ -0.61
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 OR2A25A4D2G3 310 aa11.23□□□□□ -0.61
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 GLOD5A6NK44 160 aa11.23□□□□□ -0.61
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 FFAR1O14842 300 aa11.23□□□□□ -0.61
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 DPM1O60762 260 aa11.23□□□□□ -0.61
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 DNAJB5O75953 348 aa11.23□□□□□ -0.61
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 GASTP01350 101 aa11.23□□□□□ -0.61
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 STSP08842 583 aa11.23□□□□□ -0.61
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 HOXB3P14651 431 aaPredicted RBP11.23□□□□□ -0.61
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 DDCP20711 480 aa11.23□□□□□ -0.61
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 POU1F1P28069 291 aa11.23□□□□□ -0.61
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 XCR1P46094 333 aa11.23□□□□□ -0.61
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 LIM2P55344 173 aa11.23□□□□□ -0.61
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 RBBP4Q09028 425 aa11.23□□□□□ -0.61
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 ZNF630Q2M218 657 aaPredicted RBP11.23□□□□□ -0.61
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 SOWAHCQ53LP3 525 aaPredicted RBP11.23□□□□□ -0.61
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 CRB2Q5IJ48 1285 aa11.23□□□□□ -0.61
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 RBM45Q8IUH3 476 aaKnown RBP11.23□□□□□ -0.61
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 RHOXF1Q8NHV9 184 aa11.23□□□□□ -0.61
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 GGHQ92820 318 aa11.23□□□□□ -0.61
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 UBE2E3Q969T4 207 aa11.23□□□□□ -0.61
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 LGALS12Q96DT0 336 aa11.23□□□□□ -0.61
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 SIGLEC11Q96RL6 698 aa11.23□□□□□ -0.61
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 MENTQ9BUN1 341 aa11.23□□□□□ -0.61
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 MS4A8Q9BY19 250 aa11.23□□□□□ -0.61
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 FAM32AQ9Y421 112 aaKnown RBP11.23□□□□□ -0.61
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 A0A1W2PPV9 198 aa11.22□□□□□ -0.61
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 SEMA7AO75326 666 aa11.22□□□□□ -0.61
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 GADD45GO95257 159 aa11.22□□□□□ -0.61
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 KRT75O95678 551 aa11.22□□□□□ -0.61
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 TGFBR2P37173 567 aa11.22□□□□□ -0.61
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 UBE3AQ05086 875 aa11.22□□□□□ -0.61
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 EIF4HQ15056 248 aaKnown RBP11.22□□□□□ -0.61
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 UAP1L1Q3KQV9 507 aa11.22□□□□□ -0.61
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 PERM1Q5SV97 790 aa11.22□□□□□ -0.61
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 AQP11Q8NBQ7 271 aa11.22□□□□□ -0.61
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 PHF10Q8WUB8 498 aaKnown RBP11.22□□□□□ -0.61
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 GEMIN6Q8WXD5 167 aaKnown RBP11.22□□□□□ -0.61
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 ZNF347Q96SE7 839 aa11.22□□□□□ -0.61
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 PIP5K1AQ99755 562 aa11.22□□□□□ -0.61
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 EPS8L2Q9H6S3 715 aa11.22□□□□□ -0.61
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 KCNK6Q9Y257 313 aa11.22□□□□□ -0.61
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 TRBV4-1A0A0J9YWV2 114 aa11.22□□□□□ -0.61
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 C1QTNF3-AMACRE9PGA6 284 aa11.22□□□□□ -0.61
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 SLC22A1O15245 554 aa11.22□□□□□ -0.61
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 IGFBP1P08833 259 aaPredicted RBP11.22□□□□□ -0.61
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 OCM2P0CE71 109 aa11.22□□□□□ -0.61
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 OCMP0CE72 109 aaPredicted RBP11.22□□□□□ -0.61
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 ALPPL2P10696 532 aa11.22□□□□□ -0.61
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 UQCRC2P22695 453 aa11.22□□□□□ -0.61
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 GJA4P35212 333 aa11.22□□□□□ -0.61
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 RPL3P39023 403 aaKnown RBP11.22□□□□□ -0.61
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 TP53BP2Q13625 1128 aa11.22□□□□□ -0.61
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 C10orf62Q5T681 223 aaPredicted RBP11.22□□□□□ -0.61
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 SVOPQ8N4V2 548 aa11.22□□□□□ -0.61
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 DNAJC22Q8N4W6 341 aa11.22□□□□□ -0.61
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 TMEM19Q96HH6 336 aa11.22□□□□□ -0.61
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 AIF1LQ9BQI0 150 aa11.22□□□□□ -0.61
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 ZBTB20Q9HC78 741 aaPredicted RBP11.22□□□□□ -0.61
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 CCNB1IP1Q9NPC3 277 aa11.22□□□□□ -0.61
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 IMP3Q9NV31 184 aaKnown RBP11.22□□□□□ -0.61
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 PSORS1C1Q9UIG5 152 aa11.22□□□□□ -0.61
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 MOSPD1Q9UJG1 213 aa11.22□□□□□ -0.61
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 ANGPT4Q9Y264 503 aa11.22□□□□□ -0.61
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 C2orf16Q68DN1 1984 aa11.22□□□□□ -0.61
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 SCN3AQ9NY46 2000 aa11.22□□□□□ -0.61
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 A0A1W2PP55 124 aa11.22□□□□□ -0.61
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 OR52A4PA6NMU1 304 aa11.22□□□□□ -0.61
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 CLDN25C9JDP6 229 aa11.22□□□□□ -0.61
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 BOLA2-SMG1P6H3BVE0 249 aa11.22□□□□□ -0.61
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 M0R082 166 aa11.22□□□□□ -0.61
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 KAT7O95251 611 aa11.22□□□□□ -0.61
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 46.5 ms