RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000588972.1

ATG4D-210, Transcript of autophagy related 4D cysteine peptidase, humanhuman

TSL 5

Gene ATG4D, Length 632 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATG4D-210ENST00000588972 FOXJ2Q9P0K8 574 aa7.39□□□□□ -1.23
ATG4D-210ENST00000588972 KLHL8Q9P2G9 620 aaPredicted RBP7.39□□□□□ -1.23
ATG4D-210ENST00000588972 IL17BQ9UHF5 180 aa7.39□□□□□ -1.23
ATG4D-210ENST00000588972 AMACRQ9UHK6 382 aa7.39□□□□□ -1.23
ATG4D-210ENST00000588972 CNOT11Q9UKZ1 510 aaKnown RBP7.39□□□□□ -1.23
ATG4D-210ENST00000588972 SATB2Q9UPW6 733 aa7.39□□□□□ -1.23
ATG4D-210ENST00000588972 CHKBQ9Y259 395 aa7.39□□□□□ -1.23
ATG4D-210ENST00000588972 SCN8AQ9UQD0 1980 aa7.39□□□□□ -1.23
ATG4D-210ENST00000588972 COL27A1Q8IZC6 1860 aaPredicted RBP7.38□□□□□ -1.23
ATG4D-210ENST00000588972 NBASA2RRP1 2371 aa7.38□□□□□ -1.23
ATG4D-210ENST00000588972 LY6G6EA0A0G2JKS1 128 aa7.38□□□□□ -1.23
ATG4D-210ENST00000588972 MBD3L2BA0A1B0GVZ6 204 aaPredicted RBP7.38□□□□□ -1.23
ATG4D-210ENST00000588972 GOLGA6L9A6NEM1 432 aa7.38□□□□□ -1.23
ATG4D-210ENST00000588972 NEMP2A6NFY4 417 aa7.38□□□□□ -1.23
ATG4D-210ENST00000588972 CDRT15L2A8MXV6 281 aa7.38□□□□□ -1.23
ATG4D-210ENST00000588972 HACD1B0YJ81 288 aa7.38□□□□□ -1.23
ATG4D-210ENST00000588972 USP17L23D6RBM5 183 aa7.38□□□□□ -1.23
ATG4D-210ENST00000588972 KCNN4O15554 427 aa7.38□□□□□ -1.23
ATG4D-210ENST00000588972 ZSCAN12O43309 604 aa7.38□□□□□ -1.23
ATG4D-210ENST00000588972 PAK4O96013 591 aaPredicted RBP7.38□□□□□ -1.23
ATG4D-210ENST00000588972 MT-CYBP00156 380 aaPredicted RBP7.38□□□□□ -1.23
ATG4D-210ENST00000588972 ATP1A1P05023 1023 aaKnown RBP7.38□□□□□ -1.23
ATG4D-210ENST00000588972 TUBBP07437 444 aa7.38□□□□□ -1.23
ATG4D-210ENST00000588972 THEGLP0DJG4 465 aa7.38□□□□□ -1.23
ATG4D-210ENST00000588972 GIMD1P0DJR0 217 aa7.38□□□□□ -1.23
ATG4D-210ENST00000588972 SLC2A4P14672 509 aa7.38□□□□□ -1.23
ATG4D-210ENST00000588972 GM2AP17900 193 aa7.38□□□□□ -1.23
ATG4D-210ENST00000588972 TNFRSF1AP19438 455 aa7.38□□□□□ -1.23
ATG4D-210ENST00000588972 SAT1P21673 171 aa7.38□□□□□ -1.23
ATG4D-210ENST00000588972 HNRNPA2B1P22626 353 aaKnown RBP7.38□□□□□ -1.23
ATG4D-210ENST00000588972 LHCGRP22888 699 aa7.38□□□□□ -1.23
ATG4D-210ENST00000588972 CDAP32320 146 aa7.38□□□□□ -1.23
ATG4D-210ENST00000588972 DUSP3P51452 185 aaPredicted RBP7.38□□□□□ -1.23
ATG4D-210ENST00000588972 F2RL1P55085 397 aa7.38□□□□□ -1.23
ATG4D-210ENST00000588972 ELP6Q0PNE2 266 aa7.38□□□□□ -1.23
ATG4D-210ENST00000588972 XRCC4Q13426 336 aa7.38□□□□□ -1.23
ATG4D-210ENST00000588972 TUBA3CQ13748 450 aa7.38□□□□□ -1.23
ATG4D-210ENST00000588972 FGFBP1Q14512 234 aa7.38□□□□□ -1.23
ATG4D-210ENST00000588972 PCLAFQ15004 111 aa7.38□□□□□ -1.23
ATG4D-210ENST00000588972 KCTD19Q17RG1 926 aaPredicted RBP7.38□□□□□ -1.23
ATG4D-210ENST00000588972 ISXQ2M1V0 245 aa7.38□□□□□ -1.23
ATG4D-210ENST00000588972 TEX44Q53QW1 395 aa7.38□□□□□ -1.23
ATG4D-210ENST00000588972 TPRG1LQ5T0D9 272 aa7.38□□□□□ -1.23
ATG4D-210ENST00000588972 ARMC12Q5T9G4 340 aa7.38□□□□□ -1.23
ATG4D-210ENST00000588972 NEK5Q6P3R8 708 aa7.38□□□□□ -1.23
ATG4D-210ENST00000588972 TUBA3EQ6PEY2 450 aa7.38□□□□□ -1.23
ATG4D-210ENST00000588972 Q6YL49 198 aa7.38□□□□□ -1.23
ATG4D-210ENST00000588972 GCNT7Q6ZNI0 430 aa7.38□□□□□ -1.23
ATG4D-210ENST00000588972 TSPAN33Q86UF1 283 aa7.38□□□□□ -1.23
ATG4D-210ENST00000588972 SLC13A5Q86YT5 568 aaPredicted RBP7.38□□□□□ -1.23
ATG4D-210ENST00000588972 CDKL3Q8IVW4 592 aaPredicted RBP7.38□□□□□ -1.23
ATG4D-210ENST00000588972 LPCAT1Q8NF37 534 aa7.38□□□□□ -1.23
ATG4D-210ENST00000588972 HCAR2Q8TDS4 363 aa7.38□□□□□ -1.23
ATG4D-210ENST00000588972 PIH1D2Q8WWB5 315 aa7.38□□□□□ -1.23
ATG4D-210ENST00000588972 C1orf54Q8WWF1 131 aa7.38□□□□□ -1.23
ATG4D-210ENST00000588972 DVL3Q92997 716 aaPredicted RBP7.38□□□□□ -1.23
ATG4D-210ENST00000588972 IMP4Q96G21 291 aaKnown RBP7.38□□□□□ -1.23
ATG4D-210ENST00000588972 ZNF764Q96H86 408 aaPredicted RBP7.38□□□□□ -1.23
ATG4D-210ENST00000588972 APOLD1Q96LR9 279 aa7.38□□□□□ -1.23
ATG4D-210ENST00000588972 RABEP2Q9H5N1 569 aa7.38□□□□□ -1.23
ATG4D-210ENST00000588972 MBNL1Q9NR56 388 aaKnown RBP7.38□□□□□ -1.23
ATG4D-210ENST00000588972 GIMAP4Q9NUV9 329 aa7.38□□□□□ -1.23
ATG4D-210ENST00000588972 FBXL17Q9UF56 701 aa7.38□□□□□ -1.23
ATG4D-210ENST00000588972 DNPEPQ9ULA0 475 aa7.38□□□□□ -1.23
ATG4D-210ENST00000588972 U3KQA8 63 aa7.38□□□□□ -1.23
ATG4D-210ENST00000588972 LRP4O75096 1905 aa7.37□□□□□ -1.23
ATG4D-210ENST00000588972 SPTBN1Q01082 2364 aaKnown RBP7.37□□□□□ -1.23
ATG4D-210ENST00000588972 A0A0J9YYE9 177 aa7.37□□□□□ -1.23
ATG4D-210ENST00000588972 A0A1W2PNU3 283 aaPredicted RBP7.37□□□□□ -1.23
ATG4D-210ENST00000588972 CXorf65A6NEN9 183 aa7.37□□□□□ -1.23
ATG4D-210ENST00000588972 CTDSP2O14595 271 aa7.37□□□□□ -1.23
ATG4D-210ENST00000588972 SCAMP1O15126 338 aa7.37□□□□□ -1.23
ATG4D-210ENST00000588972 TM7SF2O76062 418 aa7.37□□□□□ -1.23
ATG4D-210ENST00000588972 TRBC1P01850 177 aa7.37□□□□□ -1.23
ATG4D-210ENST00000588972 FGGP02679 453 aa7.37□□□□□ -1.23
ATG4D-210ENST00000588972 PIRTP0C851 137 aa7.37□□□□□ -1.23
ATG4D-210ENST00000588972 PSMB4P28070 264 aa7.37□□□□□ -1.23
ATG4D-210ENST00000588972 AKT2P31751 481 aa7.37□□□□□ -1.23
ATG4D-210ENST00000588972 POLR2LP62875 67 aaKnown RBP7.37□□□□□ -1.23
ATG4D-210ENST00000588972 PLP2Q04941 152 aa7.37□□□□□ -1.23
ATG4D-210ENST00000588972 FOXI1Q12951 378 aa7.37□□□□□ -1.23
ATG4D-210ENST00000588972 SGCGQ13326 291 aa7.37□□□□□ -1.23
ATG4D-210ENST00000588972 OLIG2Q13516 323 aa7.37□□□□□ -1.23
ATG4D-210ENST00000588972 SNX1Q13596 522 aa7.37□□□□□ -1.23
ATG4D-210ENST00000588972 IRF4Q15306 451 aa7.37□□□□□ -1.23
ATG4D-210ENST00000588972 SIX1Q15475 284 aaPredicted RBP7.37□□□□□ -1.23
ATG4D-210ENST00000588972 RBM44Q6ZP01 1051 aaKnown RBP7.37□□□□□ -1.23
ATG4D-210ENST00000588972 RFLNAQ6ZTI6 216 aa7.37□□□□□ -1.23
ATG4D-210ENST00000588972 DPPA4Q7L190 304 aa7.37□□□□□ -1.23
ATG4D-210ENST00000588972 GSTA5Q7RTV2 222 aa7.37□□□□□ -1.23
ATG4D-210ENST00000588972 PID1Q7Z2X4 250 aa7.37□□□□□ -1.23
ATG4D-210ENST00000588972 PTAR1Q7Z6K3 402 aaPredicted RBP7.37□□□□□ -1.23
ATG4D-210ENST00000588972 PRUNE1Q86TP1 453 aa7.37□□□□□ -1.23
ATG4D-210ENST00000588972 SLC22A18ASQ8N1D0 253 aa7.37□□□□□ -1.23
ATG4D-210ENST00000588972 PELI3Q8N2H9 469 aa7.37□□□□□ -1.23
ATG4D-210ENST00000588972 ARL14Q8N4G2 192 aa7.37□□□□□ -1.23
ATG4D-210ENST00000588972 CCDC110Q8TBZ0 833 aa7.37□□□□□ -1.23
ATG4D-210ENST00000588972 TMEM170AQ8WVE7 144 aa7.37□□□□□ -1.23
ATG4D-210ENST00000588972 FAR1Q8WVX9 515 aa7.37□□□□□ -1.23
ATG4D-210ENST00000588972 TADA1Q96BN2 335 aa7.37□□□□□ -1.23
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 39.2 ms