RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000550044.1

CS-217, Transcript of citrate synthase, humanhuman

TSL 4

Gene CS, Length 546 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CS-217ENST00000550044 DDX39BQ13838 428 aaKnown RBP9.07□□□□□ -0.96
CS-217ENST00000550044 TBCCQ15814 346 aa9.07□□□□□ -0.96
CS-217ENST00000550044 MINDY4Q4G0A6 757 aa9.07□□□□□ -0.96
CS-217ENST00000550044 PAGE2BQ5JRK9 111 aa9.07□□□□□ -0.96
CS-217ENST00000550044 DCAF10Q5QP82 559 aa9.07□□□□□ -0.96
CS-217ENST00000550044 MED27Q6P2C8 311 aa9.07□□□□□ -0.96
CS-217ENST00000550044 ABHD13Q7L211 337 aa9.07□□□□□ -0.96
CS-217ENST00000550044 TREML1Q86YW5 311 aa9.07□□□□□ -0.96
CS-217ENST00000550044 ZC3H7AQ8IWR0 971 aaKnown RBP9.07□□□□□ -0.96
CS-217ENST00000550044 RNF175Q8N4F7 328 aa9.07□□□□□ -0.96
CS-217ENST00000550044 AFAP1L2Q8N4X5 818 aa9.07□□□□□ -0.96
CS-217ENST00000550044 TMEM102Q8N9M5 508 aaPredicted RBP9.07□□□□□ -0.96
CS-217ENST00000550044 FDCSPQ8NFU4 85 aa9.07□□□□□ -0.96
CS-217ENST00000550044 TTLQ8NG68 377 aa9.07□□□□□ -0.96
CS-217ENST00000550044 ACMSDQ8TDX5 336 aa9.07□□□□□ -0.96
CS-217ENST00000550044 ZBTB9Q96C00 473 aa9.07□□□□□ -0.96
CS-217ENST00000550044 SNRNP40Q96DI7 357 aaKnown RBP9.07□□□□□ -0.96
CS-217ENST00000550044 MTFMTQ96DP5 389 aaKnown RBP9.07□□□□□ -0.96
CS-217ENST00000550044 MS4A6EQ96DS6 147 aa9.07□□□□□ -0.96
CS-217ENST00000550044 SMIM10Q96HG1 83 aa9.07□□□□□ -0.96
CS-217ENST00000550044 FER1L6-AS2Q96M78 137 aa9.07□□□□□ -0.96
CS-217ENST00000550044 NSUN5Q96P11 429 aaKnown RBP9.07□□□□□ -0.96
CS-217ENST00000550044 IP6K3Q96PC2 410 aa9.07□□□□□ -0.96
CS-217ENST00000550044 F2RL3Q96RI0 385 aa9.07□□□□□ -0.96
CS-217ENST00000550044 EFCAB11Q9BUY7 163 aa9.07□□□□□ -0.96
CS-217ENST00000550044 PITHD1Q9GZP4 211 aaPredicted RBP9.07□□□□□ -0.96
CS-217ENST00000550044 RHBGQ9H310 441 aa9.07□□□□□ -0.96
CS-217ENST00000550044 NOL11Q9H8H0 719 aaKnown RBP9.07□□□□□ -0.96
CS-217ENST00000550044 ACTR8Q9H981 624 aa9.07□□□□□ -0.96
CS-217ENST00000550044 MLXIPLQ9NP71 852 aa9.07□□□□□ -0.96
CS-217ENST00000550044 SEMA3GQ9NS98 782 aa9.07□□□□□ -0.96
CS-217ENST00000550044 ASF1BQ9NVP2 202 aa9.07□□□□□ -0.96
CS-217ENST00000550044 COPG2Q9UBF2 871 aa9.07□□□□□ -0.96
CS-217ENST00000550044 DCDC2Q9UHG0 476 aa9.07□□□□□ -0.96
CS-217ENST00000550044 FBXL4Q9UKA2 621 aa9.07□□□□□ -0.96
CS-217ENST00000550044 RNF11Q9Y3C5 154 aa9.07□□□□□ -0.96
CS-217ENST00000550044 DCHS2Q6V1P9 2916 aa9.06□□□□□ -0.96
CS-217ENST00000550044 IGHV3-20A0A0C4DH32 117 aa9.06□□□□□ -0.96
CS-217ENST00000550044 A8MT66 165 aa9.06□□□□□ -0.96
CS-217ENST00000550044 PRSS44E7EML9 344 aa9.06□□□□□ -0.96
CS-217ENST00000550044 FAM227AF5H4B4 570 aa9.06□□□□□ -0.96
CS-217ENST00000550044 STX16-NPEPL1H3BU86 382 aa9.06□□□□□ -0.96
CS-217ENST00000550044 PPP6CO00743 305 aa9.06□□□□□ -0.96
CS-217ENST00000550044 OR7A17O14581 309 aa9.06□□□□□ -0.96
CS-217ENST00000550044 STX16O14662 325 aa9.06□□□□□ -0.96
CS-217ENST00000550044 ERI3O43414 337 aaKnown RBP9.06□□□□□ -0.96
CS-217ENST00000550044 DLX3O60479 287 aa9.06□□□□□ -0.96
CS-217ENST00000550044 B4GALT2O60909 372 aa9.06□□□□□ -0.96
CS-217ENST00000550044 CLEC3AO75596 197 aa9.06□□□□□ -0.96
CS-217ENST00000550044 TBX6O95947 436 aaPredicted RBP9.06□□□□□ -0.96
CS-217ENST00000550044 TAC1P20366 129 aa9.06□□□□□ -0.96
CS-217ENST00000550044 NEK2P51955 445 aa9.06□□□□□ -0.96
CS-217ENST00000550044 CDH13P55290 713 aa9.06□□□□□ -0.96
CS-217ENST00000550044 STXBP1P61764 594 aaKnown RBP9.06□□□□□ -0.96
CS-217ENST00000550044 EEF1A2Q05639 463 aaKnown RBP9.06□□□□□ -0.96
CS-217ENST00000550044 IFFO1Q0D2I5 559 aa9.06□□□□□ -0.96
CS-217ENST00000550044 RUNX2Q13950 521 aa9.06□□□□□ -0.96
CS-217ENST00000550044 CPSF6Q16630 551 aaKnown RBP eCLIP9.06□□□□□ -0.96
CS-217ENST00000550044 LIPJQ5W064 366 aa9.06□□□□□ -0.96
CS-217ENST00000550044 SP5Q6BEB4 398 aaPredicted RBP9.06□□□□□ -0.96
CS-217ENST00000550044 GRHL2Q6ISB3 625 aa9.06□□□□□ -0.96
CS-217ENST00000550044 EMBQ6PCB8 327 aa9.06□□□□□ -0.96
CS-217ENST00000550044 SH2D5Q6ZV89 423 aa9.06□□□□□ -0.96
CS-217ENST00000550044 TDRPQ86YL5 185 aa9.06□□□□□ -0.96
CS-217ENST00000550044 RBMXL3Q8N7X1 1067 aaKnown RBP9.06□□□□□ -0.96
CS-217ENST00000550044 CLEC1AQ8NC01 280 aa9.06□□□□□ -0.96
CS-217ENST00000550044 OR7G3Q8NG95 312 aa9.06□□□□□ -0.96
CS-217ENST00000550044 OR11G2Q8NGC1 345 aa9.06□□□□□ -0.96
CS-217ENST00000550044 OR52B6Q8NGF0 335 aa9.06□□□□□ -0.96
CS-217ENST00000550044 ZNF473Q8WTR7 871 aaKnown RBP9.06□□□□□ -0.96
CS-217ENST00000550044 PNPLA2Q96AD5 504 aa9.06□□□□□ -0.96
CS-217ENST00000550044 FAR2Q96K12 515 aa9.06□□□□□ -0.96
CS-217ENST00000550044 MTERF1Q99551 399 aaKnown RBP9.06□□□□□ -0.96
CS-217ENST00000550044 VN1R1Q9GZP7 353 aa9.06□□□□□ -0.96
CS-217ENST00000550044 REXO4Q9GZR2 422 aaKnown RBP9.06□□□□□ -0.96
CS-217ENST00000550044 OR51B5Q9H339 312 aa9.06□□□□□ -0.96
CS-217ENST00000550044 C12orf65Q9H3J6 166 aaKnown RBP9.06□□□□□ -0.96
CS-217ENST00000550044 ZBTB26Q9HCK0 441 aa9.06□□□□□ -0.96
CS-217ENST00000550044 SEMA4BQ9NPR2 832 aaPredicted RBP9.06□□□□□ -0.96
CS-217ENST00000550044 C14orf105Q9NVL8 296 aa9.06□□□□□ -0.96
CS-217ENST00000550044 PCTPQ9UKL6 214 aa9.06□□□□□ -0.96
CS-217ENST00000550044 TMCO1Q9UM00 188 aa9.06□□□□□ -0.96
CS-217ENST00000550044 HRH3Q9Y5N1 445 aa9.06□□□□□ -0.96
CS-217ENST00000550044 SVILO95425 2214 aa9.06□□□□□ -0.96
CS-217ENST00000550044 A6NHS1 94 aa9.05□□□□□ -0.96
CS-217ENST00000550044 SAP18O00422 153 aaKnown RBP9.05□□□□□ -0.96
CS-217ENST00000550044 RTCAO00442 366 aaKnown RBP9.05□□□□□ -0.96
CS-217ENST00000550044 CDH16O75309 829 aa9.05□□□□□ -0.96
CS-217ENST00000550044 SUPT7LO94864 414 aa9.05□□□□□ -0.96
CS-217ENST00000550044 CLDN9O95484 217 aa9.05□□□□□ -0.96
CS-217ENST00000550044 GSTA1P08263 222 aa9.05□□□□□ -0.96
CS-217ENST00000550044 ACPPP15309 386 aa9.05□□□□□ -0.96
CS-217ENST00000550044 CD33P20138 364 aa9.05□□□□□ -0.96
CS-217ENST00000550044 ITGA3P26006 1051 aa9.05□□□□□ -0.96
CS-217ENST00000550044 GSTM2P28161 218 aa9.05□□□□□ -0.96
CS-217ENST00000550044 CCNG1P51959 295 aa9.05□□□□□ -0.96
CS-217ENST00000550044 SKP1P63208 163 aa9.05□□□□□ -0.96
CS-217ENST00000550044 BTG2P78543 158 aa9.05□□□□□ -0.96
CS-217ENST00000550044 PCDH1Q08174 1060 aa9.05□□□□□ -0.96
CS-217ENST00000550044 E2F2Q14209 437 aa9.05□□□□□ -0.96
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